BGIOSGA004502
| Gene Name |
BGIOSGA004502 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004502, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03840 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004502-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004502-PA |
| Length |
4188 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:35401113..35405300 |
| Sequence Coding Region |
35401113..35401465,35401555..35401669,35401751..35401870,35403129..35403239,35403535..35403573 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:35401113..35405300 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:35401113..35405300 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACGGGGAGGAGGTTGCTGCAGTTCCAGTCGCTCCTCGCGCAGCAAGCCCTACGCCTCCGCGCCGCCCCGAGACCTAAACCCCAACCTAACCCCCCCCACCGATTCCTCCACGCCCCATCCAGTCCCGCGGCCGCCTCGCCCTCCCGCCTCCCCCTATGGCGCAGCACTGGCTCGCTCCTGCCGGTGAGCGCCGCGGCGGCCGCGGCGGCGGCAGCCGCCCGGGCCGCCGCGGCGCGGTGGCTGATGGCCGCGCGCGAGGCGGGCTCGCTCGAGCTCTTCTCGCTGCAGCGGCGCAGGTCCTCGGGGTGGTTCCCCTCCTCGTCCATGTTCCTTAGCGGCGTGTCCTGGGCGAAGTGGTTGCCGTCCGCCGATGGGGCAGTGTTGATGCTCGTGGGCGCCAATGTGGGCGTGTTCATGCTATGGCACCTGGCTGATCCTAGCTTCATGAGGAGGCATTTTATGATTTCTCTTGATAACTTCAAAAGCGGGAGGTTACACACGTTGCTCACGAATGCCTTCAGCCACGCAGAGAGTGGTCACCTCATCAGCAATATGATCGGTCTCTACTTCTTCGGATCAAGTATTTCCAACATGTTTGGTCCTGCTTTTCTACTGAAGTTGTACGTAGCAGGAGCACTTGCTGGATCTGCATTCTTCTTGCTAGAGAAAGCCTTCCTAGCTCCACGAAGACAGTTTTATGGCGGATGGGACAATTCAAGAACTCCTGCGCTTGGTGCAAGTGCTGCTGCTAATGCAATTATCCTTCTTGACATCTTTTTGTATCCAAAGAAACTAGTCTATCTTTACTTCTTCATTCCTATTCCAGCTGCAATTATGGGGGCTATTTTGATCGGTGCTGATTTGCTGAGGGTGAAGGAAGGGTTGGATCTGATCATGTACTCCATCTGGTGGGCTGATAGTTGCAACATGTCATTTGACGAGTTACTCATGGACCATGCGACTCGTCCAAGTCTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATGRRLLQFQSLLAQQALRLRAAPRPKPQPNPPHRFLHAPSSPAAASPSRLPLWRSTGSLLPVSAAAAAAAAAARAAAARWLMAAREAGSLELFSLQRRRSSGWFPSSSMFLSGVSWAKWLPSADGAVLMLVGANVGVFMLWHLADPSFMRRHFMISLDNFKSGRLHTLLTNAFSHAESGHLISNMIGLYFFGSSISNMFGPAFLLKLYVAGALAGSAFFLLEKAFLAPRRQFYGGWDNSRTPALGASAAANAIILLDIFLYPKKLVYLYFFIPIPAAIMGAILIGADLLRVKEGLDLIMYSIWWADSCNMSFDELLMDHATRPSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..353#443..557#639..758#2017..2127#2423..2461