BGIOSGA004569
| Gene Name |
BGIOSGA004569 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013157H06, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004569, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004569-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004569-PA |
| Length |
5020 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:36458844..36463863 |
| Sequence Coding Region |
36458844..36458900,36459759..36459869,36460180..36460242,36460923..36460956,36461487..36461609 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:36458844..36463863 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:36458844..36463863 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGGGAGGTACGACCGGAACCCCTTCGACGAGGACGACGTCAACCCCTTCGCGGGTGGAAGTGTACCTCCAGCTTCCAACTCTCGGATGCCACCTCTTCCTCACGAACCTGGGTTCTATAATGATCGTGGTGCCACAGTGGACATACCTCTTGATTCAACCAAGGACATGAAGAAAAAGGAGAAAGAACTGCAGGCAAAGGAGGCTGAGCTAAACAAACGGGAAAGCGAATTGAGAAGAAGAGAAGAAGCTGCATCCAGAGCTGGGATTGTCATTGAAGAGAAAAACTGGCCACCCTTCTTCCCTATTATTCATCATGACATTTCAAATGAGATACCAATCCACCTACAAAGGATGCAATACCTTGCATTTTCTTCGTTGTTGGGATTGGCGGCATGTCTTTTCTGGAACATAATTGCAACTACAGCAGCATGGATTAAAGGGGCAGGTGTTATGATCTGGTTGCTAGCCATTATCTACTTTATATCTGGTGTACCTGGAGCCTATGTGTTATGGTATCGCCCCCTTTACAATGCGATGAGGACTGAGAGTGCTTTGAAGTTTGGATGGTTTTTCCTGTTTTACTTGATCCATATACTGTTCTGCATCTGGTCTGCTGTGGCTCCCCCATTTCCTTTCAAAGGAAAGTCTCTGGCTGGGATTTTGCCGGCTATTGATGTCATAGGAAACAATGCTATTGTGGGGATATTTTACTTCATTGGATTTGGACTGTTCTGCCTTGAATCACTACTCAGCGTTGTTGTCATCCAGCAAGTATACATGTATTTCCGTGGAAGTGGGAAGGCTGCTGAGATGAAACGTGAGGCAGCTCGTGGTGCTATGAGATCGGCCTTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAGRYDRNPFDEDDVNPFAGGSVPPASNSRMPPLPHEPGFYNDRGATVDIPLDSTKDMKKKEKELQAKEAELNKRESELRRREEAASRAGIVIEEKNWPPFFPIIHHDISNEIPIHLQRMQYLAFSSLLGLAACLFWNIIATTAAWIKGAGVMIWLLAIIYFISGVPGAYVLWYRPLYNAMRTESALKFGWFFLFYLIHILFCIWSAVAPPFPFKGKSLAGILPAIDVIGNNAIVGIFYFIGFGLFCLESLLSVVVIQQVYMYFRGSGKAAEMKREAARGAMRSAF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..57#916..1026#1337..1399#2080..2113#2644..2766#3362..3424#3521..3614#3702..3747#3876..3943#4313..4361#4598..4663#4934..5020#ATGGCGGGGAGGTACGACCGGAACCCCTTCGACGAGGACGACGTCAACCCCTTCGCGGTGAGCTGCTGGGTTAGGCTGTAGCTGGGTCGGGGGGCTAAACCCCCCCTCCGCGTCGCAATCGCGCCTCCTCCTTGCTTCATCTAGGCATGGAGATGCTTGTCCTCGCGCCTGTGTGGATGGGGTAGTCGAGCTGCGTCCCGGATTGGCATGTGTTGTGCTGGTTTTCTGGCCGTGGCCGCTTCGTCTGGTCCTGCACGCGGCACGCCATGTGGGGTGCTTTGGATCAGCCTGAGTTGTTGGCGCTAGGGTTAGTGATTTAGGATCCGCTGTTAGGGGGTTGGACTTGGATGGCGCGAATACGGCCTTTTTTGCTTGTCTATTTGCTAGCTGATCGCGAGGCGTGGCAACTTTTCCCCTTGTATTGTTATACATTTTCATAGGAGAAATGATGCTCGGATTGAAAATTGGCTCTTAGGTTGTGTTGGGACGTTATGTTTCTGGTTTTACGAGGGAATATGTGGTGCAATCGATGTGTATAACTTGTGAAAATGGTCGGTCTACTCTTAGAATTATTGGAAAATATCCGTAAAATGGGGCAGTTCACACTTGTTTGGTTCAGATCGTCTATAACATTAGGAGATTGAAGATTGTCTCTGCCAGTATAAACATTTAGTGTCGTAAGCCTGCAGTCAGTTTACTCTCAGTTTGCTGGATATGCACGTGTCAGCGAGTCCATAATCATGTGAATTGTGTGTATGCGTGCACATGCTCCATCTAGGATTTCTAAACTGTCAAATTTTGAGCTTTCGGCCAATAGGCGTAAAAAGGGATAATAGAGTTGGCTGAATATTCTAATTTTAGCAGCCTCCTTCAACTATCTGTTTGTTTCATTTTTAAATGTACCCTGTTCTGCAGGGTGGAAGTGTACCTCCAGCTTCCAACTCTCGGATGCCACCTCTTCCTCACGAACCTGGGTTCTATAATGATCGTGGTGCCACAGTGGACATACCTCTTGATTCAACCAAGGTACTTGTATTTCCATTGAGCGGTAATACTACGTGCTACTATATTTACAAGTTATGTTCTGTACCTCAGCGTGAGAAAATCATACTGTACTTAGCTCTTTCACTCTGATATTATTACTCTGTTAGTGTGTAACAACAGTTGCATGCTTCATTTTTTGTTATCTTATCTCTTTAAAAGGCTGAAGAACACAATTAATCTAGTAATGATGGTTTCACTATTCCTTGGTTTGGATGTTTGATACCATATATTCTTTTGTTGCTGTATTTGTGGTTGGTTGCTTATGCATTGAGTATGTTCGTATGTAATTCAGGACATGAAGAAAAAGGAGAAAGAACTGCAGGCAAAGGAGGCTGAGCTAAACAAACGGGAAAGCGTATGTGCCTTCTGTAGTTATGCTTGAAACTTGGAATTTTCAATTGATCTTTTCATGAGCAATGTGATTTTTAACCAATGTTTGATGAAGTAAAAAACTATTCTAATGAATCAAGTTGTCAACTTCCCCTGGCCAAAGTCCTAATTCCTAACCTTTTTCCTATGATGTATTGGGAAGCACCTATATATTGTGTTAGTATTGAGTATTGAACTAGTAACCATTATGCAATGTGAAAGATATTTAGCTGGCATGGATTTGACACAAAGATCCGGCACCCAATAGACCTCGCTGATCTAACCATTAATTGAATCATTGACATTGCACAATTGGTTTGAAATGATGAACAAAACATGGATATCTATACACTCAATTATAGCACTTTGAAAAGAAGGATGGCTGTTTTTTTAGATAAACAGAAGGATACCAGCGTGCTAATGCAAACTAACATTATCAAATGATTTCATCTAGATATCTCCTCTTTTCATAAAATATTGCGCATGAGAATTACGTGTATAGAATGCTGAATCTGTGAGTGTGCTGAGTTTTACTCATAGAGTAAAAATTTGATCCAACAAGTTTCACATGATTGGAGGTTAAAACACCCTAGATTTGCGTACAAGCATGCTCTTGTATTTTCTTTAAATACACCACCTGATTTTTTGTGATTCCCTGATACGCAGGAATTGAGAAGAAGAGAAGAAGCTGCATCCAGAGGTATATTTTTTTCTCGCAGCTGAGTACGTGTAATCTTTTTGTCTTTGTGTTTCTAACAAAAAATATTCGAAGATAGGAAACAGTTGTTCATGATATTTGTGTCGATTGGTTAATTAGGAAGTTGACTAGAAAACTATAGCTAATTTTAGATTTAGAGCCTGAGACTTAAGTTACACTTTGCAATATAATGAGATTTGTAGGCAAGTATCCCTTGTTGTACAATTTAGAAATGCTCCTGTTTATGCTATATTACTCCCTCTGTCGCATAAAAAACCAACCTAGTACTGGATGTTTCACATCCTATGATCCTAGTACTACGAATCTGGACATATCTCTATCCAGATTCGTTGTACTAGAATGTGTCACATCCAGTCCTAGATTCGTGTTTTTTGGGACGGAGGGAGTACATTGTGTTCGTCTTTCTTGAAAAGGCTATTCTTGCTAATTTTGTGCTTATGTTTGTTCTGTTGCAATCTATTTTCCATTTTAGTTGTTGCTTCTGCCTTTCAACTCTTTCTTTTATTTTTCAGCTGGGATTGTCATTGAAGAGAAAAACTGGCCACCCTTCTTCCCTATTATTCATCATGACATTTCAAATGAGATACCAATCCACCTACAAAGGATGCAATACCTTGCATTTTCTTCGTTGTTGGGTAAGTGTTAGTTTTAGTTTTAAGTTTTAACTCTCTTTTTGTTCCCTCTTGTTGGGAAAGCTGTCACAAGAACTAAAATACCTGGTGGAACCACAATTCTTTATATCCTTTTGCTTAAACATTGTGAATAAAATACTGCCTGAATCACTACATTTACTGTCCAATCAATGAATTTCTGCTGAGTCAATGCCAGAAGTGAGTAGTGACATGAGAAAAACGTGCCTACTTTGAGACATTTTGATATCAATGAACTTCTCTAATCTTGACTTATATATCCAATTAAGAGATTCTTTTTTAAAAAAATAGAAGTTGCAACCTGTGTCTTTTGAGAAAAATAGTTATTATCTTCTTGGTGCAGTAATTATGTAAGCCTAATAAGCATAAGCATGTGGTGTCTACCCTGTTTTGTAGCTGGGCTAAATGTCTTTCTGTAAAAAGATGTTCAAAGCAACGCTAACAATACTTGGCATCTTGTAAAAAGAAGCACTATTTAGTGGACTGAATTTTGGTTGTGAGAGCTAGTACCTATTTGCATGTTGGTGTAGCATTGCTCTACAAAGCTGCTTCTTATTGTGCAAACTTTGATGTCATGCAGGATTGGCGGCATGTCTTTTCTGGAACATAATTGCAACTACAGCAGCATGGATTAAAGGGGCAGGTATGGCTGACTGAGTACCTTACTATATATTTATCTTATGGATCAGCTGCCATCTGCACTGACACTTCAAACTAATCCTGCGGTTCAATTCAATAGGTGTTATGATCTGGTTGCTAGCCATTATCTACTTTATATCTGGTGTACCTGGAGCCTATGTGTTATGGTATCGCCCCCTTTACAATGCGATGAGGTTGTGAATATACTTGTGTTTTTGTTATTTCTGCACACTATTTCTTCTTATATTTGACATAGTGTATTGTTACAATGTATGTTGCAGGACTGAGAGTGCTTTGAAGTTTGGATGGTTTTTCCTGTTTTACTTGGTAAGACCCTTACCTTCTGGTAACTGTAAGGTTAAAATGATCTAGTATAAGATTAATGGTTTGCCACACTATTGGTTGCAAAATTGCAGATATTCCGTGCAGTGCTAACAGTGTTTGCCCCCTTTCAGATCCATATACTGTTCTGCATCTGGTCTGCTGTGGCTCCCCCATTTCCTTTCAAAGGAAAGTCTCTGGCGTAAGTGTTCTGTTATTTTATTTAAGTAAACATACATTTTATTTAAGCAGCAACATTGGAGCACTGGATAGTGTCTTAGTGGCTATGACTTAAAAGTGCTTTGAGACTTTGTTATTCTTCAGTTTTAGCATATATATTAGTATTTGGCTCATAGAGGTACCTGTGCAACAGTTCTAGGTTGCTTTTACGTGGCATTTGCATAGTTATTAGGTGATGGTGTTAATTGTTAGGGTAATACCTGGATCACTGCTATTGATGCTCTAAATTGTTACAAACTTGTAGCAATTCAACTTGCAGGCTGTCCATTTTCTCTACTTCAATTTATAAATACCACTTCTCTAATTGCCTCTCCCTTTTTTTTTGCCACAGTGGGATTTTGCCGGCTATTGATGTCATAGGAAACAATGCTATTGTGGGGGTAAGTCTCACTGTTTACTTAATGTTTTTCTTCTAGATTCAAGTTAATTTGAGATATCAGGGTTAGTATCTTGGGAGGACCCTATTTGCATTTTTTTAACAGACCTTTTGCCTCAGTGAGTAAGCACTGCCGCACTGGGACTCTGGGAGTTCGTGATGCTTTGCTTAATTTATTTGATTGGCATGTCTCATACAATTGATTAAGTCATCAACATTGTTCACACTTTCTTTCGACAGATATTTTACTTCATTGGATTTGGACTGTTCTGCCTTGAATCACTACTCAGCGTTGTTGTCATCCAGGTGAGTTTTATAAAACTTGATCTTAGCCAAAGCCAAATAGTAACACCTTGGTGTCTGTTCAGCAACACTCCTTCATTCTGCCGTTCATCATCATGCGTCATGCTGTGCCTTCAGAATATATACATTTCTATTTGCATTGATGTCTCCACTCCCAACTAGAATGTGCTGTCCCCTAAGATTTTGTTCTTGTTGCAATA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| External Link(s) |
