BGIOSGA023267

From RiceWiki
Revision as of 13:30, 26 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA023267| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023267, complete gene.| tag = OsI_237...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA023267

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023267, complete gene.

LocusTag

OsI_23703

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA023267-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA023267-PA

Length

7439

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:25679875..25687313

Sequence Coding Region

25679875..25680381,25681855..25681995,25682913..25683278,25683510..25683614,25683930..25684070
,25684625..25684828,25685502..25685588,25685985..25686096,25687270..25687313

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:25679875..25687313 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:25679875..25687313 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCGACGAGCCCCTCGACGCCGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCGGAGACCCCCTCCACCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCTCCCCGGCGCTCCTCCTCCGGCCGCGGCGGGTGGCGTTCGAGCACGGGCTCCTCCCGATCCCCAAGCTGGTGTTCCCGGAGGGCACGCTGACGCAGACCCTGGCCCAGACGAAGGAGCGCCTCATCGCCGCGGCTGGGGGAGACGGAGACGCCTCCGCGGCCCCGCGGGTGGGCGCCGCGGCGCTCGCGGAGGCGCTGCAGATCCCGCGGGAGCTGGCGGCGCTGGTGCTCGGGACGCTCGCCGCTGTGCTCCCCGCGGAGGAGGAGGCGGAGGACGCCGACCTCCGCGACGTGCTCCTCTTCCTCTACATCCAGTCCTACAAGCGCCTCGTCCCGCGCGCGCACAAGGATTCGCCCGCGGTCACCGACGTGTGGCCCTCCACCTCCGCCTTCGATGGCTACCTCTCCGCGCTCTCCCCGATCCAGCTTGTACGCAGTAACAGTCGCCGGTTTATGCCTTCACAAGCAGATGAAGAAGCTCATCAATTATCTTATCTGCAAAAGCATATGGTCAACATTCTGAGTCTTTTGGCAGATTCTGTTGATGGAGAGGGCGATGAGTCTATGGTATTGACAGCAGAGACATTTGAGCATCTCGGATTTTTATTTCAGTTTTCTGAAGGGACTCCTTTAAGCCAAGTGGCTACATTTTTTGCAAATTCTGATCCAGACATGCCTGCTGCACCTGTTCCCGCTGCTCAGGTTCATGATTGGATTCTGCAGAATATAGCTGCTTCATTAGAAAATACAGCAGAAAAATTGACAGCAAAGGAAAACAGCCAACAGAGTGCATCTGATCCTGATGTGACAATGGCTGAGGCTGTCACAAATTCAAGAATTCATAGCAGTTCACCAACTGGAACTGCTGTTCCAAACAATCAAGGACACTACCGAAATACAACTTTCCTGGAGGGTTTCTCCAAAACTTCTGTAGTTTTGAACTGCCATGACTCTGTTATCTACATATTAGCTCCTGTTAAATATGCCACTGTCTATGGGTGTTCTGACACTACTATCGTTCTTGGTGCTGTTGGTAAGGTGGTAAAAGTGGAGCATTGTGAACGAGTGCAAATCATTGCAGCTTCAAAGCGAATTTGTATCGCCAATTGTCGTGAATGTATCTTCTACTTGGGAGTAAATCACCAACCGCTTATTGTGGGTGACAACCATAAATTACAAGTTGCTCCATTCAATACTTATTATCCACAATTGGGAGAACATTTGGTGCAAGTTGGTGTGGATTCTAACATCAACAAGTGGGACCAACCTTTTGTGCTGGGAGTTGTTGATCCACATGATTCATTATCTCATCCTGCAGGGGTTTCTGATGTCCAAGCTGAATCTGCTACTTGTCTAGATCCTGATCTATTCACCAACTTTTTGATTCCCAGTTGGTTTGAGGCACAAGGACCTACAAAATATAATCCATTTACATTGCCTGAAGTTTATTGGGCATCCCAAAGGAAAAAGCATGTTTCTCTGGAAGATATTCAAAAGAATATCCGAGAATTGGAGCTTGATGATACTCGGAAAAAAGAATTGGCATCTGCCCTTCATGCCCAATTCAAGGACTGGCTATACGCTTCAGGAAATATCCGCCAGCTCTACTGTTTGCAAGGGGAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MADEPLDAAAAAAEAETPSTAAAAAAASPALLLRPRRVAFEHGLLPIPKLVFPEGTLTQTLAQTKERLIAAAGGDGDASAAPRVGAAALAEALQIPRELAALVLGTLAAVLPAEEEAEDADLRDVLLFLYIQSYKRLVPRAHKDSPAVTDVWPSTSAFDGYLSALSPIQLVRSNSRRFMPSQADEEAHQLSYLQKHMVNILSLLADSVDGEGDESMVLTAETFEHLGFLFQFSEGTPLSQVATFFANSDPDMPAAPVPAAQVHDWILQNIAASLENTAEKLTAKENSQQSASDPDVTMAEAVTNSRIHSSSPTGTAVPNNQGHYRNTTFLEGFSKTSVVLNCHDSVIYILAPVKYATVYGCSDTTIVLGAVGKVVKVEHCERVQIIAASKRICIANCRECIFYLGVNHQPLIVGDNHKLQVAPFNTYYPQLGEHLVQVGVDSNINKWDQPFVLGVVDPHDSLSHPAGVSDVQAESATCLDPDLFTNFLIPSWFEAQGPTKYNPFTLPEVYWASQRKKHVSLEDIQKNIRELELDDTRKKELASALHAQFKDWLYASGNIRQLYCLQGE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..507#1981..2121#3039..3404#3636..3740#4056..4196#4751..4954#5628..5714#6111..6222#7396..7439#ATGGCCGACGAGCCCCTCGACGCCGCGGCGGCGGCGGCGGAGGCGGAGACCCCCTCCACCGCCGCCGCTGCCGCTGCCGCCTCCCCGGCGCTCCTCCTCCGGCCGCGGCGGGTGGCGTTCGAGCACGGGCTCCTCCCGATCCCCAAGCTGGTGTTCCCGGAGGGCACGCTGACGCAGACCCTGGCCCAGACGAAGGAGCGCCTCATCGCCGCGGCTGGGGGAGACGGAGACGCCTCCGCGGCCCCGCGGGTGGGCGCCGCGGCGCTCGCGGAGGCGCTGCAGATCCCGCGGGAGCTGGCGGCGCTGGTGCTCGGGACGCTCGCCGCTGTGCTCCCCGCGGAGGAGGAGGCGGAGGACGCCGACCTCCGCGACGTGCTCCTCTTCCTCTACATCCAGTCCTACAAGCGCCTCGTCCCGCGCGCGCACAAGGATTCGCCCGCGGTCACCGACGTGTGGCCCTCCACCTCCGCCTTCGATGGCTACCTCTCCGCGCTCTCCCCGATCCAGGTTAGGTCTCGATCAATCCCCTCCCCCTCCCCCTCTTCCGCCGCCGCCCTGGTGGGCACTTGTTCTGTTAGCTTTGTGTGCACAGTGGTTTGCGGCAGCCGATTATGATCACTTGCGTTGGATTTGGGAGCGACCGAGTGACCCGTTTCAATGTAATTTCAAATGGATTTATCGTACAGAGATGGGCAATGTTTCTGCCAACTGAGGAATGCAATTGTGGGATCACTACTATAAGTTAGAAATAACATGATATGTCCATAGCTGAATGATTCCTATTTAAGGACTGGCCCCAAAAAAAAACTTTAGTCTGAAATGCTGTTTGATTCCTAAAAGATATTCGCTTTTGTACGAATACATTGTAAGAACTGACAAAAGCTTCAACTTTACAATGCTACTGGCACTTCACAAGAACATGAGAAACCTTTGATAATGGTTCTCTTCGCTTGTCAGTGTTATTTTTCTTTGAACACTGCTATACGTACGACTGCTCTATCCGACCGGTGTACGACGGAACGGCAGAGCAGCACAATACTTAACGGCGTAAGTTGGAACAGCACCAGCAGCACAGCTCTTGACGCTGTGTAATACACAGTCGTACGCCGGTCGGACACTCAAGTCGTATGTATAGCATTTTCGTTTTTCTTTATCCATATCCATTGGAATATTTGATGTTGTGCAATGGTAAACTGGTAATATTTATGATAGTACTGGACACCAGTCTGTGGCTACTCGGGGTCACAGAGAGTGGGGCATTCAAAACAATTCAATTAATCATCAGGTTGCCTGGTAGCTACATTGCTCGCTCAAGCTGATTCATAATTTTGTAAGCTTTTCTCTGTAGCTGGATTGTAATATTATACCTCAAAATATGCTCTTCCAATATATGATGACTACAACTATTCAGTATTCACATAGACTGCAAATATGTGTTGGTTAAGTGTTGTAATAGTTGTGATAAAAATACTTCAGCACAAAATGTGCTGCTATTGCCACAATTTATTTGCAGACGTCACTGTTATAAGGTCTAAATTTAAAATGTGAGAAGCTTGACCCTTGGTCCACCTATTTCCTTTTCTAATTTATCCTGATATCTACTCTATATTCATCCTCATCCCTGCTTTTAGAAATTCCATCTCACCTTCTGTTCATATTCCCCTTTGAAATGCTGTTTACTTGTATTATTGTATCATTCTATCATGTCGTGTAGGAGTCCTATGGTAGGACTAGAGATGCCTCGGCTAGGCCGAAGGGCTCTTTTAGTCACTCTTTTTCATGACTCTGTGAGTTATGCAAGCATGGGACTGTTGAATGTTGACTGTTCCAGTTTGCTCCTTTTCATGATTGCCACAATAGCACTTTGCCATCACTTGCGACTTGCTTTACTCCTGCTAGGGCAGAGACCAACAGTTTCTATATTTGTTACTTGTAAGGGCCTTTTTAATATTAATCTTCATTGTTTATGTTAATATGCAGCTTGTACGCAGTAACAGTCGCCGGTTTATGCCTTCACAAGCAGATGAAGAAGCTCATCAATTATCTTATCTGCAAAAGCATATGGTCAACATTCTGAGTCTTTTGGCAGATTCTGTTGATGGAGAGGGCGATGAGTCTATGGTTAGTATAGCTATTGTATAAATGTTTGTCTGTCCTTTTCTGATGTAGTTGTTTGTGGAAAAAAACATATAATTGTTTCCTGTTCAGTGCCCATGAGTCCATAACTACGATTAAATTTGTCCTCTTGATTCCAAATATAAGTCCTTTTAAACCTGTGCACAAGAATTTAGAAAATAAGGCCGAGTTTAGTTCCAAACTATTTCTTCAAACTTCCAACTTTTCCATCACATCAAAACTTTCCTACACACACAAACTTCCAACTTTTCCGTCACATCGTTCCAATTTCAACCAAACTTCCAATTTTAGCGTGAACTAAACACACCCTAACTGACTTGACTTTGTTGCCACATTGAAAAGATGAGTTATTTATTTGTGAGAGGAGTAGCATTTGTTTGGCAAGAGCAAACATGGAAGGGAAGATGAAAAAGGTGCTGGAAGACTGGAAGTTATAAACAGCATACATTTAGGAAAGATCAAATGGACCTGCATTTGGAATCACATTTTGGAATAGGAGGGGGTATAACTCAAAGCTTTATCAAGCAAATAAAGGACTGGAAAGGGCCCTCCACTGTGTGATAAAAAGAAATAATGAATAGTCAGATAACATATTCATATGATGATATGAACAGTTATGGGTACGGAAGCTTCATCGCCTGTTCAGGAAGCAGCTGACAAAGTAAATTCTAGGCTAATTTCTGCAATGAAATGTACTTTTTAATTTTTTGGATCAATAGAATATTGAAGATCTTGATGTATAGGTCCATCGTTGTGTACTACTTTCAAACTCCCAATAAATCTGGGCACTTTAAGTCATGTAGGATTAATTATTCCATTTGAAAAGTATATTCAACTTTATGGTATTTTTAGTCTCAAGATTCCCTGGACCCTAACTGTTATGCACATTGCTTTTTATGCAGGTATTGACAGCAGAGACATTTGAGCATCTCGGATTTTTATTTCAGTTTTCTGAAGGGACTCCTTTAAGCCAAGTGGCTACATTTTTTGCAAATTCTGATCCAGACATGCCTGCTGCACCTGTTCCCGCTGCTCAGGTTCATGATTGGATTCTGCAGAATATAGCTGCTTCATTAGAAAATACAGCAGAAAAATTGACAGCAAAGGAAAACAGCCAACAGAGTGCATCTGATCCTGATGTGACAATGGCTGAGGCTGTCACAAATTCAAGAATTCATAGCAGTTCACCAACTGGAACTGCTGTTCCAAACAATCAAGGACACTACCGAAATACAACTTTCCTGGAGGGTTTCTCCAAAACTTCTGTAGTGAAACCAAGCATCAGATATCAAAGGGGCATGTCAAGTAAACGGTATGCAGTCTATTGAGTTTTCTGGTACGTACTTATAAACTATCTAGAAGGGCAGGAATAAGCCGTTACGCTTGTTACTTGATATCTCTGTGTGTTGTAATTCAAAAAACAGAAACTACCTACTCCAGACTCTTATTTGAAAGTCGAGATTTTGTCAGCCTACTATTGATGAATTTTTTTTTTGTAGGTTTTGAACTGCCATGACTCTGTTATCTACATATTAGCTCCTGTTAAATATGCCACTGTCTATGGGTGTTCTGACACTACTATCGTTCTTGGTGCTGTTGGTAAGGTATGTATATCATACAACTTTTGTTAACAATATTTCAGCTTGAACATGAAAAAGTATGAGATCCCTTGAATTTTTTTTATTGATGTTTCGACAACCAACACACTTTGTTAGAATTTTGCTCTACCAAAGGGCAAACCATTTTATGCCACTGATGCCTATTGATATGTGGGTGGACCTTGGGTCCATATAGCATCACAATGACCTATTGTGGAATGTGCTTGCAGATATACAACTTAATGTGATGCACATTCTAGAAAAGCCTATAGACACTTTTCTCTTTTCTGTTTGTAGTTCTAACAATTTTCATGCGATCAGGTGGTAAAAGTGGAGCATTGTGAACGAGTGCAAATCATTGCAGCTTCAAAGCGAATTTGTATCGCCAATTGTCGTGAATGTATCTTCTACTTGGGAGTAAATCACCAACCGCTTATTGTGGGTGACAACCATAAATTACAAGTGAGTATATCTTTTTCTAATCAACTATTTATATCTTATGGACAAGTGTACACTGTTGTATATACATATCTGGTTGCTATAAAGGATAAATAGCTTTATGGACAATCAAAAAGGAAAAAAAAAAGGAAGCATGGAGACATACAGGATGTTCAAGTTTCTTAACAGAAACCTATGCTGATATCTGAATGTTTTCATATCCTTCATAACTAATTGTTAACCAATAAGAAGCCATCCCATCAAATTAAGGCGACTACATCATTTGAGATGCTAAAAGAAACTAGCGCATGTTTAACCTATGTCATTTTGGTTATTTGGCAATACTTGCTAGTTGGCAAGGAACCATTTCTAGTGAAGGACCACATATTTAGTTTTCCCTCAAAAGTGTTAAGGAATCAGACAAACCTTCGAGTTTATAATTTGATTTATTGATTTTGGTTCATTCACACAGAAACAAGTTTGCTTTAAAAACATGGAAGTTACACTTAATTTGATTCAATGTAATTCTCTTTGTATTTCAACAACATCAAATAAATTTTTATTTCTTGCTTTGTCAGGTTGCTCCATTCAATACTTATTATCCACAATTGGGAGAACATTTGGTGCAAGTTGGTGTGGATTCTAACATCAACAAGTGGGACCAACCTTTTGTGCTGGGAGTTGTTGATCCACATGATTCATTATCTCATCCTGCAGGGGTTTCTGATGTCCAAGCTGAATCTGCTACTTGTCTAGATCCTGATCTATTCACCAACTTTTTGGTATGTAACTATATGTTACCCTTCTCCGATTGTCTTTCCCAATTTCAAAGACACGTGGATTTAGTGAAAATCTTAGCTGCTTGTACTGAGCAGATTTCAGCTTTTCATTTGTTGGCATATGACAACCTTTTGTACACGTTATGTGTCCAATGTAATGTTGACATGTGTGACGTAGCAAGCAATCAAATGACTAATCGGCCTTTGGGGCTCACTAGTTGTACATGGTCCGAGGCCTAACTTGAATGGAGTTCAAAAGAGATGTAAAAGAGTTGAAGACTTTGGAGTCACTAAACCCTTCAAATCATCTTTTTATGTTATCATGCTGCACCTGCTTACCTAGTTTTTGGCCTGGTGTGGTTGGCCAGTAGTATTCATTTCACGTTTCATTAGTACTTTAGTAGATTAAGTTGAATTGGATGTGCCTGCCTGAATACGTGCATGTATCTGCATTAACATTATCATGTTTTTTTTTTTCTTTTGCCTTCTTTGACTCATCCAAATCAGTTTTGGTAAGAATTGATGAAGCCATTTTGCTACATTTTTTGGTTGTAACTAGTAGGAAATCAAGAATATCCCTATTGCTCAGCATTTGATGCAGTTCAAAACTTTAATCCCCGAATCACTATTTTTTCTCTGTAACAAAAATGTGATTGGTGCCTAATTTTCTGTACAGATTCCCAGTTGGTTTGAGGCACAAGGACCTACAAAATATAATCCATTTACATTGCCTGAAGTTTATTGGGCATCCCAAAGGAAAAAGGTATGTATGCATTACAATCAAGCTGCAACACAATTTTCATTTCTTTCTAACAGTGGTTTAGTCAGAAAGGGCTTATTTAGTGAGATGCTTGCTTGCTAGTTAGGGTGGTTGTCTGATGTAACTGTGGACAATAGAGGAATTCGATAAAAATATGCATCCATTGTTTGCCTATTTTATTATCAATATTCATAGCAAAAAGTTGTGGTGGATGTTCCGTGAATATAGTTTGAGCAGGATTGATCAAGATTATGAAATCTAAGAATAATTTACTGCAAGTTGTGGGTAAAAGTACTCAGGAGCACAGATCATGTAAATTATGCTTTCTGATAAAACACTAACATGCTCCTGATTATCATATTTATTTCTGAAGTTCGATTCCTTTCTGTACAATTTCAGCATGTTTCTCTGGAAGATATTCAAAAGAATATCCGAGAATTGGAGCTTGATGATACTCGGAAAAAAGAATTGGCATCTGCCCTTCATGCCCAATTCAAGGACTGGCTATACGGTAATACTCACCTATTGATAAAATTTGCTTAGAGTCTTTAAAAAAAAAAAATCTTAGAGAATATATACTCCCTCTGTCCCATAATATAAGGGATTATGTGATACAACCCTGTCCAGATTCGTAGTACTAGGTTGTGTCACATCGCTCCAAAATCGCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTATTAAGGTTTACATAGTTGCATGTCTATTTTTTCAAACTTGTGTGTGTCTTATTAGTTTAGACTCAGAACATTATCTTTTCATGGTTTGGCTGTTTTTTCTTAATCCATGGACTCATGGTTATCCTAAAGTATTTGATGCTCATGTTATCCTAAAGTAATTGGTGGTATTTGAGCACATGAATAATGTGATCAGATATTATGCTGGGCCAATTATGATCCCAAGTTAGACAAATGTGCCATGTGCAACTTCCTGTGCAGTAGTTACCAACTGGTGATTGCTTATGGATATGGGGCTGTAATTGTTTATAATGTACTCTTCTCATCTACATCAGCTACTATTCAATTGATGTTAAGGTGTGTTTGGATCCCAGCCATTGAATGCCATAGCTACAGTATTTTCGCCACGCTACAGTGTTTTCTGAGGCGGACGAAACGTCCGCCACACTCCTGTGGCAAGCCACGCCGTGGCGTGGCATTCCAAGCCGCCAACCAAGCAGCCCCATTTCTTGACCACCTTTTAAATAACAAATATGGCTATCACTTTCACTGCCAAGTGTATAGTCCAACAATGGTATTGGAGTTCTGGACCCCTGTAAGTGTTTGATTTGTCTAAATTTGGGCAGGACTTATAGGGATACCTGGAAGTGCAATTTTTAATTCTTACCTTGTTAGAAGCTTGAATCTTGATTGCTTATCGTGATTAGAGGCTTGATTATTTAACTAATCTATCATATATTAAAATGTTGGATACGATTATTTATGTATGTTATTGGTAGTTGTTCATCCAACTAGATATAAGCATAAAAGTAGTTTATTAAGTGAGTTGTACTGGTCGCTCAAGTGGTAAACTCAATCAGTGATTTCTGTGAAAAAAAAAAATCTTTATCCTATTTCAGTGTTGACACTCATTCTTGTTCACGCAAAGGATGGCCTGTTCTATTTTGCAGTACTCTGTTTGAACAAACTAATAACAATTCTGTATTCCATTTCCAGCTTCAGGAAATATCCGCCAGCTCTACTGTTTGCAAGGGGAATAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA023267