BGIOSGA020680
| Gene Name |
BGIOSGA020680 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020680, complete gene. |
| LocusTag |
B1153E06.39 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020680-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020680-PA |
| Length |
4684 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:30019019..30023702 |
| Sequence Coding Region |
30023535..30023702,30023108..30023200,30022194..30022274,30021953..30022024,30021720..30021851 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:30019019..30023702 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTGGCGGTGGGCTCTCGCGCGGCGCGTCGCCGCGCTGGGCGCGACGAGCGGCGGTGGGGACGGCGCCACCGCCCAGGCGCAGCGGCTCTTCTCCTCGGCGGCTGCCCTCCTCGGGAGGCACCCTCCACCGCCGTCGCCGCCGCACTACCAGATTCGGAGCAAGGTGGTGGGTTGCAGAGGAGCTACTTTCGTGAGCTCGCGATGGTTACATGATGCTCAGTACCAGGTTCGCCAGGATGGGTTATCAAGGTCTGAGGAACAGCAGGATCCATTTGAGTTGGTTGCTGATGAGTTGTCACTTCTTGCAAATAGGCTACGATCCATGGTAGCTGCTGAGGTCCCCAAACTGGCATCAGCTGCTGAGTATTTTTTTAAGGTGGGAGCTGAGGGTAAAAGATTCAGACCCACGGTATTATTGTTGATGGCATCAGCTCTGAAATTCCCCTTATCAGATTCAACAGAAGTGGGAGTTTTAACTATACTGGCAAATAAGCTCCGCACGAGACAGCAAAATATTGCCGAGATAACTGAAATGATTCATGTTGCAAGCCTTCTACATGATGATGTACTGGATGATGCTGACACTAGGCGTGGCGTCAGTTCGTTGAATTGCATTATGGGGAACAAGCTTTCTGTTCTGGCTGGTGACTTCCTCCTGTCTAGAGCATGTGTGGCACTTGCAGCGCTTGGGAACACAGAGGTGGTATCTCTAATGGCTACTGCTGTAGAACATCTAGTTACTGGTGAAACCATGCAAATCTCCACAAGTAGAGAGCAAAGGCGAAGTATGGATTACTACTTGCAGAAGACGTACTACAAAACAGCATCATTGATATCAAATAGCTGCAAGGCTGTCGCTATTCTTGCAGGGCACACTGCTGATGTGTCGATGCTCGCATATGAATATGGTCGAAACCTGGGTTTAGCCTTCCAGTTGATCGACGATGTTCTTGATTTCACAGGCACTTCTGCATCCCTTGGGAAGGGTTCATTAACTGATATCCGTCATGGAATCATTACCGCACCTATGCTTTATGCGATGGAAGAATTCCCACAACTACATGAAGTTGTTGACAGGGGTTTTGACAATCCTGCAAATGTTGAGCTTGCTCTTGACTACCTACAGAAGAGCCGCGGGATTGAAAAGACGAAAGAGCTTGCAAGAGAACATGCTAACCGTGCAATCAAAGCCATAGAAGCTCTCCCAGACAGCGATGATGAAGATGTTCTGACATCAAGGCGTGCTCTTATTGACATCACAGAGAGAGTCATCACTAGAACAAAATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSWRWALARRVAALGATSGGGDGATAQAQRLFSSAAALLGRHPPPPSPPHYQIRSKVVGCRGATFVSSRWLHDAQYQVRQDGLSRSEEQQDPFELVADELSLLANRLRSMVAAEVPKLASAAEYFFKVGAEGKRFRPTVLLLMASALKFPLSDSTEVGVLTILANKLRTRQQNIAEITEMIHVASLLHDDVLDDADTRRGVSSLNCIMGNKLSVLAGDFLLSRACVALAALGNTEVVSLMATAVEHLVTGETMQISTSREQRRSMDYYLQKTYYKTASLISNSCKAVAILAGHTADVSMLAYEYGRNLGLAFQLIDDVLDFTGTSASLGKGSLTDIRHGIITAPMLYAMEEFPQLHEVVDRGFDNPANVELALDYLQKSRGIEKTKELAREHANRAIKAIEALPDSDDEDVLTSRRALIDITERVITRTK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..168#503