Os11g0540100
| Gene Name |
Os11g0540100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Xaa-Pro aminopeptidase 2 (EC 3.4.11.9) |
| Version |
NM_001074570.1 GI:115485788 GeneID:4350667 |
| Length |
11378 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0540100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:21550841..21562218 |
| Sequence Coding Region |
21551350..21551517,21552610..21552734,21552883..21552954,21553051..21553155,21553662..21553716 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:21550841..21562218 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:21550841..21562218 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcggcggcggcggggaggaatgctctcctggacgagctgcgcgcgctcatggcggcccactccccgccgctccacgcgctcgtcgtcccatccgacgacgcccaccagagcgagtatgtggcggagcgggacaagcggctgcagttcatctccgggttcaccgggatcgcccgcagcgctggtttggctcttatcactatgaaggaggcgctactgtggacggatgggcgttactttttgcaggcagagaagcagctcagtgatcactgggaattgatgtgcatgggagaagatccaccagttgaagtttggattgctgataacctatcagatgaagccgtcattggaattaatccatggtgcatctctgttgacactgcccaaagatatgagcatgcattttcaaagaagcaccagacactgtttcaactttcttctgacttggtagatgaagtatggaaggatcgtcctctggctaatactcagcctgtagtgcaccctgtcgagtttgctgggtgtagtgttactggaaaacttaaggagttaagaaaaaaattactacatgaaaaggctaggggcattataattgctgcccttgatgaggttgcttggttgtacaatattagaggaaatgatgtgcactacagcccagtggtccattcgtattctattgtaaccctgcacagtgctttcttttatgtggataacagaaaagtatctgttgagagctacatgtctgagaatggtattgatatcagagactataatatggttcaatcagatgtaagcttgcttgcatctggacagctaaaaggctctgcagttaatggtagctcacatgagggaaatggtatgaatgataattcaaaaattttgattgataattcgtgctgccttgcactctactcaaaactggatgaagatcaagttcttatactgcaatcacctgttgctctttcaaaggctgtgaagaatcccgtagagctggatggtttgaggaaggcacatattcgagatggtgtggctgttgtgcaatacctggcttggcttgacaatcagatgcaagagaactatggagcgtctggttactttagtggggccaagggatcacagaaaaaggagcatgtggaagtaaaacttactgaggtttctgtgagtgataaacttgaaggtttccgtgccgctaaagagtactttaaaggtccgagttttcctatgatttcagccgtgggaccaaatgcaacaatacttcactattcacctgaagcaagttcatgtgctgaacttgatactgataaaatatatctgtttgacactggggctcagtatcttgatggtactacagacatcacaagaactgtacattttggcaaaccatctgagcatgaaaagtcatgctacacagctgtgttgaaaggccacattgcactagacactgctgtatttcctaatggaaccacagggcatgctcttgatattctcgcacggacaccactttggaaaagtggtcttgattatcggcacggcacaggccatggggttggatcttatttgactgttcatgaaggtcctcatcaaattagcttcagaccttctgctagaaatgtaccactacaagcatcgatgactgtaacagatgaacctggttactatcaagatggaagctttggtataaggttggagaatgttctgatagttcaagatgccaatactaaatttaattttggagataagggttatttggcatttgaacatataacatgggctccgtaccagacaaagctgattgacgccactttgctggcccctgccgagattgaatgggtaaacacgtatcactcagattgccgaaggattttgcagccttacctgaatgagcaggagaaggaatggctgaggaaagctactgagcctattactgtgagctgttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAAAGRNALLDELRALMAAHSPPLHALVVPSDDAHQSEYVAER DKRLQFISGFTGIARSAGLALITMKEALLWTDGRYFLQAEKQLSDHWELMCMGEDPPV EVWIADNLSDEAVIGINPWCISVDTAQRYEHAFSKKHQTLFQLSSDLVDEVWKDRPLA NTQPVVHPVEFAGCSVTGKLKELRKKLLHEKARGIIIAALDEVAWLYNIRGNDVHYSP VVHSYSIVTLHSAFFYVDNRKVSVESYMSENGIDIRDYNMVQSDVSLLASGQLKGSAV NGSSHEGNGMNDNSKILIDNSCCLALYSKLDEDQVLILQSPVALSKAVKNPVELDGLR