BGIOSGA004996
| Gene Name |
BGIOSGA004996 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004996, complete gene. |
| LocusTag |
P0551C06.20 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004996-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004996-PA |
| Length |
6817 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:42963285..42970101 |
| Sequence Coding Region |
42963285..42963405,42963760..42963881,42964226..42964389,42964810..42964900,42965500..42965679 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:42963285..42970101 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTCTCCGGAGGCGGGAGCGCCGGGTCATCGCCGCGGCCGGCGCGGCGGCGCTCGTCGCCGTCGGCCTCAACCTCGCCTTCTCCGCCGTCGCCGCCCACCGCCGCAGGAAGCGGCGAGAGCTCCCAGGGTTTACTGCGCAAGTCAACCTCTCAGCTGCTGACATCAAGAGATTAGCTGATCGCGTCGTTTCTAAGTCGAAGGAAACATACGACGCTGTGGCTGCGGTTCCCCTAGATAAAGTCAGCTTCTCTAATGTCATTGCACCTCTGGCGGAATTAGATGCTCAGCAATTCCCACTGGTTCAAGCCTGTGTGCTTCCTAGAATGGTCTCACCGTCTGATGATGTACGAAGGGCCAGTGCAGAAGCAGAGAAACGATCGGATTCTCACTTCCAGCAGTGCAGGCAGCGTGAAGATGTGTATCGTGTCATAAAGGCATTCACACAGAAAGGTGAAAGAATAGGTCTTGAAGCAACAAGATTTGTCCAGTGCATGGTAAGAGAGTTTGAACGCAATGGTGCTAAACTAACTCAAAGCAAGAAAACGGAGATGGAGAAACTGAAATCTCACATTGATGACTTAAGTTTGAAGTATATTCAAAGCTTAAATGATTCCACAAAATTTCTTCTATTGAACGAGGAAGACCTGGCTGGGATGCCACTAGAGTTCTTAAAGGAACTGGAAAATACAAATGGGAAGTGGAAGGTTCTGCTGACCAGTTATTATGTTACTCCAATTCTTGAGCATTGCAAGGTTGGCTCTACCAGGAAACTGATTGCTGTTGCTTATGGCCAGAAAGGTGGAAAAGAGAATATAGCCATCCTGGAAAAATTGGTCCAGCTAAGACACCGGCTTGCTAGATTGCTGGGGTATCCCAATTATGCTGATTATGCTATTGAACCTAGAATGCCGAGGACGTCAAGGAAGGTCTTGGAGTTTTTGGAGGAGATGTCAGAACAATTAAATGGCCTAGCTAATAGGGAGCTCAGCGTACTCAAAGATCTGAAGATGAAGGAGGAGGGTGATGCTCAATTTAGCGTGGAAGACCTGTTATACTACATGAAAAGAGCTGAGGAGCTCAAGGTTGATCTTGACATTGGTGAAATTAAACAATTTTTCCCTGTTGACCTGGTCATATCAGGAATATTGAAGATGTTTCAAGATCTGTTTGCACTGCGATTTGAGGAAATGAAGGATGCTGAGACTTGGCACGATACAGTTCGTCTCTTTTCTGTCTGGGATGCAAGTTCAAGTGATCTTTTGGGTTACTTTTTTCTGGATATCTTTTCCAGGGAAGGAAAATATGCACATACCTGCGTCGTGGCACTTCAGAATGGATGCCTGTGTTCTAATGGCACAGATAAGGTTCCAGTTGCAGTTCTATTGTCTCAATGCCCGAAAGAGTTTGATGGGAATTCAGCACTGCTGAGGTTCCCAGAAGTTGTAAGGATATTCCATGAATTCAGTCATGTGGTCCATCATATCTCCAACAGAGCCACCTTTTCTAGATTTTCGGGTCTTCAACTGGAGGGGGATTTTGCTGAAATTCCAAGTCTGTTACTTGAGAATTGGTGCTATGAGAACATTTCTCTAAAAATGATGTCTGGCTTCCATCAGGACATTACGAAGTCTATCACTAGTGAGGCTTGCCAATCACTGAAAAGAAGGCGTGACATATTTGCTGGCCTGAAACTGAAACAAGAGATCCTTTTGTGCCTTGTTGATCAGATAATACATACAGGCGAAAATGTGAACATTGATGACTTAATCAAGGATCTTCATCCAAAGGTAATGCTAGGTATACCTTTGTTGGAAGGGAATAGCCCAGCTTCATGTTTTCCACGTATTGCTATTGGCTATGATGCTGTGTGCTACAGTTACATATGGAGTGAGGTGTTTGCGGCTGATCTGTTTGCATCAAAATTTAAAGACGACTTGCTAAATCAGCATGCGGGGTTGCGGTTTAGAAATAAGGTATTGGCTCCAGGAGGCTCGAAAAATCCCCTTGATATCATATCTGACTACCTTGGACGAGAACCATCATTGCAAGCTTTCATTCAGAACCGAACGAGGAACAGTCTGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLRRRERRVIAAAGAAALVAVGLNLAFSAVAAHRRRKRRELPGFTAQVNLSAADIKRLADRVVSKSKETYDAVAAVPLDKVSFSNVIAPLAELDAQQFPLVQACVLPRMVSPSDDVRRASAEAEKRSDSHFQQCRQREDVYRVIKAFTQKGERIGLEATRFVQCMVREFERNGAKLTQSKKTEMEKLKSHIDDLSLKYIQSLNDSTKFLLLNEEDLAGMPLEFLKELENTNGKWKVLLTSYYVTPILEHCKVGSTRKLIAVAYGQKGGKENIAILEKLVQLRHRLARLLGYPNYADYAIEPRMPRTSRKVLEFLEEMSEQLNGLANRELSVLKDLKMKEEGDAQFSVEDLLYYMKRAEELKVDLDIGEIKQFFPVDLVISGILKMFQDLFALRFEEMKDAETWHDTVRLFSVWDASSSDLLGYFFLDIFSREGKYAHTCVVALQNGCLCSNGTDKVPVAVLLSQCPKEFDGNSALLRFPEVVRIFHEFSHVVHHISNRATFSRFSGLQLEGDFAEIPSLLLENWCYENISLKMMSGFHQDITKSITSEACQSLKRRRDIFAGLKLKQEILLCLVDQIIHTGENVNIDDLIKDLHPKVMLGIPLLEGNSPASCFPRIAIGYDAVCYSYIWSEVFAADLFASKFKDDLLNQHAGLRFRNKVLAPGGSKNPLDIISDYLGREPSLQAFIQNRTRNSL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..121#476..597#942..1105#1526..1616#2216..2395#2644..2721#2867..2947#3299..3391#3610..3690#3787..3949#4066..4186#4471..4543#4808..4915#5183..5280#5367..5412#5776..5872#6203..6276#6355..6459#6545..6625#6707..6817#ATGTCTCTCCGGAGGCGGGAGCGCCGGGTCATCGCCGCGGCCGGCGCGGCGGCGCTCGTCGCCGTCGGCCTCAACCTCGCCTTCTCCGCCGTCGCCGCCCACCGCCGCAGGAAGCGGCGAGGTACGCGCCGCCCGAAACCCCCCCGGAGTTTTGGTTACGATGCTCCCCTCATGGCGCTCTACTTTTTCCTCAAGCTGTGCACGCCTCTCCTGCTTCTGCTCAATTGTGTAGCAATGTAGCATCCGCTGTTGATTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGTGAAGAGTGGAAAAATGGCCCCCATAATGTTGCCCTTCTGTCCGCAAATCCACGCGTGAGATGTAGAAATATGTGTTTGATCGCAATAAATATTGCAGGAATTTAACTCTTGGGGCATGGAGTTATGAAGATTTAGTGGCGTAGTTTTCGCGTGATTGAATGTTTGAATGTGTTGGATGGTTGCAGAGCTCCCAGGGTTTACTGCGCAAGTCAACCTCTCAGCTGCTGACATCAAGAGATTAGCTGATCGCGTCGTTTCTAAGTCGAAGGAAACATACGACGCTGTGGCTGCGGTTCCCCTAGATAAAGTATGTATCCAACACTCTGCTGCCTCTGCATTTTTTATGGAATATACCTTTTCAATCAAATCTTAGGCATTGTTTTGGAATGTGTATATGCTGCATTATTTCATTTGCATCCCACCATTACGTTGAAATGCTTTTTGTGGTATAGCAGCAGAAACACGTACGCTTTACAGTATGTTGTTTCTTAATTTCATTAAGTTGATAATGTGACATGAATAAATGTGTGGGTTCTTTTTAAATGCCTCAACACTGGCAGGATATATTCATCCTATACTGTCTATTTGCCTGCATAAAGCCAAAGAGTGGCACGGGTTTCATATTTTGGTACATGATATGTTCTGTTGCAGGTCAGCTTCTCTAATGTCATTGCACCTCTGGCGGAATTAGATGCTCAGCAATTCCCACTGGTTCAAGCCTGTGTGCTTCCTAGAATGGTCTCACCGTCTGATGATGTACGAAGGGCCAGTGCAGAAGCAGAGAAACGATCGGATTCTCACTTCCAGCAGTGCAGGTGCAACTTGTTACTTATTTCCTTTTCTATCTACACGGTGTAACTGCTGGTAGTTATACATCTACCAGACAGAGTTGCAATCACTGTTGATAAATAATGTGAAACCATGCACATAGGTTGGTATCTTGGTATCTTAAGAATCCACGATACTTGTATTATTATATAACCACTTCAGTGAGCATTCGTAACACATAACTCATTCCGTATTCATTCCTTTCCTTGTTGATATGGCTAAATGAAGTGATATGATTAAGAAAACACATTCTTAATAGAATCTGAATTCCCTTTCCTTAATAAAACAAGGGCCCCTGTTTCAAATAAAACAATAACCTGAATTCCCTGTTATTGACCTTTCCGATCTAATAAATTCCTGTTGAGACTCTAGTATAAGTACCTTGTTTTTTCGTGCAAGGTGTCCAGGCAGCGTGAAGATGTGTATCGTGTCATAAAGGCATTCACACAGAAAGGTGAAAGAATAGGTCTTGAAGCAACAAGATTTGTCCAGTGCATGGTAGACGATTCCCTTCTCTGAATGATGCTATGATCACGCAGCTCTATAGATGTCCCTTGTCATTGTATCTTTTCTTCATCCGATGTACTACCTCTGTTTCATATTATAAGTCGCCTAGACTTTTTTCCTAGTCAACTTCTTTAGGTTTGATTAAATTTATAGAAAAAATTAGCAACATCTCCAACACCAAATTTGTTTCATTAAATGTAACATTGAGCATATTTTGATAATATGTTTATTTTGTGTTGAAAATGTTGCTATATTTTTCTATAAACTTGATCAAATTTTAAAAAGTTTAACTAGGAAAAAAGTTAAAACGACTTATAGTATGAAATGGAGGGAGTACCTTTGTGCGTGCTCTATCTTTTCTTGTTCGTTTTGCATTTCACCTATGATTTATTGACTTTAAAAGATTAATATCTGTTCGTTTTTAGCTATAGATCAAAGTTGAAGGTAGACAGTGGATGTATAGCTACTTTACTTATGAATCTGTTGGGAAATAAAGGATATGCTGTTTGCTTAAAAGGTGTCCCAGCATATTTCTTGACCCAACGAGTACCTGCTTGCTGATTCAATCATTATGTCAATGACACATACAGGTAAGAGAGTTTGAACGCAATGGTGCTAAACTAACTCAAAGCAAGAAAACGGAGATGGAGAAACTGAAATCTCACATTGATGACTTAAGTTTGAAGTATATTCAAAGCTTAAATGATTCCACAAAATTTCTTCTATTGAACGAGGAAGACCTGGCTGGGATGCCACTAGAGTTCTTAAAGGTAAGCTGGGAGGATGCAGTATACACACTTCCGAATGTTCACACATCCATGATCCATCCAATATTATTCTTTAATGAGTTTACCTTTAGGAACTACAATGTGCGAACATTGGACTGTTAAAAAATGGGAGTACTCAGCTTTTATTGAAAGCTATTTTTGGACTTTACGAATGAACTGAAGTGTGATAAGAGAAAAAAGGATGATACTATTTCTATCTGATCCTACATTACAATGACTGTTCAACTCAGGAACTGGAAAATACAAATGGGAAGTGGAAGGTTCTGCTGACCAGTTATTATGTTACTCCAATTCTTGAGCATTGCAAGGTCAGCTCTATTTTGTGCTTCTTTTCATGCACATCTGCATAAGGCATTTAATATTATATGCTGTGGAGTACTTAAGATTAGAATCTTTTTACTACAATTCTTTTATATAATCGCTAACTGGTCTAATTTATTTCTTGTTTTCAAGGTTGGCTCTACCAGGAAACTGATTGCTGTTGCTTATGGCCAGAAAGGTGGAAAAGAGAATATAGCCATCCTGGAAAAATTGGTAACTCCAAATATCCATATCTGTAAACTCATAAGGAACTTATACCTTTCGATTCATGATTTCATTTATTTCGCACAACTAAGTTCTATGTTGCAGTTGGTCAATTACCCAGGAAAGATATGTAACATTATAGCTCATTGAAATAGGATTTTATTATTTTACGTCCAACCTGTGCTGTAGAGGTGCACTAGGGTGCAATCAACATTTATGAGCATTATTTGACTTAAGCGTTACAATGTTTTAATTTCTTAACTGGTAAAGCAATTGCTTATTTTAGATGCATAATCTCAGTTCATAATGGAAACCAGCAGCTGACAAGTTGTGTTTCCCCCCCTTTTAACATAATAATAGGTCCAGCTAAGACACCGGCTTGCTAGATTGCTGGGGTATCCCAATTATGCTGATTATGCTATTGAACCTAGAATGCCGAGGACGTCAAGGAAGGTTTGTACTTTCCCATTATGCAGATCTGCTAGAGATTTTTTTTAGCTAAATCTGCATTCTTAATTTTGTCTCAATATACTGATATAATTACTCTCAGATCATCAGTTTTCCAACAAGATGATGTTTAGCCATTTCATTTGCATCCCCTTTCACATGCTCACCTAAATTTGCATATGATACCAAGACCCACTCATGCTCTAAAGGACTTGTACCTACAGGTCTTGGAGTTTTTGGAGGAGATGTCAGAACAATTAAATGGCCTAGCTAATAGGGAGCTCAGCGTACTCAAAGATCTGAAGGTTTTGGACAAAGCTCTTATTGATCTCTCTCTTTCTTTTTATTGATTACACTCTTTTTATTAACAATTTAAACTCATAGTCATCTTCTAATCTCAGATGAAGGAGGAGGGTGATGCTCAATTTAGCGTGGAAGACCTGTTATACTACATGAAAAGAGCTGAGGAGCTCAAGGTTGATCTTGACATTGGTGAAATTAAACAATTTTTCCCTGTTGACCTGGTCATATCAGGAATATTGAAGATGTTTCAAGATCTGTTTGGTAAGATGTACCCATCAGAGAATAAACCATAACCCCCCATTATTCATAAAATTCGACTGGATATACCTCTTCCAAAATATGACTGGATGTGTTTTACTCTCATCTTATTTTGGCAGCACTGCGATTTGAGGAAATGAAGGATGCTGAGACTTGGCACGATACAGTTCGTCTCTTTTCTGTCTGGGATGCAAGTTCAAGTGATCTTTTGGGTTACTTTTTTCTGGATATCTTTTCCAGGTTTGTTTGGATGCATGCTGGTGAAGTTTTAATAATTTTGCTAGCCTCACGCTACTATTTAGAAATCTAGTTGAGCATGCATATTGAAACATTACTTCTGAAAGCCAATTCTCTTAGGATAAAATCTTATCTTGATAAATGCAGACACAGAACACATGAAAGAAACATTAAGGATAAACAGCATAACATGGAAACACAAATCACAAGGGAAAAAAATCCACACTTCCACTTCCACTTGCGACCAAATAAAGTAATTTTGATGAACTACTTGACTTTATTCCCAGGGAAGGAAAATATGCACATACCTGCGTCGTGGCACTTCAGAATGGATGCCTGTGTTCTAATGGCACAGATAAGGTAATGTAGAGAATTCATGTATTTCTAGTGCAGTTAGAGCATGATCATTGTTCGAATCGGCTCATTGAAAGGACTGGTTATTCAAAGTAGTGTAAAAAGGGTGTCTGCTAAAGCAAAGCTACTGGAGACTTAATCAAAATTTTACAAGCTAGAAAACGACTCTGCGGTTCTCAGTTTCTCACGAGTCGCGATATCTTTAATCGGTGAAATGTACATGTGGATTCTAGTGG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|
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