BGIOSGA004680
| Gene Name |
BGIOSGA004680 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004680, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0085D07.17 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004680-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004680-PA |
| Length |
5546 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:38070764..38076309 |
| Sequence Coding Region |
38070764..38070859,38071763..38071824,38072526..38072613,38072698..38072759,38072840..38072936 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:38070764..38076309 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGGGAGCCGGAGGGAGGAGGAGAGGAACGAGAAGATCATCCGTGGGCTCATGAAGCTGCCGCCCAATCGCAAGTGCATCAATTGCAACAGTGTGGGGCCACAATATGTATGTACCAATTTCTGGACCTTCATATGCTTGTCATGCAGTGGAATACACCGGGAGTTTACCCACCGTGTCAAGTCAGTGTCAATGGCTAAATTCACTACTCAAGAAGTGCGGTCTCTTGAACAGGGAGGGAACCAGCGAGCACGTGATATCTACCTAAAAGATTGGGATTGGCAACGAATGAGGTTGCCTGACAATAGCAATCCAGACAGGATAAGGGAATTCATCAGAGCTGTTTATGTAGACAAGAAGTATGCTGGTGGGAAGTCCACGGACAAACCAGTCAATGATAGTGAGAGTGTAAAGAGCAGCGAAAATGATACTAGAAGACCTAGCTCCTACCATTCGTATTCCCAAAGCCCACCTTACGATTTTCAATATGAAGATAGACGATATGGTAAACAAGTGGACACACTTGCACGAAGGCCTTCAGATAGGGCACTCTTTGATGGGAAGCTTGGCAGTTTTTTATACAGTCCAGGTCGTTTGAGAGATCAGATGCATGAAGATCGATTTGCTAATGAGAGTACTGGGTCAAGGTTTTCTGATTTTTCGGCCTCAAGCACTGGTGACATTAGAAATGATGTGCTTTCTCCTAGCTCTCAGGATACAGGGTACAGCAGTCCTTCTATCCACCATTCAAGGAATGTGTCTTCTGAAAATCCTCCATCCCATCGGCATCCGAATGCAACTTCTCAAATTGATTTTAATGGAGTCCGACGATCACAGAGAACAGGTTCTTCAGGAAGTTTTGGATCATTTGATGGTAGCTCAGCATCTAATAAGTCAGTTGATTCAGGTGCCTTACCTGATGCACCTACAGAAAAGCCAGTGAATTCTGCTGTAAATCGTCAGTCTGTTGCGCCCCCCATGGCTCATTCAGCACAATTGTATGCCTCGCAGAGCAATATAAACTCTTCAGTCAGCCAAACTGCTCCCACCAGGGAATCTGTGCAACATGGAAGGGTTCACATGGTCTCTGTAGCAAAGCCGCCGGTTTCAACACAGCCAACGACTTCCACAAATCAGGACTTCTTTGATCAGTCAATGCAACATCCGGTCAATTCTGCAGCACCAATAGATCTTTTTGCTGGCTTTAACCAACAGGCTCCATCAGTTCCCCATAGAGCAGTTGATGTAGGCAGCCATTCTGTTCCTAAAGAAACTCTGCATGACGTTGTGGTTCAGAAAGCCGTGGCATCTTCACCACCTGTTCAAGCCGAAGCACCCTCTACATCTCATCCTGTCCATCATGATCTCTTGAGTCTGTCGCCTTTGCAGGAACCTTCAATTTCCTCTACCCCTCCGTCAATAGATTTATTTGCTGGCTTTGACCAACAACTGCCACCTACAACTAGTGTTCAGCAAAGTCAACCAGCCGAACCATCAATTTCCTCTACCCCTCAGTCAATAGATTTATTTGCTGGCTTTGACCAACAACTGCCACCTACGACTAGTGTTCAGCAAAGTCAACAGGCAGCCCCATTGGTTGCTGACGAAGGATGGGCTTTCTTCCTCGATACACCTCAACACGTATCTCCGACTTCCATTTCAAACGTGCAAGCTCAGGTAGCCACCGCAATAGCTGCATTCCCTCCAAGTGAGAGTCTTGCTAAAGGAACTAATCAGTCAATGTTGCCAACTTCGCCACCAAATGCTTTGATTCCACAAAGTTACCCGCTTATGATGGATCAGTGGAGTTTAAATGCTGAAGAGGTGAAGACCCCTGTCTCCAAAGAAACCTCACAGCCTTGGAATGCCTTTGGTGCATCTACTGGGAACACACCCAACGACTCATTCACATTTAACACTATCTCTCAAGTAGCACCTAATCACTTCAATGTGCCTAGTGTTCCACATGCTGAAGCCAGAGGTCCACAGGATTTGCCTAGCAGTGAACCTGAAAGACTAACCCCTGGGGATATAACCCCTGGTTTCAATGTCTCTCCTGGTGACATGGCTGGGCCATCATTTCGTGGACCACTTCAACAGCAACTGGACATCGTGCCATCTCAGCCTGCAAAATCAACAAATCCATTTGACATGGCATTTGAGTCTGATGTTGAAGCCAGTAACATGTTCATGGATCTGACCTCGCTGCAAGAAATGTTGCCAAATCCCCATGTCAATACAGATTATTCCAACTTGACTGAGTCATGGATACCTCATAATTCTAACATGCCTTATATTTCCTCTGGGCCACAGGGAGGATTATCATACATGGCAACACAAGTACAAGACTCCCTCATGCTGAACTCCGCACAAGGGTCATTTCCGCCCAGAAATCCATTCGAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSRREEERNEKIIRGLMKLPPNRKCINCNSVGPQYVCTNFWTFICLSCSGIHREFTHRVKSVSMAKFTTQEVRSLEQGGNQRARDIYLKDWDWQRMRLPDNSNPDRIREFIRAVYVDKKYAGGKSTDKPVNDSESVKSSENDTRRPSSYHSYSQSPPYDFQYEDRRYGKQVDTLARRPSDRALFDGKLGSFLYSPGRLRDQMHEDRFANESTGSRFSDFSASSTGDIRNDVLSPSSQDTGYSSPSIHHSRNVSSENPPSHRHPNATSQIDFNGVRRSQRTGSSGSFGSFDGSSASNKSVDSGALPDAPTEKPVNSAVNRQSVAPPMAHSAQLYASQSNINSSVSQTAPTRESVQHGRVHMVSVAKPPVSTQPTTSTNQDFFDQSMQHPVNSAAPIDLFAGFNQQAPSVPHRAVDVGSHSVPKETLHDVVVQKAVASSPPVQAEAPSTSHPVHHDLLSLSPLQEPSISSTPPSIDLFAGFDQQLPPTTSVQQSQPAEPSISSTPQSIDLFAGFDQQLPPTTSVQQSQQAAPLVADEGWAFFLDTPQHVSPTSISNVQAQVATAIAAFPPSESLAKGTNQSMLPTSPPNALIPQSYPLMMDQWSLNAEEVKTPVSKETSQPWNAFGASTGNTPNDSFTFNTISQVAPNHFNVPSVPHAEARGPQDLPSSEPERLTPGDITPGFNVSPGDMAGPSFRGPLQQQLDIVPSQPAKSTNPFDMAFESDVEASNMFMDLTSLQEMLPNPHVNTDYSNLTESWIPHNSNMPYISSGPQGGLSYMATQVQDSLMLNSAQGSFPPRNPFE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..96#1000..1061#1763..1850#1935..1996#2077..2173#2330..2761#2873..3892#3982..4113#4185..4301#4820..4900#5159..5285#5385..5430#5501..5546#ATGGGGAGCCGGAGGGAGGAGGAGAGGAACGAGAAGATCATCCGTGGGCTCATGAAGCTGCCGCCCAATCGCAAGTGCATCAATTGCAACAGTGTGGTAATAATCTCCTCCGCCTCCTGCTTGCGTTTGTTGCTGAGAAGCTTGATTGGTGGTTCATTTCGTTCCCGGATCGTTGCACGGTAGAGCGTGGAATTGGTCTGCTGGGTTGTAGTGTTCTGCAGTTAGCGCAGATTTATGAAATCCATTTGTCTCTGGTGTGAACTTTTGGTTCGTCCGTATGTTTAAGCTTCAATGTTGGTTGGATGATGATAGGGCGGCTCGTTCGTTTCTGATACAGGGATGACATCTGAGAATAGTGAATCCGTTGCTATTAGCTGTGGTTAGTTTGGTTTTATATGTTATATGATTGGTTAATCAATAGGGAAGGTAGTTCTTGGCTCCTGAGTTTTATTGGCTCGTGAATTTCATTACTTCATGCACAGTTGTTTGTATTTGATATCTAGTCGCTAAGTTGGCTGAAATATGAGCCGCTGAACTTTTAATACTCTACTCCCTCCATCCCACAAAATTTCAAACCCTAGCATTCCAAGATGAAATTAAGGAGGAAGGCAAAATACCAAAATGTCCCTAATTAATAGGAAAGTTGTATTGATGGATGGGTAGGTGAGGGGTATTTAAAGGATAAAATTTCTTGATTTGTGAACTGGTGGTAGGTAAGAAGATAGAAATTGGTTTATTTTGGGACAAAATTCAAACATAGAAGTTGATTTATTTGGGGACGGAGGGAGTACATGTCAGCAAGTGCCTCCGCAACAGTGTGGTAATACTCCCAAGTGCCTCTGAAATTGTTTAACAATTGTTTGTGCCCTATTTTTGCAATGGTTCACAAAATATGACCAGCGGTTCAGCACCATGTTTTCTTTTAGTTGCACTTCTAAGTGAACTCAGATGTCATTGTATTTATTATGTTAACTGAAGCACATAATTGTTTTGTTGCAGGGGCCACAATATGTATGTACCAATTTCTGGACCTTCATATGCTTGTCATGCAGTGGAATACAGTAAGTATTTTGTTCCATTTATCTTGTCGTACATGCCAATTTCTGGTCCTCAGCTGATTTCCTTCTTCGTTCTAGTTTAGAGTTAATGAAGGTCTATTCAGCTTTTGCTCATGCAAGAAAATTTGTGTTCACTTATCTATTGAGCAATGATACTTGCAAGAAGATGTGTGTTGTGGTATCTGATGCTAAGAATGTATGGCATGGGGAAATATAAAGCATTATTTATGGTCCATTTCTTACAAATAGTTCACAATCTAATATCACAGATTCACAGTTGTTTATTCAGCTAATGTCACTCCATATACGGAATTTTCTATTTCATTATTTGCGACTCCGTGGCATGTTTAGCTCAAGGATTTCGATTATCCTAGGATGGGTTGGCCCATCATAATGTTAACCCATTCCATAGTTTTTGTGGGAGGACCCCGTTACTTAGTTTCCATTATTATTGCGGCTATGAGAAAAAAAGGTGGTGATGAATCTGTCTTTCATTCTTGAAACATGTGTTGTTAGGGTTTGACTGGTTTAAAAAATAATTTTCAAAAATAAAGAAAGAAGTGAATGAATTTGGCAGAGAAGTACTTAATCGGATTTGGACCACTGACCCACGTCTTACCACTGCATTAATCTAACATACATTGTTGCTGTACTGTTGGTATTTGATAGGAGTAGTAATCTCTTTTTTTTATGTGTTAAAACAGCCGGGAGTTTACCCACCGTGTCAAGTCAGTGTCAATGGCTAAATTCACTACTCAAGAAGTGCGGTCTCTTGAACAGGGAGGGAACCAGGTAATTCCGGGAATTACTTTGTTTTGTCCTCTTTAGACTTTAGAGTGACCTGGTCATATGCTTACATGGAGGTCATGGGTGCAGCGAGCACGTGATATCTACCTAAAAGATTGGGATTGGCAACGAATGAGGTTGCCTGACAATAGGTGAGTTTGTTTTCATTCCCATGTGCCGTGGAAACTTCTAGTACATTTCTTTATAATTATTCCGCTATGTTTTATTTCAGCAATCCAGACAGGATAAGGGAATTCATCAGAGCTGTTTATGTAGACAAGAAGTATGCTGGTGGGAAGTCCACGGACAAACCAGTCAATGATAGTGAGGTAATGAGTTTATAAATCTCAATGGCTGCTGATATTTGATATCCAAATATTTTATTGTCCTTAAACTATTTATGCTGCAACCTTTTCATTATTTTCAAACTTTTCATTATTTTCCACATTCATTTGCTGACTATAGATTTCAAAATATTTGAATAGAGTGTAAAGAGCAGCGAAAATGATACTAGAAGACCTAGCTCCTACCATTCGTATTCCCAAAGCCCACCTTACGATTTTCAATATGAAGATAGACGATATGGTAAACAAGTGGACACACTTGCACGAAGGCCTTCAGATAGGGCACTCTTTGATGGGAAGCTTGGCAGTTTTTTATACAGTCCAGGTCGTTTGAGAGATCAGATGCATGAAGATCGATTTGCTAATGAGAGTACTGGGTCAAGGTTTTCTGATTTTTCGGCCTCAAGCACTGGTGACATTAGAAATGATGTGCTTTCTCCTAGCTCTCAGGATACAGGGTACAGCAGTCCTTCTATCCACCATTCAAGGAATGTGTCTTCTGAAAATCCTCCATCCCATCGGCATCCGAATGCAACTTCTCAAATTGATTTTAATGGAGTCCGACGATCACAGGTTAATGTTCTCCCCATTCATGTTATATGTTTCCAGCTAATGCTCATTGACTTAAAACCAACTTCTGAGGTAGAGTGGTTTGAAATAAATATACCTTCTTTCTATGTGCAGAGAACAGGTTCTTCAGGAAGTTTTGGATCATTTGATGGTAGCTCAGCATCTAATAAGTCAGTTGATTCAGGTGCCTTACCTGATGCACCTACAGAAAAGCCAGTGAATTCTGCTGTAAATCGTCAGTCTGTTGCGCCCCCCATGGCTCATTCAGCACAATTGTATGCCTCGCAGAGCAATATAAACTCTTCAGTCAGCCAAACTGCTCCCACCAGGGAATCTGTGCAACATGGAAGGGTTCACATGGTCTCTGTAGCAAAGCCGCCGGTTTCAACACAGCCAACGACTTCCACAAATCAGGACTTCTTTGATCAGTCAATGCAACATCCGGTCAATTCTGCAGCACCAATAGATCTTTTTGCTGGCTTTAACCAACAGGCTCCATCAGTTCCCCATAGAGCAGTTGATGTAGGCAGCCATTCTGTTCCTAAAGAAACTCTGCATGACGTTGTGGTTCAGAAAGCCGTGGCATCTTCACCACCTGTTCAAGCCGAAGCACCCTCTACATCTCATCCTGTCCATCATGATCTCTTGAGTCTGTCGCCTTTGCAGGAACCTTCAATTTCCTCTACCCCTCCGTCAATAGATTTATTTGCTGGCTTTGACCAACAACTGCCACCTACAACTAGTGTTCAGCAAAGTCAACCAGCCGAACCATCAATTTCCTCTACCCCTCAGTCAATAGATTTATTTGCTGGCTTTGACCAACAACTGCCACCTACGACTAGTGTTCAGCAAAGTCAACAGGCAGCCCCATTGGTTGCTGACGAAGGATGGGCTTTCTTCCTCGATACACCTCAACACGTATCTCCGACTTCCATTTCAAACGTGCAAGCTCAGGTAGCCACCGCAATAGCTGCATTCCCTCCAAGTGAGAGTCTTGCTAAAGGAACTAATCAGTCAATGTTGCCAACTTCGCCACCAAATGCTTTGATTCCACAAAGTTACCCGCTTATGATGGATCAGTGGAGTTTAAATGCTGAAGAGGTGAAGACCCCTGTCTCCAAAGAAACCTCACAGGTATTTCACCAGTTGGAATATGACCTGTTAGAGATTTGCTCTGCTTGCAAATGTTTACTATGGACTATTTCTCCTTGACTATTTTCCAGCCTTGGAATGCCTTTGGTGCATCTACTGGGAACACACCCAACGACTCATTCACATTTAACACTATCTCTCAAGTAGCACCTAATCACTTCAATGTGCCTAGTGTTCCACATGCTGAAGCCAGAGGTCCACAGGTGAGCATGTTTGATTTAATAACTCTGAGATTATATAAAGGCTAGATTTGTCATATTGAATCATTTTACAGGATTTGCCTAGCAGTGAACCTGAAAGACTAACCCCTGGGGATATAACCCCTGGTTTCAATGTCTCTCCTGGTGACATGGCTGGGCCATCATTTCGTGGACCACTTCAACAGCAACTGGTATGTTTTATCAATGATTCAAGATTCTTTGCTCTGCAAGCTTTCCTGATTTGTTCTACAACAGTTTGATTTTGATTGAGAACAAGCATATACAATTTTTCTGTTACTTCCCAACTTATGACAGATAGTTTTATCCTTTTTATTCCTGGTATCTAGTTTACCATGATATTGTTGGCTCATCGCTGAATGGACAATTTATGAAATTTGGAACCTGTTAGAAAGATGATGCTAGACTGGATGTTTTTTTTATCTGTATGGATTGCTGAGATTATTAATGCACACAGACAGAATGGTCTTGTAATTTTGCATGTAAGCCTTTTAGTTATTTTGCTTGTTAATCTTGTTATAGTCTGTATTCACCTACAGTGAGTACTTTCACTTTTTTCTACAATCTATTGGTTTGGGACTTTGGGCACAAATGATGATGCCTGTCGTGGGGCGCTACCTGGAGCCTTACTATGTCAGTTTTCTAAATGGTTTGTTTTGCTTTTTAACTGTTCTTTTGAATTTTGTTTCAGGACATCGTGCCATCTCAGCCTGCAAAATC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