BGIOSGA003796
| Gene Name |
BGIOSGA003796 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003796, complete gene. |
| LocusTag |
B1114B07.27-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003796-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003796-PA |
| Length |
4187 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:24171754..24175940 |
| Sequence Coding Region |
24171754..24171829,24171948..24171988,24172623..24172692,24172788..24172936,24173049..24173144 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:24171754..24175940 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGCCGCGCGTGGGCAACAAGTACCGCCTCGGGCGGAAGCTCGGGAGCGGCTCGTTTGGGGAGATCTACCTCGGTACTAACGTGCAGACCAACGAGGAGGTCGCGATTAAGCTGGAGAATGTGAAAACAAAGCATCCACAATTGCTGTACGAGTCAAAGCTGTACAGGATACTTCAGGGTGGAACTGGGATTCCAAATGTCAAGTGGTTTGGTGTTGAGGGTGATTACAATGTTTTGGTTATGGACTTATTGGGCCCAAGCCTTGAGGATCTCTTTAGCTTTTGCAACAGAAAATTGTCTCTAAAAACTGTTCTAATGCTTGCTGATCAAATGATAAATCGAGTTGAATTTGTACACTCAAAGTCTTTCTTGCATCGAGATATTAAGCCAGACAATTTTCTCATGGGCCTTGGAAAGAGGGCAAACCAGGTATACATGATTGATTTTGGACTGGCAAAGAAATACCGGGACACTTCAACACACCAGCACATTCCATACAGAGAGAACAAAAATTTGACTGGGACAGCTCGATATGCTAGTGTAAACACCCATCTTGGAATCGAACAAAGCAGAAGGGATGACCTTGAATCTCTTGGATATGTACTCATGTACTTCTTAAGAGGAAGTCTTCCATGGCAGGGTCTAAAAGCTGGGACCAAAAAACAGAAGTACGAGAAAATTAGCGAACGGAAGATTGCTACATCAATTGAGGCTCTCTGTCGCGGATACCCTTGTGAGTTTCAATCCTACTTCCATTACTGCCGTTCACTACGTTTTGAAGATTTGCCAGACTATCAATACCTGAAGAGATTGTTCAGAGACCTTTTCATTCGAGAGGGATTTCAGTTTGATTACGTTTTTGACTGGACCATTCTTAAGTACCAGCAGTCACAGATAACCAGTGTTCCACCACGTGCTATTGCTGCAGCAGCAGGGCAAAGCTCTGGAATGTCTCCAATAGCAATTAATAATAGGCTATCAGCCACTGAAGAGGGAAGAAGAAGCGGGTGGTCAGATGATCCTACACGACGTCAGGTTCCACCTACAGGAATAAATGCTGGCAGCTTATCAAAACAGAAGTCCCCGGTTAGGCCAGACATGTCCACTTCAAAAGATGCTTTGTTCTCTAGTTCGACAATGTTGGGTCGGTCAAGCGGATCCTTAAGGCGACCTGTTGTTTCTAGTAGCCGAGAACTGCAAAGCAGCGAAGCTGAACCATCACGTAGCCGCACACCAGATGCAAGTCCTGGGACATTCCAAAGAAGTGCTCCTCCACGTAGGAGCTCACAGATGCTCGACTATTCTGACCCCAGGCATTCGTCATCTGGCAGGCATGCAGCTAACAAGAACTATGAGTCCACTATAAGAGGCATCCAAGGCCTAAATTTTGATGCCAACGATAGGATCCACTACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEPRVGNKYRLGRKLGSGSFGEIYLGTNVQTNEEVAIKLENVKTKHPQLLYESKLYRILQGGTGIPNVKWFGVEGDYNVLVMDLLGPSLEDLFSFCNRKLSLKTVLMLADQMINRVEFVHSKSFLHRDIKPDNFLMGLGKRANQVYMIDFGLAKKYRDTSTHQHIPYRENKNLTGTARYASVNTHLGIEQSRRDDLESLGYVLMYFLRGSLPWQGLKAGTKKQKYEKISERKIATSIEALCRGYPCEFQSYFHYCRSLRFEDLPDYQYLKRLFRDLFIREGFQFDYVFDWTILKYQQSQITSVPPRAIAAAAGQSSGMSPIAINNRLSATEEGRRSGWSDDPTRRQVPPTGINAGSLSKQKSPVRPDMSTSKDALFSSSTMLGRSSGSLRRPVVSSSRELQSSEAEPSRSRTPDASPGTFQRSAPPRRSSQMLDYSDPRHSSSGRHAANKNYESTIRGIQGLNFDANDRIHY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..76#195..235#870..939#1035..1183#1296..1391#1488..1558#1831..1892#2026..2089#2173..2257#2336..2462#2539..2621#2705..2765#3633..3772#3894..4187#ATGGAGCCGCGCGTGGGCAACAAGTACCGCCTCGGGCGGAAGCTCGGGAGCGGCTCGTTTGGGGAGATCTACCTCGGTTCGTGCCGCCGCTCCCCGCCTTGTGGGGGGGTTTCCGTTTTTTTGGTTTTTTTTTTGGTGGATTGTGTTCTCTTCTGGTGTCGCTGAATCTGTTGGGTGTGGATTTGCGCCTGCAGGTACTAACGTGCAGACCAACGAGGAGGTCGCGATTAAGCTGGTGAGTTGATGCGATAATACTCATGTTTTCGCATATTCTACAATTTTCCTTTCCCTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGTCGTCGGGGTAGTCAATTAGTGGATTGGGGAGGAAGTGATGGATAATTGTTCTGAATCAAAATAACCTATGAATTCACCCTAGCACATTTGGACTGGTAATTTGTGTAATAGAAAGGCCAATAAGCACTGGAACAAATGTCGCCTGCCATACGGCTTGGGAATATTTTGATATGGGTTGGGCTGTGTAAGCTCTTCTGTCTCTTTCACCCAGCTCGTCTGTCTCTTTCACTCTCAGTAGTTTAGATTAGTAACCGTGAATTGATTTTACAGTGTATTTTAAAGGGATGTGGCAGCTGGACCCTTTTCATCTGTTTACATCCATCAGCAAAAAATACGTATTTGTTTACTTCGCTTCTAACTGTAACCCTGTCATTTACAATCTTTTTTTTTTTGAAATGTATGTCACATTATCAGTGTGAGAATAATGTTTGTTATTATGTCTCACTCAGTCAATGTCTCCTGATTGTCCATTTAAACAACTGCAGGCTTTGCCCTATATGGTTGATAAGCCCCTCTTTGGACTGATATGCATTTCTTTTTCTTTGCGTTTGTCCAGGAGAATGTGAAAACAAAGCATCCACAATTGCTGTACGAGTCAAAGCTGTACAGGATACTTCAGGGTGGAAGTAATGCACTTTCTTTTATTTACTTTTTTTTTCCTTTTGCATTCCATTTTTTTTCCCTGGGAGATAATAACCTGCATTCTGTATTTGTCCTGCAGCTGGGATTCCAAATGTCAAGTGGTTTGGTGTTGAGGGTGATTACAATGTTTTGGTTATGGACTTATTGGGCCCAAGCCTTGAGGATCTCTTTAGCTTTTGCAACAGAAAATTGTCTCTAAAAACTGTTCTAATGCTTGCTGATCAAATGGTACAGTATGAAATTAAAGCCAAGTGTTGTTGCTCTTTGTGTTATTATTACATAGTAGTCCTATCTGGTTAAATGCATTTGATTGTTTCTAATTTCTCCATATTTTTATTAGATAAATCGAGTTGAATTTGTACACTCAAAGTCTTTCTTGCATCGAGATATTAAGCCAGACAATTTTCTCATGGGCCTTGGAAAGAGGGCAAACCAGGTAAGTGATTTAGGTGCTGTTTTTGTGCTTATAGTTCTAGGTCTTAATTGTAACATTAGGTGGCTGTAGTTACATTTTCTCCCTTATCCGTTGTAGGTATACATGATTGATTTTGGACTGGCAAAGAAATACCGGGACACTTCAACACACCAGCACATTCCATACAGGTAATATTTTGTAATCCATCTATCTATGAGGTTCATATTTATTAATCTTTTATGTTTGCATCAAATTATCATTTTTTTCACTTATGCATTACTTTATTAAAATTGCCTTCGCATTGCCTACTGTCACCTCACTGGTCACTATAACTATATTGTGTTTATTCATAAAATTTGGTCATCGATGAAAGTTTTTTCTTACCAAGTGCCATTCTTCTTCTGAGTGAGACTTCTACCCGTCTCAAGAAACCATATGACAATTGTCTACTGAAGTGCAGAGAGAACAAAAATTTGACTGGGACAGCTCGATATGCTAGTGTAAACACCCATCTTGGAATCGGTAAGTCTGGTGCAACTTGAATTTTGATCCCATGCCTATGTTAAATGCACAATTGTATGCATTTCTTCAATTATTTTGTCTTGCTGGTAGATCTAGTTTGACAAATGAACTTTGGTATTTTTTTTTTCAACAGAACAAAGCAGAAGGGATGACCTTGAATCTCTTGGATATGTACTCATGTACTTCTTAAGAGGAAGGTTAGTTATGTTAGCTTTATTTGATTATCTGCTTATATGGTCTGTTGTGCTCTAAACAACACATTTGCTCTTCTTGGTACCAGTCTTCCATGGCAGGGTCTAAAAGCTGGGACCAAAAAACAGAAGTACGAGAAAATTAGCGAACGGAAGATTGCTACATCAATTGAGGTCATTCTTCCCCTCTGAAGATTTAATTATGGCTATGGACCAACATATTCTTACCAGCATTTTCTTTTTCATCTTCAGGCTCTCTGTCGCGGATACCCTTGTGAGTTTCAATCCTACTTCCATTACTGCCGTTCACTACGTTTTGAAGATTTGCCAGACTATCAATACCTGAAGAGATTGTTCAGAGACCTTTTCATTCGAGAGGGTTGGTTTCTGCACAAAATGTTTCAAGAAATGCTCTTTTTGGGATACCTCTGACAAATTGCTGCTTCTATCTGTAGGATTTCAGTTTGATTACGTTTTTGACTGGACCATTCTTAAGTACCAGCAGTCACAGATAACCAGTGTTCCACCACGTGCTATTGTCAGTGCAAGCCAAAGCACTCCTTTCCTGCAGTTGCATACCCAGATGGGTATCTGATGAATGTCCATGCTCTTTTGTTTCAGGCTGCAGCAGCAGGGCAAAGCTCTGGAATGTCTCCAATAGCAATTAATAATAGGCTATCAGGTATGCAATTTTACAAATTGTAATTGACTAGAAAAAATGCATGTGCGTTGCAACGGGTGAAGTCTATTTTAATCTTATTATTGTTATATGGTTTAGTTAAGATGAAATTCACTGTGGGAGTTCGCTTGGATATATTTTTTTTAGAAAATCATGAGCTGCAGTTAGGAGTTCTATCGTCTCATATTAGCATGCGAGTTTTTTTTAAACAGATTTCCTATATGATTCCTTTTGTATTACCAAAAGTGAACGATCTTAAAAACCGACTCAAATATGGATATGTATTTCCAAAAGCAAGCGAACTTAAAAACTGACTCATACACGGATGACGTACCAAAATACCGGCAAAAACACGGATGACGGACCGCGGAAACATCTACAATTTTTATAACCGACTTAAACACGGATTACGTCCCGCAGAAACATCTACAATTTTTATAATAGTAGAGAAGAGATATAGATTAAAACCAAAACATAAAATTAAAACCAACTCAAACACGGATGATGGACCGCGGAAACATCTTCAATTTTTATAATAGTAGAGGAGATGTGGTGATAGCTGCTTGTTTCTTTACAATTTATCATCAAATCACAACACATATATCAGGTGATTAGAGCAAAAGGTGGTGCAACATAAATTACGATTAAAAAATGGTAACAGTAAAAACAGTAAGTTATGTAAAAAATGTTCCTTTCTGTTTCCTGCCTATCAGATAATTGCATAACCTACTCTTGCTTGTAACTGAAATCATGGCACACTTGATGAGGCGAGTTTTGAAAAAGATTATTTTGTTTCTATGACCTAGCTCATATGTTTTGTGAAATCTGCATTCATTAATTCTATATGGTTTATGTCCTGAATTGATTTAGCCACTGAAGAGGGAAGAAGAAGCGGGTGGTCAGATGATCCTACACGACGTCAGGTTCCACCTACAGGAATAAATGCTGGCAGCTTATCAAAACAGAAGTCCCCGGTTAGGCCAGACATGTCCACTTCAAAAGATGCTTTGGTGAGTTTTTTTTAGTTTTGTTTAGGTTTGACTTGTTATTGTGATAAATGCTCCATCAAAGCCTGAAGATATTTTGGTTATCTTTTTGCGATGTGATATGTGATCCTCAATTGACTTGTAGTTCTCTAGTTCGACAATGTTGGGTCGGTCAAGCGGATCCTTAAGGCGACCTGTTGTTTCTAGTAGCCGAGAACTGCAAAGCAGCGAAGCTGAACCATCACGTAGCCGCACACCAGATGCAAGTCCTGGGACATTCCAAAGAAGTGCTCCTCCACGTAGGAGCTCACAGATGCTCGACTATTCTGACCCCAGGCATTCGTCATCTGGCAGGCATGCAGCTAACAAGAACTATGAGTCCACTATAAGAGGCATCCAAGGCCTAAATTTTGATGCCAACGATAGGATCCACTACTAA</dnaseqindica> |
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