BGIOSGA021950
| Gene Name |
BGIOSGA021950 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021950, complete gene. |
| LocusTag |
OS06G0142900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021950-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021950-PA |
| Length |
3954 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:2412758..2416711 |
| Sequence Coding Region |
2416595..2416711,2416323..2416473),complement(2415510..2415778,2414882..2415161),complement(2414118..2414422 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:2412758..2416711 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGAGGAAATGCCAACCATGTAACACTGGACATTCTGTTGTGGAGCTCGCTATTGCTATACATTATGTCTTCAATGCCCCAATGGATAAGATATTATGGGATGCTGGTCAGCATACATATGCACACAAGATTCTCACAGGAAGGCGCTCACTCTTTCATACTATTAAGCAAAGAAAGGGGCTTTCAGGTTTCACATCCCGTTTCGAGAGCGAATATGATCCCTTTGGTGCAGGACATGGATGCAATAGTCTCTCCGCAGGCCTTGGGATGGCAGTCGCAAGGGATCTAGGTGGGAGGAAAAACCGAATAGTAACAGTTATAAGTAACTGGACAACTATGGCTGGTCAGGTGTATGAGGCAATGGGTCATGCCGGTTTCCTTGATTCTAACATGGTAGTGATTTTAAATGACAGCCGGCACACCTTGCTTCCTAAAGCAGATAGCCAATCAAAGATGTCTATTAATGCCCTCTCTAGTGCTCTGAGCAAGGTTCAATCCAGCAAAGGATTTAGAAAGTTTAGGGAGGCTGCAAAGGGACTTTCCAAATGGTTTGGTAAAGGGATGCATGAATTTGCTGCCAAAATTGATGAGTATGCCCGTGGTATGATAGGTCCTCATGGAGCAACTCTTTTTGAAGAACTTGGATTATATTATATTGGGCCTATTGATGGGAATAACATTGATGATCTCATTTGTGTACTCAAGGAGGTTTCTACTCTAGATTCTACCGGCCCAGTACTTGTGCATGTAATCACTGAGAATGAAAAAGACTCAGGTGGAGAATTTAATAGTGAGATTACTCCCGACGAGGAAGGGCCTCCAGACTCAAGCCAAGACATTCTAAAGTTTTTAGAAAATGGTCTTTCTAGGACATATAATGATTGCTTTGTAGAATCACTAATAGCAGAAGCAGAGAATGACAAGCGTATTGTGGTGGTTCATGGAGGCATGGGAATAGATCGATCAATCCAATTATTTCAGTCCAGATTTCCGGACAGATTTTTCGATTTGGGTATCGCCGAGCAACATGCTGTTACGTTTTCTGCTGGTTTGGCATGCGGAGGCTTAAAGCCTTTCTGCATAATTCCATCCACCTTTCTCCAGCGAGCATATGATCAGATAGTCGAAGATGTGGACATGCAAAAGATACCAGTTCGCTTTGCAATCACAAGTGCAGGTCTGGTGGGATCTGAAGGCCCGACTAACTCAGGACCATTTGATATTACATTCATGTCATGCCTGCCAAACATGATCGTCATGTCACCATCTAATGAGGATGAACTTATTGACATGGTGGCAACAGCTGCAATGGTTGAGGACAGACCCATTTGCTTCCGGTATCCCAAGGGTGCCATCGTTGGGACTAGTGGCACTTTAGCATATGGGAATCCACTTGAGATTGGTAAAGGAGAGATTCTTGCTGAGGGGAAAGAGATAGCTTTTCTTGGTTATGGTGAGGTGGTCCAGAGATGCTTGATAGCTCGATCTCTTCTGTTCAACTTTGGCATCCAGGCAACTGTTGCTAATGCGAGATTTTGCAAGCCACTTGACATTGATCTGATAAGAATGTTGTGCCAGCAACACGATTTCCTAATCACCGTGGAAGAAGGAACGGTTGGTGGTTTTGGCTCACACGTCTCGCAATTTATTTCACTCGATGGGTTGCTTGATGGCAAAATAAAGTGGCGACCCATTGTACTACCAGACAGGTACATCGAACACGCTTCGCTCACAGAGCAGCTCGACATGGCTGGGTTGACTGCTCATCACATCGCAGCAACCGCACTGACCCTTTTAGGGCGACACCGAGACGCACTTTTGTTGATGAAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSRKCQPCNTGHSVVELAIAIHYVFNAPMDKILWDAGQHTYAHKILTGRRSLFHTIKQRKGLSGFTSRFESEYDPFGAGHGCNSLSAGLGMAVARDLGGRKNRIVTVISNWTTMAGQVYEAMGHAGFLDSNMVVILNDSRHTLLPKADSQSKMSINALSSALSKVQSSKGFRKFREAAKGLSKWFGKGMHEFAAKIDEYARGMIGPHGATLFEELGLYYIGPIDGNNIDDLICVLKEVSTLDSTGPVLVHVITENEKDSGGEFNSEITPDEEGPPDSSQDILKFLENGLSRTYNDCFVESLIAEAENDKRIVVVHGGMGIDRSIQLFQSRFPDRFFDLGIAEQHAVTFSAGLACGGLKPFCIIPSTFLQRAYDQIVEDVDMQKIPVRFAITSAGLVGSEGPTNSGPFDITFMSCLPNMIVMSPSNEDELIDMVATAAMVEDRPICFRYPKGAIVGTSGTLAYGNPLEIGKGEILAEGKEIAFLGYGEVVQRCLIARSLLFNFGIQATVANARFCKPLDIDLIRMLCQQHDFLITVEEGTVGGFGSHVSQFISLDGLLDGKIKWRPIVLPDRYIEHASLTEQLDMAGLTAHHIAATALTLLGRHRDALLLMK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..117#239..389#934..1202#1551..1830#2290..2594#2844..3122#3335..3619#3805..3954#ATGTCGAGGAAATGCCAACCATGTAACACTGGACATTCTGTTGTGGAGCTCGCTATTGCTATACATTATGTCTTCAATGCCCCAATGGATAAGATATTATGGGATGCTGGTCAGCATGTATGATCCCTCTATCTTTTTGTTTTGTGCTAAGATTTTGCCTCCAGTAAGCTATCATATACCATTTCATATAATCGGAAATGTTTTACCTTTTGTGTTCAATATTTTTTCTCATCTGCAGACATATGCACACAAGATTCTCACAGGAAGGCGCTCACTCTTTCATACTATTAAGCAAAGAAAGGGGCTTTCAGGTTTCACATCCCGTTTCGAGAGCGAATATGATCCCTTTGGTGCAGGACATGGATGCAATAGTCTCTCCGCAGGCCTTGGTATATATAGTGTTGCCTCTGTTAAATGTTAATACATTAATTCATGCCTTGCACTTCAAGAACTGCTTGCTTTGTTGTTAGACCTCTCCTTCTATTTAAATGGATTTCCTTAAGATATTGATTTCATTGTGTTTGGAATCCGTACAATATTCCATAGTTTTTTTCATCTTCGACTCCGATTAGCTTCCATGCATTTTATCAATAGTTCAGCTACCTGAAACAGAGAAAAACAGTGCTTCTTGCTTTTTAAACCAAGGTATACAGTGCCGGGATGTACGACTCAAAATATAATTCAAGAAATATAATATAAGTTCTGATGTATTCAAGTTCATATCCTTCTGGTGTGGTATCAGCAGTCATGATATGAAATTCTTAAACTATCTTATTTTGCTAATGGAGTTAATAATCATTATAGAAGTTTGCATAGTCTATTAGAATCCTAAGTATGTTTCTACATTTAATCATGAATCTCCTGATGTTTTATTCTTTTATGTCAAATGATTTCCTTTTATTCGTTTATAGCTTGAAAATGATCTCTTGTCAGGGATGGCAGTCGCAAGGGATCTAGGTGGGAGGAAAAACCGAATAGTAACAGTTATAAGTAACTGGACAACTATGGCTGGTCAGGTGTATGAGGCAATGGGTCATGCCGGTTTCCTTGATTCTAACATGGTAGTGATTTTAAATGACAGCCGGCACACCTTGCTTCCTAAAGCAGATAGCCAATCAAAGATGTCTATTAATGCCCTCTCTAGTGCTCTGAGCAAGGTTCAATCCAGCAAAGGATTTAGAAAGTTTAGGGAGGCTGCAAAGGTAAAACTTTATGCTTCTGTATGACATAATGTACTAGATTTGAACTTGCTAATAAAACATAGTTTTTTTTAACTGTCCTGTTATTTCCTGATTATGATTATAGTATAGACATATAGTTTCTAGTTGATTGTTTCTTTTCAGTTCTCTTTTTTATCTGGTAGTGACAAATGTACTTGTTACTTTCAACTTATTGTTATAAAAGCCTGCTAATTGACTTGCTGCTGTACATATTATGATGAAAAATTTCCAGGAAGTTTTGGCATGGGTTGTCTTTCTACTTTCTTAATAACAACAGTCTTGCACTGCCTTGAGTTTCCTGCTTTGATACGAATTTTGTTTCCTTTCTAGGGACTTTCCAAATGGTTTGGTAAAGGGATGCATGAATTTGCTGCCAAAATTGATGAGTATGCCCGTGGTATGATAGGTCCTCATGGAGCAACTCTTTTTGAAGAACTTGGATTATATTATATTGGGCCTATTGATGGGAATAACATTGATGATCTCATTTGTGTACTCAAGGAGGTTTCTACTCTAGATTCTACCGGCCCAGTACTTGTGCATGTAATCACTGAGAATGAAAAAGACTCAGGTGGAGAATTTAATAGTGAGATTACTCCCGACGAGGAAGGTGTGCAATTACAAATTGTCAACGAAATTTTCTGCAATCCTATGAATATGATAGCGTACATTCTGCTTTCTCTGTTTTCTCATTTTACATTCTGGATGTCTTGCTTTGATATTAATACAGAGAGATAAGTGAAGCACCACAGCATGAATTTGAGGAAGGAAACAGCGCGATAAGGATTTGTTTGAGTGGCAATATGCATGTGAATGTTGTATTTGTTTGAAAAATGATAGAACACACTACTGAAATTTCAAATGAAATATGTGAATCGGTTCTCACCTGTAGAATCATTCACAATTCACAACATTCAGGAACTTTAAGGTTTCACATATCAGTTATGTTAAATATTACATGTATAAGTCAACTATCCTTTGAGATCCTTCCTACATGTCTTTGCACAATCAAATCATATAGGATACTAAAATGAATCTATAATTTATTAACTTTTTTCTCTGCTAACAGGGCCTCCAGACTCAAGCCAAGACATTCTAAAGTTTTTAGAAAATGGTCTTTCTAGGACATATAATGATTGCTTTGTAGAATCACTAATAGCAGAAGCAGAGAATGACAAGCGTATTGTGGTGGTTCATGGAGGCATGGGAATAGATCGATCAATCCAATTATTTCAGTCCAGATTTCCGGACAGATTTTTCGATTTGGGTATCGCCGAGCAACATGCTGTTACGTTTTCTGCTGGTTTGGCATGCGGAGGCTTAAAGCCTTTCTGCATAATTCCATCCACCTTTCTCCAGCGAGCATATGATCAGGTGCCCTTTGCTCCCATCTCCCCATGTATTCCTCCTCTCTAACTGTACTCCATATTTGCTCTGCTACATGGTTGAAACAATCATTAGTAGGCTTTGTAAGCCATCTTCCAAATTTTCATGTACTACAATAAAATAGTTGAAACAAGCATATTTTCTGTAATAGTGGGCTATAGACTAAAGCTCCACTTAATCTGTATGGCTGCTTTACTGCAAGTACTTCGCATTTGATAAAGCTCACATATATGCCAGATAGTCGAAGATGTGGACATGCAAAAGATACCAGTTCGCTTTGCAATCACAAGTGCAGGTCTGGTGGGATCTGAAGGCCCGACTAACTCAGGACCATTTGATATTACATTCATGTCATGCCTGCCAAACATGATCGTCATGTCACCATCTAATGAGGATGAACTTATTGACATGGTGGCAACAGCTGCAATGGTTGAGGACAGACCCATTTGCTTCCGGTATCCCAAGGGTGCCATCGTTGGGACTAGTGGCACTTTAGCATATGGGAATCCACTTGAGGTAGCTCTACTTCAATTTCTTTTTTTGATTCTAAGCAGAAGTCACTTGGAAAATAGTACAGCTTGAAAGCTATCAGTTACGCTAATGCTGGAATTCATGCCCACCTAAAAGCTGGTGTTCTTTGGTGAACTGAAAAAAACAAGCTGGCAATACCTTTGTGCGCTTAAACATTTTGCATGCTGTTCTTATTAGTTTTGGGGACTCTCTTTCAGATTGGTAAAGGAGAGATTCTTGCTGAGGGGAAAGAGATAGCTTTTCTTGGTTATGGTGAGGTGGTCCAGAGATGCTTGATAGCTCGATCTCTTCTGTTCAACTTTGGCATCCAGGCAACTGTTGCTAATGCGAGATTTTGCAAGCCACTTGACATTGATCTGATAAGAATGTTGTGCCAGCAACACGATTTCCTAATCACCGTGGAAGAAGGAACGGTTGGTGGTTTTGGCTCACACGTCTCGCAATTTATTTCACTCGATGGGTTGCTTGATGGCAAAATAAAGGTAAGAATTTAAACTCTTACACGGATTTTAACTCCTGTTATCTAGTATAAATCCATCCAATATTCTTGCAAGTTGCAATGGAGCTTCACCCTTTTGTATTGCAATATGCCACTTGCCTTGTGCTCCATTCATGTTTTGTATAAATGATAATTTCAAACAATGACTCTTTTTCTGTTAACTTGCAGTGGCGACCCATTGTACTACCAGACAGGTACATCGAACACGCTTCGCTCACAGAGCAGCTCGACATGGCTGGGTTGACTGCTCATCACATCGCAGCAACCGCACTGACCCTTTTAGGGCGACACCGAGACGCACTTTTGTTGATGAAGTAA</dnaseqindica> |
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