BGIOSGA020739
| Gene Name |
BGIOSGA020739 |
|---|---|
| Description |
Vacuolar ATP synthase |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020739, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0051O02.43 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020739-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020739-PA |
| Length |
6078 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:28984070..28990147 |
| Sequence Coding Region |
28990079..28990147,28989381..28989507,28989220..28989275,28989070..28989126,28988867..28988978 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:28984070..28990147 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTACGATCGCGTCACGACCTTCGAGGACTCGGAGAAGGAGAGCGAGTACGGCTACGTCCGCAAGGTTTCTGGACCTGTGGTCGTGGCTGATGGAATGGGTGGTGCTGCCATGTATGAACTTGTCCGAGTTGGTAATGATAACCTCATTGGGGAAATTATTCGTCTTGAGGGTGATTCAGCCACCATTCAAGTTTATGAGGAAACAGCTGGGTTGATGGTCAATGATCCAGTGTTGAGAACAAGAAAGCCTCTTTCAGTTGAATTGGGACCTGGTATCCTTGGAAATATCTTTGATGGAATCCAGCGCCCTCTAAAAACTATTGCTATAAAGTCTGGAGATGTGTACATACCACGTGGTGTTTCAGTCCCTGCTCTTGACAAAGATCAGTTGTGGGATTTTGAGCCAAAGAAGCTAGGTGTTGGAGATGCCATCACTGGTGGAGATCTATATGCTACTGTGTTTGAGAATACGCTGATGAAACATCATGTTGCCCTTCCTCCTGGTTCTATGGGTAAAATAAGTTACATTGCACCAGCTGGCCAGTATAGCTTGCAGGATACAGTTCTGGAACTGGAATTCCAGGGCATCAAAAAGCAATTTACTATGCTCCAGACATGGCCTGTCCGGTCACCAAGGCCTGTTTCATCAAAGCTTGCTGCTGACACGCCTCTTCTAACAGGACAGCGTGTACTTGATGCACTATTTCCCTCAGTTCTTGGAGGAACTTGTGCTATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGAAAAACTGTCATTAGTCAGGCACTTTCAAAGTACTCCAATTCTGAAGCTGTGGTTTATGTGGGCTGTGGGGAAAGAGGAAACGAGATGGCTGAGGTCCTTATGGACTTCCCACAATTGACAATGACATTGCCTGATGGACGTGAAGAGTCTGTCATGAAAAGAACTACACTTGTTGCTAACACATCCAACATGCCTGTTGCTGCTCGTGAAGCCTCCATTTATACAGGAATTACAATTGCTGAATACTTCCGTGACATGGGCTATAATGTCAGTATGATGGCTGATTCTACTTCTCGGTGGGCTGAAGCTTTGCGTGAGATTTCAGGACGTCTGGCTGAAATGCCTGCGGATAGTGGTTACCCTGCATATTTGGCTGCACGTTTGGCATCCTTTTACGAACGTGCTGGTAAGGTGAAATGTCTCGGCAGTCCAGATCGGACAGGCAGTGTCACAATTGTTGGTGCTGTCTCTCCACCTGGAGGTGATTTTTCAGATCCTGTTACCTCTGCAACTCTTAGTATTGTGCAGGTCTTTTGGGGATTGGATAAGAAGCTGGCTCAAAGAAAGCATTTCCCATCTGTCAATTGGCTCATCTCTTACTCAAAATACTCAAAGGCTCTGGAATCCTTCTATGAGAAGTTTGATCAAGATTTCATTGATATTAGAACAAAAGCTCGTGAAGTGTTACAGAGAGAGGACGATCTAAATGAAATTGTCCAGCTTGTTGGTAAAGATGCACTGGCAGAATCTGATAAGATTACATTGGAAACAGCCAAGCTACTAAGGGAAGATTACTTGGCACAGAATGCATTTACCCCATATGACAAGTTCTGTCCATTCTACAAGTCTGTTTGGATGATGCGCAACATTATTCATTTCAATACATTAGCAAATCAGGCTGTGGAGCGCGCAGCTAATGCTGATGGACAAAAAATAACATACAGTGTCATAAAGCATCGTATGGGTGATCTATTTTATCGCCTAGTATCTCAAAAGTTTGAGGACCCTGCAGAGGGTGAAGATGTCCTAGTCGCAAAATTCCAGAAATTGTATGATGACCTCACAACCGGATTCCGCAACCTAGAAGATGAAGCTAGGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSYDRVTTFEDSEKESEYGYVRKVSGPVVVADGMGGAAMYELVRVGNDNLIGEIIRLEGDSATIQVYEETAGLMVNDPVLRTRKPLSVELGPGILGNIFDGIQRPLKTIAIKSGDVYIPRGVSVPALDKDQLWDFEPKKLGVGDAITGGDLYATVFENTLMKHHVALPPGSMGKISYIAPAGQYSLQDTVLELEFQGIKKQFTMLQTWPVRSPRPVSSKLAADTPLLTGQRVLDALFPSVLGGTCAIPGAFGCGKTVISQALSKYSNSEAVVYVGCGERGNEMAEVLMDFPQLTMTLPDGREESVMKRTTLVANTSNMPVAAREASIYTGITIAEYFRDMGYNVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLAARLASFYERAGKVKCLGSPDRTGSVTIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLSIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYSKALESFYEKFDQDFIDIRTKAREVLQREDDLNEIVQLVGKDALAESDKITLETAKLLREDYLAQNAFTPYDKFCPFYKSVWMMRNIIHFNTLANQAVERAANADGQKITYSVIKHRMGDLFYRLVSQKFEDPAEGEDVLVAKFQKLYDDLTTGFRNLEDEAR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..69#641..767#873..928#1022..1078#1170..1281#1375..1412#1545..1646#1742..1798#1879..1950#2084..2185#2296..2491#3053..3159#3637..3831#3932..4018#4097..4201#4465..4562#4670..4748#5779..5867#5964..6078#ATGTCGTACGATCGCGTCACGACCTTCGAGGACTCGGAGAAGGAGAGCGAGTACGGCTACGTCCGCAAGGTTCCCTCACCCCTCATCGTCTTCCTTCCTCTTCCCCATGTTGGATTGGATCGGTCACTCTCGTGCGTAGATGCGGCGGCCTCTGCTTCGGATTCGGCTTGTTCCGGATCGGTGGAGTTTTAGCTGTGAGTCTCTGTGGATTTTAGTGCTGGTCTCGAATCCCCGATCGCGAGAGTGTGGGTGGCACTGCTGCTGACTGGGGAATCGTCAGGCGATGCGACTGTGCCGAGAGCCTCGGACTCGGGTGGTGTTTGGATCGAGTTGAATTGATGCGAGATTAGGTTGATAGGACGGTTGAATTTAGGTTTCTACTGGTGTTCGGATCACGCTGGCTAGACTGCGTGGATCGAGGTTTGATGCGTTAACTTCCAAACTCATATGCGGGACACTATTGTGATGGGGTTGGTTAGTGAACCATCCCCGATGTGGAGATGCGCTATTATCCTTGGGAGTTTAGCCCGTTTGGATAATATGTTGATTGTCTACTATTGGCACATGATCCATCATTTCATCCCTCTTTTTTTTTTTTGTATTGAACGAATTGTTTCGCCTTCATATTGCATTCTTCTAGGTTTCTGGACCTGTGGTCGTGGCTGATGGAATGGGTGGTGCTGCCATGTATGAACTTGTCCGAGTTGGTAATGATAACCTCATTGGGGAAATTATTCGTCTTGAGGGTGATTCAGCCACCATTCAAGGTATAGGACGGTGAAATTCTACCTCACATATTTGTGGTGCCTTTTCCCCACATGACATGTACAATATAAATTTCACCAATTTTTTCTTGTGATTACCGTTTGCAGTTTATGAGGAAACAGCTGGGTTGATGGTCAATGATCCAGTGTTGAGAACAAGAAAGGTGTGATGCATTGTTAAATTCTATGTGCATTTCACATATGGTTTTCTTACCCTTTTCATTTCTTTTATAACACATTGTTGCTATTTTCATCAGCCTCTTTCAGTTGAATTGGGACCTGGTATCCTTGGAAATATCTTTGATGGAATCCAGGTGAGACAAATGTAATAATCGGACATTTATTAGGCTGATATGAGGACTTTATGCTGACTACATGACCTTTTTTCCTTTCTACACTTTGCAGCGCCCTCTAAAAACTATTGCTATAAAGTCTGGAGATGTGTACATACCACGTGGTGTTTCAGTCCCTGCTCTTGACAAAGATCAGTTGTGGGATTTTGAGCCAAAGAAGCTAGGTATTGTGCCTGCTAACCTGTTATAAAATCTGAGCATGTCTCTTTTCAAGTTTTATCCTGTACATAGATAAATTACATTGGTCATTTGAATAGGTGTTGGAGATGCCATCACTGGTGGAGATCTATATGCTGTAAGTTAACAAGACAGTTCCCTTTTTTACAAGTTATTATCTTGTGTTATTGCTAGCGATCTTCTGCAATCTGCAGATCCCTGATGATGTTAATCTTTTTATGTGTCTTTGTGTTGCCTAACTGCCTCACAGACTGTGTTTGAGAATACGCTGATGAAACATCATGTTGCCCTTCCTCCTGGTTCTATGGGTAAAATAAGTTACATTGCACCAGCTGGCCAGTATAGCTTGCAGGTTAGTACGTGTTACTTAAAGCTGCTTCTTCTGTGCCTCATTTTTTTTTCTGCTTAACTTTATGTGATGTCCTAATCATAATGCTCTGTACACAGGATACAGTTCTGGAACTGGAATTCCAGGGCATCAAAAAGCAATTTACTATGCTCCAGGCAAAGTGCTTTCCCTTTCATTAAATCCGTATTTACCGAGTTTATGTATATCTGAATGTCATCATATTTATTCTCTGCAGACATGGCCTGTCCGGTCACCAAGGCCTGTTTCATCAAAGCTTGCTGCTGACACGCCTCTTCTAACAGGACAGGTACACGAAGCTTGCTACTCCCAGCTCCTTCATAATGTGTTGTTTTATTAGTGTCAAAATTTAATGAAGTGATGCTTTCCTGTCCTGTTCTATCATATTTTGCCGTGTCTCATATCCTGTGAACTGTTTTCAGCGTGTACTTGATGCACTATTTCCCTCAGTTCTTGGAGGAACTTGTGCTATTCCTGGAGCATTTGGTTGTGGAAAAACTGTCATTAGTCAGGCACTTTCAAAGGTATTTTCACTATTCCTCTCTATTTGATAACTGCTAGCATTGCCCATGGGCATTAGCCTTTTAAAATGACTGAATTCTGTGCCTTTCCTGACTGAAAATATCTTATGCAGTACTCCAATTCTGAAGCTGTGGTTTATGTGGGCTGTGGGGAAAGAGGAAACGAGATGGCTGAGGTCCTTATGGACTTCCCACAATTGACAATGACATTGCCTGATGGACGTGAAGAGTCTGTCATGAAAAGAACTACACTTGTTGCTAACACATCCAACATGCCTGTTGCTGCTCGTGAAGCCTCCATTTATACAGGTAATACATATATACTGATTACTGATGTTTTTAATTTCGCATTCCACTAGTATAGTACTACATGAATGTGTTTCGATCTTCTGAAGTTCATTTTCTCTAGAAGAAAGTGTTGCTTTGTTGGAGACTATAGCTATCACAATACATCAGACCATGGATTTCTGCAGGCTTGTCCTTAGCCATTTGTGATCTATGAGCTAATTTTGGAATAACTAAGGTTGCATTGACAAATACATCTATGCATGTTCCATAATTGTTCAGTAGAACATTGAGGATCACATCTTTATGTTATCCATGGCCTGTATTATTTATTGAGGATATACACATATTCCTGTTAGCCATGACCTGTATTACTTACTAACTGTTCTGTTGCAGTTCAGTTTATGAGTTATGACGGATGGTAACTAACTTGCTAGCACTAGATCTTTTAGTGAATGAACATCATCAAAGTGGTAAATATGTGTAGTTTCTTGTAGAACACTAAAAGGAGTCCTTGCTTAGTTATGCTTTATGCCTGATGTTTTCTTTATCAACAAAACAATCATATTTTTTTCTGCCCACCAGGAATTACAATTGCTGAATACTTCCGTGACATGGGCTATAATGTCAGTATGATGGCTGATTCTACTTCTCGGTGGGCTGAAGCTTTGCGTGAGATTTCAGGACGTCTGGTATGATGCTTCCTTTCGAGTTGCTATTTTACCTTTTTGGCCTGTATTTTTGTAACTTATATTGACTTCTCAATGCTGTGCTGTGACATGAATGAGAATTCTTTCTAATGTATCATTATCCACTATTTGTATTTGGGGTTTAATTTTTTCAGGATTATNGTTTATTTTCTTTCCGTTCAGTAGCTTATTTTATTACTAATTTCATTAATAGCTGACTGTAACCTCCAACATCAAGAATACTAGTGCAATGGGGATATATTAATGTGTTGAACAGAAGTAAAATCTGTTACTAGTACATCATGGCTGAAACATTTACATGGAAGTTATCATATACGTCTGATGCATCGTGCTTGAAATATTTACTATGCAGTTATCTTACTAGGAAATTATTTGGAGTCGAAAGTGCTCTCGCTAGCTAGTTACTGCTTTACTCTGCACTAATATGAATTTGAAACTGATGATTTGATCAATTTCCAGGCTGAAATGCCTGCGGATAGTGGTTACCCTGCATATTTGGCTGCACGTTTGGCATCCTTTTACGAACGTGCTGGTAAGGTGAAATGTCTCGGCAGTCCAGATCGGACAGGCAGTGTCACAATTGTTGGTGCTGTCTCTCCACCTGGAGGTGATTTTTCAGATCCTGTTACCTCTGCAACTCTTAGTATTGTGCAGGTAAGGAAACTGCTAGATTAATCCAACCTTTGAATTAAATTTTCAAACCTTTCTAACTGCATGTTCATTGTTTGATAATCTTAACTCCTCTCAATTGCAGGTCTTTTGGGGATTGGATAAGAAGCTGGCTCAAAGAAAGCATTTCCCATCTGTCAATTGGCTCATCTCTTACTCAAAATACTCAAAGGTTATTCCTAACTTCCCTATGATGTCAATACAATTAAAATCGCCATTTTACACTAACATACTATATCCTGTACTGTAGGCTCTGGAATCCTTCTATGAGAAGTTTGATCAAGATTTCATTGATATTAGAACAAAAGCTCGTGAAGTGTTACAGAGAGAGGACGATCTAAATGAAATTGTCCAGGTATTTTTTTTTCACCTTGTGCAAGGATGATCTGTTCCCTAGATTTAGTCGTAGAAGCAATAGTTTGAACTTGGACCACTTAAACATGGTGTTTTTGTTTTCCAAGGTCCTCCTTTTTGGTCTTTCACAATATTTGTTTTCTTCATTAGATTTGGAGTTGCTCAAACTATTCAATTTGTATTTTATTGATATTTGTTGACCCTTCTTGCTTTGTGTAATATTATTGTGGCACCATTTGGCCTAATATCTTCACCAAATTTCAGCTTGTTGGTAAAGATGCACTGGCAGAATCTGATAAGATTACATTGGAAACAGCCAAGCTACTAAGGGAAGATTACTTGGCACAGAATGCATTTACCCCGTGAGTCATACCCTAGTTTTTTCTGATTTAATACAGATTTATTGGTTGTCTCTATTTTAATGATTAACCATTTTCTTTAGTCTGATCATCTCTATATAATGAAACAGATATGACAAGTTCTGTCCATTCTACAAGTCTGTTTGGATGATGCGCAACATTATTCATTTCAATACATTAGCAAATCAGGTAAATCTAACGTGTTTTTACCACTCCTTTCGTCCTTG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