BGIOSGA003978
| Gene Name |
BGIOSGA003978 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003978, complete gene. |
| LocusTag |
COXVB |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003978-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003978-PA |
| Length |
3841 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:27250508..27254348 |
| Sequence Coding Region |
27250508..27250558,27250684..27250734,27253896..27253962,27254057..27254136,27254283..27254348 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:27250508..27254348 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:27250508..27254348 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCCATCGCCACGGGGCTGGAGCGCGAGGAGCTCGCGGCGGAGCTCAAGGGGGAGAAGCGGTTCGACATGGATCCTCCCGTAGGCCCATTTGGTACCAAGGAGGCCCCAGCTGTCATTGAATCCTACTATAACAAGAGGATAGTTGGTTGTCCTGGTGGTGAAGGAGAGGATGAGCATGATGTTGTATGGTTCTGGTTGAAAAAAGATGAACCGCATGAGTGCCCAGTCTGTTCACAATATTTTGTGCTTAAGGTCATTGGTGATGGTGGTGATCCAGATGGACATGATGATGACGACGAGCATCACCACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPIATGLEREELAAELKGEKRFDMDPPVGPFGTKEAPAVIESYYNKRIVGCPGGEGEDEHDVVWFWLKKDEPHECPVCSQYFVLKVIGDGGDPDGHDDDDEHHH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..51#177..227#3389..3455#3550..3629#3776..3841#ATGCCCATCGCCACGGGGCTGGAGCGCGAGGAGCTCGCGGCGGAGCTCAAGGTGGAGATGCCTATGCCTTCTTTTTTTTTCGTTTTTTTTTTGCTTCTTCGGGTTGGAGTATTGCTCCTTTTTGTCTGTTCTGGAAATGGGTTTCGTGATTTGCCGATCTGTCTGTGGTTTCGCAGGGGGAGAAGCGGTTCGACATGGATCCTCCCGTAGGCCCATTTGGTACCAAGGTGAGGCGTTCGCTGGTCGTAGTTGTAGGATATTTTCTATTGATTCTGTTGATCTGAAATTCTGAATCTGCGATCGTCACCATACGTGGTGGTTCTATTCCTTAGCTTTAGGTTTATTAGAGCTGAATTTAATGAAACTATGAATTGCGAATGCTTTGCTAGATTACCTTCGACTTGATTCGCGTTGTGCTGGGAGGGAGAAACTGCATTTTTTGCCAGTAGTCATGCTATATTGCCTGGTTCTATACACTAATGCGTTTCGGGAATTGTTTTTGTGTGCTATTCTTCAATGCACCATTGTTGTAAAACTTGTTCACTCTATGACGGGCAATGTGTTTGATCTCCATGTTCATTGCCTTTGCCTGTCTACTAAAGCATTAATAGTTGTTCCACATTATTGAGCAAATGATTGTTACTAGTTAATATATTGGTGCAAACTATTCTTCCCCCGTTGGCAGTTTGCGATGTTATGACTAATGCTACTTATGATAAGTTCTTGTCATATATTGTAGGGATGCTTTCTTTAAACTTCTATGAGTAGTTGGTGCAGGATACACAATAATGTTTACACAGTGTGTGCTATCTTATTTGATCAGAAACGCAGCGCTCCTTTCATATAAACTAATATGGCTGACCCAATCCTATTGATTAATATGCATATTGGTGGGGTGCCTTTTCTTCATTGAAACTGTTTTTTGGATATGCCATTAAGTTACATTCTTTTGACTAGCTGGAACACCTAAATAAACATTAGTTGCTGAGAAATATCAAGTTTAATATGCATTTTTTTTGTGTTGAAACAATTGTCGAAGTCGAAATTAGAGACTGAATGGTGAACATTATCTTGGGAATGTTGCATTAATCTGTTTTTCTATAGCTATCTAGCAAACCGGTACCTGTAACTGGGAACTGTTTATAAGTATTGTTTGGCGGTGAGAGTATGTTAACTTCATTTTGTTGTTGCATTTGTGATATAGTAGTGGACTACAAACTTACTGTGGTTAAATGCTTGAGCTATGCAATGCAAGGACTTTTAGTCCTGATACTTAGATTTTTTGTTAAGTTGGCAATCTATGTCTCAGATTGAATAGGAACTATGAAAACCTGTTTTTGAAGCAGGGGTATTTGGTGACCTGTTGTAGAATGTCTTTGTACATCACCTAACTGCAAATCACCTGATTGATTATTCTGTTCTAAGAGTGGTGCGATCGTTTTTTTTAAAAAAATTGGACTATCCCAAAAACATTAGTGTTCGTGCCAAATTTAGTAGGTTATTACGGTAACCGCTAGGTGGTGAACTGTGCCCTTGTGTTCCTGCAAAGGTGTTTCGCTTACCTCTTGATGTCAGCAGGGATATTTGGTGACCTGTTGTAGAATGTCTTTGTACATCACCTAACTGCAAATCACCTGATTGACTATTCTGTTCTAAGAGTGGTGAGATCTTTTTTTTAAATTTTTTTTTGACTATCCCAAGAACATTAGTGTTCGTGCCAAATTTATTAGGGTAACCACTAGGTGGTGAACTGTGCCCTTCTGTTCCTGCAAAGGTGTTTCGCTTACCTCTTGATGTATACCAGAAAAAAATAACGACACACTAATGTGTGAAGTGGCTCAACAAGAACCAGCATACATCCGCTGCTGTGCCCTCACCACACCCACCTGTTCTTTGGATGATTTTCCTCTTCCTGTAGCCAAGTCTTTTAACATTAGTACTATGTATGTTTTTTTTCTTGAATTCTGATTTCTGAATGCCTATTATTATCACAGCATGTTTTTTTTCTCTAATTCTGATTTCTCAATGCCTAGTATTATCACAGCAGACCACACAAGCTTGGTCAATTTATAGACAGTGATGTGATCATTAAATATCAAGTTGCGTTTTTAATCCGAAATCTGTATTTCATCTGTAAAGAGGTCATCAAATATTTGTAAATGAGCATATTTATACACCTTCATGTATTTGTACAATAAACAAATGTCTGTGTTTGAGGGACTCGTCCAGTTTCCCCTAGTTTGCTCCCTTCTGTGTTACACTCCCTTATATCCTTGTGACACATCGTACTGTTACTTATTTGAATTTACCTGTCATTCATTTTCCCCATTGCTGTTTGCTTTTCCTGTTGGAAACAGGTTTCTATGTTACTTGTCCACAATTCTTATTTTGAACTGAACCCATTTTACCCCCTGTTGGCTTTCCGCGGAGTCAAAATCTAACTACTCAACTCTTAGAACTTTGTTTTATGCCCTTCAGCTAGCAATACCAGTCCACCGCTTCAATCAATCCAGCCCAGTTTATATCCTATCAGTTACTCAATCTCTTCTGTGTACAAAGTAGTAGCCACCTGCATCATGCCCAATCCTGATCACCTGCCACGCTCCACATCCCAAATGTAGGAGTCAGGAGGCAAGCCATGATGACAGAGACTCTGGTTTAGCAGCGTGCAATGGAAGTGCAACTGAAAATTATTATTTTTTTCAATTCTAAGACGTAGAATATGGTAGTGAGAAAATTATTGCCGATGAGAACCTGGATTTCTTTTTGTTGAGATACAGATGCAGAGGAGACAGGAGAGTAATGAAGAACATTAGAGGCGGGACCTTGATTTATTCTTATTGACGGTTTCTTTCTTGCCTGTACATCAAGCCTTAAGTCCTTTCCTTAATTTCCTTGACGCTGTGTGTGAACATGGTCCTTTGACCTCTGCAAACACAGCCACAATGGGCAGCAGGGTGCTGCAAGAGGTGGCGATAGATTGCACAATCCCAAGTATTCCCTGCTGATTTTAGCCTGTCCTGGCTCACCATGACCTTTCCTGTACTTCAACTTCTGCTACGATTAAGTCTTTTGAATCTGTTGCAGCATGTTACACCTTTTTGTTTGTGTGTGTGTGGGTTGGGGGGTAGCCTATCCATGTTGATGTCTTGTTGATTAAACATGGGTGGTTTAGAGTGAGGGCCTGAGGGGGATGATTTGCACTGATTGTGATTTGCGATTGCTTTAAAATGATGAAATTTCAACTTTGGAGCTATTCTTTTAAATTGGCTGTAAGGATGATGCTGGATCTGAACCATGGCACATTAGTCTCTTCATTTATTATCTTGCAGCATCATTTGAGCACCATGTCATGTTATTCATCAATTTGCTATGGTGTTACCTGCAGGAGGCCCCAGCTGTCATTGAATCCTACTATAACAAGAGGATAGTTGGTTGTCCTGGTGGTGAAGGAGGTCAGTCAGTGTTGACTTGGCTCAGCGAAAACTCTAAACTGCCAAATATTATGCAATACTGTTATCAACATTTTTTCACATCTTTCATTTACAGAGGATGAGCATGATGTTGTATGGTTCTGGTTGAAAAAAGATGAACCGCATGAGTGCCCAGTCTGTTCACAATATTTTGTGGTAATTGGAATTCGTTGTTTGACATATTACTTTAATTTATGTATTTAGTAACTGTTTTTATTGAATGTAGCTCACAGTTCCAAGCTGTTTTGATTCTGTAATGTTCTATTGTTCTTTAATGGATCTTTGTTGCTCGCCTTTTGCAGCTTAAGGTCATTGGTGATGGTGGTGATCCAGATGGACATGATGATGACGACGAGCATCACCACTAA</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
