BGIOSGA022716
| Gene Name |
BGIOSGA022716 |
|---|---|
| Description |
NBS-LRR type R protein, Nbs7-Pi2 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022716, complete gene. |
| LocusTag |
Pi2_C101A51.12 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022716-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022716-PA |
| Length |
6862 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:11301503..11308364 |
| Sequence Coding Region |
11301503..11301647,11301906..11302053,11305499..11308364 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:11301503..11308364 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:11301503..11308364 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCATGACCCGGTCCAGTACTGCCTGCACGCGGAGAGTGCAACGAACCTCACTACCCACCTAATAGGACTAGTAAACGAGAAGTCAAGGTATTTTATTGTTGCTCATGGCTTTGTGGACCGAATTGGGATATTGGATTGGTCAGTCTTTGGCGAAGGTGAAGAATCCATTCAATCGATGGCGGAGACGGTGCTGAGCATGGCGAGGTCGCTGGTGGGCAGTGCCATCAGCAAGGCCACCTCTGCGGCGGCCCATGAGGCGAGCCTCCTACTCGGCGTCCAGAAGGACATCTGGTATATCAAAGATGAGCTGAAAACAATGCAAGCGTTCCTACGAGCTGCTGAAGTTATGAAGAAGAAAGATGAGCTCTTAAAGGTTTGGGCAGAACAGATACGTGACTTGTCCTATGACATTGAAGATTGCCTTGACGAATTCAAGGTCCATATTGAGAGCCAAAATCTGTTTTATCAGATGGTGAAGCTCAGAAAGCGCCATCTGATAGCTACCCAAATCCGCAACCTCAAATCAAGAGTTGAAGAAGTGAGTAGCAGAAACTCACGCTACAATTTAGTCAAACCTATTTCATCCAGCAATGAGGATGACATGGATTGTTACGCAGAAGACATTCGTAATCAGTCAACTAGCAATGTGGATGAAACTGAGCTTGTGGGGTTCTCTGACTCTAAGATAAGGTTGCTCGAATTAATCAGTGCCAATGTCAATAATGGTCCAACCAAAGTAATATGTGTGGTTGGGATGGGTGGTTTAGGCAAGACAGCTCTTTCCAGGAAGATCTTTGAAAGCAAAGAGGACATCGGAAAGAACTTTCCATGTAATGCATGGATCACTGTGTCACAATCATTTAACAGGATTGAGCTACTCAAAGATATGATACGGCAATTTCTAGGTTCCAATTCATTGGATCAAGTCTTGCAAGAATTGCAGGGGAAAATGGTGGTGCAAATACCTCATCTTTCTGACTACTTGAGAAAAAAGCTCAAGGAAAAGAGGTATTTTGTTGTTCTTGATGATCTATGGTCTTTAGATGCATGGAACTGGATTAATGATATTGCATTTCCTAAGAATAACAATAAGGGCAGTCGGATTGTAGTAACCACACGAGATGTTGGTCTAGCCGAGAAGTGTACCACAACTTCCCTAGTCTACCATCTTGAACACTTGCAGATGAATGATGCCATAACTTTGCTACTGAGAAAAACAAATAGAACACATGAGGACATGGGAACAAACAAAAATATGCAAAAAATAGTTGAACAAATTGTAAATAAGTGTGGCCGTCTACCATTAGCGATACTTACAATAGGAGCTGTGTTGGCAACTAAACAAGTTTTAGAATGGGAGAAATTTTATAAACAGCTTCCTTCAGAACTTGAAAGCAACCCAAGCCTTCAAGCTTTGAGGAGAATGGTGACCCTTGGCTACAACCACCTGCCATCTCATCTGAAATCATGCTTTTTGTACCTAAGTATCTTCCCTGAGGATTTTGAGATCAAAAGGAGTCGCTTGGTAGACAGATGGATTGCAGAGGGGTTTGTTAGAGCCAAGGTTGGGATGACGACCAAGGATGTTGGGGATAGTTACTTTAATGAGCTAATCAACCGAAGTATGATTCAAAGATCAAGAGTGGGCATAGAAGGAAAAATTAAGAGTTGCCGAGTCCATGATATCATGCGTGATATCACAGTTTCAATCTCTAGAGAGGAGAACTTTGTATTCTTACCAGTGCATGATGGCTCCAATCTAGCACAGGAAAACACTCGCCACATAGCATTGCATGGGAGCATGTCCTGCAAAACAGGATTGGATTGGAGCATTATTCGATCCTTAGCTATTTTTGGTGACAGACCCAATAATCTAGCACACACTATTTGTTCAAATAAATTCAGGATGTTACGGGTGTTGGATCTTGAAGATGTGAAGTTTTTAATCACACAAAAAGATTTCAACAATATAGCATTGTTGCGTCACTTGAAGTACTTGAGCTTTGGAAGAATATTCTCGTCATGCATATATACTCTTCCCAGATCTATTGGTAAATTACATGGCTTACAGACCTTGAATATGTCAAGTACATACATTGCAACACTACCAACTGAGATCAGTAAACTCCAATGTCTGCGCACTCTTCGTTGTACAAGGGTATCTAATAATAACAATTTTAGTATAAAACACCCGGTGAAGTGCTTAACTAACACAATGTGTCTGCCTAATATATTCACACCTTCAGTTAGTAGCGACAATCGTGCCAAACAAATTGCTGAATTGCACATGGCCACCAAAAGTTGTTGGTCTGAATCATACAGTGTGAAGGTACCCAAAGGTATAGGCAAGTTGGGAGAATTACAGATACTAGAGCATGTGGATATCAGGAGGACTAATACTAGTGCAATCCAAGAATTGGCGCAACTAAGCAAGCTGACTAAATTAAGTGTGACAACAAAGGGATCCACAGAGGAAAAATGTAAGATACTCTATAGAGCCATCCAAAGGCTCTGTTCCCTGCAATCTCTCCGTGTGGATGCTGAGGGGTCCTCAGGAAATGGAACACTTAAATGTCTAGATTCTATTTCCTATCCTCCTCTGTTACTAAAGACACTCAAGTTGTATGGAGATCTTGAAGAGATGCCCAACTGGATTGAGCAGCTCTCGCACCTCATGAAGTTCTACTTATTAGGGAGTAAACTAAAGGAAGGAAAAACCATGCTGATACTTGGGGCATTGCCCAACCTCATGCTGCTTTGTCTTTCACTTGATGCTTACCTCGGGGAGAATCTAGTATTCAGAACAGGAGCATTCCAAAAGCTCAGGACACTTTGGTTTGACAAGCTGGATCAGCTAAGAGAGATTAGGTTTGAGAACGACAGCTCGCCCCTATTGGAAAAGATAGGAATCCGATACTGCAGGTTGGAAATAGGGATTATTGGTATCTCTAACCTTATGAGGCTAAAGGAAATTACACTTGGATACAGAGTTAAAGTTGGTTATCTTGGTCAGTTGGAAAGAGAAGTTGGCACACACCCAAATCGCCCCGTGCTACGTATGGAGGAGGACCGAAGCTGTCACGACCTGAGAAGGGATGGCAAAGGATCAGCTGTAGAAATGGACGCAACGGAGCCCCTCCCTGAGCCCGAGAGCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MHDPVQYCLHAESATNLTTHLIGLVNEKSRYFIVAHGFVDRIGILDWSVFGEGEESIQSMAETVLSMARSLVGSAISKATSAAAHEASLLLGVQKDIWYIKDELKTMQAFLRAAEVMKKKDELLKVWAEQIRDLSYDIEDCLDEFKVHIESQNLFYQMVKLRKRHLIATQIRNLKSRVEEVSSRNSRYNLVKPISSSNEDDMDCYAEDIRNQSTSNVDETELVGFSDSKIRLLELISANVNNGPTKVICVVGMGGLGKTALSRKIFESKEDIGKNFPCNAWITVSQSFNRIELLKDMIRQFLGSNSLDQVLQELQGKMVVQIPHLSDYLRKKLKEKRYFVVLDDLWSLDAWNWINDIAFPKNNNKGSRIVVTTRDVGLAEKCTTTSLVYHLEHLQMNDAITLLLRKTNRTHEDMGTNKNMQKIVEQIVNKCGRLPLAILTIGAVLATKQVLEWEKFYKQLPSELESNPSLQALRRMVTLGYNHLPSHLKSCFLYLSIFPEDFEIKRSRLVDRWIAEGFVRAKVGMTTKDVGDSYFNELINRSMIQRSRVGIEGKIKSCRVHDIMRDITVSISREENFVFLPVHDGSNLAQENTRHIALHGSMSCKTGLDWSIIRSLAIFGDRPNNLAHTICSNKFRMLRVLDLEDVKFLITQKDFNNIALLRHLKYLSFGRIFSSCIYTLPRSIGKLHGLQTLNMSSTYIATLPTEISKLQCLRTLRCTRVSNNNNFSIKHPVKCLTNTMCLPNIFTPSVSSDNRAKQIAELHMATKSCWSESYSVKVPKGIGKLGELQILEHVDIRRTNTSAIQELAQLSKLTKLSVTTKGSTEEKCKILYRAIQRLCSLQSLRVDAEGSSGNGTLKCLDSISYPPLLLKTLKLYGDLEEMPNWIEQLSHLMKFYLLGSKLKEGKTMLILGALPNLMLLCLSLDAYLGENLVFRTGAFQKLRTLWFDKLDQLREIRFENDSSPLLEKIGIRYCRLEIGIIGISNLMRLKEITLGYRVKVGYLGQLEREVGTHPNRPVLRMEEDRSCHDLRRDGKGSAVEMDATEPLPEPES</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..145#404..551#3997..6862#ATGCATGACCCGGTCCAGTACTGCCTGCACGCGGAGAGTGCAACGAACCTCACTACCCACCTAATAGGACTAGTAAACGAGAAGTCAAGGTATTTTATTGTTGCTCATGGCTTTGTGGACCGAATTGGGATATTGGATTGGTCAGGTACCTGAGTGAGTACTACGCTGTTAATATAGATTGACATGAAATGGAAAACAGAGTCCTCGGCGTCTAAACCCACCTAACCCATGATAGACTGCTGGTAATTTAATTTCAAATGTCAGGGGAATATGATTGTCTGCATGATGCGCGAGTGATATAAACTCCATGATAAGCATCCTCTCTGCTCAGACCTCAGAGAGCTCACTGCAAAAGCTACCATTTCTGATTCGATCTGGTCGCCAAGTTCTCTCCCCTGTGCAGTCTTTGGCGAAGGTGAAGAATCCATTCAATCGATGGCGGAGACGGTGCTGAGCATGGCGAGGTCGCTGGTGGGCAGTGCCATCAGCAAGGCCACCTCTGCGGCGGCCCATGAGGCGAGCCTCCTACTCGGCGTCCAGAAGGACATCTGGTGCGTACTGCACGAAAACCTCACCCGTAGTTTCCATCTTCGCTTCCGTTTTATTGATTGCCAGTTTCAACCAAAATATGTCAGGCAAAACTATTGCTGAAATGCGCAAATATATCAGGGACTTAATATATGTTTTTACTTTGCCTATGGGTGCGTTCCTTTTTCTTGAAACGGTTGCACCCCAGCTTTTAGTGGAAGCATATCCCTATCTCTACTAATATAAAAATTAAAGATATTTTTACCGGTACTTTGATACGTCATCCATGTATGAGTCTGTTTTAAGTTCGTTCGATTTTGGAAATACATATCCATATATCCATATTTGAATCGGTTTTTAAGTTCGTTCCCTTTTGGAAATATAGAAGGAGTCGAATAAGAAATCTCTTTGAAAAAACTCGCATGCTAACCTGAGATGATCGGACTCCTAATTGCAACTCATGATTTTCTAAAAATATATATATCCAAGCAAATTACCACAACGAATTTCACCTTAATTAAACCGTATAACAATAATAAGAAATAACCTTCATCTGTTGTAATGCATGGGCATTTTTTCTAGTAAATTATAAAGTTATCTTAGTAGTGAATGGGACACCAATAATCTTTCTAAAACATCTCTTTAAGTGGAGGACGCAAATCTTTGCCTTTAATTTTGAAAAATATTTCTTCTTGTCATTAAGCAAAGAAAGTCCCTCGGTGGTCGAAATTAACCGTTCCATAAATCATGTGTGCTAAATCCACTGAACTGAAGTAGAACGTTTAAAATACGAGAAATTTTTTATGCCTTGAGAGATACCAAGACGTACCTGTTGTCGAAAGACAACTGTTTCATATCGAAAGACGTGGTTCACTCAGTGAATTAATGGAATAGTAAAAGCAATATATTAATTGGTAAGAAATTTTTTGGAATCTCCCATTATATGATCTTAGGGGGCTATTTATAGCCTTAACACAAACTCATGCCTCCTAGGGTTTAATTTGTATAGGGGAATTTACATGGGTACCCTTATGATAGGGACTTTAGTGAGGGCACACAATATCATTTGTGTTTATGGGCTCTTACGTGAACTCCTTGGGCCGGTCCATTACTGGTGAAAGGCCTCCATGGTGTCTCCCAAGCCCTCTGCCGAAGCCACTTCTAACAAGAGCGAAACCCTCCTGCTTCGCTCTACGGCCTTTGCCCGAAGTGATGGCTCGTTAGGGTGATGGGCTTGGTGGCGAACCCCTCGGTCTTCATCATCTAACTTCGTCAGCTGCTTCGCCTTATGGCTTCGCCTCATGGACTCAGCTAACCTCAAGGTTCTCGTGGTTTCAGCAGGCCCGGCCGAAGGCCCTCGTGATATGCCTCCAACAGTACCATAAATTTTCATACCTCCTAGTACCGTAGATACCAAATTTTATATTAGAAAATATATTCGGTACCTCCTCAAAGATTGAAAAATCACTCTTAAACTACACACATGTCCATAAACTTGGACCAATCAATCATGTCAGTGCGTGAACAAGTAAGATATGTACCGATATCCTAACACTACTGGGAACCCATCTTTAGTCCCAGTTTGCAACCCTCTTTAGTCCCGGTTACAAACCGAGACGCCCAAAGCACATCTTTAGTCCCGATTGGTATTTGATTTCGAGCGGTGCCATGCCCCACATCGAGTTGCTCTCGACATCCCCAAATCCCCACATCAAATTGACATCATATATCGAATGAACATATTCAACAACAAAATCATCCATAAATTCACAAAAACATCTTAAAAAATCTACAACAAAATCATTCATCCACAAATTCTTTTCTTTATTCACTTCTCTCCTTGCTTCTCCTCGGGCAAGGCGGCTGGCAAGCCCGGTCGAGCTCCTCGTCGCCGCCTCGAGGGAGGGCCAACAGCCATGTGAGGAGATAAGGACGCGGCTCTCTCCCTCCACCGTGCGCCTCTTTTTAATTTTTAGTCCCGGCTGCTATAAACAATGGGGACTAAAGTGATGATCTTTACCAATCGGGACTAAAGATCGTTGGCCCCTATAACAATTGAAACGTGGCTAAAAATAATCTTTAGTCATGGTTGGTGTTACCAACCGGGAATATAAGATTATAAAGTGTCGTTGGGCTTTTCAACCGGGGCTAAAGGTATTTTATAGTCCCGGTTTCTATTTGAACCGGGACAAATGTGATTTTTGTCATCCGGGCAAAGATCAGTTCTCCATTAGTGTAATCTGGGCAAATTTTATTACATGACACCTGAAAATTGTGTAATTTGCTCATAGACATCGAAAAATGTGTCATGGATGAATGATATTTAAAAGATTGATAATTTGCAAGAGAACACTTTCAACTCAAATTGGAGGGATAAATTGTTAAGAAAGACATGAATGCCCCTATGACTACATGCTTCAAACATGACGTCAGAGTAAAAATTTTGAAATTATGCAACTCTAAAATTACCATCATCCCAAGTACATCACTACATACATTATATTCATGTTCACTCCAACCTCTGTTCAAAAGCTTTTGACCCTAGGGGTATTCTCGTATTTTTGAAGAATTTTTCTCTTCAAATAAGCTGAAAGCGTCCTCCAGCAAATTATCAGTTTTTAAAGTGTCTTTTAGCCGTGACATGTTTTTACGATTACTACCAGCAAACTACACAAATTTTGATTGTCCTGTAGCAAAAATTTGCTCCTAATCTTTGTATAATGTAGCATTAGAGAGGTCTAAAGTGCATATGACATGGTTCGACTGTTGATGTGGCCAAGAATTTTGCCTTTAGACCCTCGTGCTATAGTACGCATTCAAGTAGACTCTCACCACTCCCAAATATTTTTGTACATCACTTAAAATACAAAATTTCTAAATGTTGAGAAATGCATATTTGCTTATTTCGGGTGGTAAGAATCGATTTTAGAGGCAAACAGTTGTGAAGGGACCTAAGTGTAAAATTCTCGCCACCGTAGCCAGGCATGTCAGCATTTGAGTTACTAGCTGACTGCCCATGCATGCTTTGCATAGGAATTAAAAAAAAAAAACTATCGTGCGCTCTAAAGCCCCCCAAAAACATAATAAAAATATCCCATTGTATTCAATTTCACATTATTTTTTGTACATGTATGTGATGCTATGGAATTGGTCCCAAATGTCAGTGGTGGTGGGTAGTGACAGATTCACCATTCATCACCATTGCAGTCTTTTAAATAACCATCTACAGTTTAGACTTGAAATGATACATTAAACCAATATTAAATACCCATATGTGCTTATAAGTTTATGTACCTAAATGAACCTTCGGTTTCAAATTCAAGGACGGGTCATGTATTTTACTCAAAAACTTATGATGTCTTTAAAGTATATATTGTATGAAAATTTAGTCATTTTATTATTTTTCTAATATAAGATTCGGATTTCTACTAGAGATATCCTAAATTACTTTGAAATGAATGATTGCAGGTATATCAAAGATGAGCTGAAAACAATGCAAGCGTTCCTACGAGCTGCTGAAGTTATGAAGAAGAAAGATGAGCTCTTAAAGGTTTGGGCAGAACAGATACGTGACTTGTCCTATGACATTGAAGATTGCCTTGACGAATTCAAGGTCCATATTGAGAGCCAAAATCTGTTTTATCAGATGGTGAAGCTCAGAAAGCGCCATCTGATAGCTACCCAAATCCGCAACCTCAAATCAAGAGTTGAAGAAGTGAGTAGCAGAAACTCACGCTACAATTTAGTCAAACCTATTTCATCCAGCAATGAGGATGACATGGATTGTTACGCAGAAGACATTCGTAATCAGTCAACTAGCAATGTGGATGAAACTGAGCTTGTGGGGTTCTCTGACTCTAAGATAAGGTTGCTCGAATTAATCAGTGCCAATGTCAATAATGGTCCAACCAAAGTAATATGTGTGGTTGGGATGGGTGGTTTAGGCAAGACAGCTCTTTCCAGGAAGATCTTTGAAAGCAAAGAGGACATCGGAAAGAACTTTCCATGTAATGCATGGATCACTGTGTCACAATCATTTAACAGGATTGAGCTACTCAAAGATATGATACGGCAATTTCTAGGTTCCAATTCATTGGATCAAGTCTTGCAAGAATTGCAGGGGAAAATGGTGGTGCAAATACCTCATCTTTCTGACTACTTGAGAAAAAAGCTCAAGGAAAAGAGGTATTTTGTTGTTCTTGATGATCTATGGTCTTTAGATGCATGGAACTGGATTAATGATATTGCATTTCCTAAGAATAACAATAAGGGCAGTCGGATTGTAGTAACCACACGAGATGTTGGTCTAGCCGAGAAGTGTACCACAACTTCCCTAGTCTACCATCTTGAACACTTGCAGATGAATGATGCCATAACTTTGCTACTGAGAAAAACAAATAGAACACATGAGGACATGGGAACAAACAAAAA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