BGIOSGA004300
| Gene Name |
BGIOSGA004300 |
|---|---|
| Description |
Single myb histone 4 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004300, complete gene. |
| LocusTag |
MYB28 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004300-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004300-PA |
| Length |
5359 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:32640168..32645526 |
| Sequence Coding Region |
32640168..32640317,32642913..32643112,32643598..32643682,32644230..32644313,32645045..32645339 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:32640168..32645526 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGCGCCCCGAAGCAGAAGTGGACCTCGGAGGAGGAGGAGGCGCTGCGGCGCGGCGTGCTCAAGCATGGCCCCGGCAAGTGGCGCACCATCCAGAAGGATCCGGAGTTCAGCCCCGTCCTCTCCTCCCGCTCGAACATCGACCTCAAGGACAAATGGAGGAATTTGAGTTTTAGTGCAAGTGGACTGGGTTCAAGGGATAAATTAAAGGTTCCAAGGATAAAAGGGCCTTCATCTTCCACATCTCCAAGCTCTCAGACTCCGCTTCTCGTCCTACCCCCAAATAAAGTTGCTGAGGCTTCACCATCCGCAGATCCTGAGAAAAGCTCTCAGGATGTGAAGATTCCAAAGTACAGTTCCATGGTAATAGAAGCTCTTTGTGAAATTGGGGATCCAAATGGTTCGGATGTTGATGCAATTTGCCACTACATAGAGCAAAGGCACGAGGTGCAAGCGAATTTTAGAAGATTGCTTACTGCAAAATTAAGGAGGCTTATAGCAGCGAAAAAGATTGAAAAGATTGACAGGTCCTATAGGATCACAGAATCTTATGCAGCCAAAGTTTCGCAAGCAAATAAGTCTCCAAGTCCAAAGAAGGATCCAGCCAAGCCACTGAAGGCATCGCAGAATTTAGGTTCATTTGCTGGTACGAGTCCTGCCCTAGAAGCAGCTGCGGCTGCAGCTATGAAAGTGGCTGATGCGGAGGCCAAATCACACCTTGCGAATGAGCACATGACGGAGGCTGAAAGGATCTTCAAGCTTGCTGAGGAGACCGAGTCTCTCGTTACACTCGCAACAGAGATCTATGAACGATGTTCAAGAGGAGAGATATTAACAATAATGCAAGTGGCGCAAAGCAATTTTGAATTCCAATCTGTTAGCGGCAACGGCAGCGGCACTGGTTCTACTGTACTTGCATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGAPKQKWTSEEEEALRRGVLKHGPGKWRTIQKDPEFSPVLSSRSNIDLKDKWRNLSFSASGLGSRDKLKVPRIKGPSSSTSPSSQTPLLVLPPNKVAEASPSADPEKSSQDVKIPKYSSMVIEALCEIGDPNGSDVDAICHYIEQRHEVQANFRRLLTAKLRRLIAAKKIEKIDRSYRITESYAAKVSQANKSPSPKKDPAKPLKASQNLGSFAGTSPALEAAAAAAMKVADAEAKSHLANEHMTEAERIFKLAEETESLVTLATEIYERCSRGEILTIMQVAQSNFEFQSVSGNGSGTGSTVLA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..150#2746..2945#3431..3515#4063..4146#4878..5172#5253..5359#ATGGGCGCCCCGAAGCAGAAGTGGACCTCGGAGGAGGAGGAGGCGCTGCGGCGCGGCGTGCTCAAGCATGGCCCCGGCAAGTGGCGCACCATCCAGAAGGATCCGGAGTTCAGCCCCGTCCTCTCCTCCCGCTCGAACATCGACCTCAAGGTACAGCCTCTGACCTTGCCCCTGCGCCACCGCCGGCTCCCATGCGCCGGTGGCTCGTGCGGTCCGCTGCGTGCTCGTTGCATCGCTAGATTTTGATTAGCCGAGTTTCCCCGTGGCTCTGTTCGTGATGCGCTGTGCCGTCTGCGTCTGATTTCGTGCATGATGCTACTGTTAGCCGTGTGCGTAGGATCCTTAGAACTCTACAGCCGGGGACATTTTTGGTAGATTTGGGGTTGGGCAGGTGAGATTTTGGGCTTCTAGGTTTCTAAAAACGCAAGCCTGAGCGGACTCGGTGGAATTTGATTATTGCGAAGTTGTGATGTGAAAACCAGGGATGTCCTGGTAGATTTTTTTTTTCGAGGCCGGGGGGGGGGGTGTCCAGCAGGTGAGATTTTGGGCTTCTCTGTAACTAAAAATGTATAAGCGTGACTGACTTGGTGGAATTAATTTTGATGGATTGCCTTTTTCTCTGTGTGGGTGTGGGTTTTTTTGCGCTGCATGGCTGCCACTGCCGCGTCCTTGAGAAGACAGACAACCGGTGGCTCTGCGTGTGTCGGGGTTGGGGTGTTATGCTGCGCGGCTGCCACTGCCGCGTCCTTGAAAACATAAACGGTGGTTGCTTCGTGATCTGGAGCATACAGTAAAATACTGTTTTCATTCACAAACAAATGATGTTAGAATATTTGAATTTTGTCTTGTGTCTGTTCATGGGATAACATAATATCTGCAAAAGTTCAATTGGTGGAATGGATTCATTCGTTATGTGGTTTTGCCCATAGATGCTGCTACAAGTTCAGAAGAGAAGAATTATGGTGCTGTTGTCTGTGGGTATGGTCATAGTGGATTGAAACTAGCAGGACAGACAGGAGCTGTTTTCTAGTTGAACAAATGCTGGAGTACCTCTTCCTTGATAACAGAGCAGTTATTGCTATTCAGAAAGGATTTAGCATTGATCAGTTGAGAATGTGGATGGATAGTCAGGTCATGAACCGCATTGTTCATACTGTTCATAAATCAAAACCTTAAATAGAATGCTTTTCATGAGTTTGGAGAGCAATGGAGACTGAGAAGTGATTGTGGCCCACAGAACGCTTTTGGTATTTCAAGAAACATTGCTTGCCATGTGGAATCTGATTATTTACTGTAAACTGTAATATTCAACCACAAAATTATTTCATAAATATTTTTTTTAAAAAAAGTCGATAATTAGGCAAATGCTTAGTTATTTTTGACAATGTAGTTCTATTTTGGATGCAAAGTTGACCAAAACAAAGTTGGCTTAGCTTTTCCTCCATTTAATTACAAACCTTTGGATGCTGACTTGGATTACATGGCCTTTGAAAACTGGAACCTGTCCAGATTACTGAACTCTATTCAGTACCATAAGAAATGACATGAGAAACTACATTGTAAAGGTAGAAAAAAAGTTACAAATATTTTACTGTCAAATATAATAATAATAATAATAATAATCCTTCGTGTTTTAAAATATTTTATCTAAAACATCATGAATGTTGTATCGGAGGGTAATATAGTTTTATTGTTTCAAGGATGAATATCCTCCTACAGAATAGAAATAGAATAATCATTCTAAGTTGTACCCATCCTTATATATAAAGTTATAATCACTATCTAGGTAGTTTTACTACCAAAATTACAGTAACACACAGGGGAAAAATTTGTAGTTCTCAATAATTTTGAACACTGCACCGAATGACCCTACCAGTTCTAGATATTGACAAACTTCAGATTGAGTATGTGTTTCAGTCATTTGTGAAGGCTTGATAATCTTAGATAACTTTGCCCAATGGTTATTTTACTTATTTCTAATTTGATTGCTGGGTCATTTTTTTCGTCCTCCGGGTCCAATATGTGAATAAACTACTAAATAAATTTATGCATATAGGAACAAGTTGCACACATATATGTATCACAAAAAAAAGTAATTATCTTCTGACCTAAACAGTTGCATAAATGCATACATATAATCTCATCCAGGCGCAATGTCATAAAAAATGATCTTATGAATGAGGGGTGATATAGAGCACTAGTACTTTTTAAGTAGTAGAGATATGCTGCTGGTTGCTTATAATGTCCCTAGACTGAGCATATGTGAAAAAATCCGCATTGTTCATCCAGTGAGTACTATTACTTGTTAGCTGTTGCTGCAAATTCTTATGCAACACATAATGTTTACTCTTCTGAAGCAACATTTGTGTTGTACAATTGTACTCTCCTATTTCATCCTCTCGTAAGTGCTAAAATATGGAATTGGAGCAATGGTATGCCAGCATGTCTTTTCCTGTGATCTCTTTAGTTAATGAAGAGGGCTGTGAAAAATAGAATCACATAATGTTCTAAGTTGATACAGATTTTTTTGTTAAAACATCTTGTCCTACATTACAATCATCTTCCATGCCTACAATCCAAGTCAGCAATATTTGTTAAAACTTAGACGATGTGTTGTATCAGTATTGAAATTTGAGGAATACAAGGAAAGTCTGTCAGTTCAATTGTACTGTGCATCCTGCACCCTGTTCAAGTGCTTTTATTATCTTCCCTTCTTTCTGTTTCAATTTTATTTGGTTCTTTCAGGACAAATGGAGGAATTTGAGTTTTAGTGCAAGTGGACTGGGTTCAAGGGATAAATTAAAGGTTCCAAGGATAAAAGGGCCTTCATCTTCCACATCTCCAAGCTCTCAGACTCCGCTTCTCGTCCTACCCCCAAATAAAGTTGCTGAGGCTTCACCATCCGCAGATCCTGAGAAAAGCTCTCAGGATGTGAAGATTCCAAAGTTAGCCTTTCATTATCTTCAGTTCAATCAATTAAGCTGACAGGAACTACATAGTATAAGTCATTGTATGCCTTCAAATTTTGGTCACAAGCATGCACTAATTTATTTTTGTTCATGAATACATACAAAATTTATTTTTATTTATTATGCCCATTTTAGTATTAGTGCATGATATGCTCAATACACCTGAAAGTCTTGTTCTATTTATCTGAGCTAAATTACGATATTTGTATGATTTTCATTCGATGAAATAGTATGTTAGTTTAAACGATAGTTACTTTTTACGAGCAGTGAAATAAAAATGAAAGAGCGAACAGAGTAATCAAGAATAATATAAAATCATAAAGATTGAAAACAATCCTTGGAGCAATGGGCAGAGTTGGCGATACTTTTTTTTATAGTTTGCAATCAATATTATGACAATTTCATTTTGTCCTCGACAAGCATTTGATTCAGAAATTGATCATGTACAAATTCCCTGCTAGGTACAGTTCCATGGTAATAGAAGCTCTTTGTGAAATTGGGGATCCAAATGGTTCGGATGTTGATGCAATTTGCCACTACATAGAGGTTGTGCATCTGCACAAATTTTCTTATTTGGTATCACTATTTGCCAGTAGTTATTTTTATTTCTTCTGAATTCATTCAAGTTTTGTTTGTTCTTGATTTCGTAATAAATTATGATTCAGATATGTGTACAACTAACATGATCAGAATATTAACAAAATGCGATTGCTTGATTCTTTTTCTCTTCTGAATCATTGCCTGATTGACTGTATGGTATAAAGTCCCTTAGTTATTGGTATATATGTGTGCCATTGTGTTTATTTCAGCTTCCTATACTTTAGGAAGCTTCTAAAAGTGCCTTTGCTACTACCGGAGCTTTCACTTTGGATTTTATAACAATTTCCTGCACAACTACCATGTAGTGTGGGACTAAAAAATATTTGTTTGGATTCAGTATGATGGATCCCAATCCCAAATCAGACAACCCTTCTGAGACCATTTTTTCTTACTCAGTGTTGCATCCTGTTTTATCCTTAGAAGTGATTGGTAGGAATTGTTATATTGCTAAATGATGATACATTGCTATGCTGTCTTTGTAAAATATGTGCAGCAAAGGCACGAGGTGCAAGCGAATTTTAGAAGATTGCTTACTGCAAAATTAAGGAGGCTTATAGCAGCGAAAAAGATTGAAAAGGTGAGATTTACTAATATTCCTTCTTGTAGACAACACTATTCTTTTGCTTGAGTGTGGCTTACATATTCCCCTTTAGGTTTTGTTTGGATGGTTAAGAGTGGCGGGTTTCCTAGTTTCTACCATCTCCACATGAATAAGGATGGAACCCACTCATTCTGAGGCTTATTTTCCCATTTCCCGCTATCTTCCTCGCATAATCAATAGCTGGGTACACATTTAGGGCCTCTGCATGACGAGTTGATGACTATGGATAACATTGGTTGGAGGATAGGGAAGCCTCACTGAGCTATCTTCTCAGCATTTGTTTTGATTTGAGGGAAATTTGCGATTTAAAGATTTTGCAATTATAACTCTGCATCAAGCCCATAATTCAGATTCTTCATTTTACTTCTCTTTTGTAAAATTGGCATTCAATAACTCAATTTACAATTATTCATTGTGGAACTGTGCATATTATTCAAGTTCTAATTGTTTATTTGATATATTGACTTTCCCTTCGAAATGGATTTGTCTAGAATGCATAAATTGGTGTTTGAATCCAGATTATCATTCTTTCTTTTTTAGTATATGGAGCACACATGCAATATATCCTGTAGTCCTGTGGCTAATCTTCAGAATCTTCTTTGTGTGTTCATAAGATAGATAGCAAAGATCTCCAGGTGCAAGTGGTAGCTATCTAACTACTTATGTTGACATTTATCTAACTACATTATACTTTTGACATGAAACAGATTGACAGGTCCTATAGGATCACAGAATCTTATGCAGCCAAAGTTTC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| External Link(s) |
