BGIOSGA022795
| Gene Name |
BGIOSGA022795 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013045F22, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022795, complete gene. |
| LocusTag |
OsJ_21146 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022795-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022795-PA |
| Length |
4253 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:13117157..13121409 |
| Sequence Coding Region |
13117157..13117170,13118453..13118540,13118639..13119450,13119684..13119753,13121212..13121300 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:13117157..13121409 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:13117157..13121409 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGACCAAGAGGGTTCTTTGCAAGTTCTTCATGCATGGAGCTTGCTTGAAAGGAGAGTACTGTGAGTTCTCCCATGATTGGAATGATCAACCAAACAATGTTTGCACGTTCTACCAGAAAGGTTCATGCTCGTATGGTAGCCGTTGCCGATATGACCATGTCAAAGTTTCTCGTAACCCCACAGTGGCTCCACCACCAAGCTCAAGTACTACAACACGTGCATCTAGTTCTCTTCAACCTTTGAGTTTCGGGCGCCCTCACCATGTGGGGTACCAAGCAGATTCAAGCAACCCAAGGCAACAGATATCTATGGATGTGCTGGCACATTCTGGAAGTAAGCCTGTATGGAGAAATGATTTTCAACATGAAAGTGTACTTGAGGATGGGATTGACTGGTCAATAAGTCCAACTGTGCAAAACCAGACAACCTTGAGTCCTGCTGATCTGCCAATCTGTTCTTTTGCTGCTGGTGGTAATTGTCCTTATGGGGAAGAGTGCCCTCAGATGCATGGAGATCTGTGCACAACCTGTGGGAAAATGTGCTTACATCCTTATCGTCCTGATGAGAGGGAGGAACATACCAAGCTATGTGAGAAAAACCACAAGCGTCTTGAGTCTTTGAAACGTAGCCAAGAGATAGAATGCAGTGTCTGCCTGGACCGTGTGCTCTCAAAGCCTACTGCTGCTGAAAGGAAGTTTGGACTCTTATCTGAGTGTGATCATCCCTTCTGTATTTCATGTATTAGAAATTGGCGTAACAATTCTCCTACGTCTGGAATGGATGTGAACTCAGCACTGAGGGCTTGTCCAATATGTCGCAAACTTTCATACTATGTCATTCCAAGTGTTCTTTGGTACTTTTCGAAGGAGGAAAAGCTGGAGATTATTGACAACTATAAAGCCAAACTCAAGTCTATTGACTGCAAGTACTTCGATTTTGGAACTGGTACTTGTCCCTTTGGGTCAAGCTGTTTCTACAAGCATGCCTACAAAGACGGACGCTTGGAAGAGGTCATACTGCGACATCTTGATGCTGACGATGGAAGTACAGTGATTGCCAAAAATATTAGGTTGTCGGACTTCCTCAGTCGGTTACATCTTTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSTKRVLCKFFMHGACLKGEYCEFSHDWNDQPNNVCTFYQKGSCSYGSRCRYDHVKVSRNPTVAPPPSSSTTTRASSSLQPLSFGRPHHVGYQADSSNPRQQISMDVLAHSGSKPVWRNDFQHESVLEDGIDWSISPTVQNQTTLSPADLPICSFAAGGNCPYGEECPQMHGDLCTTCGKMCLHPYRPDEREEHTKLCEKNHKRLESLKRSQEIECSVCLDRVLSKPTAAERKFGLLSECDHPFCISCIRNWRNNSPTSGMDVNSALRACPICRKLSYYVIPSVLWYFSKEEKLEIIDNYKAKLKSIDCKYFDFGTGTCPFGSSCFYKHAYKDGRLEEVILRHLDADDGSTVIAKNIRLSDFLSRLHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..14#1297..1384#1483..2294#2528..2597#4056..4144#4220..4253#ATGTCGACCAAGAGGTAATCTCGATTCGATTCGATTCCTGTTGGGTCCGCTGTTTTTTGGACGATTTGGAGCCAAAGTTCGGTGAGAGGCCGGGCGTGTGAGCCACGAGCTTTTCAATTTTGTTTTTGTGCGGGGCGGTGGTGGAGCCGCGTGTGGGATTCGGGCGCGGTGGTGGTGGGTTTGAGCTTGCCTAAGACCTAGGGTTAACCTCCTCCGGTGATTTGGATTTTGCTGAAGGGCAGAATGGTGGTAAGGCGGGCTTTGAGCTAACGCGCTGCTCGTTTTGGGGCAATTTGGGCATAGGGTGTAGCTTAGTTGATGTACGCTAATCTGCCACATTAGCTGTAATTTTTCGCTTTCGTGGAGTTTCACTATCTTCGTAATTTAGCATGGAGGAAGAATCCGGATGGCGGTTCAGTTGCTTTTGCGCTTCCATTACCTCTGGTTGCTTCGAGTCAAATATGTTGCGTTTGCGCCTCCATTAACTCTGGTTGCTTAGCCAAATGTGTTATACCTGCTAAACGCGTTGAAGGCCCAAACGTCGCCCTCCTTTTAGGGCTTTAGGTATGGTTTGGATTATGAATTTGTGATGTGTCCGCGTTTCGTTTGATTGTTGTGCTGGTAGGTTGAATAAGGGGAGTGCTGGAGTGGCCTGTGTTTACTTCGCTTTTCTGCATATTTTGGTTCTCCGCACTTTACAGGTCAAATGAGAGTATCAATTTTGACTCTGGTGCCCCATTTTATGCCAGCAACTGATAAGCACACTGGTTTGGCAGCGCCTTAGGGTGGTCCTTGACTTGCCTGTTTTACTACGAATTTTGAATATTACAGCATCGTATAAATGAAAGTAGTTAGATTGGGCTCAGTTTAATGGTGGCATATATGCTGCTTGTTCAATTCTATAAACACAACAATTGCACTAGGGGATCTGGTCTGTGGATTTCAACAAAGGTTATATATTCGAGTTGCTTAAAGCTCTACGTTATACGAAAGAATTAGAACTACTGCTATTGTTGATATATAAGATGTTAAAAGTATTGAAGTAAGCAAAGCAAGATGCTCAATAGTAACCTCATTAGTATGAGATGCAATCCCTTCAGACTGGTCATTTAATTTGGTTGCCCTGGCATCAGTCCTAAGATGATTGTTTTCACATTTGATTTGCTTATGGGAAGGCTCCACAAAAACTTGTTATGTTATCCTGATTCAGATCATTCCCTTCCTGGCTTCCTGGGATTGAACGGAAAGTTCTGGTAGTTTGCTTACAGTTCTTTTGGTTATGTTTCGATCTATCAGGGTTCTTTGCAAGTTCTTCATGCATGGAGCTTGCTTGAAAGGAGAGTACTGTGAGTTCTCCCATGATTGGAATGATCAACCAAACAATGTAATGTATTAGTAAATGATTGATGTGCTCTGATTTCATTGCCATACTTAACAGTGCAAATCTTCTACTGTTCCTTACTTTGATTCTTACTTGCTCAGGTTTGCACGTTCTACCAGAAAGGTTCATGCTCGTATGGTAGCCGTTGCCGATATGACCATGTCAAAGTTTCTCGTAACCCCACAGTGGCTCCACCACCAAGCTCAAGTACTACAACACGTGCATCTAGTTCTCTTCAACCTTTGAGTTTCGGGCGCCCTCACCATGTGGGGTACCAAGCAGATTCAAGCAACCCAAGGCAACAGATATCTATGGATGTGCTGGCACATTCTGGAAGTAAGCCTGTATGGAGAAATGATTTTCAACATGAAAGTGTACTTGAGGATGGGATTGACTGGTCAATAAGTCCAACTGTGCAAAACCAGACAACCTTGAGTCCTGCTGATCTGCCAATCTGTTCTTTTGCTGCTGGTGGTAATTGTCCTTATGGGGAAGAGTGCCCTCAGATGCATGGAGATCTGTGCACAACCTGTGGGAAAATGTGCTTACATCCTTATCGTCCTGATGAGAGGGAGGAACATACCAAGCTATGTGAGAAAAACCACAAGCGTCTTGAGTCTTTGAAACGTAGCCAAGAGATAGAATGCAGTGTCTGCCTGGACCGTGTGCTCTCAAAGCCTACTGCTGCTGAAAGGAAGTTTGGACTCTTATCTGAGTGTGATCATCCCTTCTGTATTTCATGTATTAGAAATTGGCGTAACAATTCTCCTACGTCTGGAATGGATGTGAACTCAGCACTGAGGGCTTGTCCAATATGTCGCAAACTTTCATACTATGTCATTCCAAGTGTTCTTTGGTACTTTTCGAAGGAGGAAAAGCTGGAGATTATTGACAACTATAAAGCCAAACTCAAGTAAGTTTGACAATTTTTATATCATTTTTTTCTGTGGCATGTTCTCTTATGTGCAAGATTGTTGGCATATTCTTTATAATTTATTGAATGAGCATAGTCATCAATTTATTTGAAAATGACATTTCTTATGCATGCCCTTTTCTGAAATATCCAAGCTGATATATTTCGTGAGGAGTGATTTATGTTTAATACTATTATGTCCCTGAATATTCGAGGAATGTTTACTATTGCAGGTCTATTGACTGCAAGTACTTCGATTTTGGAACTGGTACTTGTCCCTTTGGGTCAAGCTGTTTCTACAAGGTAGAAAGCTATATCTTTACATGCTATAAACATGTGAATTCAGTGCTACTAATGTACTTTTGTGGCTTTTCATCAACATAAATCTCACTAGCTATCCAGATAACTAGAGAGCCCTATAAACAATCGCCCGCCTGTCTATTGGCATTTGGCACTAAGTCAAGCACCTGGTCTAAACAAATCAGTTGCTTGGCACCTTTTTACTCAATCAGTTGCTCTGATGGAAACTGCCCAACTTATGTTCTTACATCAGATTACACCATCTGCAAATCCCTAAAGACCTTTTGTGTTACTGGAATTTATGAGTGTCTGCAAGCGTGGCTTAATATTTTCTCTCTTTTTTTTTCTTTTAAATGCTGCTCCTTGGGCATCCTAGGTCCTACCTTCACCACAGTCCACAGCCTTTATGTCGGTTTAAGGAGTTGCCAAAAATATGATGATGTCTGTACTATACAATACAATTAACTCAAGACAAGACTTATTAGTAATACTTATGGACCCTGTTAGATAATTCTTGAAAAATAATGGTATAATTTTTCCCCTCAATATTTGGTGTTCATTGCTAGCTTGTTACCATCTAGTGAATTTTTAACCAATAGTGTGGACTCCAACGTTTTTTTAATCAATGATTATATTTACATAGTGTAATTTTACATTAGCTCAAATGGTTCAAGTTGATTAGCAGTATCTATCACACTCTGGCAAGTGTAATTGGTAGGTATGCTAGGTAGGCCTCTTGGGCTCAGAGGTTTGTGTCCAGGAGGTGCTGTGATTAGTTGGTGTGCAGTTTTTAGCATTAATGGATGTAGAAAGAATCGAGATGCAAAACAGAGAAACTGGACGAGGCATTATGTTTATAGAGAATGAGACTGGCGCCTTTTTTATACAGAGAAGTCCCTGACAGCACTAGATTGCACCATATAAAGTGTCCTAATATTACATTGAAGTATTTCACTGCTTAATAAATCATAACATTGTACTAACATAGTGCACTTCCTAATAATCCATATCAGGAGAAAACCAACTAAATCAGTTCTTGGCAAAAATCATATCAGCTAAACATATATAGCATCTTAATGTTGTGTTCGTCTTGAACTCTGTCGCACACATTGCATCTCGTCATGTTTGCCCAGCTGCTGCCATACCACTGTCGCTCCTTAGTAATTTCTCCACATGAGAACATACTTAAAAGAACCCTAGACAACGCTTATGTTGTGGCTTTTCCACTTTTATTCTACATTCAAGCTTGTATCTTGTATGTGATTTTCATACTGGTCCAGTATGAGTAGAGTGTACTGTGCATTCTGTTAATATTTGGGGAAACTGATCTCTTGTTCTCTCTTTTTAGTTTTTACTATCACCTTGTTGAATAGCATTAGGTACTATTGCTGTAAACTGTGCACTTTACTGGACAGTCTTTTCATGTCATTGAAACTAAACATTGTACCTCATGTTTGACAGCATGCCTACAAAGACGGACGCTTGGAAGAGGTCATACTGCGACATCTTGATGCTGACGATGGAAGTACAGTGATTGCCAAAAATATTAGGTATGTGCTCTCTTTTAGGTGTCTATTTAATATATTTTCTCATTTTAATGTATTATCATCCTTTATGTGTTCCAGGTTGTCGGACTTCCTCAGTCGGTTACATCTTTAG</dnaseqindica> |
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