KAHIRDGVAVVQYLAWLDNQMQENYGASGYFSGAKGSQKKEHVEVKLTEVSVSDKLEG FRAAKEYFKGPSFPMISAVGPNATILHYSPEASSCAELDTDKIYLFDTGAQYLDGTTD ITRTVHFGKPSEHEKSCYTAVLKGHIALDTAVFPNGTTGHALDILARTPLWKSGLDYR HGTGHGVGSYLTVHEGPHQISFRPSARNVPLQASMTVTDEPGYYQDGSFGIRLENVLI VQDANTKFNFGDKGYLAFEHITWAPYQTKLIDATLLAPAEIEWVNTYHSDCRRILQPY LNEQEKEWLRKATEPITVSC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>10702..10869#9485..9609#9265..9336#9064..9168#8503..8557#7592..7672#7373..7507#6379..6442#4466..4533#4215..4301#2882..3127#2641..2763#2229..2510#1173..1312#374..446#77..187#gaccattacttcgtcggagaaaagaaaaaagagagaaaaattccaccgattcggaggaagtcgaagcggaggggcaatgtcggcggcggcggggaggaatgctctcctggacgagctgcgcgcgctcatggcggcccactccccgccgctccacgcgctcgtcgtcccatccgacgacgcccaccaggtctgctcttggcgccgcctcgtccgcggaatggggggaggcgattgatcggtcgggtcgggattagatccgatccgaccgagctccattttttttgttggattttgcgttttcagctatctctcctcctgttggttttgttggttcgtgctggtgattgaggattggcgcgatttgtgggtgcagagcgagtatgtggcggagcgggacaagcggctgcagttcatctccgggttcaccgggatcgcccgcagcgctggtatgttgcttcctcaacctcaatccatccgtcccttatgacttgtgagctcattctgtgctagttcaccagccgatgagttgggctgcgatgagttcaggataacttgccttggatctgtactgggtttgcacgatttggttaggttactgtttcggcaaccgcattacattctgtaatagtgtgatagaagtggcagaagtggattgttgaaatggttaagtatttagatcttctgcgtggcatggcatgaccgcaacgattggctatttttctcataggtttgcttaacacttagcgtggtttgttacttttgttgtgacgtgctaggcagcccagaaaagaaaatgcaaacatgggccacacatcaagcgtctttgtaatgtcaagtgccactccatccaaacttgtgcaatcaatgggtgctttaatcaagtataatcatgtgatggtaaattttttatagttttgttcactacttcactgcctatagacataaggcacaaaagtttcgtgtggctctttatgccattgcccattggggagacaacttttacaatttggggtggtacctcaaagtagttttgtactgggaagaacttaactcatttctgttttctactaggatggatgtaacataatgaactacttgtcgatttcttttgttttctggttatcatagatgcagtactttctcagttcatgtgtatattgggttctatacaggtttggctcttatcactatgaaggaggcgctactgtggacggatgggcgttactttttgcaggcagagaagcagctcagtgatcactgggaattgatgtgcatgggagaagatccaccagttgaagtttggattgctgatgtaagtcttgaacatctgttcttgagcatgttcacgaaattaattaattttctcagtctaacataaaaaatgtaggttcacacaacttgtacgtggaagttaatataatttagttatatccttcctatctctttttttttcaacagccaggtcaaagttttcatccttggtttttgaaatctgccacagtttttgtgttgtaaaatcccaaaaatggttttattcttgttaactttagcaagtttctctcctaaatgcggtctttatagctttgtttttagataaccatattcagttgtgttggtaatacctcaagcctactatctttctacctggctgctctggtagattcaagtaatcacatgatagccggtttgatacatgggacttcctttcaaaatttgtcagaaatatcagagttttggacacattaaattattgtgatcttagcaaatgtgaacagaattgaaagacaaaattggtgagatgtttgttttgttatatggagaaaatgtttattttattatatggagaaaacctatgcacaattatgccagttatggaatgataaatacattaataatatatctttcttcctggctgccagagtagattcaagtaaccagtgatagttggtttggtatacgggaattctgtccaaaactgccagaattatcagaattttggacaataatttattttgatcttatgaaatgcaatcagaaatttaaagacctgcacgaggtttctgttttgctatggaaaaaactatgaacaatcataccaattattctatgactagagagaatgagtttagttatttttttttgcattgtaacactactcatgatgaccatgttattttgttctgaaatagtattgtttctgactaatttgtttgttattgtgcaatcagaacctatcagatgaagccgtcattggaattaatccatggtgcatctctgttgacactgcccaaagatatgagcatgcattttcaaagaagcaccagacactgtttcaactttcttctgacttggtagatgaagtatggaaggatcgtcctctggctaatactcagcctgtagtgcaccctgtcgagtttgctgggtgtagtgttactggaaaacttaaggagttaagaaaaaaattactacatgaaaaggctaggggcattataattgctgcccttgatgaggtgctattaaacttatttgtttcttggtttcttattcagtacaatatatccaattgtgtatgttttgatttcttgaaattttgttaactttgccagttttaattattctccttttgttattcttatttaggttgcttggttgtacaatattagaggaaatgatgtgcactacagcccagtggtccattcgtattctattgtaaccctgcacagtgctttcttttatgtggataacagaaaagtatctgttgaggtcagttaatccactgaacatattttcttcaattataccattatgtctttcatagaatcgtagtcatgattttgaagggcatgtagtgaactgtgactcttatttagtcaaggtccagagctacatgtctgagaatggtattgatatcagagactataatatggttcaatcagatgtaagcttgcttgcatctggacagctaaaaggctctgcagttaatggtagctcacatgagggaaatggtatgaatgataattcaaaaattttgattgataattcgtgctgccttgcactctactcaaaactggatgaagatcaagttcttatactgcaatcacctgttgctctttcaaaggctgtgaaggtaaattttgcttccgttgtccctcttttatgctagtatttaacagatcatgtcggcagcttttccaatatactattcgtggatgaaaactgatgtatttacttgattatgggaaaaaaatattacacgttataaacctaacaaatagcttagaataagttgtctaagtaatacagtagaagattttttttttgagaattgtatttttagaagcatggagcaaataatctgtgacaataatccgattaataagcagaaaagaacgggatctaaaaccatgtgttttaatttatacttactctagtattgttaagagggtatatgcgtttcaagcatcttggaacttgctagtaaaacaacaacctgataattgaagtttgtagcctgagttgtatatatgagctcaatcaattaccaagagcttttgcctcctggttaggttgaaattaggggagttggagatagaaatgaaggacaagaatcattgacaatttaacgtcaagccacatagttttgtgctatctagctccaccagccttagctagaatttgctcgcaaaatagttttgtgagagactgtcacccctcagcttggctaccgtagtaggacctatgctgtgctgttctgggaatgacaaaatactcttggtcagccaaaatttgtattacaaatcaagatataaccatatatatgttggggttatggtggggtacttttttgggttttgtagggcataggagggcataggaggaggtaatggtggggtggcgggagcggacggacaactccccttttagaatagtagagagaagaatgggaatataacactttacactagaagtgtattctgttcaagtattccttttgtttcctgctattatttttagttctttttatctatggaaaatcagctatatgccattacaagtttttatcatttattaatctgtatgcctgtatttttgatttctaatgatgatgtaaaatccgatagagctggatggtttgaaaatcagctatatgccatcgaaagttttatcattattaatctatgcctgtattttaatttcttgtaatgatggtatagaatcccgtagagctggatggtttgaggaaggcacatattcgagatggtgtggctgttgtgcaatacctggcttggcttgacaatcaggttggtgtaaatgtatttcttgtgtagcctgttagccttggacttttcttatgctcatatttgaggatatgacaatttgatttgtacctgcaatgttctttaatgctgctgcaatctttctagttattttctacttgctctcatgctcgttgtcctattgacagatgcaagagaactatggagcgtctggttactttagtggggccaagggatcacagaaaaaggagcatgtgtgagtagtagtgttgtatttatgttctttcggtatcatatggaacatatgatcttttgtttacctataaaaaatttggaataatgcattatcaaaagatggccaacatctctttttagattaggtttgggctgtcagaactgtctaaatcatttataggataaacagcggtttcttgccctcatgacatcgttgtcttgagttttttttttaagaggctgggataaaattttcttgaacttcatgtgcaatacttgcaacttgacttggttgcgagcttgagacagttctttcaataatcatccatttgagtttttctttggaggaggttgggataaaattcttgaacttcatgtgcaatactgcaaccccacttgattacgaacttgagacagttttttaaatacattgttaccaaattcttcaataagactgatacgattgattggtctgtgtgtttctcttattactttttttacccccctgttcctcggatacaatcgatccttctacggccaaatctcaatttgtgggaagccttcgatggcttccttatgaaaacatccatttgtatatgggtattaggtatagatgttttccttttggatcatatttaaaatgtagttccttcatttttacacggctgcatctcagcactgcatgcttaagctaaacactttcagcaaaagccatgttctgcattcaaattatagaccaaggtttacatgttcattttttgtttttacctatcttctggaattatcatgtatccaattttctcatttatgctgctcatctatttcccatgtggatgtgtacatcatctacttgcattctctgcccttttgtgtattttccaatggttaatgttgttgtagcaaatgtactctgtcaaacttgtgagcacttttacatttggcaaattccttgaaatttcaatgctccatgattatttttgttcttagcctattctttttgttatatattaccttcatcctgaaatataagaagtttttggggttgcacataggtattaagaaagtaggtgaaaataaattgagaaaggttgattggtttagaagaggaaataggtggagaaattaaaatgtggaaaattgtgattggttaataagagaatgtaggtggagaagttgttatcttttgtgataagagggaatataaagaagagtaaattgcatcagtgatacacgaacttgtcaggttggtgcaatttagtgcatgaacttataaaacgctcgttttggtgcattaacttgtctggtgtgtgcgaaccaatgccaaatgccatgagcaggccaatttttctaagttgaacatcataaatttgtacgataagtgtgtgcatgtatggtagaaattctatatttgtaaacttggtttctactttttctttctttcttgtttctaccctttgcattattactcggttttttatttcattctttatgcaattatatgctttagtgtatgttttgctgaacagatctttgtctagctacgtgatatccttctgagatacatatttacatagcgttcaaatcaacaacaaaatcagcaagataaaccctgccatgcgattttggccttggtccacacacactaaacaagtttgtgcaccaaaacaaacgtttacaagttcatgcactatttcacctaccttacaagttcatgtaccactgatgcaatttactctataaagaatcataccattttaatcatatattgtttaatacatgcataatggcaatcaattgttatttgctttattatatatgaacagtagtgtgcatttgtgttaataatatttttgtttcactcctgtagggaagtaaaacttactgaggtttctgtgagtgataaacttgaaggtttccgtgccgctaaagaggtatgctgctaaaacatcactcttctttcaagcttaagtgtactacattactatggatcttttatagctcctgtaaacagctgtagttactgtcattagcctcgatttttgaaattaaaaaatcagcaagtacactttggttttgtgaaaactgttaaaatataaaacaagttcctgatagttactccctccgtttcatatatatgtctagattcattaacatcaatatgaatgtgaaaaatgctaaaatgatttacattgtgaaacggaggaaatagttacctgtgacttagttttagcaagccctaatatccattgcaagtttggaactaatattatagccaaggccaatgtggtttcacttgtatccgttaagaactatctgtacattgaaaaatgtattattaactattttatttttcttgtgcaatcactgagagcaatgcacactgttctttggagtatatcagttatcatgattatcgaccttatagctggggagtagttttcgagccccccatcgcatttgtaaaccctggttgttactttgacgtaaacacacagtaagtggagatagagggaaccgtcagaggccctcaatctccttagtggagagctcagagtgaacgtagaatcttttgcataaaacagagcaaaactaaggacaattttacactgctgattgtatgttcaatctgagctcttcattaaggacattgagggtctccaatagttccctctttctctgcttactgtgtgtttgcatcaaagtaacaacaataagacgtgttttagtggaacattttttctttggttgttagatgaatatagaaactactacaaagcattgcttgaggtcattttgcagttcataactatagtctcctgttatgccacaactttggaataaccagtaacatatttctgcagtactttaaaggtccgagttttcctatgatttcagccgtgggaccaaatgcaacaatacttcactattcacctgaagcaagttcatgtgctgaacttgatactgataaaatatatctgtttgacactggggctcaggttgaatacatttcagtccaaactcaaattttatgttagatgacctgctataatcttactctttctatggtagtatgcttgcagtatcttgatggtactacagacatcacaagaactgtacattttggcaaaccatctgagcatgaaaagtcatgctacacagctgtaagttctgtttcaccacttgctaaaattttcttttatttagaactaatcgtatgtcacatactaagttctatttggaattaaggaccatacttgtggtgtcatcctagaagttactgaataagtcatttgttcaagcatcattttgattcttgtttttctttcacatgttttgctttgcttgaatatgcattattttctgcgtgtttctaagctctaggatgttgcaccttgctagcatctagtatatgagtgtccaataatcaattgacttgaaatgtaaccttacccacgtaagtgcaccttgctagcatctatctagtatacgagtgaccaataatcaattgacttgaatggaacattacccgtataacctttctccattaatagtttgaccaatggaacatgtattttactaaacacactaaacttgaccagcatacaagaaatagatacttaactgctagctcccctgtatttatttaacaattctagtattatttcccatgaatttaggacttagtaactgacatgcaacgtgttgaaagtcatgttgaaatgctattgattccctcatttccggaattgcattacttgtccctacttagtggatctgaaaattctgttcttgaataatctgtaaaaatggcaggttgagttttttttactggcttgttacttgatttcctttgtagaaataagcacaattaaatgcttgattctataatagtttgtatctaaacattgtccttgtagttttgacttttgactcttctttttctactatttattcaatttctaatgcaagtgatatcgaacattggaaataggtgttgaaaggccacattgcactagacactgctgtatttcctaatggaaccacaggtgagtattttgaactttcataattcatacttccatacatatgaactctagagtttgacattgatcatgtcgtaccctaatgataaaatggtctccaggtgtaccacggggtttctaacatcacctgatagtgtatgagttgatacaatcatctgttcttcatttgagtgcataagcttaaaaacatgtgacatcatgttttctcaaagtctcattgcctcgaaggtcattttcaacgtttctttaacctttgaaaactataagaagattgcactagtcactaatgtcatttagtgatatacaatttcgctaaaattccctagcaataaatttgggaaggaaaaatggatgacagaaagttgtatctgatgacttttatactaccatgttctgaaaccaatgaatgttcactgtgtttatacttagttttggcaaattatatttcaaaagaagccatgaaattctattataaattgtgatgtaatgctttacttaaacctcaacagggcatgctcttgatattctcgcacggacaccactttggaaaagtggtcttgattatcggcacggcacaggccatggggttggatcttatttgactgttcatgaaggtcagatactggttcattctcttcgatggcagtaaataatcggattatatgggtactttaaatgtttaatttatactgtttgtgcttttaatccaggtcctcatcaaattagcttcagaccttctgctagaaatgtaccactacaagcatcgatgactgtaacagatggtcagtgcatatcctaactggatcactatttatttcaataggactgtccaacagtttaatatgaaactactttgtagtcgaccattcaatgctaattatcttggtgcaatgatcagtgtaaaaagttcaacttgcataatatttgcagaacctggttactatcaagatggaagctttggtataaggttggagaatgttctgatagttcaagatgccaatactaaatttaattttggagataagggttatttggcatttgaacatataacatgggtaagcattgattgttcaatctctaaattattaactctcactttggtaactgttcttctctttgtttcattcattttggactatatcttgtaaccagaagttgatgcgtttatagaggtgtttcaagtctctgtgttttgtaaaatactactccctccgtattttaatgtatgacgccgttgactttttaacaaacatttgacctttcgttttattcaaaaaatttatgtaattattatttattttattgtgatttgatttatcaccaaatgttctttaagtatgacataagcatttttgtatttgcataaaaaaattgaataagacgaatggtcaaacgttggttaaaaagtcaactgcgtcatacattaaaatacaaagggagtatcttcaattcacaagagatatccattgatactaatatgttgtactatcgttagctcgttgctttttttatacttatatgaccatttttatgtcaaccttgttgccagttttttttttttttgaatatttgcattatgtaaactaggatatgatgcatgaggatcattatatcaactaattcttggctgagttctttctctcaagttggagagatctccagcagacgcgaaacgagaaagctcattagcacgtaattaattaagtattattaattataaacttgaaaaatagatttatttgaatttttcaaacaacatctgtataaatattttttgaaaaacacatcattcaacagtttgaaaagcgtgctaacgaaaaacaaaaagttaaagtttgaagttgaagaaaagaactaggccttggagcgagtcctggcgaggaatctccatcatattttttattgctttctaaataatctttacttttcataacagaagcagcttctccttaaatctccttaaagtggtgctcatgttattgttctactcgtcgtgcagaatatactcagttctattggcatatcacaatctccacatacgaactgctgctcaccagttcaatatactacagttcattaacatgtaatgcttgtcatgcatcatttgtttgcccatgtattgatggatttcttgcgttattatgcaggctccgtaccagacaaagctgattgacgccactttgctggcccctgccgagattgaatgggtaaacacgtatcactcagattgccgaaggattttgcagccttacctgaatgagcaggagaaggaatggctgaggaaagctactgagcctattactgtgagctgttaagccatcgactacatgagcacatggcacagggtctcaaccagttgcagccattcgtgctagatgtgcagaagtgcagatggtttctgacatgccatgctttgccttgggttgaatgcgaagatatggaagtagaaataggactagaggactggccgcttacctagtccctaccatgaatatgggctgtgtttgaatccaaacttcagtccttttccatcacatcaacttgtcatacacatacaacttctcagtcacatcatcttcaattccaactaaaattcaaactttacgctgaactaaacactagttgtgtttgtacggttctccagacgttgcttgaatgccttgtgggcatttgtatcgtgatgtatcgagcggcgagtaattgcagtgtaataataagcggccatgtctggtgataagctgttgtttaaaattgtatctcacatcaaccctgcctcacggctttgaaactgagcgacgccggtaacaaaaggggaaagtctatt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |