BGIOSGA004792
| Gene Name |
BGIOSGA004792 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004792, complete gene. |
| LocusTag |
P0005H10.2-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004792-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004792-PA |
| Length |
3713 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:39820615..39824327 |
| Sequence Coding Region |
39820615..39820768,39822057..39822218,39822555..39822733,39822808..39822903,39822995..39823064 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:39820615..39824327 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGATTTGGCGTGTCCCTAATTATGATGTGTTGGAGAAGTGTACAGAAGATATCCTCTCTCTAATCAAACCAGTGGAGGGTGACCGAAACAAACGAATATATGCAATTCAGGAGCTGGCAGATACAATCTATTCAGCTGGGGCCTTGAGAGGTGCTTCTGTAAAACCTTTTGGATCCTTCGTATCACAACTTTATGCAAAATCAGGTGATTTGGATGTGTCAGTTGAGCTGTTCAATGCCTTGAATCTCCCTATAAGTAAGAGAAAGAAGCAAGATACCCTGAGAGAAGTAAGGAGAGCTTTGCAAAAGCGAGGTATTGCTAGACATATGGAGTTCATTCCTAATGCAAGAGTTCCAGTCCTTCAGTATGTGAGCAACCAATATGGTATTTCCTGTGATATATCCATTAGCAATTACCCTGGTCGAATTAAATCGAAAATCTTCTACTGGATCAATACTTTGGATGATCGCTTTGGTGATATGGTTTTATTGGTCAAGGAATGGGCCAAAGCTCAAAACATTAATGATCCAAAAAATGGAACCCTGAATTCCTATTCACTTTGTCTACTTGTTCTCTGTCATTTTCAGACATGTGAACCTGCAATATTACCACCGCTGAAGGAGATTTATGAAGGGAACATCATGGAGGACATTTCAGGGAGGGCGTACTATAATGAGAAACATCTTGATGAGGTTTGCTCCATAAATATAGAAAGATTCCGGCGCCAAAATATGGGGCAAAGAAATCAGAGCTCTCTTTCTCATCTACTTGCATCATTCTTTCACAAGTTTTTCCGCATCGATGCCCTTTCGGATAAGGTTATATCGACTTACACTGGTCGGTTGGAGAGAATCCAGGACAATCCAAGATGGATGGACAAGTCATACAGCTTGTTTGTTGAAGATCCATTTGAGAAACCTGATAATGCTGCTAGAGCAGTCGGTTCCTTTGAGTTCCAAGATATTGTCAATGCCTTCAGCAACGCGAGCAATAAGTTTGTTTCTGATGCGCATGCGCTTACTGACCGAAATGGATTATTGTCACTGCTTTGCACACCTGATGTTGGATCAAAACTTGGTGGAAGAGCCAGTGCCAGCCGTTATACAAATACCTTAGTGAGTCCTCATGACAGATTTTTATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSIWRVPNYDVLEKCTEDILSLIKPVEGDRNKRIYAIQELADTIYSAGALRGASVKPFGSFVSQLYAKSGDLDVSVELFNALNLPISKRKKQDTLREVRRALQKRGIARHMEFIPNARVPVLQYVSNQYGISCDISISNYPGRIKSKIFYWINTLDDRFGDMVLLVKEWAKAQNINDPKNGTLNSYSLCLLVLCHFQTCEPAILPPLKEIYEGNIMEDISGRAYYNEKHLDEVCSINIERFRRQNMGQRNQSSLSHLLASFFHKFFRIDALSDKVISTYTGRLERIQDNPRWMDKSYSLFVEDPFEKPDNAARAVGSFEFQDIVNAFSNASNKFVSDAHALTDRNGLLSLLCTPDVGSKLGGRASASRYTNTLVSPHDRFL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..154#1443..1604#1941..2119#2194..2289#2381..2450#2546..2676#3256..3363#3468..3713#ATGTCGATTTGGCGTGTCCCTAATTATGATGTGTTGGAGAAGTGTACAGAAGATATCCTCTCTCTAATCAAACCAGTGGAGGGTGACCGAAACAAACGAATATATGCAATTCAGGAGCTGGCAGATACAATCTATTCAGCTGGGGCCTTGAGAGGTAACTCACACCTAAAGTTACCACATAACCCCTGTATTATTTGAAAATCTTCCGTTGGGTTCCTTGTATTTATTGACGGTATGGTGTTGTGATGTTTCTACATCAAGCTTGGTTAGACTTATCTATGATCTTGAAGAGAAAATGTGTTTTCCACTTTATTGCTGTGAATGCTAGCTTGGGCATGGATTTCTGATAGATCTCTGAAAGAAAAGACCCAGTCTTATAGGTGTAAGGTGCCTCTGCGGTGCCTATCGTATTTCTTGTTATATTCATAAGGAACCTTAAGTTTTAAAGTTATCATCACACTTTGTCTGGGCAATAGTTTGAAAATACAATGAGTGACATATTTATGCAATCCATAGTACTTAAAAGTGATGTGTTTGTTTTGTGATCGATGCTAGAAAATGGTCTTCATGCTGCGATTGCTGTATGGCAATGGGAACTCTACGGCAGACCCATGAGGTTGCTAGCAGGCAACTGTTGACCTATGACAGTTCACAGTACACAGTAACCGTTAACCAACAATTTGTCATATCATGCCTGACAAATGACAATCACGATAAGCTTGTGTTGCTAGAATTAAGGGTGGGCATAATTACCTGAAACCAAAGAACCAATCCAAACTAACTGAGACCAAATACTTATGTCAGAGTTTCTAACTAACCGAATTTAATTTGGTTATAGGCCTGGTTAACCGAATTGACCGAAATATAGTTAATAAGCGCAAAATCAACCTGTTAAGCCTATTAAGTATCATGTTTGAACAGTTGAATTTTGATGTTAAGTTGCAAGTGCTATATTTGTGTTCTATATCATTTGTTGTTTATTTTGTGACTTTTTACTGTCAAACATGTCCTGAAACTGGGGAATTGCTGCCAAATTTTTTACTACCAAAACATGTCCTGAAATTGATCAATCAGTTCGGTCATGACCTAGGACCGAACCAAAATGACCAAAACCAAATAGCTTGGCCTTTATGATTTTGCATTGAATTTCGGTCTTGATTTTCGGATGGCCAAAATTCGAGAAGACCAAAGAATCAATCCGAATTAATTGTTCAAACCGAATGGTTACCCATAGCCAGAATGGAGCTGCTCAAATGTCACATAATGTTTTTACTGGATTTTTTTTTTTTTGGTTACATTCTCTTGTTATACAATGGATAGTGTCTTCCTCAATGCATATATTATTTATAAGTTTGCATGTTGGAAAAGGGTAACTGTTAGAGAAGTCAGCAGTGCAATTATTTTAGTGTTTCTTTTTCTGAGTTCTTAACTTTCCTTTATAGGTGCTTCTGTAAAACCTTTTGGATCCTTCGTATCACAACTTTATGCAAAATCAGGTGATTTGGATGTGTCAGTTGAGCTGTTCAATGCCTTGAATCTCCCTATAAGTAAGAGAAAGAAGCAAGATACCCTGAGAGAAGTAAGGAGAGCTTTGCAAAAGCGAGGTAAACTTTCTTTTCGATTAATGAAAACAGCTTTAACCGAAATGATAGAAGTTTTGGTTGTGTGTTCTTTGTGATCAAACAAATAGTCACTATATGCATATACATGCACCAAGGAAAGCAATAAGTGGGCTTTGCGCGTCTTTGATGCAGCGGCCAGGTTATCCATTATCTAAAAAAAAAAAGGAAAGCAATATATCTTGTGAGAGGTGAAGTCACTGTAATGAATAAGTTTTGATCAAGCTATTCACGATCTTCTTTTTGTTCCGTACTTCATTCAATGCAACCCTTTTTGTTGAATTTACAGGATATTCTTATCTGTTTTCATTCCTTATTTAGGTATTGCTAGACATATGGAGTTCATTCCTAATGCAAGAGTTCCAGTCCTTCAGTATGTGAGCAACCAATATGGTATTTCCTGTGATATATCCATTAGCAATTACCCTGGTCGAATTAAATCGAAAATCTTCTACTGGATCAATACTTTGGATGATCGCTTTGGTGATATGGTTTTATTGGTAAGCTCTGTGTAACCAAGAGAATTCTCTTTTTGCTACAATCTTCCTTTTTGTTAAGCCATGTTTTTTGGCAGGTCAAGGAATGGGCCAAAGCTCAAAACATTAATGATCCAAAAAATGGAACCCTGAATTCCTATTCACTTTGTCTACTTGTTCTCTGTCATTTTCAGGTGTTATTTCTTACTTTACAAGTTACCTCTATTTCTTATTTATTGTTCCATTAAAGTTATCTATATGCGTTCTTTATTCTGAGCCTTCCAGACATGTGAACCTGCAATATTACCACCGCTGAAGGAGATTTATGAAGGGAACATCATGGAGGACATTTCAGATAAGATTTCATTATGGGAATATGGCTTACCTGTGATGGATAGTGACTATCTATTTGTCAGTGCCTTGCTGTTTAACTGCTGCATTCACATACAGGGAGGGCGTACTATAATGAGAAACATCTTGATGAGGTTTGCTCCATAAATATAGAAAGATTCCGGCGCCAAAATATGGGGCAAAGAAATCAGAGCTCTCTTTCTCATCTACTTGCATCATTCTTTCACAAGGTAATTGAACTTGTGGCCACTATATTGGCTAGTCAACCTTGTCTAAGAGAGTATGACTTCCTTCTAAGTACTGTAGTTCTGTTGTTCAAATACAGGTGTATGTTTTATTCTTGTCTTTAGGCATGTATCTCCACATTTTGTTCTTAACTATGTTAATGAATCAACACTGGCATTTTTAGGCCATATATGGTCTCTCTTGAGCTTGTTCAGACATATTTGGTCTGCTTAATCTAACTCACTGGGGGTGTAAATCCAATGACGACGACTCATATGTAACCTTTTTAGTAACTAGTAGCTATCAAATTGTCAGTACATGAGCTAATCTCATCAGTGATTTCATGTTGCTTAACTCAAGATAGTCAGTAAAATACATTTAAAAGTTATCTGCAATTCAGCATTTGTAGTATGTCTACGCAATGAAATTTGGCCTGAAACTTCCCCAATACCAAGGTTCAAGGGCTAGTGTCAAAATTGTAGCCTTTAGTTTTCTTGCTTTGTATCTGGGATTATTGCATCTTTCTTTAGTTTTTTAACCTGAAGAGCTAGATGGGCTTAACCAGCAATTTATATTGCCTGCAGTTTTTCCGCATCGATGCCCTTTCGGATAAGGTTATATCGACTTACACTGGTCGGTTGGAGAGAATCCAGGACAATCCAAGATGGATGGACAAGTCATACAGCTTGTTTGTAAGGCTTTCCTTTTTTATGCTTTTGGTGGTTATGATGATTGATGTTGCTAAAAGTTTTAGCCCAAGTGCTGATATTCTATCTACTTGCTATTTATTATGTAGGTTGAAGATCCATTTGAGAAACCTGATAATGCTGCTAGAGCAGTCGGTTCCTTTGAGTTCCAAGATATTGTCAATGCCTTCAGCAACGCGAGCAATAAGTTTGTTTCTGATGCGCATGCGCTTACTGACCGAAATGGATTATTGTCACTGCTTTGCACACCTGATGTTGGATCAAAACTTGGTGGAAGAGCCAGTGCCAGCCGTTATACAAATACCTTAGTGAGTCCTCATGACAGATTTTTATGA</dnaseqindica> |
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