Os11g0484000

From RiceWiki
Revision as of 09:10, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os11g0484000| Description = Class II aldolase/adducin, N-terminal family protein| Version = NM_001074440.1 GI:115485528 GeneID:4350524| Length =...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os11g0484000

Description

Class II aldolase/adducin, N-terminal family protein

Version

NM_001074440.1 GI:115485528 GeneID:4350524

Length

7231 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0484000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:18863397..18870627

Sequence Coding Region

18863604..18863695,18863887..18864005,18864091..18864200,18864437..18864538,18864624..18864773
,18865114..18865269,18865471..18865632,18866468..18866557,18867071..18867190
,18868242..18868337,18868421..18868557,18870319..18870541

Expression

GEO Profiles:Os11g0484000

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:18863397..18870627 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:18863397..18870627 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgtgctgcggcggcggaaggggggagggggcggcggcgacggagtcggaggcgtacctggagggagaggcggtgagggaggcgcgggagctggtggcggagctgtgccgccacttctacggccaagggtgggtcaccggaacggggggcagcatcaccgtcaaggccaacgacccggcgctccccctcgccgatcagctcatcgtcatgtccccctccggtgtgcagaaggagaggatggtggcagaggacatgtatgtgctgtcagcagatgggaaggtgctctcctcacctgtatcaaagccatggccaaacaagcctccaaaatgtactgactgtgctcctctgttcatgaaggcttatctgatgagaggagctggggctgttattcatagccatgggatggaaacttgcattgcaaccatgcttgatcctggtgcaaaagagtttaggatgacacatatggaaatgattaaaggaattaaaggccatggttaccgtgacgaattggtggttcctataattgagaacactccttatgagtatgagctcactgactcactggctgaggcgattgcagcataccctaaggcaactgcagtccttgtacggaaccatggaatttatgtatggggtgattcctggatcaatgccaagacacaggctgaatgctatcattacctttttgatgctgccatcaagctctatcaattgggtattgattggacaactcctgagcatggtccaataaacagtgccaaaagaccacgcagtgttctaagctctagtattccaaatggatgccctgattccaaatcatcaaagcattgtgttgttcttgacattgagggaacaactactccaatatcatttgtgactgatgtgatgtttccctatgcccgtgataatgtgcgaaagcatctgacttcaacatatagttctgatgaaaccaaagaggacatcaaactattgcgcatccaagttgaagaagacctgaaaaatggaattgttgggtctgttccaattccacctgacgatgctgacaaagaagaggttatcaatgcattagttgctaatgttgaatcgatgattaaagcagacaggaagattacgtcgttgaaacaactccagggccacatatggaggactggttttgaaagtaaagaactgcaaggagttgttttcgatgatgtccccgaggcgctaaagcactggcatgctagtggcatgaaggtctacatatactcaagtggcagccgggaggcgcaaaggctattatttggcaatacggcctatggtgatctgcgacaatacctctgtggtttctttgacaccacaaccggtaacaaaagagaaacaaggagctactttgagatttcgcaatcacttggggtggacagtcctgctcagatcttatttatcaccgatgtcttccaagaagctgttgctgcaaaaagtgcaggttttgaggtaataatctccattcgcccgggaaatgcaccgctccctgagaatcatggtttccggactatcaagtcgtttagtgagatctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MACCGGGRGEGAAATESEAYLEGEAVREARELVAELCRHFYGQG