BGIOSGA021248
| Gene Name |
BGIOSGA021248 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013000K15, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021248, complete gene. |
| LocusTag |
P0021H10.10-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021248-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021248-PA |
| Length |
8245 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:16711002..16719246 |
| Sequence Coding Region |
16718499..16719246,16717327..16717401,16717174..16717208,16717009..16717087,16716774..16716863 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:16711002..16719246 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGACAATAATAGACTATGTTGACCTGTGCAATGATGAGGAGATTATTGTAGAAGAACCTGGTCCTCATGGACAAGTTCATGCAGCTGACATGCATGTAGAATTAGTTGACTTGACCACTGAAGGAGATGGTGTTGAAGATCAAAATATTCCTGGCAAAGATGATGCTGTTCTGTGTACAACATTACACAGTCCAAATTTTATTGCAGCTCATGGTCAAGGTGAAACAGCTCACCGCATAGTAACATTGTGTAAACAGGGATTCATTGCAGTAGTTGATGATGCAGAAGAGGCTATGCAATCTGGAAATAGGGAGCTCTCTGCAGCAAATGATGGCAAGGGAGAGGCCATGCAATCTGCAGATCAGGGGATTGTTGTGGCAGGTGATTGCACGGAAGATGTTATGATGTCTGGAAATCAGGACTTTGCTTCAGCAGTTGCTGATGCAGAAGAGACAATGCAGTCTGGAACTCAGGAATTTGTTGCAGAAGGTGATCACTCAAGAGATGCTATGCAGTTTGGAAATGCTGGTCAAGCTTCCACATGCTCATCAATGTCAGAGCAAGGTGCTATCACATACTCATCAATGACAGAACAAATTGCTACTGCATCCTCATCAATGACTGGACAATGGAGTAGGGAGGCAGCTGCTTTTCTATGTTCACGTCCCATGTCTATTGCATTGCCATTCCCCCGGCAGTTCTGGAAAGCTGGGGAATACAGTGTTGCTGCTCAATCCACCATCAACAGTGATCAGAACCACTTAAGGATTCACCCCAAGTTTCTTCATTCGAATGCTACTTCACACAAGTGGGCATTTGGTGCTATTGCAGAACTTCTCGACAATGCTGTTGATGAGGTGAACAATGGAGCAACCTTTGTGAAGATAGATAAGATAAAATGTTCTCTCATTGATGAGTATTCATTGGTAATACAAGATGATGGAGGTGGTATGAGTCCAGAGTCTCTTCGACATTGCATGAGCTTTGGGTTCTCCAAAAAAAGTGGGAATTCATCCATTGGACAATATGGAAATGGGTTCAAAACCAGCACAATGAGACTTGGAGCAGATGTTATTGTATTCAGCTGCACACAAGATAATAGGAGATTGACACGGAGTATTGGTCTACTCTCTTATACATTCCTTACAAAAACTGGCTGCAATGACATATTAGTACCAGTGGTTGATTATGAATTTGATGAATCATCTCATACTCTCAAGAAGATAATGGACCGTGGTGAGAAACATTTTTCTTCCAATTTGTCCACTCTTTTGAAGTGGTCTCCATTTACTACAGAAGATGATTTATTGAATCAATTTGGAGACATGGGATGCCATGGTACCAAACTAATTGTGTTCAACTTGTGGTTCAACGATGCATGGGAAATGGAACTTGACTTTGCATCTGATGAAGAGGATATTATGATCTCAGGAGCACCTGCCATGCCAGATGGAAAGAAGACAGTAGGAAGGTTAAATCATATGCATGTCGCAAATCGCTTTCGATATTCACTTCGTGTTTATGCATCTATACTATATCTTCAGCTACCAAAACACTTCAAAGTCATCCTGTGTGGACAAGTTGTTGAGCCACATCACATTGTCAATGATCTCATATACTGTGAATGCATCAAATATCGACCACAAGTTGGAATAAACATAGAGGTTGACGTTATTACTACAATTGGCTACTTAAGAGGTGCTCCAAAACTGGATATACATGGATTTAATGTCTACCACAAGAACCGCCTTATACTGCCCTTTTGGTGTGCTCACCCTGATAAAAGTCACAGCAAAGGCATTGCTGGGGTTTTGGAGGCAAACTTCATAAGACCTACTCATGATAAACAAGATTTTGAGAAGACGGGACTTTTCCATAGACTTGAGACACGGTTGAAAGAAATGACACTGGAGTATTGGAAGCACCATGCTCATTTAGTTGGATATGCTCGAGTCACAAAAGCACTTCCTCCAGCTCATTATGCATCCACTGTTGCTCGTGATGATAGTTTAGCAGCTCAAGCTTCCACAGTGGCTTATGATGACAATTCAAGAGCCAGAGAATCTGTATTGTTTGACATGTCTTCCAATGGAGAGTCATCCAAAAGAAGAAATTCATGCTCAGTGATTCATTGGAGGGCTCAAAAAAGGCAGCACATCAATGATTACGCTAATCAACCTCCAGACGTCAATGCTGTTCAGATGCAAGATGAAAGGATCAGACATTTAATCTGTCAGAAGAAGGTGCTAAAGGATGAGTGCTCTAAACTTGAGGCATCAGAGCAGCAACTCTTATGTAAGGCAGACCGCTTACGAAACGAGCTCCTTGAGTGGCATGAGATGTACAAGAAGCTAACCGACGAGGTGAAATTCTACGATGCATACGCATTGCAGCGTTGCAACCACTCCAGCTTCCCACGGTATCAAGGTTCTGACGCTGGATGTCTTACAAGACCTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MTIIDYVDLCNDEEIIVEEPGPHGQVHAADMHVELVDLTTEGDGVEDQNIPGKDDAVLCTTLHSPNFIAAHGQGETAHRIVTLCKQGFIAVVDDAEEAMQSGNRELSAANDGKGEAMQSADQGIVVAGDCTEDVMMSGNQDFASAVADAEETMQSGTQEFVAEGDHSRDAMQFGNAGQASTCSSMSEQGAITYSSMTEQIATASSSMTGQWSREAAAFLCSRPMSIALPFPRQFWKAGEYSVAAQSTINSDQNHLRIHPKFLHSNATSHKWAFGAIAELLDNAVDEVNNGATFVKIDKIKCSLIDEYSLVIQDDGGGMSPESLRHCMSFGFSKKSGNSSIGQYGNGFKTSTMRLGADVIVFSCTQDNRRLTRSIGLLSYTFLTKTGCNDILVPVVDYEFDESSHTLKKIMDRGEKHFSSNLSTLLKWSPFTTEDDLLNQFGDMGCHGTKLIVFNLWFNDAWEMELDFASDEEDIMISGAPAMPDGKKTVGRLNHMHVANRFRYSLRVYASILYLQLPKHFKVILCGQVVEPHHIVNDLIYCECIKYRPQVGINIEVDVITTIGYLRGAPKLDIHGFNVYHKNRLILPFWCAHPDKSHSKGIAGVLEANFIRPTHDKQDFEKTGLFHRLETRLKEMTLEYWKHHAHLVGYARVTKALPPAHYASTVARDDSLAAQASTVAYDDNSRARESVLFDMSSNGESSKRRNSCSVIHWRAQKRQHINDYANQPPDVNAVQMQDERIRHLICQKKVLKDECSKLEASEQQLLCKADRLRNELLEWHEMYKKLTDEVKFYDAYALQRCNHSSFPRYQGSDAGCLTRP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..748#1846..1920#2039..2073#2160..2238#2384..2473#2555..2630#2878..2956#3140..3274#3837..3935#5590..5691#5779..5925#6101..6193#6618..6666#6759..6870#7035..7210#7288..7394#7474..7529#7862..7904#8087..8245#ATGACAATAATAGACTATGTTGACCTGTGCAATGATGAGGAGATTATTGTAGAAGAACCTGGTCCTCATGGACAAGTTCATGCAGCTGACATGCATGTAGAATTAGTTGACTTGACCACTGAAGGAGATGGTGTTGAAGATCAAAATATTCCTGGCAAAGATGATGCTGTTCTGTGTACAACATTACACAGTCCAAATTTTATTGCAGCTCATGGTCAAGGTGAAACAGCTCACCGCATAGTAACATTGTGTAAACAGGGATTCATTGCAGTAGTTGATGATGCAGAAGAGGCTATGCAATCTGGAAATAGGGAGCTCTCTGCAGCAAATGATGGCAAGGGAGAGGCCATGCAATCTGCAGATCAGGGGATTGTTGTGGCAGGTGATTGCACGGAAGATGTTATGATGTCTGGAAATCAGGACTTTGCTTCAGCAGTTGCTGATGCAGAAGAGACAATGCAGTCTGGAACTCAGGAATTTGTTGCAGAAGGTGATCACTCAAGAGATGCTATGCAGTTTGGAAATGCTGGTCAAGCTTCCACATGCTCATCAATGTCAGAGCAAGGTGCTATCACATACTCATCAATGACAGAACAAATTGCTACTGCATCCTCATCAATGACTGGACAATGGAGTAGGGAGGCAGCTGCTTTTCTATGTTCACGTCCCATGTCTATTGCATTGCCATTCCCCCGGCAGTTCTGGAAAGCTGGGGAATACAGTGTTGCTGCTCAATCCACCATCAACAGTATGCTCTTTACCTTCCTTTTCGGGCCCAGCAGTCTATATCTTATCATGCTACCAACAGCAATAAATGTCACCTCATTTAGAACCCTCAGTGCCGGTGGCTTTTTATTTCCAGTTTTCCACTGTCTACTCCACTTGACCAGACCTCATCATTGGCAGGGCAAAAACTGCAAACGAACAATTGACTCTTTCATATAACTCTACTCGAAAATGAATTTTATAGAAGGGCTGTTGCAACTTATATATAGGAGATATAATAAGAGATATTGTGTTCATCTGAAGTTAAAACAAATCTAAAAAACCTTCTTTCATCATCTATTTCACAGGAAAACCCACTAGGTAGACTAAAACATTTGCTATATTTTGTATATTCATCAGAAATGCTTTCTACCTGGCACTGCCGAAAATGTTGCTGTGCGGATGCTATGGCACTATGGCAGACGTACTAATATACTATTTATTTGAACTATTTCTTTGTTAATTCGGTCTATCTAGGAGTAAATAACTAAATGTCAGTATTTCCCAAAATCACATGTTTTGTTGAAGTATTTCGGCTAGAGACATGTAGCCCGAAGTTTTACTTCAATCAAGCAAACCATATAAAGCTAGTATCACTAGCCACTGAACATGATATTTTTAAAAGCTTATGACCTCCAGATCTGGAGCGACATGCTACCAACTAGAAAAACCTAGCGTTATCTGCAATTATGATAATACAACATGTGATATTTATGAAACTACCTTTTCTCCTAGATATTCCATATAATAGTGATAAGTTTTCAATTGTTAAATTAGGTTGCATCTAGGATTCAGTTAAGAAACAGCAAAATAAGTCTTATGTTTGTAATCTTTTTTCTCCAGACTATGTCTATTCCTCCCCTAATACCAAAATATCCTTTTAAACCATGTTGCCCGCCCTCTTTCTGTATGGTATTTAACATAGCATACAGAGGAAAATCTTGCTCTTATGTTGTATTAGGATTATTTGCTAGTTCACTCATCTGGATTGGTGGTTTTGAACTTTAATCCCATTCCTATTAGTTTGCACCTTTTTCTTTATTATAGGTTATTCTCACGATTAAATTTGCAATTTTTCAGGTGATCAGAACCACTTAAGGATTCACCCCAAGTTTCTTCATTCGAATGCTACTTCACACAAGTGGGCATTTGGTGGTGCGTCATAGTGGCATCAGTAAAAGCTTTGCACTTTTCTTCTGCTTTTGTATATGTGCTCTTAACTATTCAGACATGTACTCAAGGGTGATTTATTGATTAAATTTTGTTTCTACAGCTATTGCAGAACTTCTCGACAATGCTGTTGATGAGGTTTTGATTTAAATATATCAATGCTAAACTTTGTCAACATTATTTGTGTTTCAATTCTATTGTTTTACATGTTTAACATGGAAAAGGTGAACAATGGAGCAACCTTTGTGAAGATAGATAAGATAAAATGTTCTCTCATTGATGAGTATTCATTGGTAATACAAGGTATCATTCAAATTTGTACTATCTAATTGTGTTGCCGATGTAATATGTTTTTCTCTGAAGGAATTTTCTGCATGAAGTTTTTTCCTAAGTAGAAATATTGTGTGTATTGTTTATTATAACTGATATTCTTAAATTCTATTTCAAGATGATGGAGGTGGTATGAGTCCAGAGTCTCTTCGACATTGCATGAGCTTTGGGTTCTCCAAAAAAAGTGGGAATTCATCCATTGGACAATGTAAGAGTTCTGAACAGTGCCTTTGGCCCCTGTCTATTGCTTAATACTTCAGAACCTGATTTGCAAGTTCACCACTACCAGATGGAAATGGGTTCAAAACCAGCACAATGAGACTTGGAGCAGATGTTATTGTATTCAGCTGCACACAAGATAATAGGTTCTTCCTAATTTAACATTACATTATCTTCTTATAATATTTATATTCAGATAAGAAAAGTCAATGCAGAGTAATACTGTTTCATCAACATATTTAGCGTCAATTCCTCAACCTCTTTGGTTCTTACTGACCCTGAAAATCACCACATGATGTTAATCATTGAAGCAAAATATTAATTATATTAAATGTTGCTTTCAGTTCTCTCTGATTTATTGAGCTAACTCTGTTTATGTTAATGTTTTGACAGGAGATTGACACGGAGTATTGGTCTACTCTCTTATACATTCCTTACAAAAACTGGCTGCAATGACATATTAGTACCAGTGGTCAGTTCATTAACTTGTTAGCTACATAACCTATATCAACTTAACTTTGTTTCAATGCAGAAGTTAGCCAGTAGTAAAAGTTTTTAGCAAACTAGTTACGTGCATATGGCTCTTCAATTTTGGTCTGTACATGACACTAATTTTATAATCAACTAGAGAAACTTTCTGTTATTTTCTTTGTAGGTTGATTATGAATTTGATGAATCATCTCATACTCTCAAGAAGATAATGGACCGTGGTGAGAAACATTTTTCTTCCAATTTGTCCACTCTTTTGAAGTGGTCTCCATTTACTACAGAAGATGATTTATTGAATCAAGTAAGTTTCTCTATTTATCTTTATTTCTTTATATCTACCATAATACATTTTGTAAATATATGTTGCAAATGATTTTATTGGGTCACGGTATCCTAAGAATCAAATATGCAGATACACCAAATACAAGTAATAGTTAGTTCTTCAATGATAGCATAACTACTTTATACTCCCCCTACGTGTGGAAACATGTTTTGAACATATGTAAAGTTAAATTTTCTAAACTTTGAGCATCAATATTCTTTATTATGACTGGATACATAAAATCCATATGCATAAATTTGCCAGAAAAATACTTTAATAATATTACAATTTTATGAAATTCTAAAAGTATATTACAATGTAAATCAGTGGTCAAAGTAACATGATTGGGGCCATTTTAATGTCAAAAAGAATATATGTTCCTGACTGGTAGGTGTAACACAAAGATTTATTGTTATTGTTATTGTTATTGGCGAATATCTAGACTTTGTCTCGATGTGCAATTGCTCATGGTATATATCTTTTTTCATATTTAGACAGCAGGCTGTTCAAGATTTTCACATACTCATACATTTTCTTTCAGTTTGGAGACATGGGATGCCATGGTACCAAACTAATTGTGTTCAACTTGTGGTTCAACGATGCATGGGAAATGGAACTTGACTTTGCATCTGATGAAGAGGTAAATGTAAATGTAAATGGAACTTGACTTACTATTTACTTTTTCCTTATCCCAGAAATGTAAATGTTCATTGTATTTAGTTTGTGCAATACTCTGTGAAGTATTATAAAACTTGACTTTCAAGCTGTTTGGTTTGAGTGAACTGGTGAATCAGTGAATACAACATCTAATTCTAATTTTAAACCTAACCACTTGTTTAGTTGGGAGAATGGAATGAATCTGTGCATCAGAGAATGTACATAGGCTCTAGAAAGATGCTAGAGGAGAGATAATTTTGTTATTATAGGTGCTGAGGGGTGTGTAAGTTGGTTCTTTTGCTAAAATGGTTGGCATCTCTTGCTAATCTTGGCACCTGGTCCTAAGCAATATTTTTTTGTTTTTAGCAAGGAAAATCTATCCATATCATTTTATAAATTATTCATTTAAAATATAGAATTTCCAAATTTTTAGAACATATATCACCTAACATGGTGCTAAGGGATAGGATAAAAATATGTAAGAGGGGTCTTTTGGAGAGATAGCACTCATATGTCACTGTCTACTATATTATCCAGAGTGGGTGGTAAGGGATGCCAATCATGCTCTCACCTCCTCACCCTCAAAAGCACCAAAAAGCATTCTTCCTGAGATGGTTAGATTACTTATGCTAAAAAAATTTACTTATTTGCTTACATTTGTTTATATATTTTTTGGCAGTAGTATACAGTTATGTTTGCACGCGTTGAGTAACTGATATCATCTTATGTACTGAAATCATTTACTTTCCATTGAGGGAAGATATAGAAATATTATGATCTAGATGTCCATGTCCATTTTTTATCTTTTACTTGTACCACCTTTGGAGCC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| External Link(s) |
