BGIOSGA004742
| Gene Name |
BGIOSGA004742 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004742, complete gene. |
| LocusTag |
P0460C04.12 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004742-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004742-PA |
| Length |
4617 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39068206..39072822 |
| Sequence Coding Region |
39068206..39068491,39068890..39069507,39070290..39070590,39070695..39070974,39071273..39071380 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39068206..39072822 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:39068206..39072822 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGCCGGGCCTGGACGAGGTCATGGCGTTCCTCACCGACCACGGGTTCGCGGGCGCCGCCTCCGCGCTCCGCGACGACGTCCTCGCCCGCGCCGCGTCCGCCGCCGGGGACGCCGGCTCCGATTCCGATGCCGCATTAGATCCCCAGCTCCCGCCCCTCCGGTTGCCGGCGTCCACGTCCGGAGGCGGTGGGGCGCCGGCGGCGCCGCCTGCAAGCCCTGGCTCCAGCTCTGACTCGGCGTCGTCCTCTGCCTTCGTCAGCATGCGCTCCTCGCCCTCAGGGATGCTGAATCCATATGGAGTCTGGTCGCCGCGGCACTCGGACACGTCGTCATCGGAGATGGAGTTTGGCACAGCGCGTCAGTACGACGCCACCGACTTCTTTTTCCAAGAAGGTTGGCTTTACGACGACCATCTCTTCCATAGCAAGTCGGAGCTGGACGACGACAATGGAGAAGACAAAGAGGAGGACAAGTTTGTTCTTGGTGTCCACGATGGCTCAGGGAGGATAGAGATGGGAGTGCTTAGTGCCGGTGATGACCACCGTCATGAACATGTTGGCAATGACGGCTGTGAGGGATGTGCTGAGGTGTACACATGTTCATCACCGCTCTGCGGATGCTGTGGCGAGGGACTGAAGAACGGGGGGCTAGAGGTGGTGAAGGATTCTAGCTCCACTGTCTATGGGAGGTACCAGATCATTGATGACCAGACAGAGATACTTGATGAGTGTGGCATGGATGGGTTTCAGTTGAAGCACCCTGCGGATGTTGTGCTTGAGTGTCATTTGCCAAGAGATTCTGGGGAAGGAGATGAGCGATCGGAGCTGAGTGTAGTGGAGAAGGAGCTTCAAATGCTCAGTTCATTTGGTACTAGGGTTGATGCAGATGCTTTTACAAGTCCTGGACTTGTACACGATATCACAGACAATGCCAAACTGGATGATAGCATTGAAAAGAATATGAAAAACAGTAGTGACAAATATCTGAAGGAAGGTTATAGCATAGAGCCTTTCCCTGAGAGTTCTGTTGATGATACCTTTGAGTTTGGAGATATTGGACCATTGAATACTGATGCGCAAAACTCAACTGCTGCTAAAGCTGAGGAAGAAAATCCAGAGACAAATGTTGATCTCGCTCTCGCTAATTTCCATCGAGAATATGAGGTATTTGAACTGAGAATTGTCCACCGCAAGAACAGGACCGGCTTTGAAGTAAGCAAAGATTTCCCCATTGTCATAAATTCAGTTATAGCAGGAAGATATTATGTCACTGAATACCTTGGCTCAGCTGCATTCAGTAAAGTTGTGCAAGCACATGATCTTCAGACAGGAACTGATGTTTGCCTTAAAATAATTAAAAATGATAAGGATTTCTTTGATCAGAGTCTGGATGAGATCAAGCTTCTGAAGTTTGTGAACAAATACGATCCATTAGATGAGTATCATGTGTTGCGTCTCTATGACTATTTTTATCATCAGGAACACCTTTTTATTGTCACTGAATTACTGCGAGCAAATCTATATGAGTTCCAGAAATATAATCAGGAATCTGGTGGTGAAGCATACTTCACATTGCCTAGAATACAGGCAATAGCTCGGCAATGTTTAGAAGCCTTGGTATATTTGCATCATTTAAGGATCATTCATTGTGACCTGAAGCCTGAAAACATCCTTATCAAGAGCTACAGCAGATGTGAAATTAAGGTTATCGATCTTGGAAGTAGTTGCTTCTTGACAGACAACTTATGTCTCTATGTACAATCACGGTCATATCGAGCTCCTGAGGTCATTCTGGGGCTTCCTTATGATCAGAGGATTGATATTTGGTCTCTTGGTTGCATCCTTGCGGAACTCTACACTGGTGAGGTACTATTTCCTAATGAACCAGTGCCCATAATGCTTGCTCAAATGATCGGGATAATTGGCCCAATTGACATGGAAATGCTTGCCCTGGGAGAGGAGACGCAAAAGTATTTCACTGATGATTACGACCTTTTCACCAAGAATGAGGAAACAGATCAATTCGAGTATTTGATCCCAGAAAAGTCTTCTCTGCAGCATCACTTACAATGCCCTGATTCAGAGTTTGTTGATTTTCTATCCTATTTGCTGCAAATAAACCCCAGGAGAAGACCAACGGCAAGTGAAGCGCTACAACATCAATGGCTTTCATTTGCATACTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAPGLDEVMAFLTDHGFAGAASALRDDVLARAASAAGDAGSDSDAALDPQLPPLRLPASTSGGGGAPAAPPASPGSSSDSASSSAFVSMRSSPSGMLNPYGVWSPRHSDTSSSEMEFGTARQYDATDFFFQEGWLYDDHLFHSKSELDDDNGEDKEEDKFVLGVHDGSGRIEMGVLSAGDDHRHEHVGNDGCEGCAEVYTCSSPLCGCCGEGLKNGGLEVVKDSSSTVYGRYQIIDDQTEILDECGMDGFQLKHPADVVLECHLPRDSGEGDERSELSVVEKELQMLSSFGTRVDADAFTSPGLVHDITDNAKLDDSIEKNMKNSSDKYLKEGYSIEPFPESSVDDTFEFGDIGPLNTDAQNSTAAKAEEENPETNVDLALANFHREYEVFELRIVHRKNRTGFEVSKDFPIVINSVIAGRYYVTEYLGSAAFSKVVQAHDLQTGTDVCLKIIKNDKDFFDQSLDEIKLLKFVNKYDPLDEYHVLRLYDYFYHQEHLFIVTELLRANLYEFQKYNQESGGEAYFTLPRIQAIARQCLEALVYLHHLRIIHCDLKPENILIKSYSRCEIKVIDLGSSCFLTDNLCLYVQSRSYRAPEVILGLPYDQRIDIWSLGCILAELYTGEVLFPNEPVPIMLAQMIGIIGPIDMEMLALGEETQKYFTDDYDLFTKNEETDQFEYLIPEKSSLQHHLQCPDSEFVDFLSYLLQINPRRRPTASEALQHQWLSFAY</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..286#685..1302#2085..2385#2490..2769#3068..3175#3441..3719#4158..4301#4444..4617#ATGGCGGCGCCGGGCCTGGACGAGGTCATGGCGTTCCTCACCGACCACGGGTTCGCGGGCGCCGCCTCCGCGCTCCGCGACGACGTCCTCGCCCGCGCCGCGTCCGCCGCCGGGGACGCCGGCTCCGATTCCGATGCCGCATTAGATCCCCAGCTCCCGCCCCTCCGGTTGCCGGCGTCCACGTCCGGAGGCGGTGGGGCGCCGGCGGCGCCGCCTGCAAGCCCTGGCTCCAGCTCTGACTCGGCGTCGTCCTCTGCCTTCGTCAGCATGCGCTCCTCGCCCTCAGGTAGTTAGGGGATCAGGGCACAAGGCTGAATTTTTTTTTCATCATCTCTCAGCGTTAAACCCATCTCTTCTCGTTTTCCGAGGTCGTCAGTTATGTCGCGCGAAATCTCGATCTGTGCGCCGATGTTTTTGGCGGCTATGGTTGGCTTTGGGTCCAATTCGAACCTGCTGGATCAAAGCCAGCATATCTCTGTGCATATGTTCATGGAGGAAAATTGTGATCTTTTGATCTAGTAGGGTGCTGGTTAAACCCCTTCCCCTGGGTTTTGTACACCAATGATACTGCTTGTCGTTAAATTCTGATTTCTCAGTATAGTTGAGTGTTCTAATTTGCGGATTTGTGGGTGTTTAAGTCACGATTTTGGTCCTAAATTTGATATATTTTGTTTGTGAGATTAGGGATGCTGAATCCATATGGAGTCTGGTCGCCGCGGCACTCGGACACGTCGTCATCGGAGATGGAGTTTGGCACAGCGCGTCAGTACGACGCCACCGACTTCTTTTTCCAAGAAGGTTGGCTTTACGACGACCATCTCTTCCATAGCAAGTCGGAGCTGGACGACGACAATGGAGAAGACAAAGAGGAGGACAAGTTTGTTCTTGGTGTCCACGATGGCTCAGGGAGGATAGAGATGGGAGTGCTTAGTGCCGGTGATGACCACCGTCATGAACATGTTGGCAATGACGGCTGTGAGGGATGTGCTGAGGTGTACACATGTTCATCACCGCTCTGCGGATGCTGTGGCGAGGGACTGAAGAACGGGGGGCTAGAGGTGGTGAAGGATTCTAGCTCCACTGTCTATGGGAGGTACCAGATCATTGATGACCAGACAGAGATACTTGATGAGTGTGGCATGGATGGGTTTCAGTTGAAGCACCCTGCGGATGTTGTGCTTGAGTGTCATTTGCCAAGAGATTCTGGGGAAGGAGATGAGCGATCGGAGCTGAGTGTAGTGGAGAAGGAGCTTCAAATGCTCAGTTCATTTGGTACTAGGGTTGATGCAGATGCTTTTACAAGTAAGTACTTCTGAAGTCTTAAACTTTCTGCTTGATTTCACCCTTCAATATTAGTACTCCACTAAATACAGTATTTGTACTAATTTTCAACATTAACCCTCTTTGCTCCGATGAAGATATTATGAATTTATTTATTGAAGTGGGAGAACAGGGTTGAATTACAGCATTAAAGAGTTTGGATACTGTTAGGCACCGTTTGGATGCTAGAATTGAATTGTGTAGTTATCCCAAAAAAAAAAAGAATTGAATTGTGTTTGTGGAAATGGTGGTCCAATTCAAATTTCAACTATAATTGGTGTTGGGATCCAATTCAACTTGAATTGTGTATGAGTGGTGCAGACAATGCTGAATGAGAGATGTTTTGTTACTGTTGTAAACTGAAATTTGCTGTTAAATATGCACAGAGCTAAAAAAAAAATGGTGCATTTTAGTGGTAACCTCTTCCAGAAACATTACTGCTGTTATACGATTATGCTTCACATGGGTTTTCTCTGTATATTAGAAGAATTGAAAATTTTCTTCTGCTCTTCAATATAATATGTAACTTGGTTTTGGTAACACTACAGAAATGAAATGAATCTGGATTTAAAAATGCACATTTGAGGAGACATTTTTTAACAAAGAAAGGCCAAACCTATTTTATTATCAGTCTTGCTGAACTGTTGTTTGTTTACCAACGTTTGTGTGAATTTGCAATTTAATTCCAGTCATCTTCTTATCCTGTATAAAGATCATTTGCTGCTTGCTTCGTTAGGTTTACTGTAAATGTTTGTTGTCTTTAGGTCCTGGACTTGTACACGATATCACAGACAATGCCAAACTGGATGATAGCATTGAAAAGAATATGAAAAACAGTAGTGACAAATATCTGAAGGAAGGTTATAGCATAGAGCCTTTCCCTGAGAGTTCTGTTGATGATACCTTTGAGTTTGGAGATATTGGACCATTGAATACTGATGCGCAAAACTCAACTGCTGCTAAAGCTGAGGAAGAAAATCCAGAGACAAATGTTGATCTCGCTCTCGCTAATTTCCATCGAGAATATGAGGTATTTGAACTGAGAATTGTCCACCGCAAGAACAGGTTCACAATCACTTCTTGTTTCTCCCTTCTCTTCTTCCATTTTTGGTTGGTAAATGATACTTCCAAGTTAATTCTTATGCTCATATAGCATGTCTTCACTGCAGGACCGGCTTTGAAGTAAGCAAAGATTTCCCCATTGTCATAAATTCAGTTATAGCAGGAAGATATTATGTCACTGAATACCTTGGCTCAGCTGCATTCAGTAAAGTTGTGCAAGCACATGATCTTCAGACAGGAACTGATGTTTGCCTTAAAATAATTAAAAATGATAAGGATTTCTTTGATCAGAGTCTGGATGAGATCAAGCTTCTGAAGTTTGTGAACAAATACGATCCATTAGATGAGTATCATGTGTTGCGTCTCTATGACTATTTTTATCATCAGGTATATCACTTAAGAAATAAAGTTGACTAAGATACTCCCTTTGCATTGATGTTATGCTGCATACTTTTTGGCTATTCGGAAGCTAAGGAAGTTTGAAAGGGATATATTGTTGGTCTTTGGCAACTTTGAAAAGGATCTATGATGGCTAAAAGCAATATAGCTTCTTATTTTCAGTTGATTTCTTAAATTGCTTGCATGCTTGTTTAATTGTAGAAAAATCATAGAATTTATTAGTACTTTATTTTTTGCGGTTGCAAAATCATAGAATTTCTGTAACGGCATATTGACATTGCAACAGGAACACCTTTTTATTGTCACTGAATTACTGCGAGCAAATCTATATGAGTTCCAGAAATATAATCAGGAATCTGGTGGTGAAGCATACTTCACATTGCCTAGAATACAGGTATGTTTGACCGTTCTATACTAAGATGCTATCTATAATTGTTGCATATGCATAGACACTTACAGTTCAATTTGTAGTATGCACGATATGCAATGTTCCAAACCAATTTAATATGCTTCATTTAAACATAAAGTTTTTGAACCGTAATTGATCATTTTCTTGGAATGATACTGCTGTAAATAAAATGATTAACTGTTTTAAGTGCAATTAAATTTAACTTAAGAAAAAAGGTTTTGATGAACAAAAGTTCCCCCTTTTCTTTCAGGCAATAGCTCGGCAATGTTTAGAAGCCTTGGTATATTTGCATCATTTAAGGATCATTCATTGTGACCTGAAGCCTGAAAACATCCTTATCAAGAGCTACAGCAGATGTGAAATTAAGGTTATCGATCTTGGAAGTAGTTGCTTCTTGACAGACAACTTATGTCTCTATGTACAATCACGGTCATATCGAGCTCCTGAGGTCATTCTGGGGCTTCCTTATGATCAGAGGATTGATATTTGGTCTCTTGGTTGCATCCTTGCGGAACTCTACACTGGTGAGGTAAGAAGCTTCTGTACCTTGCTAATCCTTCTTTTTGGACACGTGCTGACCTTTTAGCTGTGTTAAACCCATAGTGGCCTGTTGTCATACAGCACATAGAATTTTATGGAGATTTCAACACACTGCATTAATAGTGAAGTGCTGTGTTGGCATGTTTGATACCTTCTTTCTTGTCTAAATGCTATGCAACATATAGCTCCAAACAGAAAATAGAGATCAAACTTCTGTGCCAGAGTTTTTTTTTTTTGAACGAATGCCTGAGTAAATTTTGGGGCACAAGGACTGGCTTTAATAAATAAAGACAAATAAGAACGTTTTACATGGAAACGAATAATGTGCTTCAAGTTGTTTTGTTGTTATCCATATGGAAACAAAGTTGTTTTAAAATTTAAAAATGCTAATCGTCTAATTATAATTCCTAACTGGTACACATAACAGGTACTATTTCCTAATGAACCAGTGCCCATAATGCTTGCTCAAATGATCGGGATAATTGGCCCAATTGACATGGAAATGCTTGCCCTGGGAGAGGAGACGCAAAAGTATTTCACTGATGATTACGACCTTTTCACCAAGAATGAGGTACACTATTCTTAGTGCTAGTGGAAGTAGCCTTTCCTGTGACCACTCGAATTTCATCATGTCTATCTCTCTCTGTGGACTGTGCGAGTTATAACACATTGAACACTGAACTCATTTTGTTGTTTACCTCATTTCTATTCAGGAAACAGATCAATTCGAGTATTTGATCCCAGAAAAGTCTTCTCTGCAGCATCACTTACAATGCCCTGATTCAGAGTTTGTTGATTTTCTATCCTATTTGCTGCAAATAAACCCCAGGAGAAGACCAACGGCAAGTGAAGCGCTACAACATCAATGGCTTTCATTTGCATACTAA</dnaseqindica> |
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