WVTGTGGSITVKANDPALPLADQLIVMSPSGVQKERMVAEDMYVLSADGKVLSSPVSK PWPNKPPKCTDCAPLFMKAYLMRGAGAVIHSHGMETCIATMLDPGAKEFRMTHMEMIK GIKGHGYRDELVVPIIENTPYEYELTDSLAEAIAAYPKATAVLVRNHGIYVWGDSWIN AKTQAECYHYLFDAAIKLYQLGIDWTTPEHGPINSAKRPRSVLSSSIPNGCPDSKSSK HCVVLDIEGTTTPISFVTDVMFPYARDNVRKHLTSTYSSDETKEDIKLLRIQVEEDLK NGIVGSVPIPPDDADKEEVINALVANVESMIKADRKITSLKQLQGHIWRTGFESKELQ GVVFDDVPEALKHWHASGMKVYIYSSGSREAQRLLFGNTAYGDLRQYLCGFFDTTTGN KRETRSYFEISQSLGVDSPAQILFITDVFQEAVAAKSAGFEVIISIRPGNAPLPENHG FRTIKSFSEI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6933..7024#6623..6741#6428..6537#6090..6191#5855..6004#5359..5514#4996..5157#4071..4160#3438..3557#2291..2386#2071..2207#87..309#actcttcctactacaaaaaaccaaaccatcaccacaaaaagcatcaaggcgagctcgaatcccggcggcggcggcggaggagagccatggcgtgctgcggcggcggaaggggggagggggcggcggcgacggagtcggaggcgtacctggagggagaggcggtgagggaggcgcgggagctggtggcggagctgtgccgccacttctacggccaagggtgggtcaccggaacggggggcagcatcaccgtcaaggccaacgacccggcgctccccctcgccgatcagctcatcgtcatgtccccctccggtatcctcctcctcctccgccttcctcagcctcacaccctccctccacctgttcgatgaattgccacggcggcaggggatgttattccgggatcgacgagggtgggtgggtgggtgggtaggaacgtagtctgctgcgtggagttcggttaaattaacaatttcgatggcattgacttgcctgtgtctcatcactcttgtgctgctactacgtatctagagcagtcgagctttgtattgtttaatttggtttactcatgcgttgtgttgctctgtggcaatacaaagtggagtcaggaacaggaaggaccacctctctcctgtactatcttgcactgctctgctcctgctggacgaactgactgatgtgattttgcatatggggattgctcgttggcatgcacagttgaagattgtgctctgctgctcatgttagttattgtgatctgtattaacgtacaagattgtgggggtgtaaggccctgtttctttcagcttgggattattataatccagattattgggagtaagctgaaagaaacagacaacttattgaagtagcttattataatctgaagcccagcttattataatctgataagctcatttaggtgagctttttccagattattgggtaaaaaattacccaccatgccaccccactccctctttagatttgcaaacccaataatctaggctctattaatctaggaaagaaacaactaaccgcttattctactacagattataacaatctagcttatagtaatctaactcaataatctagattataataatcttaagctgaaagaaacagggcctaagtatcagataagcttagttgggtgttgatttgggcttgttactaaaaaaattggaactacggttgctttattattcttatgtaggctgcttgtccagacagttggaatagacttaagcatttaggaggctaggtgcttatttcatattgatatggcccacccctcgtatgtttgactgattgcagtttttgtgaaatggctcagcaagcactgcagtagcggttgaacactgtggtcaactttatttatccgagtgtggttaatagtctggaacgttctcagatatttcactgttaagtcagaaactggccaagaagaattaacagtttgaattatgggagctggaaaaccaagtgatttctgtacaaagtcagactagaataaaacatgcaataataattgtacactactaaggaaaaaaaattcttgttatgttaataatttctatgacaaagataagttgctaaggagccaagatcaattttatttacaaactagtaacttaaaatatttctagctttcaagtgtgaactattatgcttattagcttatgtctcaatgcagttgagcatcagtgcatgatgcatgtgaagtgttactattacagtttttactttaaaaatacttgtgtaaacctgtgcgtagttgtaatgtccagtattggaccaccttgagcatttcattatctaggcctgctataaagatacaatgttatcctcttttgatgaaaacatgattttgcaattttggacatgcctattgatgtggaaagaggtttgtctagcgccacaaatcaatcatggggatgaaacaaagctgaaaacctgaatcactaaacagaacgtgattttctaccagtcgaccataacttctgtgagcactaaggttgcgatttgaaccaaaagaaacgatataagaaattttaatcacattctcaggtgtgcagaaggagaggatggtggcagaggacatgtatgtgctgtcagcagatgggaaggtgctctcctcacctgtatcaaagccatggccaaacaagcctccaaaatgtactgactgtgctcctctgttcatgaaggttatcagtgctatcctttgcttaatttgtccgcttcaacttgttttagtctaaattgtctaattttcattggtattttgcaggcttatctgatgagaggagctggggctgttattcatagccatgggatggaaacttgcattgcaaccatgcttgatcctggtgcaaaagagtttagggtgaacccacttgtctcttttccccatgaatcttagctaatgttccagttctgctttatatttctcatgaagttagctgtgatgtttacaaaaatgtggtagtactaagaaaatacaccatttctcatgtagtgtaccacattatggacatttttctgtctgatctaatgtgtcaaattgaaaaatggataattgttcatatttttagatttccgcttacttttccattacaagaacttccatggtattaacaattaagtgctaaccttctagatgatgcactattcaataaattggagattatgtttgctccatttgtttttcatttcatggcagacattattacatatgtactaaaaagagtggtgaacattttttaaaagatttgatcgattattgatttcacacagacatgcatcagctatcaggaccagttggaataatgtcatacatattttctaaatttggtacactgttgattccaatatttagagaagtgcacgatgcatacattggtcgggatgtcatgatactagaatgtactccctctgtccctaaatataagggattttggttggatgtgacacattctagtacaacgaatctggacataaagcctgtccagattcgttgtactaggataagtcacatccaaccaaaatcccttatatttagggacagagagagtattaaatttaaacatgaagtttaccatccccacatattgcttagcatatccaagacatcagtgctattccaacactattctattggctaattaattcgaaagcaaactcagaaaaatccaaaatatcatatgtatccactatttcaataaggttggtaatttgttcattgtgtttgtagtaggcaaagctaatagcagaaactatttgctgtttgcatatggccagggttttcagtcagtagaacttatgatagtcatagtattatctcatttgattgattttttttagtcgtagatccacctctaaagtgactgtgatatggaaatctttatttgaccatatactgctattctatcttacagatgacacatatggaaatgattaaaggaattaaaggccatggttaccgtgacgaattggtggttcctataattgagaacactccttatgagtatgagctcactgactcactggctgaggcggtatgttactattgtccttctttggagtttcagtttctcaatcttcgcaaaaaaacaaatattatatttgtagtctgttgttctcataacttcgtgtggataaaatagatattgttctaacaacgggattggccaacctgtaggcaatgaagcaatcgttacaaccatctcgttcatctgtcatttaggatttaacttacaaaacttattaaattgatgttgattatgaggaggttattctcaatattacctccattctcaatatgtcattttggattatgtacattactgcagtcaaacctttaaacttaagcttactactatgcgcaaaacaatgtaagctcgtcactcatagaaatgatattaacagatatataatttttatatacaattgaaaagtagtgatcaaaactgtgtattggagactatgttaatgaccaaaacaacaaataacaaagaacaaatagaatattttggatggatctagagaactgatgtgaaaatatataacagattgcagcataccctaaggcaactgcagtccttgtacggaaccatggaatttatgtatggggtgattcctggatcaatgccaagacacaggtatgtttttctaacctctcatttttactttgtttatttcttcattttagattgtcagctctttcaacaatcaaatagtaatctccttacactatgcccttgttcatcaatatcttcaagactacctaggtcgtgggtatacattaattatatgactatctgttagatgcacttcaataatatttatatcaagcctgctatttgataatagttttgtgataaatataagggtatattgtgttggcgctttggcggtatataaacttgttaggtgggtgcaatttagtacacaaacttgtaaaatactcattatggtgcatgaacttatctagagcgtgcgtgctagtccaaaacttgtgactattcatgttgagttcgtctgattatagaatgtcaggcgcacacgtgagggtatgagatatgtcgtatgtgtaaataatttaaccttgttcttcatttatttcgtatccattgcatactccctttatgtataattaacatgacttattgtatgtttgattgactatatgcatatttacgtaacatcatattgacatgtgagcctacataacatcctaatcagtgctcaacttagtgaaattagttacaacatattgttttggctctagtttgcacgtattagacaagtttatgcactgaaatgagcgatttacatatgcatgtactaaatcgcatccaccttgtaagttcatgtaccaactgtgcaatttactctaaatataactgtggtcatgcacacattgtgagggataatggttcctggactttatgccatgacatatatttacttaattgctatgcctgtgcttttcaggctgaatgctatcattacctttttgatgctgccatcaagctctatcaattgggtattgattggacaactcctgagcatggtccaataaacagtgccaaaagaccacgcagtgttctaagctctagtattccaaatggatgccctgattccaaatcatcaaaggtctgttctttgttctgagtatttgcaaaatctaccttctaaatgatttttttagatcttatagtgtaccgttttgcagcagtgagtactaggtgttattgtttgtgtactttcttaactttgtggttgctacatctggtcaactcatccatataatatgtttctggaatacaaatagctaacctttgtgttctcttgcagcattgtgttgttcttgacattgagggaacaactactccaatatcatttgtgactgatgtgatgtttccctatgcccgtgataatgtgcgaaagcatctgacttcaacatatagttctgatgaaaccaaagaggacatcaaactattgcgcatccaagtaagttatgataaatcaattttgcacatcccatgaagctgttgatcctgtaaggctgcaagcttgtaccatctaagtatttgtcgatggtatttaagtcatactatttgattagccctgtgaaaattattttgttttgaattgttagatttgatctaagttaccataccaattttggttcctcaacttcctatttgtggacgtagttaactgttttaccaccatggtggaaagtggctggagtcctcaccaccagaaccatgagttttaccactaggccacgtgaatgtgcccatctctgttttatgcaagatataacatattagcattcattattcaggttgaagaagacctgaaaaatggaattgttgggtctgttccaattccacctgacgatgctgacaaagaagaggttatcaatgcattagttgctaatgttgaatcgatgattaaagcagacaggaagattacgtcgttgaaacaactccaggtagattagtccacattctttttcggtgctgcaagcatattcctgtttctttgatggatttcagcatttttaatgcaaattccagggccacatatggaggactggttttgaaagtaaagaactgcaaggagttgttttcgatgatgtccccgaggcgctaaagcactggcatgctagtggcatgaaggtatctctttagtcaaattcgtgtggaagtgtgaactttaaacttttcatggctcctaatatgttttcatggtttactatagttattactagctgccaacttgggtcaagaacgttgaccctagatagtgctaaacaatatcaatttcaaatttttgaatcatccattgcaaaaaatacaaaaaaaggtgtattagtattagatgacatgataacaaataatatacctgcaaataggtctacatatactcaagtggcagccgggaggcgcaaaggctattatttggcaatacggcctatggtgatctgcgacaatacctctgtggtttctttgacaccacaaccgggtatgatttcttgttccatttctatttctctgcatatactgaaaaatggtagtgaaattatgattccatctcgcataaaccgcagtaacaaaagagaaacaaggagctactttgagatttcgcaatcacttggggtggacagtcctgctcagatcttatttatcaccgatgtcttccaagaagctgttgctgcaaaaagtgcaggtaatgactagttctggtcaaatattcatgggaatgttcatgcttttatttggtggataagatgctttagctttaaccagtcgacctctctgggtgccattcctaatcatgtgatcatttcaagctatcattcgtttccttgggtcaagatttcatattatatttttctttcccgacattttctttttcaggttttgaggtaataatctccattcgcccgggaaatgcaccgctccctgagaatcatggtttccggactatcaagtcgtttagtgagatctgaagaaggtacgcaaagacaatgtcaggagtgctttgatggcgagctacctagcatatgtaagaacaatgcaaataataaatggaaaatccggaatggtggcaaaataaataaatttgtaaatgtgggcatattgttgcattattgtgccatccgtcgacggttttgtagctcttttttagcaaagaggaataataaaattgttgttgc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0484000, RefSeq:Os11g0484000