BGIOSGA022827
| Gene Name |
BGIOSGA022827 |
|---|---|
| Description |
Vhs and gat domain containing protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022827, complete gene. |
| LocusTag |
P0531C01.15 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA022827-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA022827-PA |
| Length |
7601 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:13951963..13959563 |
| Sequence Coding Region |
13951963..13952066,13953107..13953185,13954638..13954736,13954808..13954921,13955198..13955358 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:13951963..13959563 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGCAGTCGGTGCTCGTCGACCGCGCGACGAGCGAGTCGCTCATCGGGCCCGACTGGTCCCTCAACCTCGAGATCTGCGACATCCTCAACCACGACCCCTCCCAAGCCAAAGATGTAGTGAAGTCTATCAAGAAACGCATTGGGCACAAGAACTCAAAGATCCAGCTTCTCGCACTAACATTGCTGGAGACACTGATTAAAAATTGTGGAGACTTTGTTCATATGCACGTTGCTGAGAGGGATATACTCCATGAAATGGTGAAGATAGCTAAGAAAAAGCCTGATTATCATGTAAAAGAGAAGATACTAATTCTGATAGACACTTGGCAAGAAGCTTTTGGTGGTTCCCGTGCAAGATATCCGCAATATTATGTAGCATATCAAGAGCTCCTGCGCGCTGGAGCTGTATTTCCTCAAAGACCAGACAGCTCTGTGCCAATCTATACTCCTCCACAGACTCAACCTCTACGGAATCTTCCTCCAGCTCTGCGTAATACTGAGCGTCAACAAGAAGCACCTGAATCTTCTTCAACACCAGAAGTACCTACACTGAGTTTGACAGAAATCCAGAATGCACGTGGTGTCATGGATGTTCTTTCAGAGATGTTGAATGCTATTGATCCTGGCAACAGAGAGGGTCTAAGACAGGAGGTTATTGTGGACCTTGTGGATCAATGTCGTTCTTACAAGCAGAGGGTGGTACAGCTTGTCAACTCAACCACGGACGAGGAGCTGCTAAGCCAGGGTCTTTCATTGAATGATGATTTACAGCGTGTTCTTGCAAAACACGATGCAATTGCTGCAGGCATAGCAGTTCGTGTAGAAAAACCAAAATCAGTCCAGGCCCGAGGGGACAGGTCTCCATCAATCAAACCAGAAGGGGCAAAACAGCCAGATCAGAGGTCTTCTGAAGCTGCCAGTACCGTGACTCCATTTGAGCAATTAGCGCTTCCAGCACCTGCATCATCCAGCAGTTCCAAACCTCCTGTAGAACCAGCTGTTGGCCCTAGTATTGACCTACTTAGTGGTGATGACTACTTCAAGCCAGAACCTGTTAATTCCCAGGCCCTTGTTTCTGTAGGCAATCCACCTGCTGCTTCAGCCAACAATACCTTGGACCTGGTAGACATGTTTGCACAAAGCAATGTTGGCAACAACCCGAACCCTGCTGTCACCTCTTCTATGTTGAATTCAAATCCTAGTCTCTCTGAGCCACAGCTGTATCCCTCACAGCAGACTGTGCCACCACAACAGCCTTCTCTATACTCTAATGGGTTAACTTCAAATACAATGGCACCGTATGATCAACCCTCTGACATAAACGCCACAGGTTCATGGAATAGTCAATTTGCTCATGGAATGCTTCCTCCACAGCTTCCTCCACAACTTCCTCCACAGCAACCACCAAATTACGGTCAAGGTCAAGATCAGAGTGGTGATCTCCCACCACCACCCTGGGAAACTCAACCTGCAGAAAGTGATCAATTCCAGCCTGGGCAACCTCGTGGGCTAGCAATGCCATCAGGGCAAATTGGAGGCATTCAATCCCAACCTGTTCAAGTTCAGCCCGGGCAAGTTGCACCATCACAACCAATGCTGACCGGGCAACCCACAGGAATGCAGTTTCAGCAAGGGTTTGGGGATCAGCTTGGGGCTCAACAAACACAACCCTTGCACACACAATATGGTGGAATGTATCCTACAATGCAAGGTAACCAATCAGCTGGCATGTATCCCCAGCAGATGGCTGGAGATTTCTACCAGCAACAGATGTATGGTGGTCAGATGGCTGGTTATGGATACGGTCAGCAGTCTGGAGGATACTATGCTCCAAACGCTGCGTATGGGTATGGCGGTGCAAACGAGCTTTCTCAGGGAATGAATGGCCTTGCAGTGCAAGATAACAGTTTGTATGGAACTTCTGCATCCTCTTCCTTCCAGCAGCCAATGAGGCCATCCAGACCCGAGGATTCCCTCTTTGGTGATCTTGTTAGCATTGCTAAAACAAAGCCTAGCAAAACTGCAGCTAATAAGGCTGGTGGCTTGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPQSVLVDRATSESLIGPDWSLNLEICDILNHDPSQAKDVVKSIKKRIGHKNSKIQLLALTLLETLIKNCGDFVHMHVAERDILHEMVKIAKKKPDYHVKEKILILIDTWQEAFGGSRARYPQYYVAYQELLRAGAVFPQRPDSSVPIYTPPQTQPLRNLPPALRNTERQQEAPESSSTPEVPTLSLTEIQNARGVMDVLSEMLNAIDPGNREGLRQEVIVDLVDQCRSYKQRVVQLVNSTTDEELLSQGLSLNDDLQRVLAKHDAIAAGIAVRVEKPKSVQARGDRSPSIKPEGAKQPDQRSSEAASTVTPFEQLALPAPASSSSSKPPVEPAVGPSIDLLSGDDYFKPEPVNSQALVSVGNPPAASANNTLDLVDMFAQSNVGNNPNPAVTSSMLNSNPSLSEPQLYPSQQTVPPQQPSLYSNGLTSNTMAPYDQPSDINATGSWNSQFAHGMLPPQLPPQLPPQQPPNYGQGQDQSGDLPPPPWETQPAESDQFQPGQPRGLAMPSGQIGGIQSQPVQVQPGQVAPSQPMLTGQPTGMQFQQGFGDQLGAQQTQPLHTQYGGMYPTMQGNQSAGMYPQQMAGDFYQQQMYGGQMAGYGYGQQSGGYYAPNAAYGYGGANELSQGMNGLAVQDNSLYGTSASSSFQQPMRPSRPEDSLFGDLVSIAKTKPSKTAANKAGGL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..104#1145..1223#2676..2774#2846..2959#3236..3396#3886..3967#4112..4197#5683..5862#6033..6544#6967..7601#ATGCCGCAGTCGGTGCTCGTCGACCGCGCGACGAGCGAGTCGCTCATCGGGCCCGACTGGTCCCTCAACCTCGAGATCTGCGACATCCTCAACCACGACCCCTCGTGAGCGTCTCCTCCTCCCCTCCTCTCTTCAGTTTCCGCGTATAATTTTTTGGTTGAGCGGCCGCCGCGCTGGTGGGCGGCGGCGGGGGTGCGAGTTGGTCGGTCGCGCGGCCCATTGCTTGGGCGGGTGGTTCCCCGCGCCGCGAATTTTAGTGCTTGCTGGTCTTGCAGTCGTTTCTACTGTAGTTTGTTGTGGGAAATAATGGAATGGTAGTGGGTGGCTGACTGGCTACGATGTACTGGTTTTCGCTGCCGGGGAATTGAAAGTTGAGGTTTCAGACAAAGATGGTGTGGCTCGATGCGCGTGCGAGCAATGGGGGGATTTTTGGGCTAGTAATTGAGGGATTTTTTTTTTTTGCAATGATGGGGAAAGGGGGAAAGTGAAGCGGGCAGCTTTCTACCCTCGCTATATCACTATTATAGGTTGTGTGTATTTAGTGAGTTGGTCATCTTTCTGCTCTTGCGGTACCACTAGTATAGGTGATATTTGGGTTCCATGGATGGACTGATGGCGAATTTGCATCCTACCTTGCAAATATGACACTTTACACCCTTAAACAGGTCAGGTGGTATAATCTGTCATCAAAAAATAAATTAAGTTACAGTGAGTCAGTTACTAACACTCTTAACAACCATTGTAAAACGAGAAGAAAAATGAATGTGAAATTTCAGTGGTTGTAAAGTTTAAGTCACAGGTAAGGGATAATAGCTGGGAGAGGTTATTTAAGATTTGTGCAGACTTGCCATTTGTTTCCTTTGATATCATACAATTGGTACTCTTGACCTGCTGGTGAATTTTGCACTTAAGTTTATTCTTCAGGAACTAATATACAATGAGTAAACGTGTTGATTTTCTCTCTAGCACCGCCAAAGGTGTTAGACGAATCATGATGTTATCTGCTTCCATCTTTATTGTGCTTTTATTTTAATTGGTGTGTTGCTCTTCTTTTTGTTAGATTGCTTCCTGATAACATTCTTCAATTATATCGTATGGTGTTGTCACTTCTAGTATATTTACTCATACTTCAATATTCACGTAGCCAAGCCAAAGATGTAGTGAAGTCTATCAAGAAACGCATTGGGCACAAGAACTCAAAGATCCAGCTTCTCGCACTAACAGTAAGTGTCATTCTGTATATTTGGTTTTTCATTGAATAAACGTGAACCATCAATTGTCAATTTGCCATTGACATAGGATAGGATCCTGCATTGTGGTGTTCCCGCACATAATGATAGCGCCAGATGGTATTAAAGTTTTATCATTACATGGTGTGATTTGATCTATTACATAATGATTATACACATTTCATCAAAACGACATGGTTCTGTATTGGTTTTCAGTTAGTTTAGTTGGCTAACTTAAAAATCATCATTCCACCACAATTATGTTGGATCCCTATTGGCTGTTATAATCAGGTTTCAGTCAATTCTGTCTCTTGCCAGCGACCATAAATTGGTTACCAACAAAAACCAGTTAAATCTTGGATAATTTTGTACCTACAGCATTTGAATTGAAAATTGAACATGAGATGGTTACCAAAATAAAACATATAATAACTGTTTGATGGGTGTTACAGCAGTTGCTTCATATGTTGGATTGATTGAATGTAAATTGCTTATGTACACTACATGCAATGGATTCTGTACAGCCACACACTAGCAACACTGTGAGCAAAGGAATCTGAACCATTGATGTCATCAAGGCACACGCACAGTCAACAATGCATGCCTCTACTCCCTCTGTATTTTCTGTGCGCACATTCACATATACAGAGTCCATGTTTCTGTACCATAACATAATAAAATGCATAGTGCATATCTTGCAATTTTCATTGATTCCCTCATTTATCTGCTGTTATTCTTTGGCACACATATACCATGTAGTTGTAACCAGATATAGCAATGTGATAGATTGAGCAATATACAGTGCAGTAATGCAATAATGCATATTATCTCTTGCCTAGTTATTCCATAAAATCTAACATATCCAGTTTGTTTTTATGTTAACATGGGATTGTTACGGCTGGTAATGATTCCATCTTGTTCCCAGTGGCCAGTGGTAAATTGAGCTCTGGTTATAACAGCTTAGACCTCGTTTTAAATGGATGAACAGGCCAAATTATCTGATTAGCCGGGGTGCTTAAATATTACTTTAGGAGGTACCATGATTAGATATGCCAAGTTGATAGGATGGTCATGGTCCATCTTATGGAATTTTTTTTTAGGAAAACAGCTGGAGGATATTGGGGTATTAAGTAATGGGATTGTGTACATACATTGCATGTCCAGCAGGATTTGCTTGATCAAGATATGGAGTTGACAAGGAATAGTCCTAGAGGAGAGCATATAGGAATGCAACCTTTTTTTGCCCTTCCTTATAATGGGCAGTTTTACTGCATTTATCTTTTTTTACTGTGTTTATCTGTCATGTCATATTTTTATTATGAATTTGGGAATATATTGGTAGCTTGATAATTCACTTTAATGGCTTATGACAGGCTTTACTTGAAAATGGGCACCCAAATAAGCATGTGGTGAATTATGGTGTTTATTTTGTCTTTTTTTTTCTAGTTGCTGGAGACACTGATTAAAAATTGTGGAGACTTTGTTCATATGCACGTTGCTGAGAGGGATATACTCCATGAAATGGTGAAGATAGCTAAGAAAAAGGTCTGCTAACACTGTTTGATGTCCTTCCATGCTGAAAGATTAAGATATTGATTTATTGTTTTGTTTTCTAGCCTGATTATCATGTAAAAGAGAAGATACTAATTCTGATAGACACTTGGCAAGAAGCTTTTGGTGGTTCCCGTGCAAGATATCCGCAATATTATGTAGCATATCAAGAGCTCCTGGTATTATTTCTTGTGCTATTTACTTGCTATATTAACTATCCTATTCCTCACTATTATTTTTCATCTTCTGTAAAATTCCACGTCATGTAATACTATTCACAAAACGTAATAAGTACTTAACAGACCAAGCGGCATTTGTTCCACCTTTTATTCTTACTAAAAGACAGTAAGAAAATAAACAGAATGCTTTTTTTTTAAGCTGATTATTTGGAAATATCTTTTTGTTGCTATACAGCTGTCCAGAAATTATCTTAATTTCATAATTTGATTTGTCAGCGCGCTGGAGCTGTATTTCCTCAAAGACCAGACAGCTCTGTGCCAATCTATACTCCTCCACAGACTCAACCTCTACGGAATCTTCCTCCAGCTCTGCGTAATACTGAGCGTCAACAAGAAGCACCTGAATCTTCTTCAACACCAGAAGTACCTACACTGAGGTAAATGGTTTTGAAAGCTGCTTTACCATGCAGCCATGGAATTAATATTGTTCATAACTAACATGGAAGTCGGGCTTTATCTTGTGATTTTAAGTTCAGGAAAAAAACTGAGGGTTATCGTATTATTTGTCTTTTCACCTTTTATGCTTTTTACTTGTTCCCTAAAAGTAAGTTTGGATGATTTAAACTAGGACTGAAGCACTTGTATAATTTCATTTCTATTAAGATCAATTTGTGGGAGATTGATAGGATGCTACCTAACAAAACACCTATAACATTTTGTATGGATTTACGACAAAGTATGGATGTATAAAAAGATTAAGATCAATTGCATCCCTTTCCATAGCTTGACTTCATTTACCTTCAAAAACTCAGCTTATCCTTTCCGTGGCCTTGTCAAGCAACTGCATGTAATTCCCTCTTTAATATTAAAGTTGCCTTTTCTAAGGAAGGTATAAATCACATTATCTTGTATCTACTCCCCACCAGTTTGACAGAAATCCAGAATGCACGTGGTGTCATGGATGTTCTTTCAGAGATGTTGAATGCTATTGATCCTGGCAACAGAGAGGTAATTTTCCTGTACATTGCTGTTCATATAATGTTCAGAAAGGTACTGCAGAGAAAAAAGATCCATTCCATTTCTAGTGTAGGATCTTTTTGATAAAATTGGATATTTTTGCTGCCAAGATGCTAAAATGTAATGAATACACAGGGTCTAAGACAGGAGGTTATTGTGGACCTTGTGGATCAATGTCGTTCTTACAAGCAGAGGGTGGTACAGCTTGTCAACTCAACCACGTAAGTTCCTTTTTTATGTCTTTGCCTTTCCAACCGTCATATGAATTGCAGGGAATCAGGTAGTGGGAAACATGACATACATATTTCTGACTTCCTTGTTTTATAATAAACAAAGCAGAACTTTGCTGCCAAGTTTGTTATCTTTCCCAAATTGTTCAATTATTTGAAGGCCATATGATGCTTCAAATCACCCTGCTAAAGACTGCCCATTGATTTTCTCAGAATTTTTTTTTCTAAGTTTGTTATCATGCCCATTTTCTTCAATTATTTGAAGGCCATGTGATGCTTCAAGTTTCCCTGCTAATGCTGTCCATTTATTTTCTTTAATCCATTTGTCTAAATCAACTTGGGTTCGCTCTTTAAGCATTTTCTGGAAATATCACTAATCCTAACAAATTCCTAGTTTGTGAATAGCATGTAATTGACCTGTTAATCCTAATGTAGATTTTAGACATGTCTTAAAAAGCATCCTATTCCTGATGGCATTTCCAGATCACAAGTGGGTTTTAGTGTAGTGGATTTCTTCCTTGAATGTATGCATTCCTATACTTGGACCAGTAGGTCAGAGTATCAGATATAAGAGAGTTGAACGATGATTCTGGGGGTGACCCACATCTCATAGCCAATCATGAGGGGAGGGGTGGACAAAAGCTAGTTAACAGAGCAGGAAATTCTTGTAAAAG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