Os11g0499600

From RiceWiki
Revision as of 09:11, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os11g0499600| Description = Glucose/ribitol dehydrogenase family protein| Version = NM_001074472.1 GI:115485592 GeneID:4350557| Length = 7249 bp...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os11g0499600

Description

Glucose/ribitol dehydrogenase family protein

Version

NM_001074472.1 GI:115485592 GeneID:4350557

Length

7249 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0499600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:19611607..19618855

Sequence Coding Region

19611844..19612041,19615341..19615533,19616512..19616597,19617122..19617253,19617929..19618093
,19618396..19618686

Expression

GEO Profiles:Os11g0499600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:19611607..19618855 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:19611607..19618855 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggctaaggaggcgttcgtgaacgggttcctgagcgtgttcatgcacgtggggctaacgctggtgctgctcgtctacctccccatcgccttcgcctgccgcgccctgggcaggctgctcgtcaggcccttcgtctccggcgaggacctccgcggcaaggtcgtgctcgtcaccggcgcctcctccggcatcggcgagcatctagtgtacgagtacgcgaagaagggggcgtgcgtggcgctgacggcgaggacggagatcgccctgcgcgcagtggcgaagacggcgcgcgacctcggcgcgccggacgtgctcgtcgtgccggcggacatcaccaaggtcgacgacgccaagcgcgccgtcgaggagaccgtcgcccacttcggcaaattgaatcacctggtggccaacgcagggatctggtccagttgcttcttcgaagaaattaccaacataaccgccttccacaacgtgattgatctcaacttctggggcgccgtgtacccgacctacttcgcgttgccgtacctgaaagccagccgtggcaacatcgtcgtcacctcctctgtcgccggcagggtcccgacggccaggatgagcttctacaacgcgagtaagggcgcggtgatcaggttctacgaaaccctaagggctgagctgggctcacatgtccgtgtcaccattctcaccccgggctatgtcgtctccaacctcaccatgggcaaaggcatccagaaggacggccatgtcggcattgacgaggaggctcgcgacatcaatgtggggccgctgccggtggggaagacggagacgctggcgaaggtggtggtggcggcggtgcggcggggcgactactacgtgacatggcccgggtggtactggccgttccacatggtgatgtgcacggcgccggagctcgtcgactggttctcccggaccttctacgtctccaagtccagcgaccacgatggcgacgccctcagcaagaagatcctcgaggccgtcggcggcaagaagttcctctaccccaagaccatccgcagccatgccatcgccgctagctaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAKEAFVNGFLSVFMHVGLTLVLLVYLPIAFACRALGRLLVRPF VSGEDLRGKVVLVTGASSGIGEHLVYEYAKKGACVALTARTEIALRAVAKTARDLGAP DVLVVPADITKVDDAKRAVEETVAHFGKLNHLVANAGIWSSCFFEEITNITAFHNVID LNFWGAVYPTYFALPYLKASRGNIVVTSSVAGRVPTARMSFYNASKGAVIRFYETLRA ELGSHVRVTILTPGYVVSNLTMGKGIQKDGHVGIDEEARDINVGPLPVGKTETLAKVV VAAVRRGDYYVTWPGWYWPFHMVMCTAPELVDWFSRTFYVSKSSDHDGDALSKKILEA VGGKKFLYPKTIRSHAIAAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>238..435#3735..3927#4906..4991#5516..5647#6323..6487#6790..7080#attctcctcactatttggtgcagcgacccccacccacccatcaattccttcttccttcgtctcctcctcttctccctgcacactcgttgctagctagctcacccataaataccacgccattggccacctccaatctccaagctagttctcactcacacatccctctcctccctccgccgccgccgccgccggagctaaggaagacgacgacgcataggtagataatcgtcggcggccatggctaaggaggcgttcgtgaacgggttcctgagcgtgttcatgcacgtggggctaacgctggtgctgctcgtctacctccccatcgccttcgcctgccgcgccctgggcaggctgctcgtcaggcccttcgtctccggcgaggacctccgcggcaaggtcgtgctcgtcaccggcgcctcctccggcatcggcgaggtacgtacgtagccagcacagctgagcattgcaactcattgtgtcctgcgccatctgacttactttcctctaacgtgtgtgtgggtcactgacatatgagctctttagatagcgagctcgaactcacatgtcagtgatttataaagtcatggggtgtgtttagttcacgccaaaattgaaagtttgattgaaattagaatgatgtgacggaaaagttagaagattatgtgtgtaaaaagttttgatgtgatggaaaagttagaagtttgaagaaaaattttggaactaaacaagggctatatggtgggttaagttagaggatgttagtgatttggattcttttttttctagctgtgtttgctgcatatatacaactttttttttattatattagttcttgatttaattagatactactacatggtttataatgttcagagtttattttgttcgtgctgggttttcttgaattttttttctaaaaaaatgatattgaatggtggtttgaaataatggaaatgaatgcattctaacatatgtactcctgatcacgaatagaaataggacagaattaaaagacacaaggatatacatggctctcgtgatttttaatgggttcagtgcagtggcttttattcattggtacgatttggtgctattaaagacacaaccatgcatatgagcaaagctgaaaagcagaacctgtggatttgcatggttgcaggagtatatatcttaattttgcatctgtgtcgactgtgacatggagtacgcaccaaggctagctagcacaaagttgacgtggtagtaaaaaaatcaactaaaatttcacgttggaacttaatttggtctttgttgttgcaacgacttctgccaatatggttgcaattagatttgacaagtttgatttaattagttctgataaatgtttggtgacgatgataatttaatttatttctatgctactaaataatatttgagatgataggtagaagtttatggacctcaatatataagtataagtagcatagataatttgtgtgttccagaaaaaaaagtaaaaagaaaatgaagtcggtacagtgggtaagagccaactcatgacaatttctctttcctatagttttatataattaatatctatctttcagttgtactgttcatataaatatatacagcttttatttcctatggtttctctgtaattaatatatatagctttccaaaaagaaaaataacatatccggacttcaactgtagctgatgatcatatcaatgccaactccagggtccttgactatttctctctaaaaaatattatttattggaccattttatatattaaagaaatataaaaccattttatgaccgcaccaccattggaccgaaacaagcatttatatgcataaaagcgaaatatctacagcagcaagcatgggcgcgatacttcgtctagaactagagcgtgtgtgcatttaatctggttggtataattaattgaaattagtcgaccgtatatatacatgaatctaacagtacaccgcgcgccaaaaaggcattcatcgtcgaaatatcaaatgatgcatgtggtgacaaaatcaaatcatcaactaggaggaaccgttagtcccccagatacatttctgtggtagctagattagtgagttgttgatataatttaattaacaagttaatttggtcaaagttacctttaagggatgggtcccacaaatgatttcttttgttcggtaatagcatttattttgcaattcatacttaacatagttttcagtttaagtaaacccatgaaatatcatatcattcttttttaattctgaaccatattatctgtagtgctaagcgctaacatggaagtgttggagcactgtagttaagacatgtttatctaagagcaaaactaataatacagccgacttgttagctataaggttctttgcagccttcgtcagctatttacaattaatacaggtccacttatctctctcacataattttttttggttcatgtgtttccctcttctctcctcagtctaagtatttagccaacttactgtgtcctattacacctgctcttaagcagagtatttaagctatagtcagattactctgattcctagtaggcacagaagcaataaatacaatccgggaatcccattaatttggagcatggcctctctcatcgacctctcctggaaacttgcttggccataattctagatatctgtaggagtagcagataggcagccatggctgcccccagtccccagatgcatgtgatgatacagtcacgggagttaaagatcattcatggcctgagagagatgagaggtcgtctatactactagtgatgaaatcatcagtgaacccccatcaatgatggcctatctactcgtcctattttcccttgaattctcccattaattctttgacgtgaacgtaagatacactgtgaagacgaagggcacgtacatgtacagccttgtcaggacaagccaagaaagtgagcactgtgtcctctctatcgtgtgcagaagtacacagcgaaataagatttagcacttgtttagttccaaactttttctttaaacttctaattttttcattacatcaaaacttttttacacatatagacttctaacttttccatcacatcgttctaatttcaaccaaactaacttttaattttggtgtgaactaaacacacccttatcgtctcatgattttcgatcgtgtttgtgtgtccttgcttggagaagtccagaaacgtcgtgaatcacacacgtttattaatttttgggagttaagagagaaaaaggatcgaattaataaggacgactgaccccaagaaatgatacatatgcacgtaacttgtacatgcgctaattatgcaacgctgacaacggttaaatcattaacaaaaatccatctggaaaatcataagttgacaactcgtttcagtcgaattaacaacaatcagtcagttcaaactaattaaattgcttcaaattaaaattttcctcttttcatgtaaaaattatactcttgttacacagagcaagctagtctacctttggtttcatttgtttgacagaaccagtttaattaatttcctcacaaatagtagtacggagtaactatgagtttttgtttattaagtttaattaatttcttcacaaatagtagtgcactgtgtttttgtttattaagttttttgtgtttgtcctggatgaaaattaataaaataaaataaacatggtatatatgttttttttttgcagcatctagtgtacgagtacgcgaagaagggggcgtgcgtggcgctgacggcgaggacggagatcgccctgcgcgcagtggcgaagacggcgcgcgacctcggcgcgccggacgtgctcgtcgtgccggcggacatcaccaaggtcgacgacgccaagcgcgccgtcgaggagaccgtcgcccacttcggcaaatgtcagttaactcgatcagtacaactcctactcctataccgcttaattaataagaagtattttacgttccttaagatgagatactaattaaattttacacttaattcttaatatacttattatctatagatagcaaattttatactaggggcccgttcactttgatgccattttcaaccataccatttttttaaagttataaaaaaatatctacgtttagttgttgccaaacttgataaatacgtaaaaaatcctgccaaaattttgacaaaaatagatcctgggaaataggatacttctatgtatattctctcaagaataataaaattactccaatctggaggattaatatgtccaaccatcaacttgaccgaacaagttattaattgctctgtttcaaaatttgaggtattcaattttactgctgatagtatagcgacgttgattttgtttcgagtgatatgatggttcagaccgagggcttggggcgacgttgtcctgccaacgacagcttgatctgcttatggacagaaattgattatgcgtatatggctgtgtcgttctcccaagtcccaagtggctaattaattaagacctaatcttttaggatcctgaatgtctagtagctgagaggatggaatggttcaagtcatggacttatcacttatggaagaagatattaaggctaatactgtaacagtaatgagttggaaaagaattttggttatagtctacacatgcttacgcactgtgctcttcatcatatggtgtcgttatactcatagctaaagtcaatggaatggaaattcgtagcaagttttaatatgaatgctgcctgaacacgttgctaattgggatcgatttcttgatgaaatctcggaagtagctgaactgcatgcagtgatctacagcgatagatgatttaagttagttattgtcatgtgtactaattaattatggggtaaattcaattctgcagtgaatcacctggtggccaacgcagggatctggtccagttgcttcttcgaagaaattaccaacataaccgccttccacaacgtgattgtgagttgattaattatcacacgctagctccttttgacattttcaacatttttgccacccccagcagttctcattatcaccattaaaatcttagtttaaacattagcacatctgaaatttttgagtgagtcgtttcctcttgttcacacacaaaaaaaaaacatactatatgaaaatcattttcctcacagctgaccatggtcccttatattatatcatttatttggtccaacgacgtacccaccagtaataaaatcagtggtctcccagagcttggatttcaaaaggagaccagattttatagcagtgtttagttcagcgtaaagtttggattttggttaaaattagagatgatgtgactgaaaagttgtgtgtgtatgaaaggttgatgtgatggaaaaggactgaagtttggatccaaactttggatctaaacacagcctagttgtggttaaccatcgatcagttgttaattaattcttctcttatttatagctccttaatgcacacacgattttttgcaggatctcaacttctggggcgccgtgtacccgacctacttcgcgttgccgtacctgaaagccagccgtggcaacatcgtcgtcacctcctctgtcgccggcagggtcccgacggccaggatgagcttctacaacgtaagcagcttaattagcagagactaattaaattaattacttattactagtgatactaattgcatgattaagtaattgatccatgcctctgtggcaattaaagtagtagtactactcctactcaggttgtagcaataagtttcgatcagctcacctaaccaattcaattaggtgcaccaataccccaactatagcccggggtgatggattatgcgtatggttggatatctgccaaagctaaactcacacattagtgagagaggtccatctcacaaagtatatgatagcttagcttagctagcaagccaggatctagctgatagctagcaataaccccctgttatggttcactgattatcctacatgtgtcacgcccaatagtggcggcaagtagcaggggctcattgactactcattccatgttggttcactatatgtatagttcacatgtatagtactatgcatggattgcaacattccctgtagttctagcatcacactcatctcattaattaatcagtttttgtccctacatttgatcaccaattggacacagatcaagaaaaaattttgggttggcgcgtggtccatagtactaatatcgtatgtgcttaaaaaaatattcttaaaaaaaaattgtacgcttgatgcttataactattattattattacaggcgagtaagggcgcggtgatcaggttctacgaaaccctaagggctgagctgggctcacatgtccgtgtcaccattctcaccccgggctatgtcgtctccaacctcaccatgggcaaaggcatccagaaggacggccatgtcggcattgacgaggaggctcgcgacgtaagatctcgatcgattatatatatacttgatttttagttgtacgtatgatgaagaacctttacgatgatctctactaagtagtattaaataatcattattatcatcagtataaattaaaattttggaacgaatttttcaaaatttcggtaatttccaaccccctgcaagcaaattttttggattttctaaaaatttctgaatttgataataatttatttaaattcaataaaaatatgttgatttttttgaaaaaaccttaataattagaaatatccgaaattttaatgtggggggtgcagatcaatgtggggccgctgccggtggggaagacggagacgctggcgaaggtggtggtggcggcggtgcggcggggcgactactacgtgacatggcccgggtggtactggccgttccacatggtgatgtgcacggcgccggagctcgtcgactggttctcccggaccttctacgtctccaagtccagcgaccacgatggcgacgccctcagcaagaagatcctcgaggccgtcggcggcaagaagttcctctaccccaagaccatccgcagccatgccatcgccgctagctaatataatgctcatatatcacactgattgatcgatccatccaagctatagttgcaacctacctatatatatataaactttttttatacatgatgatatcatgatcttttgataatgatgattggtttgttttagcataagaaatacttcagttaaagaggattgggagatg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0499600, RefSeq:Os11g0499600