..595#1429..1509#1679..1750#1852..1983#2053..2139#2369..2440#2844..2929#3064..3196#3303..3392#4008..4106#4505..4684#ATGTCGTGGCGGTGGGCTCTCGCGCGGCGCGTCGCCGCGCTGGGCGCGACGAGCGGCGGTGGGGACGGCGCCACCGCCCAGGCGCAGCGGCTCTTCTCCTCGGCGGCTGCCCTCCTCGGGAGGCACCCTCCACCGCCGTCGCCGCCGCACTACCAGATTCGGAGCAAGGTCCCCTCCTCTTCCTGTATTTACTAATGCTCTCTCTCTTGTGGTTTTCCTGTGACGTGCCTCGTCGATCGGTGCGCGGGTGGGTGGTGGTGGAGCTGCCCTTCCCTGGCCTGCCCGCAATGTGTTTGTGTTTATGCCGACTAGGCGACCAGTGTAGTAGTGTACCTTCCGGAATCATTCTCGTAGTTGTAGAGAGGTACTGTGTGCTAGTTGTCAAATTGGAATGACTGGGGTGGAAAGATTGAGAGATTACCGTGCGTGTATACTTTAGAGAGGATTTGTTCTTCTTCTGTTTGTGCTGATAGGTTCTGTGATTTTTGGTGTGGATTAGTAGGTGGTGGGTTGCAGAGGAGCTACTTTCGTGAGCTCGCGATGGTTACATGATGCTCAGTACCAGGTTCGCCAGGATGGGTTATCAAGGTCTGAGGTAGGCGAAGCCTTGTTTCTCCAATGATTTGTTTATGTGGGTGCTCATTCAGTTTGTAATGATCGCAGTTTTTGTGCATTTTCTTTTGGGAAGGAAGGTGTGGAGCCCCATTATAATAAATAAACTGCACATACATAATCTATTACCAAGGCACAAAAATAATCTTTCGAGTGCCATCCACCTATATACATGACCATATTTTCAGAATATGTCTAGGTCTAGCGACAGAACCGATGGGAAAAATGGGCTGTTGCCATTGTGACATACCTTTGGAATCCCACATGTTATTCTGCTATGTGGCCCGCTATTTGGGTTGCCTGATTGCTTGCATTATCTTTTTAGAGCTCTCATTTATTGCATAGTAGCGTTTCTTAGTGATACAGTTTGATTAATACCTGTTTGATGCCAATCTTTGTGCACTGCCTGTGCTGGCCATCATGAAGATTACATACCCCAATTATTAAAGATATGCAGTTTCTTCATTTACAAATCAACTTATAGAAAATGGCAATGCTGCCAAAAAAAAGACCCATTCAGTTTTCGATTGATTGATACACTTGTTAGGCAGGCACACATGTTGACCCTTTAATGGAATCAGTATGTTGCATTGCGAACCTAACAAGATAATTTACAACCATGCATTATTATCTAAAAAGGTCTGAAACTAGAATGAAATGATCTGTTCAGGAGCAAAAAATCATGCTGATCTAATTCTATTACCGGGTAATCAATGAAAAACCTTTTTTGTTGTTCGGTATGAGAGTTAATTGTGAAAATTATTGGTGTGCACCCATTTTAAGTGTCTGTAAGTCTTAAAATTCCCCTGATTTCAGGAACAGCAGGATCCATTTGAGTTGGTTGCTGATGAGTTGTCACTTCTTGCAAATAGGCTACGATCCATGGTAGCTGCTGAGGTTGGTTACACCTTGATTCTTCTGAGTAGACATGTCTGGTTATTTGGGTCTACTCTGCTGATCGCAAGATGATTGCATATGCTTCATTGACCTAGTGATTATCACATCGTCATTTTCAATGGTTCCTAAATAGGCTTCAGACTGAGCACTACTTTTTTTTTTTTTGCAGGTCCCCAAACTGGCATCAGCTGCTGAGTATTTTTTTAAGGTGGGAGCTGAGGGTAAAAGATTCAGACCCACGGTAATATCTCAGTCATGCTATTTATTGTATACTTGTTAATATCCATGCTTCCATTATCCTTTATTCATATTTGTTTTGAATGTTGTATGCTCTATTGGCAGGTATTATTGTTGATGGCATCAGCTCTGAAATTCCCCTTATCAGATTCAACAGAAGTGGGAGTTTTAACTATACTGGCAAATAAGCTCCGCACGAGACAGCAAAATATTGCCGAGATAACTGAAATGATTCATGTTAGTAGAGCAGTTTCCATTCAGAACGTTTTTTAAAAAAGAAGAATTTCAAGCTGATGTCTATCACAGGTTGCAAGCCTTCTACATGATGATGTACTGGATGATGCTGACACTAGGCGTGGCGTCAGTTCGTTGAATTGCATTATGGGGAACAAGGTATTGTAAGTCACACGAACTGCATACGCAGTGTACTAAGTGAGTATTAGATACTCTCATCAAGAACACACACATCACCTTATACACACACAAAAGGATAGCGTGAAGATGTTTTTAAAGTTTCTGGGGGCATCATTGTTCATCAATTACTTATTACTCACGGAGATGGTACTATTTAAATTATCTTTACACCAGTATTCCACAAATTATTAATTTCTTATGCTTTCAGCTTTCTGTTCTGGCTGGTGACTTCCTCCTGTCTAGAGCATGTGTGGCACTTGCAGCGCTTGGGAACACAGAGGTACTTGGATATTGTTAATCTATTTGTAATAGTCTCCAAGACAATATCATACTTATTTGTAATAGTCTAAAGGGCTGAAGTTTAAGTGGCCATGCTCTATTCTGGTTACTTGATTCTTTTCCACTCATTGTTTCACATGTGATCTCATGTCCATGTACTTGGTCTGATCTCATGCCATTTGCTTTATTGGGGATGCACGTTTCTTGGCCTCCACGTTGAGCTTATGAATCATAGTGGCTCAACTCCTAGTGTTGTCTTGGAATGTATTTCTTACCATCATTTTCTAGCCAAGCTCATACTGTATTTCTGGATTCACTCTTGTGATTGCAGTGCTAGCCCTTTTTTCTTGGTAGTTCTGTATCCTACCAAAGCACCAATTGATTTCTCTACATTGTTTCTTCAGGTGGTATCTCTAATGGCTACTGCTGTAGAACATCTAGTTACTGGTGAAACCATGCAAATCTCCACAAGTAGAGAGCAAAGGCGAAGGTAGTTGCTCTAATACCTAAATCTAAGATAATGATATTTGAAATGCTTGCAGTATTTGTTTATTCATGTACTTTATTTTCTGTATTTAAATACTCCCATTTGACAGTTCTATTACGATTCCGAACAATTTGCAGTATGGATTACTACTTGCAGAAGACGTACTACAAAACAGCATCATTGATATCAAATAGCTGCAAGGCTGTCGCTATTCTTGCAGGGCACACTGCTGATGTGTCGATGCTCGCATATGAATATGGTCGAAACCTGGTTTGTGAAACATCTTATAGTTTCCTTCCCATTTTTGAAGCTAGATTTCTTTCTTAGCTAATGCTGTGAACCTTCCAGTGACTTAGTTAACTTGGGATCCTTGCAGGGTTTAGCCTTCCAGTTGATCGACGATGTTCTTGATTTCACAGGCACTTCTGCATCCCTTGGGAAGGGTTCATTAACTGATATCCGTCATGTAATAACAGCCATCCCAATTTTCCTATTATATTTTATCTTAGCAACTTAATATCCATTTAACCTCCAACAAACATAGAATTAAGAGCTCAACAATTATTTAGAACGTTTATTTAGTGTAGAATACAAATGAAATTGACTAATAAGCATATCCTTCGTCATGCCCTTTGTAACTGTGTAAGCTGCTGTCTTGAACTTGAGTACTTAACACACCTGATAGCTTAGGCTTTAATTTGGAATTAACACCAGTGATTTGTATTGGTCTAATTGTGTAAGCATCTCAGTCGATGGGTATTTTACTCTTTTCAGCCTTATCTATCATTTTTCACATACTAGAACCATATAATTTATTACTACTATTAGAAGTTAACTCATATAACAATAATATTCTGAAGTCTGAACCCTATTGCTTGTACGAATACTTTTGTGCACCTTGTAGTAATCTAGTGAAATTAGGTGTAAAATATGGTATCAACATTTATTTTCATAGTTCTGTTTTTGACCTAATAACTTGTAATTACCAGCATATCCAGTTACAATGGTGTCGTGTGACTGCTGATTCTCTCTCTTAGGAAGTGCTTACACTGTTTGACATTCGTTGGCATTCATAATGCAGGGAATCATTACCGCACCTATGCTTTATGCGATGGAAGAATTCCCACAACTACATGAAGTTGTTGACAGGGGTTTTGACAATCCTGCAAATGTTGAGCTTGTGAGTAAATCACTCTGGATTACAAACATGCTTTCTCTAATTATTTACACACCCTTTGCAAATGTCTCACACATGGCAGATGAACATCATACTATTATACATAAAAGCCATATTTATTTATGGTAACATGATACTTGGAAATGTTAAAAAGAATTGGTTTTCAACAAATATAAACCTATTTCATGATTTTGCAATTTTAATCCAGTAATCATTTAATTTCTGATGCTGCTTATCTTCAAGATTTGTTTTGAATCTTTCACTGGGAAGCTGAAGGAAAGTGGCTTAAACTGCCATACTGTTGCAATAGTTATCATATGGTTCATATCCACATTGCATGATGAGCTACTGGGTAAAAGTAACTGCCGTAACTTAACGGTCTACACTTTATAAAATTACAGGCTCTTGACTACCTACAGAAGAGCCGCGGGATTGAAAAGACGAAAGAGCTTGCAAGAGAACATGCTAACCGTGCAATCAAAGCCATAGAAGCTCTCCCAGACAGCGATGATGAAGATGTTCTGACATCAAGGCGTGCTCTTATTGACATCACAGAGAGAGTCATCACTAGAACAAAATAG</dnaseqindica> |
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