#3304..3408#3488..3526#4087..4188#ATGGCGACGGGGAGGAGGTTGCTGCAGTTCCAGTCGCTCCTCGCGCAGCAAGCCCTACGCCTCCGCGCCGCCCCGAGACCTAAACCCCAACCTAACCCCCCCCACCGATTCCTCCACGCCCCATCCAGTCCCGCGGCCGCCTCGCCCTCCCGCCTCCCCCTATGGCGCAGCACTGGCTCGCTCCTGCCGGTGAGCGCCGCGGCGGCCGCGGCGGCGGCAGCCGCCCGGGCCGCCGCGGCGCGGTGGCTGATGGCCGCGCGCGAGGCGGGCTCGCTCGAGCTCTTCTCGCTGCAGCGGCGCAGGTCCTCGGGGTGGTTCCCCTCCTCGTCCATGTTCCTTAGCGGCGTGTCCTGGTGAGGTTTCGGTTCGTATGGTTTGAAATGGGGGATTTTCGTGGTGGTTTAGTGATTTTTTTTTGGGTTGGTTTTGATGTTCAATGAAGGGCGAAGTGGTTGCCGTCCGCCGATGGGGCAGTGTTGATGCTCGTGGGCGCCAATGTGGGCGTGTTCATGCTATGGCACCTGGCTGATCCTAGCTTCATGAGGAGGCATTTTATGGTTAGTGATCAGTCGAAGAGCTTCTGCTTTTGTTTCAGAAGTGGTTGATTAAGTGTGGCTTGATTATTGTTTGATGAGCAGATTTCTCTTGATAACTTCAAAAGCGGGAGGTTACACACGTTGCTCACGAATGCCTTCAGCCACGCAGAGAGTGGTCACCTCATCAGCAATATGATCGGTCTCTACTTCTTCGGATCAAGTGTAAGATGTTCAGCTGCTCACCATTCTCTCTTGTTATTACAATGCAGAAGTCTGTACTCCCTCCATTATCAAATAGATAACATTTTAATATCAAAATATTAAGATTTAATGTGTGCAAATGACATCAGCAGATTTTCATGATTTTCATGTAGTTATCTTCGATAATCTTTATAAATATATGATTAAAAAAAACAATGATCAAACAAGTGCATTGGTGACTATGTTGATGTCCTAAACGACAAGTAAAGAGGATTAGTTTGTCCTTCTATGCACCTATGTGCAATTTTATGCATTCTCAAATCCTAAATAGAAACAAAGGAATGGATATGGTGACTTGTCAATATAGTGGAAATCATTACTATTACTAGTTTGCTTTCTGAAACACCTGAATTATAGCTGTTTTGAATTATCAAATCAGTCAAAGAATCATAAGTTGAGTGTAGACTAAAAACATTATCTAACACTTGATCCAAGACATGATCTTTTTGCTATAATATATGCTCATCTGAATTCCAGCATCTTTTGTTGAATATTTCAAGCAAGTCTGAATTACCATCAACTTGTTGGCATGATTCATGCTGGGTGAACTTGACCGTGTAAAATTAAGAAAGAGTAATATATTTGGTAGTGGAGTATTGAATTTGATCTAGCAATTTTTCTTTATTTTGACATTATTGAATTTGACCAATCAAATTTTGATTATATTTTTTCTCTAGTAAAAAAAAATAAAATTGGCTTGATGTTTGTAAAACAATTCTTTGTTTCATTAGTTTCTTGCAAAGGTCACATGTAATGAAGAGTTATAATACTTCATTGCCAAGCCCCCCTCCATCAGTCCAGAGACACACAGAGAGGTTATTGACATTTCCTGTGCTAGTTATTCAACCGAGCCAATCAGAGTTGTACGTATTGATGACTGATGAAGGCACCATGCAGGAGAAGATGTGAGGCTGTTTTTCAGGTCTGATGAAATAGCCAGCTAGGTAGAGAGATCCTGCAATGATTTGCCATGGGAATTCGATGTCTACCATGGTTTGAATGTACTAGATACGGTTTATCCATTTTATAAAAACAAAATCAATAGCATATAACTATTCCCTTCTAATTTTAGTATTTCTATTTATCATGTTTAGTGTAGTTAAGATTCGTTCTCCAAATGAAGGGACTAGTATATATATTGTACTCTGATTTTCTATTGGCCATTTATTACTTATATTGCATGTGCTGAATTGCTTTTTTTTTTTCCTTTGTGAATCAGATTTCCAACATGTTTGGTCCTGCTTTTCTACTGAAGTTGTACGTAGCAGGAGCACTTGCTGGATCTGCATTCTTCTTGCTAGAGAAAGCCTTCCTAGCTCCACGAAGACAGGTAAGCCTGGATATGATGTGAATTCTTATGCATCAGGGAACCAGGATTTCTAATCCTGGACCAGGATGTCCTATGTCATCCAATTCTGAAACAAAATCCTATGTCAACATGATTTCTAGTTAAGAAAAGCTAACCTGTGAAAATGCTAGTGCCTGGTAGTTCGCTGCTAGCTACTAGATGCCAACCAGCCTCTTGGTATTGGCACTCGTGTGGGACATATCCTGCATGAAAAGGGTTCAATATTTATGATTTTGCAATAATCTCCCTAATCTAATATGTAATATTTATTTTGCAGTTTTATGGCGGATGGGACAATTCAAGAACTCCTGCGCTTGTATGTGATTTATTGATTTCTTGTTCTTGCAGTTCACTTTATTTCGCGCTGGTATTCAGAAAACAAGCATTATTATGACATAATCACATCAGTAGTCTGATGGCAGCGATTTTTTCCCACCTACCTATTATGTGTTCATCTTATACACCCAAATAATTAATTAAAAAGCAGTACTGCAAATTTGAATCGCTATGATAGTTTAATTTAATGTATATATAGCCAACAAAGGGATGTCCTATTTGCTACTGTACTCAGAGATGTCAGTGGAGCCTCGTTCCCTGTTCCCCCACAGGGAATTCTTCCACAGGGGACGGGGATGGTTGCAACTGATTCTCCACGGGAAATTAAATGTGGAAAAACTTATGCCCCCTTGGGTCTAGCATGGGCGGGGATGATCTTCTGTTGCCCATCCCTGTCCTTCGTGAGGATACCCGATTAAAAATCGGGATAGGGATCCAAGTCCATTGCAAATTATGTAGGCCTAAAGGTCCAATCGAGCCATAATTAGTGGATGAAGATCTTGTGTTGTTGTCACGTGGATTAGTGGATATATGCTAGTATATTTATATAAAGTGTGGATATTATTTGTTAATTACATTTCGATTTGAGATGTATATGTTGTTTTAAACGGGCCCTCCATGAGGATTAATTCCCCGCGTGGGGTGGGATGGGAAAATTGTTCCTGATTGCAGTTTACGAGGGTGGGGAAATTTGTGGCCCGCAGGGATAGGGATGGGTTGTATTCCCCAGCGGGGATTCCCCGTTGCCATCTCTACCTGTACTAGTACTAAGTTATTACTTGTTACACCCAAAACATAACCTATTATATTCATGTGAATCAGGGTGCAAGTGCTGCTGCTAATGCAATTATCCTTCTTGACATCTTTTTGTATCCAAAGAAACTAGTCTATCTTTACTTCTTCATTCCTATTCCAGCTGCAATTATGGTGAGAAGCTTTTTTTCTTCAAAACTTTCTGTTAAGCATGGTTGCTATGATGTAAAACAAAAACTCTTTGACTTTTCAGGGGGCTATTTTGATCGGTGCTGATTTGCTGAGGGTGAAGGTATGCAGTAACTTAAAATGTGATTTCTTTTCATGTGGATTTGCTAATGTAATAAGTGCTCCTTTTGGTTTTTTGGTGCTACCCTGTTGCTTTTCCATGAGTTTTGACTGTGGTAGTGTGCTGGTTCAGCAGATGCATTACAGTATAGCTGTTGGACACTGCTACTTTCATTTTTATTTCAATTTTGGGATTTTTGTGAATCGCTTACTCTGTGAAGTTCCTGCCTGCAGTAGCTCTGGTCTTAAATTAACCTGATATTTTTTAAAAAGTTGATATTCACATTTAGGGTGGCTAGGAATATTTTACTGATTTTTCCATGTGATGTTTCTGTTTCTAGAATGTACTAGCCTTTCCTGGCTAGTTGAAATTCTATGTTTTATATCTTTCTTCTTGATGATTACATTTTTCTAATTTATGCTTTTTATATATATACTTCCTTTTCCCCAAAAAAAGTTGTACAGAGGCTGATATCTGTTTATTTTTTAGAGGCAAGGTCAGGTATCAGGTACTTCTCATTTAGGTGGTGCCCTAATAGCTGCTCTTGCATGGGCTCGAATCAGGAAGGGTTGGATCTGATCATGTACTCCATCTGGTGGGCTGATAGTTGCAACATGTCATTTGACGAGTTACTCATGGACCATGCGACTCGTCCAAGTCTCTGA</dnaseqindica> |
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