BGIOSGA004539
| Gene Name |
BGIOSGA004539 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004539, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_03924 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004539-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004539-PA |
| Length |
9068 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:35993629..36002696 |
| Sequence Coding Region |
35993629..35993781,35994454..35994573,35994669..35994761,35995484..35995570,35996115..35996205 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:35993629..36002696 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:35993629..36002696 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCAGCCGGCGCTGCGACGGCGGCGGCGGCGCCAAGGCTTCCTCCTCCCCTTCGCCTGCCTCTCCGCCGCCCTCATCGCCGCTGCCCTGCTCCCCGGCGCCGCTTTCGCCGATGGCGTCACGCCCTCCGAGGCCCGCCGGCTCCGCGACGAGGTCAAAGATATGTTCTATCATGCATTTGATGGGTACATGCAACATGCTTTTCCACTTGATGAATTGCGGCCTTTAAGTTGCCAAGGAGAAGATTCACTTGGTGGCTATGCACTTACTCTTATAGACTCTTTGGATACCTTGGCTTTACTAGGGGATAAGGAGAGATTTGATGCTGCCGTGGAGTGGGTTGGTAAGAATGTCCGCTTTGATATTAATAAAACTGTCTCTGTTTTTGAAACCAACATACGCATTCTTGGGGGTCTGCTATCAGCTCACCTGATTGCCAGTGATTATGCAACTGGAATGAGAATTCAATCTTATGATGATCAGTTGCTTCATTTAGCGGCTGACTTAGCTCAAAGATTGCTACCTGCATTTGACACTCCAACAGCTGGTGGTGGCACTTTGACACTGGAATTTGGTGTCCTGAGTCGTTTGACTAATGATAGTGTTTATGAACGAGTTACAAAAAACTCTGTGCGTGGAATATGGGCACGCAGGTCGAAACTTGACCTTGTTGGTGCCCATATAAATGTATTTACTGGTGAATGGACACAGAAGGATGCAGGAATTGGCACAAGCATTGACTCATTCTATGAGTATCTTCTAAAGGCGTATTTATTATTTGGAGATGAAGAATATTTGTATATATTTCAGGAGGCTTACAAGGCTGCCATGCATTATCTCCATCATGATCCCTGGTATGTGGAGGTAAATATGAATTCTGGTGCTACTGTTTGGCCACTATTCAACAGTCTCCAGGCATTCTGGCCAGGACTTCAGGTGTTAGCTGGAGATGTTGATCCTGCCATTCGAACTCATGCTGCCTTCTTCAGTGTATGGAAAAAATATGGCTTCACCCCAGAAGGGTTTAATCTTGCTACATCCACTGTTCAGAATGGACAAAGGAGCTACCCGCTGCGGCCTGAATTGATTGAAAGCACATATTGGCTGTTCAAGGCTACTAGAGATTATAGGTACCTTGATGTTGGAAGGGATATATTAGCAAGCCTTCAATATGGTGCTAAATGTCCATGTGGTTACTGCCATATTTCAGATGTAGAAACCCACCAGCAGGATGACCACATGGAGAGTTTTTTCCTTGCAGAAACAGTCAAATATCTCTGGCTTCTTTTTGATTTAGCTGCAGGCCCTGATAATATTGTTGAAAATGGGCCATATAAATACATATTTAGTACAGAAGGTCATCTGTTGCCTGCTACTCCTCAGATAACCTTGTTAGATGAGCATTGCTTGTATGCTGGAGCATTCTGCAATGGTACTGCAGGCCATGGATATGGTACCGGTGATAGTTCTAATAAGCATCAAAATGCAAACTCTGTTCCGTTCGATGATAGTCGAACACCTTCCGATCAATCTTTATCCAATATTTTGTCTACGACAAGAGGGTACATCAAGGGAGTTTGTCCAGGATTAACTCATGCCCAGAAACTTGGCATATCATACTCTGCCGAGGAGATAACTCAATACAGCAGATTCTGGAAGTATGTCCAAGCTCAATCAAGTTCTGTTATATTGATATCGCATCCAGTCGCAAGCCAAACTGAGGGGCCTACGTCGGGCAGAAGTCAGTACAATGCAAACATTGTGGCAACTGCTGAGTCTGTAGGGACTGATACTGCCGGCGCCTCATCCCACCCCGAGGATCTTGTTAAGGAAACTGAGAGCGTCTCTGAACAGAAAGAAATCAATGACAAAGAGATCGCTTCTCAGGGTAGTCAACCGACCGAAGGAAGATACCTGACCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQPALRRRRRRQGFLLPFACLSAALIAAALLPGAAFADGVTPSEARRLRDEVKDMFYHAFDGYMQHAFPLDELRPLSCQGEDSLGGYALTLIDSLDTLALLGDKERFDAAVEWVGKNVRFDINKTVSVFETNIRILGGLLSAHLIASDYATGMRIQSYDDQLLHLAADLAQRLLPAFDTPTAGGGTLTLEFGVLSRLTNDSVYERVTKNSVRGIWARRSKLDLVGAHINVFTGEWTQKDAGIGTSIDSFYEYLLKAYLLFGDEEYLYIFQEAYKAAMHYLHHDPWYVEVNMNSGATVWPLFNSLQAFWPGLQVLAGDVDPAIRTHAAFFSVWKKYGFTPEGFNLATSTVQNGQRSYPLRPELIESTYWLFKATRDYRYLDVGRDILASLQYGAKCPCGYCHISDVETHQQDDHMESFFLAETVKYLWLLFDLAAGPDNIVENGPYKYIFSTEGHLLPATPQITLLDEHCLYAGAFCNGTAGHGYGTGDSSNKHQNANSVPFDDSRTPSDQSLSNILSTTRGYIKGVCPGLTHAQKLGISYSAEEITQYSRFWKYVQAQSSSVILISHPVASQTEGPTSGRSQYNANIVATAESVGTDTAGASSHPEDLVKETESVSEQKEINDKEIASQGSQPTEGRYLT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..153#826..945#1041..1133#1856..1942#2487..2577#4225..4284#4732..4841#5267..5317#5815..5903#6179..6260#6341..6454#6676..6755#7421..7556#7882..7952#8035..8269#8681..8769#8807..9068#ATGCAGCCGGCGCTGCGACGGCGGCGGCGGCGCCAAGGCTTCCTCCTCCCCTTCGCCTGCCTCTCCGCCGCCCTCATCGCCGCTGCCCTGCTCCCCGGCGCCGCTTTCGCCGATGGCGTCACGCCCTCCGAGGCCCGCCGGCTCCGCGACGAGGTAGTGCCCGCGCTCCTCCTCAGATCCGCCCGCTCCTAGCTCCAGTTTGTTGTAAGCTAGTTTCGTGATCCTGAGCTGCGGCGGAGGCGTTGTCTAGTTCGGATGTTGCGTGTTGGTGCTAATTTGCTGGTGCATAACTCTTCACGAACCGATTTGGGCTGGTTTTGCAATCGGGCGGCGGCGGACTCGGCGATTCGACCGGTTTAGTTAGTATGCTTAGTTAATTATCACATTTCCGGTTTTGATCATACTCAATTATTCATCGTTACACGGTTACTCCAGGAACGATTAGCTATATACGCCAGGCATTCCGACTGTTAGTAGTTCCCACTGGTGACTTTGCTGAAAGCTTTTGACTAAAGTTCAGTGCTAGGTTGATTTTGAATGTGTGTCACAACGAGATATGCTGTATTATAGGATTTTTTTAGCACAAAACTTACCACACTTGAATTTTTGGATTTTGTACAACCGAGCCAAATTGACTGGTATAGTAGTTATATTAGGTTGCTGTAACAGAGGTAATGCTTGTGGTTCTAAGTTTTTTTTTTCCTCTAATTGATGGTGAGATGCCAAACCTCATTAAGAGATATCTTCCACTTCAACAAGACGCCATCTTGTTTACAATTAACATGTGCAGAATCTAGTATTCATATGGAAATGTCTTTTATGTAGGTCAAAGATATGTTCTATCATGCATTTGATGGGTACATGCAACATGCTTTTCCACTTGATGAATTGCGGCCTTTAAGTTGCCAAGGAGAAGATTCACTTGGTGGCTATGCACTTACTCTTGTAAGCAATTAAGAAACTGCTTCCTCATGCACATTTCCTATCAGTTTTTGCCTTCATGTATTATCATGATTTGTGAATGCTTATTCATTAAACAGATAGACTCTTTGGATACCTTGGCTTTACTAGGGGATAAGGAGAGATTTGATGCTGCCGTGGAGTGGGTTGGTAAGAATGTCCGCTTTGATATTGTAAGTAAACAATTTACAATTTTTTTCACTAATTGCATAGATTAATTAATACACACCATGGTGACACCATAACTAATTAACCATTCAACCATTATTGACATATGATAAATATACAGTACTTTTTTGCTTGTATTTCAGTCTGTCCTATAGATTGAAGCACTTTATAATTTAGGATTAGCGTGTTACGTGAATATTGAAGCAGATAATATGCCATGTTGGGTGGTTTCAACTGACGTGCCATATTCATTGATTCAGAATGAAGAAACATTATGCTTGACAGTTTAGAGAGATTCTTATTTGTACCATAGTCCAATAGATCAGTCTTGAAGATTGGTTATGTTGCAAGGCTTTCAATATTGCCTTTCTCAGATTAATTTATTATATGGTGCTTCTTACAGTATGACTCACAATCTATTATGGTTGGTGATAGGGATCTCAATGCATTAAGGAATAAATGTTAGTCCTGTTGCTTTTTTTTGGTCTAATAACTTTTCACTGTATGTTTTTTTAACATTCCTTTCGAAATACCAGTTTTGCATTTGAAATGAACATAATCTTCTAGCACCAAGTATGTTATATGTGTTCTGTAGATACATCTATATATTTGATCTTTCTATTTCTTCTTAGCCTACTTATTTTACTTGTGCGAAGATTGACGTGTTCGCTTACAACTTACATTCATGATTCTGTTTCTTAATCATGTTTCCTTGCTGTATATGCAGAATAAAACTGTCTCTGTTTTTGAAACCAACATACGCATTCTTGGGGGTCTGCTATCAGCTCACCTGATTGCCAGTGATTATGCAACTGTATGTTTGTCTGGTCCTTTTTTTTGCCAGTGTTTACCACTTCTCTTGTTGATTTTCCTGATGATCTTTGCTAAATTTCTGTTAATCTTAAACACAAACTTTTTAAGTAGAACTTGAAAAATTGTATGCAAACCAAATATACTAAAGTGGGACATGAAAATCTGATTGGAGCAAAGGAATACCTGTGCTGTAACACGAAACCACTTCTGAAAGACCATATTGATAATGTGCAAGCTTATTGACACCATGACTGTTGTGATGTTAATGGAGGTGTGGCATGGTAGAAAGGTGCCTTTCTGCCTGTTCAACATATTGACCATAATAGGTTCTTTTCAGAATACGGCTGGTTAGAATAATTCTTTAATATGGCACATACGATTAGTTATATCTTAAATATGATCATGCTGATGTATTCAGTTATAACCTACATTCATAAGAAAGTGCACAATAAGAAGATGTCTCAATCTTCCTAACCTTCTATGTTACTTTCTCAAGATTTACTCAATGAAGTGTTCCGATATTTATTTTAGCTTCTTGTTGACAGGGAATGAGAATTCAATCTTATGATGATCAGTTGCTTCATTTAGCGGCTGACTTAGCTCAAAGATTGCTACCTGCATTTGACACTCCAACAGGTTTACTACGTTGTCTATTAATTACTTTGTGGACTCACACATGTTTCTTTGAAACAATGGAATATCTTGATATGTTATGTATCATATCAGAAATTTGATCCCCCAATCACCACCGTTCTCAACCCCCAGCCCACCAAAACACACATCGAACCAAACTCTTCTTTTTCAGCCAAAGCTGTTTGTGTAACAAACTTTTCCATGGTTTGGGATTATAACTGGACTACTGAACATAATGACAAAAATATCATGTTCCATCGCAGTAAATACACCCTCACATACAAGCTAAAACAGATATCCATTAATCATATCTTACTATATAGTTGCAACCCACTAAATCCTAAAGCTCAACATACAAAGATGCCACATCATTCTCAACTAACAATTATTACATCTTAAACATCATGCAAGCATGCTATATTATCTATAATTCTATATTTATTAAATTTTAGAGCTTTAAAATGCAAGAATGTTAAATCATCCCATATAATTCACATAATATTTAAATATATCTCTCCATCATTTTTTATAATATCTACTATATACATATGTAGTTCATCCTCACTTAGTTAATGCTATTTCGCTCTTCTCTCATTAAGCCATATCACATCAATTGTTTTTAGCCCTTAGATGATTAATCTATGGTCCAAATTATCTTTATCTTTTTTTTTTCTCTTTAAGTCATATCACCTCAATTATTTTTAGCCATTAGATGATTAATCTATGGTCCAAATTAACTCCCTCCTTTTCTTCTCTCATAAAGTCACATCACCTTATCATCATTCTATATACTATTTAAATTACTATAAACCATATCAACTTATGTAAGCTTATGTCGTCTAGCTATCTTACACATTATCTCTACTTATTTGATGTAAACATTATTTCTACTTATTGCTATCATATTAAACTCCTGCAGCAACACGCGGGGTTTTACCTAGTATATGCACATATGCATGTACACTAGAGCGCATGCACGTTGCACGCTTAATAAAATATGCCGACATTTGAGCATTTCTTTTCGATGGAAAGTATCCCATGAGTTATTCAAATGGCAAAGGAGTAATAGAAGAGTTTTTTCATCCTTTTAGCATCATGATATGTTCTTTCCTTCCTGTTCTGCTTAACATGTGCAGTTCTCGTTGCAGGTATTCCATTTGGATCAGTAAATTTATTGTATGGAGTCGATGAAAATGAAAGCAAGGCAAGCTTATTTTGTCCTACGTTTTGTTGTTTATAGAGCTTGCAATCAGGAACAGGCCCAGAGTTTGGACTCATGTTAATTATGGTCGATATGGAGATTAGCATAATTCCAAATTCCAAGTGTTTACGCTGTTGCTTAAGTAACTTTGGAATGATTTAACTTGAAATATTCTACTGCTTTTGTAACCACATAAATAATATACGAGAGGCACACGCACGCGCACACACACACACACATTTATCAGACTTCTCAATTTTCTTCTGTTCATTTAGAACTTAAATACCAAGTACTATCCCATCAACCATGTCTAATTTCCCATGTTTATGCTTGGTTCATCAGTACAAGCGTTGAAAGTAGAAAATTGTACCTGGCTATTAGATGGACATAAACATTCCTGAGATTAATTACTGACACAGCATTTTAGTAATAACAGATAACTTCAACAGCTGGTGGTGGCACTTTGACACTGGAATTTGGTGTCCTGAGTCGTTTGACTAATGATAGTGGTTAGTATTGACAATATATTATATTGTTGAAGATCTCTATATTATGTATTCTACATTATTACACAACTACAATAGCTACCATGTGCTAGAAAGGTGCCCCTACTTTTTTTGGTAGTTTATGTTTTAAAATCTCATATATTTTTTATGGAATTGAAATATTATAGTTGAATAGTCTGAAAGTATCCTTACTGGTACTTAACAAGTCCTTTAAGGTGCTGAGTCGTGATGTCAACATCTGTGTCCATTCGTTGTGTGTTAGATGTTCAGAACAAATTTATGCATATCTTTGACCATGAACTTCCCTAGTCCCCATAGAGATCATGTTTATTATTATTGTTCTATTGTCTCATGCTTCATTAGTTTTGGTTGTTTATCCTCTGAACACTAATTTAGTTCTTATCGCCAGTCTGTTATTCTTTGTTGAACTCACTGATTGTCACGATGCAGTTTATGAACGAGTTACAAAAAACTCTGTGCGTGGAATATGGGCACGCAGGTCGAAACTTGACCTTGTTGGTGCC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|
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