BGIOSGA003477
| Gene Name |
BGIOSGA003477 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003477, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_01832 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003477-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003477-PA |
| Length |
5921 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:15542040..15547960 |
| Sequence Coding Region |
15542040..15542078,15542166..15542256,15542395..15542522,15543010..15543091,15543329..15543558 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:15542040..15547960 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACGCAATTCGTGCCGTATAGCTTCGCGTCCCCGCGTGTGCGGAGGCTGCACACTGCCCCTTCTAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCACGGATGGTGGTGATCAGGACAAGACGAAATCCGCAAAAGATGATGATGGTGATGACAAAGTTCAGTGTAAAAAGGAGAAGATTGTCACGGCCACGAAGAAAGGTGCTGCAGTGTTGGACCAGTACATCCCTGACAACATCAAAACGGCCTACCATGTCTTGCAAGTGGGTGATGAGATCTATGATGCCACCATGAACCAGACTAATGTTGGAGGCAACAATAATAAGTTCTATATCATCCAAGCCTTAGAATCTGATGCTGGTGGAAACTTCATGGTTTACAGTAGATGGGGGAGGGTAGGGACACGGGGTAAAGGCAAGCTACAGGGTCCCTTCTCACGAGAACAAGCAATAGATGAATTTGAGAGAAAGTTCCATGATAAAACAGATATCCATTGGTCCTATCGCAAGGGATCTCATTGTTATGCACATAAATACACCTGGCTTGAAATGGACTATGGTGAAGCTGATAAAGAGAGTAATAAGAAGACCAGTTCCATTACTAATCAGTTAGAAGAAACGAAACTTGAAACTCGAACTGCAAGCTTCATATCCCTCATATGCGATATAAGCATGATGAAGCAGCAAATGGTGGAAATAGGTTACAATGCTGACAAGCTTCCTCTGGGAAAGCTAAGCAAATCTACAATACTTAAGGGTTATGATGTTTTGAAAAGGATTTCCAATGTTATTTCAGGAGCAGACACGGACAGGACACAGCTTGAACAATTGACTGGAGAATTCTACAGTGTGATCCCTCATGACTTCAGTTTTAAGAAAATGAGTGAATTCATTATTGACACTCCTCAGAAGCTAAAAGCTAAGCTAGAAATGGTTGAAGCCCTTAGTGAGATTGAGATTGCAATCAAGCTTCTGGAGGACGATTCAAGTGACCAGGATGATCCATTGTATGCCCGATACAAGCAATTTTGCTGTGACTTTACACCTTTGGAAGTTGATTCTGAAGAATACTCTATGATAAAAACATATTTGACAAATACCCATGGAAAAACATATACAGGTTATACTGTTGACATAGTGCAAATATTTAAGGTGTCAAGGCTTGGTGAAATGGAGCGGTTTCAGAAGTTTGCTAGTGCTGGCAATAGGATGCTTTTATGGCATGGTTCTCGGCTGACCAACTGGGCTGGTATTCTTTCTCAGGGTTTGCGAATTGCTCCTCCTGAAGCACCTATTTCAGGATTCATGTTCGGGAAAGGGGTATACTTTGCTGATATGTTTTCCAAGAGTGCAAACTATTGTTGTGCTTCAGAAGCATGCAAGTCTGGTGTGCTGCTTCTATGTGAGGTTGCACTTGGTGACATGAATGAACTACTGTATGGAGATTTTGGTGCCGATAACCTGCCAAATGGCAAAACTCAGACACGCAAGCTAAATCAAGTGTTGAGAAAATATTTAACTGCTATCTCCCAAGTAAATCATGAGAACGAAAACACATCCTGCAATTCTTCATGCTGGACAACTGAACATAACCGCAGACAATTGGAGCGCATGAAGATAAACATGAGATTTTATCAAATTCAATATCATTCTGAAATTACCAAATCGACCATACAAGGTACGAAAGGAGTTGGCCAAACAGAACCCAACATAGCTGAGTCCAAGATCACTGATGATGGTATGGTTATTCCACTTGGGAAACCTGAGAAGGTACCTTCGAGAAGGGGTAGCTTGATGTACAACGAGTACATAGTTTACAACGTGGATCAGATCAGGATGCGTTACATCCTCAATGTCACCTTCAACTTCCAGAGAAGGGGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTQFVPYSFASPRVRRLHTAPSNAAAAAAVTDGGDQDKTKSAKDDDGDDKVQCKKEKIVTATKKGAAVLDQYIPDNIKTAYHVLQVGDEIYDATMNQTNVGGNNNKFYIIQALESDAGGNFMVYSRWGRVGTRGKGKLQGPFSREQAIDEFERKFHDKTDIHWSYRKGSHCYAHKYTWLEMDYGEADKESNKKTSSITNQLEETKLETRTASFISLICDISMMKQQMVEIGYNADKLPLGKLSKSTILKGYDVLKRISNVISGADTDRTQLEQLTGEFYSVIPHDFSFKKMSEFIIDTPQKLKAKLEMVEALSEIEIAIKLLEDDSSDQDDPLYARYKQFCCDFTPLEVDSEEYSMIKTYLTNTHGKTYTGYTVDIVQIFKVSRLGEMERFQKFASAGNRMLLWHGSRLTNWAGILSQGLRIAPPEAPISGFMFGKGVYFADMFSKSANYCCASEACKSGVLLLCEVALGDMNELLYGDFGADNLPNGKTQTRKLNQVLRKYLTAISQVNHENENTSCNSSCWTTEHNRRQLERMKINMRFYQIQYHSEITKSTIQGTKGVGQTEPNIAESKITDDGMVIPLGKPEKVPSRRGSLMYNEYIVYNVDQIRMRYILNVTFNFQRRG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..39#127..217#356..483#971..1052#1290..1519#1610..1730#2141..2196#2461..2540#3040..3086#3206..3255#3574..3636#3785..3865#4145..4255#4342..4417#4620..4762#4991..5065#5224..5420#5598..5703#5823..5921#ATGACGCAATTCGTGCCGTATAGCTTCGCGTCCCCGCGTGTGTGTCAGTGTGTGCTCGTGGTCTGTGTCTTGGTGTGCGTCGTCTTCACTTGTGTGACTCTTGAGTCTCTGACGCGTTTCCACTAGGTGCGGAGGCTGCACACTGCCCCTTCTAATGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCACGGATGGTGGTGATCAGGACAAGACGAAATCCGCAAAAGGTTTACTTACTTACTACTAATACTGGTCAAATAATAATTTATTCATTCATCTTACTTACCATGAGCGAAGAATTGAACTTAGGTCGAGTAACTATTTTTTTGGCATGTTTTTCTTGTGTATTCAATTGGTGGGTGCAGATGATGATGGTGATGACAAAGTTCAGTGTAAAAAGGAGAAGATTGTCACGGCCACGAAGAAAGGTGCTGCAGTGTTGGACCAGTACATCCCTGACAACATCAAAACGGCCTACCATGTCTTGCAAGTGGTGTGTGATCCAATGTTTGCCACCTTGTCTCTTTATTTCTTCTGTACAATTTATATGGTTCTTTATATTCCTACTACTTGGTTATACGTGCTAGCTGAATTGCGAACAGAACACAATTTCTCTCCAGGGTAAACACAAAATTTAAAAGTTTCCATTATTCACACCATATCAGCAATTTAGTGCTTGATAGTACATTATATTGTTTTCAGTTTGGGGCATGTTTATATTATTCATAGATTGATTGGTCTTTTGTTTTGCTTGACCTGTAGCAAGTCTAATTCTATAAGGTATTTAGAGATTAGTCCAAGGAAAACTCATGATGGAACCTCTAATTTCCGTACTCGGTATTGACAGTAGCTAGTAGCTATCATACTTTTCGCATGGTCCTCTCTTCATATTATGATCTCATCATTTGATACTGAAACTGATTTGCATTTAGTTGAATATTTATCCGTGCCTTTTGCTAATTTATCAGTTTATATTGCAGGGTGATGAGATCTATGATGCCACCATGAACCAGACTAATGTTGGAGGCAACAATAATAAGTTCTATATCATCCAAGCCTTAGGTCTGTCCAACAACTCTCTCACTCTGTCCCTCTCTCTGACCTGTTTAAATTATAAAACATACTCTTGCTTCTATCAATTGAGTGATATGAATTTGACCCATGAGGTTATCTTTGACAACTGCCACTTCTTTTAGAAGAACAATACATAAACATACTCACATGTTCTTGTACAATACATACATTCAATCTCTGAAATAATGTATAGTGTTCGATCATTAACTGATGTTTTGGTTTTAGAATCTGATGCTGGTGGAAACTTCATGGTTTACAGTAGATGGGGGAGGGTAGGGACACGGGGTAAAGGCAAGCTACAGGGTCCCTTCTCACGAGAACAAGCAATAGATGAATTTGAGAGAAAGTTCCATGATAAAACAGATATCCATTGGTCCTATCGCAAGGGATCTCATTGTTATGCACATAAATACACCTGGCTTGAAATGGACTATGGTGAAGCTGATAAAGAGAGTGTAAGATTTACTTTGTGTTTTCCACTTAGTAACTGTGTAATATAGCACCTGTAATTGTTTTAATCCTTGTTCTCTTCAAATTTGTCCTAGAATAAGAAGACCAGTTCCATTACTAATCAGTTAGAAGAAACGAAACTTGAAACTCGAACTGCAAGCTTCATATCCCTCATATGCGATATAAGCATGATGAAGCAGCAAATGGTGGAAATAGGTAAGCTGTTTCAATGTTGTTGCTCTTATACTTATTGTACATCGTAGGAATATCATGTTTAACCACTTGCTGTATTCATATGCTAGCCAAATATTGTTGCCATTAAACAAAGATAATCAAATTATTTCTAACCTTCATATGTTGATTCATGGAATAATTAATTTGCATGGTAGATACTGTAATGAGGGAATTAATTTTCAGAAGAAAAACTGAGACCAAAATATGGGATTAAAACCAGTTAATGGCAGAAAAGAGTTGAATTGACTCAGTAAAAAAAGTCAAATATCATTTTATCATATGCGTGTTCGATGGTGTCCCACATGTTAAGAGTTTATCTGTTTTGAAAAGTATTTCATGTTGCTCATTCGTCAAATATCTGCTTTTCTGATTCATCTTGTGTAACTGATCAGGTTACAATGCTGACAAGCTTCCTCTGGGAAAGCTAAGCAAATCTACAATACTTAAGGTAAGTTGTTTCATATACTTTGTTTGAATTATCATGTGAGCATACAAGCCTGCAAGTTGAAGAACGGTGCATGTAAGCTTCACTTAATTCCCTAACATGCTAGATGAAAGTTAACCATAACCACATGCTATAAAAGTTATGTTTTCTGTATATTTCAGTGCCGTATGAAGTAACAGTTTGGATTTCATCGTCTTGTCCATATACCATTTGTCCCATCCTTTCTTTTCTTTTTTTCCGATAATGATGTTGTTCCACGTTCCACAGGGTTATGATGTTTTGAAAAGGATTTCCAATGTTATTTCAGGAGCAGACACGGACAGGACACAGCTTGAACAATTGACTGGGTGGGTCTATGCATTTTTTTTAATTTGGTCACAACTCACAAGCATAGCCTATAATCAAATAATAGGATGTCTGTGTTGTCTTCCGGTTTCAGATCTTTAAGATGATGAAGATTTTTTTTAAAATAAATGCTTGAATTTTAATATTTTATTATTTCTAATGTTCTAAACTGTTTTATACTTTGTAATACATGTATCATGGGCATTGTTTGAGGAAATTAGTTTTGCATTCAGTGTTAAAAAGTTAACTCGGTTGTTTTTTTTTGTCACGTTCTAGATAGAAATTACTTTTCTAGAATAAATTGCATTTGTCAGAATTGATTCTAGTAAGATGCTCTTATGTTTTTTTTTGTCACATCTAGATAGAAATTACTTTTCTGGAATAAATGCATTTGTCAGTATTGATTCTAGTAAGATGCTCTTATGCTGCATCTGTTTATATATCCTTTAAAGGCTTATATTTGTGCTTACTAAGATGCTCTTATGCTGCGTCCGTTTGCAGAGAATTCTACAGTGTGATCCCTCATGACTTCAGTTTTAAGAAAATGAGTGAGCTTTAAACGCTCTAACTTAATTGATCTTTAAGTCATGATTTAAATAATTAGGGCATCCAGCTCTGTTTTGGACCTTTATATAGGGTTATCTGACCTATTTAATTTATTTGACAGGTGAATTCATTATTGACACTCCTCAGAAGCTAAAAGCTAAGCTAGAAATGGTAATAATCTACTTTCTTTCACCATGAAATGTTTGTGCATCTTATGATTTTAAAAAATAATGAATTTATAGCATTATTTTGTTTCTATGTTAAGCCTTGTGTTATAGTGCCTATTGTACAATACTATCTAATGATGAAATTTTCTTGTCATTATCTAAATTTCTACTAAAGTTGTTGAAATTGTTGTAGCTCCATATCCTTTTCTCTATCTGATTATTTTACATCATTCATATTATTATGTTACATGTTCCTTGACTTAATGCACCTTTTTCTCTATTACACCCTGCTCATGTTATTAGCTTTCTTGCTCTTTGAAAGGTTGAAGCCCTTAGTGAGATTGAGATTGCAATCAAGCTTCTGGAGGACGATTCAAGTGACCAGGTATGTCATTATGCAAATAACTGTGGCATTCGATATGGACTTGTGGGTTCTCCTCAATTGTAAAATCTTCATTTATCTTATAATCTTCAAGTAAAGAACTCCTTGTAACTGTACAAACCTTGCACCTGTTGCATGTTTCCATATGTAGGATGATCCATTGTATGCCCGATACAAGCAATTTTGCTGTGACTTTACACCTTTGGAAGTTGATTCTGAAGAATACTCTATGGTAAAACTTCTACCAAGAATTTATATGCACAACGATTTATGGACATTACGTGCCAGTGGCAAGGCGCATCAAGATAGTACTATTTGTCATTTTTAACTTGAATATAGGCTAGGGAAAGAAAGGTAATTTCTGTGAGCTTTTATGAACAGAAAGTCAGAAACTAACTTAACATGGTAGACTGAGTTTTTTTATTATGTCTATTTACTCTTTATTAATGCTATTGTTCAACTTTGTCTGAAGTGCTTAGATTTAACCTTGTTTGAAATTTTTGCTGTCCAGATAAAAACATATTTGACAAATACCCATGGAAAAACATATACAGGTTATACTGTTGACATAGTGCAAATATTTAAGGTGTCAAGGCTTGGTGAAATGGAGCGGTTTCAGAAGGTGAGTGGATCTTCCTAATCAGCTAAGCCACCCAAAAGAACTGTGCTCCAATTGTGAAATTAGTAATTTTCAAAATGTTCCTGCAGTTTGCTAGTGCTGGCAATAGGATGCTTTTATGGCATGGTTCTCGGCTGACCAACTGGGCTGGTATTCTTTCTCAGGGTAATTCATCTATCTTAAAATTCTATTTATACATTGGAGCTTCCCTGCACATTTGTGATTTCTTTTTCTGTTGCTGAAACATTTAGTTAGTATCCTATTCCCTTCAGAAATTCCAGAATATCCTGTGCTACTTGCCACTCCTTAAATGTTGGAACTATTAAATGGATGAATGATATTATAATTAACATCACACTTCTCCTAGGTTTGCGAATTGCTCCTCCTGAAGCACCTATTTCAGGATTCATGTTCGGGAAAGGGGTATACTTTGCTGATATGTTTTCCAAGAGTGCAAACTATTGTTGTGCTTCAGAAGCATGCAAGTCTGGTGTGCTGCTTCTATGTGAGGTATGTATGCTGTACTCGCCCTCGT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