BGIOSGA020904
| Gene Name |
BGIOSGA020904 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020904, complete gene. |
| LocusTag |
P0490F09.8 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020904-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020904-PA |
| Length |
4152 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:25343425..25347576 |
| Sequence Coding Region |
25347536..25347576,25346978..25347059,25346769..25346872,25346415..25346541,25346236..25346330 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:25343425..25347576 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATCGAGCAGTTCGTAAATTTTGTCATCCGTCCGCCGCGTGCAGAGTACAATCCAGATCAGTATCTGTGGGAACCGGAGTTTACTCTTGCGGGAAGAAAGTACAAACGAATAGATTTGGAGCTTACGAACGGAAGAGACCAGACCTTAAAATGCAGCCACTATGTTCCTGCTGTCATCCCAGACAATACTGCCCTTCCTTGTGTGATCTACTGCCATGGAAATAGTGGATGCAGAGCGGATGCAAATGAAGCAGCTGTCATACTTCTCCCTTCAAATATCACCCTCTTTACACTTGACTTTGCAGGGTCAGGGCTATCAGGTGGAGAGTATGTCAGCCTTGGTTGGCATGAGAAACAGGATCTCAAATGCGCGGTGTCCTTTTTGCGAAACAATAAGGAAGTTTCTTGCATAGGCCTTTGGGGGCGATCAATGGGTGCTGTTACAAGCCTACTGTATGGAGCAGAAGACCCCTCAATTGCCGGTCTGGTTTTGGACAGTGCTTTCTCTAACCTATATGACTTAATGATGGAGCTTGTAGATGTTTACAAAATCCGAGTTCCTAAGTTCACGGTTAAGATGGCTGTGCAGTACATGCGCCGTGTAATTCAAAGAAGAGCTAAGTTTGATATAATGGATCTTGATGTTGTTCAGTTTGCCCCCAAGACATTTATTCCTGCATTATTTGGACATGCATCAAATGACATGTTTATTCAGCCCCATCACACGGACCGTATTCATCAGGCATATGCGGGGGACAAAAACTTAATCAAATTTGATGGCGATCACAATTCCCCCAGGCCTCAATTTTATTATGATTCTGTTTCAATATTCTTCTATAATGTTCTACACCCACCTCAGTTTCCTTCAGTATGCTCAAATAAGTTAGATAAGTACTACAACCTTGGTGCTTTTAAGGTTGGAGCTGGAACAAATGAGAGCTTACTGTATGAAATCATCAATGGTCTAAGGGCTGCTGGTCCTGATGCAGGCAGTTCATCGGCAGCTGCAGCTAACTTCACAAATGCTACAAAATCAGTGGTTGAATTGCTGACAGAGAGGGTCAATCAGTTGTCTATTAAAACAGATAATGACTTGGATTTTCTTTTGGATGAAAATCATAACCTCACTGAGATGGACACTCACACTGCTGAGTCTCATTTAGAGGATAAATCTCACAGGCAAAATGAGGAGTGCTGCTCATACACAAGTTCAAACCGAGAGAGCTGGGGAAGATGTTCTTCCTTGGGGGCAGCGAGTGATGGATCATCCCTAGGCGAGCGCCCTGAAATTCCTAGTCATAAGCATAAGAGCATGACGCTACGGGCCTTGGCAACACCACTGAGACGGATACGAAGGAAACCGCTCGCTATACCAAAGGAGAGGAAGAATCGATCTCTATGGAAGAGGCTCAAACAGGAGAGGCAAGAGATGGGGGAGAGCCTAACCCAGCGATTCAGGCTGTGCCTCCAAGGCCAGGCTCAACACAAGAGAACCAAGTCATCTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIEQFVNFVIRPPRAEYNPDQYLWEPEFTLAGRKYKRIDLELTNGRDQTLKCSHYVPAVIPDNTALPCVIYCHGNSGCRADANEAAVILLPSNITLFTLDFAGSGLSGGEYVSLGWHEKQDLKCAVSFLRNNKEVSCIGLWGRSMGAVTSLLYGAEDPSIAGLVLDSAFSNLYDLMMELVDVYKIRVPKFTVKMAVQYMRRVIQRRAKFDIMDLDVVQFAPKTFIPALFGHASNDMFIQPHHTDRIHQAYAGDKNLIKFDGDHNSPRPQFYYDSVSIFFYNVLHPPQFPSVCSNKLDKYYNLGAFKVGAGTNESLLYEIINGLRAAGPDAGSSSAAAANFTNATKSVVELLTERVNQLSIKTDNDLDFLLDENHNLTEMDTHTAESHLEDKSHRQNEECCSYTSSNRESWGRCSSLGAASDGSSLGERPEIPSHKHKSMTLRALATPLRRIRRKPLAIPKERKNRSLWKRLKQERQEMGESLTQRFRLCLQGQAQHKRTKSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..41#518..599#705..808#1036..1162#1247..1341#1588..1711#2285..2365#2464..2562#2660..2845#2923..3010#3100..3170#3241..3309#3564..3707#3955..4152#ATGATCGAGCAGTTCGTAAATTTTGTCATCCGTCCGCCGCGGTAATTGCACTGTAAATATTTTTTTCCCACTGAAATGATGCCTCGTGCTGTAGACTATCATGTTTCGCTGTATTAGCTCGGTTCTGTGATTTAGACGGTCATGCTTCCTAAGCCGTGGTTGAGTATTAATCTTACCACTTCAAGCATTGAAAAGCTCAGTACTTGAAATATCCAAAAGTAGGAGTTTGAGGCTGTTATTTATTAATCCCTGCTGTTGAAATTACTGTACTAGCTTGTCGAACAATTAGCGGAGTGTTGTAGTCGCAAGTGCCGCAAAGGGGGCTTATGCATTTAGTTAGCACATCAACATTCATTCCACAGTACTCTTTTTCCTAAAGATAACTTTACTTGTTTTCTTTAAGATGCACTAATGTCTAATAATGGAGTTGGAACTCGGAACCCCACAAAATGTTGATAGTCAACTGATGCTTTTTATCTTTATGGTATGAGGCAGTTAATTGGCTATGCATTTGCAGTGCAGAGTACAATCCAGATCAGTATCTGTGGGAACCGGAGTTTACTCTTGCGGGAAGAAAGTACAAACGAATAGATTTGGAGGCAAGTAAGGGGAGCTTTTTAAGGCCTTCTTTCTCTTTCATTTGTTGAAGAAAAAATCACCCTTTTACTATATATTAGCCTTATTCTGTTACTTGTATATGGCAGCTTACGAACGGAAGAGACCAGACCTTAAAATGCAGCCACTATGTTCCTGCTGTCATCCCAGACAATACTGCCCTTCCTTGTGTGATCTACTGCCATGGAAATAGGTATTTATCATAGTTGGATTATGCTTATAGGTTCTCAATTTCTTATATTAATATGATCAATCTTTTGGTGGGACCAACATTCTGATCATAGTTTACACTCTAATTCTTGGAGACCGGTCATTTATCTGTTAGTTACAGTCTCTGAGTTATTGAGATGAATCATTAATTTTGTTTTCTTCTTGTGCTTATCGTATTCCTTACAAGCTCTTTCTCTTAACTCAATGCAGTGGATGCAGAGCGGATGCAAATGAAGCAGCTGTCATACTTCTCCCTTCAAATATCACCCTCTTTACACTTGACTTTGCAGGGTCAGGGCTATCAGGTGGAGAGTATGTCAGCCTTGGTTGGCATGAGGTACATAGTCATCATAATTTTTTGAAAACACACTCTTATTGTTTTGCAATTGCACTAATCTGATAAAAATACAATCACTCTCAGAAACAGGATCTCAAATGCGCGGTGTCCTTTTTGCGAAACAATAAGGAAGTTTCTTGCATAGGCCTTTGGGGGCGATCAATGGGTGCTGTTACAAGGTATTTGGTTAAAGCGTTTGTGTTTCCCAGTTTATGACCAATTATCCAATACTTTATTTCTCTTAATGATACATTATTTTTTAAGTCTTTGGATACACTAGAATCTTTATAATATATAATTCCTGTTGATTATTTGAATTGTTACTTAGAAGTACCCCTGTCCATAAAATATTTTAAATATTTAGGTTCTATTTATGTATTGAATTTTGGTAAGTTCTTCATAACTTCTGTCCAAACTTTTGACAGCCTACTGTATGGAGCAGAAGACCCCTCAATTGCCGGTCTGGTTTTGGACAGTGCTTTCTCTAACCTATATGACTTAATGATGGAGCTTGTAGATGTTTACAAAATCCGAGTTCCTAAGTTCACGGTATGCTTGTCATTTTTGCAGAATAGTCTTGTTCACTGTTACTATGAACTGAATAAAGGAACCATTCGCTTTCTGGAGTTTGTATGATATAGGCACATGCTTTGATGAACTTTAGCTTATGCGGTAATCCGCAATCGGTGGTTTATGGTGCTTGGTTATACCGCTTGTCACCTTGTTACTGTGCTTCAGCTGACTGCTGTGTGCTGTGTGCATGACAAAGAACATGTATCTATAATTAGAAAATAATGTGTTTACATCCAGAAATAGTAGTCTTTAGGGAGCTTTGTGCGGTTCAAATGTTTTACAACTCTGGTTGCGCAACTGTGCATGACACTAGCTAACTGGTAGGTAATGTATAAAAGGTAAGAAAAGTTTTCCAAACTTCAGTTCATGCTCTATAATATAATAAAATTCTAGTATTTTCTGGTTATATATCAAGTATAGGAATAATCTAAAGTTCTAGTTAGCGATGCTAGTTTCATGTTAATTGTCTGCTAAGTTAAGTGCCTAACTGCCCACTGACTGTTGCAATACTTGCATCATATAATGTTTGCTATTATTTATATTGTTCAGGTTAAGATGGCTGTGCAGTACATGCGCCGTGTAATTCAAAGAAGAGCTAAGTTTGATATAATGGATCTTGATGTTGTTCAGGTGTGCTTTCTAAATTACCATTTGTCAGTTTCAATGGAAATCAAAGCTAACATTGGTGTTTGCCTAATCACCTCTTCTGTCTCCTTATTTTACAACAGTTTGCCCCCAAGACATTTATTCCTGCATTATTTGGACATGCATCAAATGACATGTTTATTCAGCCCCATCACACGGACCGTATTCATCAGGCATATGCGGTAAGTCTAACTCTTGCTTGCTTTACAAAGGCTGAACAGTTAATGGATGCATGCTAAATACATTTATAACTCATTTTCTTGGTGTATTTGTCTACAGGGGGACAAAAACTTAATCAAATTTGATGGCGATCACAATTCCCCCAGGCCTCAATTTTATTATGATTCTGTTTCAATATTCTTCTATAATGTTCTACACCCACCTCAGTTTCCTTCAGTATGCTCAAATAAGTTAGATAAGTACTACAACCTTGGTGCTTTTAAGGTTGGAGCTGGAACAAATGAGGTGATTATCCTTTTTTTAATGCCTATATTATCAGAAATTTTGAGGAAATTACCAACCAATTTGCTTGTATTTTTCAGAGCTTACTGTATGAAATCATCAATGGTCTAAGGGCTGCTGGTCCTGATGCAGGCAGTTCATCGGCAGCTGCAGCTAACTTCACAAATGGTGTGAGTCAGTTCCCTTAGTAGGTTATTAAATTGATATCATGAATTATCATTGTGATCCCTAAGTCAATTCCTTTTTCATTTTGTTAGCTACAAAATCAGTGGTTGAATTGCTGACAGAGAGGGTCAATCAGTTGTCTATTAAAACAGATAATGACTTGGTAAGTTCATCAGTGGTTGGTTTGCCTCAAGTACTTGAGATCTTAGCTGAGTATCTCCATCTGAATGCAGGATTTTCTTTTGGATGAAAATCATAACCTCACTGAGATGGACACTCACACTGCTGAGTCTCATTTAGAGGTAAAATAAATGAGGATTTTGAAGCATAAAATAGTTTTTTTTTGCATTGTAATTTAACACTGTGTTCTGTAAACATCTTTACATCAACATATGGTATAGTTCCCTTAATGTGGATTACCATATGTTTGTTGTTCCTACAAAACACCAAAAGCATATTTTGTTGCTCTGCTACATTTGATTGTTCCCTGAGTACAGAATATTACATAGAACTGTTTTGCTATCTCACTGATACAAAGTATTACTTCCTTTTGTAGGATAAATCTCACAGGCAAAATGAGGAGTGCTGCTCATACACAAGTTCAAACCGAGAGAGCTGGGGAAGATGTTCTTCCTTGGGGGCAGCGAGTGATGGATCATCCCTAGGCGAGCGCCCTGAAATTCCTAGTCATAAGCATAAGGTATGTCTTCTTTCTTTTCTCATTTTTGATGTCCATCTATTGCATGACCATACTGTCCTTTTTTCATAGGGTAACTTACCTTAGATATTTTTGTTAACACATCTTTTAAATAGATCCTCAAGTGAATGCATATGTCATTTTGTTTGTTACCTACTGAACCTCTCAAACTAGTGACATTGCTTTGTCCCTGACAACAACGGAAATTTTCTATTAGATCTCAATCTCATCATTTGTTCTGGAACTGTAGAGCATGACGCTACGGGCCTTGGCAACACCACTGAGACGGATACGAAGGAAACCGCTCGCTATACCAAAGGAGAGGAAGAATCGATCTCTATGGAAGAGGCTCAAACAGGAGAGGCAAGAGATGGGGGAGAGCCTAACCCAGCGATTCAGGCTGTGCCTCCAAGGCCAGGCTCAACACAAGAGAACCAAGTCATCTTAA</dnaseqindica> |
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