BGIOSGA023390
| Gene Name |
BGIOSGA023390 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023390, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_23948 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023390-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023390-PA |
| Length |
8511 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:28342852..28351362 |
| Sequence Coding Region |
28342852..28342927,28347765..28348289,28348689..28348825,28349508..28349618,28349781..28349929 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:28342852..28351362 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATCTACCGCGACCGGCCCCCTCATCAAGCAACCCAACCGAGATCCGCCATGGTCGCCTCCTGGCCATGCAAGTTCAGTACAGGGTGAATTTCAATGGTGTATTGACAGAGGTTATTAAACCTTCTCGAGGCTTAAGGCAGGGGGATCCCTTATCCCCATACCTTTTTTTGCTGGTTGCTGAGGGTCTTTCGAGTATGCTGCAAGGAGCTGAAAATAGAGGAGATTTAGTGGGAATCAGAGTGTGTCGTGAAGCACCAATGATATCACACTTGTTATTTGCGGATGATTCTCTAATACTAATGCAAGCAGACAGGAATAATGCTGATCATCTGAAAGCAATTTTGGATACTTACTGTCAAAATTCTGGACAGAAAATCAGTGAAGCGAAGTCGAGTATTTTCTTCAGTGGAAATACTGCAGTCGAAGATAAAGCTGCTGTCTGTGGATCTCTAGATATTATGACTGAAGCTTTAAACGACAAATATCTTGGACTCCCAGCGATGATAGGTGTTGATAAGAGTGATTGCTTTCGACACCTGATTGATAGAATGAACAACCGGATAAATGGATGGAAGGAGAAGATGTTGAGTACAGGGGGCTACATATGGAGAATTGGAGATGGATCACAAGTTAATATATGGGAAGATAGTTGGATACCTTCAAGCAGTAATGGGAAGATTTTAACACCTCGAGGAAGGAACATTATCACAAAAGTTCAAGAACTGATCAATCCAAAAGGTAAAACGAAAATTCAGAACGCTTGGAAGAAACCTCCTGAAGGAATGCTAATGATCAATGTTGATGCTGCCTTCGATATTGACTCGGGAAGTGGAGATACTGGGGTGGTGGTTTCAACGATGATGGATGGAGGATTTTCTGCTACAGCGGCTATGTCTGTGTTTGGTGATTGGAAGCTAATGTGGGATAGGTTTGGTACAATTTCTATTGAGCACTGTAATAGAAATTCCAATCAGGTGGCTCATGAACTGGCCAGAATACAACCGATTCTGGGTTTCGACTGGTCAGGATATGTTCTTGTGGAGGAGGTGATAAGGAAGGGTGGAAAGGTTTCGCATCTGAATGCTATTGGAATGGCGGAATTGATCTTAACGGGAGCTTGGTATATTTGGTGGGAGAGAAGACAGTTGGTGCATGGTGAACGAATACAGAACCCTGCTCGGTCGGCAATGTCTATTGCTACCTTAACCACAAACTATATGTTGTCAAATAAGAAAGGTAAAACGAAAATTCAGAACGCTTGGAAGAAACCTCCTGAAGGAATGCTAATGATCAATGTTGATGCTGCCTTCGATATTGACTCGGGAAGTGGAGATACTGGGGTGGTGCTGAGAGATCACTTGGGAGCTTGTGTTGCGGCTTCGCAAGCATTTCTTCCACATGTACTTTATGCACCGATGGCGGAGGCTTTTGTGCTGAGAGATGGGCTGGCCCTGGCACAACACAGTGGTGCTAAAAATGTTATAGTACAAACTGATTGTATGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLPRPAPSSSNPTEIRHGRLLAMQVQYRVNFNGVLTEVIKPSRGLRQGDPLSPYLFLLVAEGLSSMLQGAENRGDLVGIRVCREAPMISHLLFADDSLILMQADRNNADHLKAILDTYCQNSGQKISEAKSSIFFSGNTAVEDKAAVCGSLDIMTEALNDKYLGLPAMIGVDKSDCFRHLIDRMNNRINGWKEKMLSTGGYIWRIGDGSQVNIWEDSWIPSSSNGKILTPRGRNIITKVQELINPKGKTKIQNAWKKPPEGMLMINVDAAFDIDSGSGDTGVVVSTMMDGGFSATAAMSVFGDWKLMWDRFGTISIEHCNRNSNQVAHELARIQPILGFDWSGYVLVEEVIRKGGKVSHLNAIGMAELILTGAWYIWWERRQLVHGERIQNPARSAMSIATLTTNYMLSNKKGKTKIQNAWKKPPEGMLMINVDAAFDIDSGSGDTGVVLRDHLGACVAASQAFLPHVLYAPMAEAFVLRDGLALAQHSGAKNVIVQTDCM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..76#4914..5438#5838..5974#6657..6767#6930..7078#8001..8511#ATGGATCTACCGCGACCGGCCCCCTCATCAAGCAACCCAACCGAGATCCGCCATGGTCGCCTCCTGGCCATGCAAGGTAAGACCTTTTCCTCCCCCGCCATCTGCATTATAGCTGCGGCATCATTAGCCACCAGCAGTAGCAAGACCTGCTTAGCAAGTCAATTAGCGACCAGTCATCTTTGGCATCTCAAGCCACATTAAAATAATTTGTCTAACTACTTACATTGGTATCAACAATGAGCTGGATGGCTTGTAGTGTAGTGAAATTGCTTCATAATGGTCTTCAAATAGTCCCTGTATTATAAGTTGACTGCCTAATAAAATTAAGAAAATACTTCTTATGATGTACTTCTGTGATGTTTTTTTTACCTGGCAGGTTATTGGAGATTATTAGTTGACTCAATTAGTGGCTTGGGCACAAGCTTTAATGCGCTTACATAGACAGGTGGATCCACGGCAGTAGCCGAGCATTCTTAACCGTGCAGTAGAGGGCGGTGCCAAAGCCTGAGCTCTGGGATGATGCAGTGATTTGGGAAAAACAAGGTGAGTACATAATTTCGGACTCTGCATCCTGTGATTATCAATGTGCTTGCAGTGGATATGACTGATGCCTAGTGCGCTACTTACAATGCTATCCCTACTTACAATGCTAATCTAAAATCATTCAAGTGGTTGTTGTTCATCATTCTTAAACGTGGTACCAAGGGATATTGTTCATTTAGGATGAACTTATCGTAACCCTGAAGAGTAGCTATTTTAATTATTATATGCAAATTATTCAAAAGCAAGAATTATGTCTCATTTTGGTTGAAAAGCTATTAATAATAGTATTTCATGGCCTTATAGCAAGAATCCTGGCTCATTTTAGGCCTTGTTCGGTTAATCCCAAGGAGGGATTGGAGGGGATTTATTCCACACTTATTGGGGTGTGGAATTATTTCCCTCCAATCATCTTTAGTACCCTCCAAAGTGAACAAGGCCTTATGCAAGGGAATTTAAAATTTGTTAAGAATGTTGTATTTTATGTGGTTTAAACTCTAAACTTTAGACAATAATCTAATGCTAATGTACATGCTAAATATATGCATTTCATTGTTGATGCAGCAGTTTGCTCCTGGAAGCATACTTCTGTAGGTTCAAGCATATCTATACTTAGTAGGGCTGAACTTGTTCACAAATTCAAAGGTAATGATGCATTCTCCGTCATTGTGTATCCTCTATGATGTTTACTGCTGCGAGGTTAAAAAAATCCTCTACTCTCAATAACAAACATTATGGTCCACTAGTTTTATTTACTCTAGCCATTCTCCTGGTCACAAATTTTTAAGTGTCTTCTCATGATTTCAGATATGATCAACGTGAGGCTTATGGGAGCTTCCCCAATGGATAAATTTAGGTAAGAACGTATAGAGAACTTAGTAGTTTTACAACATCTCTTAAAGTTTTAGTTAGTACATCTCTCAAAGTCTGAACTTCAATATTTGTTGTGTTGCACTTTTTGTGCTATCTACCCTATAAGTAGCACAAATCAAGGTTGGCTGGCTCAACCGTTCAACCGTTAACTGGTTAAGATTGTTCCGAATCATAACATCAGCATGTTTGTCAATTCTCGTTAGATGAATAAATAGTGAAGTTTGTTGTTGACACAGTGACAACTATTTAGGATACTCCACCCTATTTCTCATCGTGTTCTTTAATCCTTGTACTATGAATAATGGTTACTTATTATTGTCTATTTTGAAACATACCATTTTGTTCTTAGATTAGGTTATAAGCAGTTACTGCTGGTTGGTTATATATGATACTTGATGCAACTTTACCATTATATATTATTTTAGGTGATTGCCCTTGGATCTCAGTGGGTTATGGTCTCCAAGACTCCAACAAGCCAACTTGATCATGATGCTTGTGTGTTGCATTCTTGATAGAGTTCAGGATGGTGCTTCAACTATGAAGAGCTTAAGCTGTTTTTTGCGGTTTTCTTAGGATTCTGTAGGACTAGTACATTGTTTCATGCTTAGATTGAGATGTATGTTGAATATTTCTTCTTTTTATTGCATTTGCATGTCAATCAATATAACATACTGATGGAATACTTTACCTTGTTGAATGTATTTATGCTCTAACAGGTTTATTGCAAGTTGATTAAGATTTCATCTGCACACTGTTAGTGTCCCTCAACTAGCAAATGCATATATTTTTTAAAAAATGGTTCTATCAGTGCTTCCCGAGTGGTGCAAGCAAAAGGACACGCGGTAATGATTTTTGATATTACAGAGTGGCAGCTAAGAACACACCGTAACGTGCTGTTGACGTGGCTATACCCGTTATGTCCACGTGTCAATATATAAAACTCGGGAAGCTCAGTGTCTCCGTTTGGATAGTCATCATGCCGTTAGTGGAACTTTGCAGAGTGTATTGTAGACACTCCGTAATCTCCCAACTGTTACGGAGTGTTTTTTCAGAAAACACACCGAAAGACAGCACGGGAACCTCGTATCACTCCCGGGCGTGCTGTACCACTCCGCAACATTATTACTGGTTGTTTGAAGTAGTTACCTAGCGTCCTGGCATTGTTACCGAGTGTTTTCGACACTAGGGAGCCTCTCCCATCCTAGTAGTGATCTATCTCCAAACATGAATTGCACCATATAACAAACATCAACCATATATAACAAATTAATCATCACAGTTTGACAAAAAAAAAAACGAGGGAACTTGATCAACTAGCTAACATGTACCATAATCATCATATACATACAGTGAGAGTACCACTCATCAAGAAGAAATGGTCCAGTTAGATCTCACCAAAAGCAGTGTACGGCTGAGATGCAACAAGAACGGCAGAGATGTGTGGCGCCACCGTGTGCTGGTATAATTGTACCAGCCGGCCGGCCGGCTGGCCGGAGAGATGCAAATAATACGGCAAATGCGATGGATATGTATGTATGGCAAGACGAGGGCCACATCTATCCCACACATGGGACGGTTTCCTTTTTCCTCCATATGTCTCTCTCTCCAAAAAGTCCCAATTGACAGCCATATATGTTCAAGCACGAGATTGCTATTAAGCGATCGGTCGCGTGGGGGAGGCGAACACGATCACGTTTCTCTATACAATTTAAATCTAATTTTATCTATTTAAAAGAATAATTTAGGTATAAAGTCTTTTTTATCGAAGTTTATATGTATAAAGTTTACGTGTATAAAGTTTACGTGTATAAAGTTCATGTGTATAAAGTTTACGTGTATAAAGTTTATGTGTATAAAGTTTACGTGTATAAAGTTTATGTGTATAAAGTTTACCATTTTCTTGTATAAAATCTAAAATTTAAATTGACATTTATAAAAATATTTTATTTAGAAAATCCTTAACTCTAATACAACCAAGGACTGCATACCTAATATGCTTAAGTGAACACTAACCATATGCTAATTGCTATAAAATATAATCACTTTGACTAATCACATGGAGATAATATTGATATGAAGCAAAAGTACGGTATAGCTGGTATTGTTGGCTTAACAAATATACCCGGTCGAACTCGATCGCGGGGGGACGATCGCCGCGATCGTTCGCGTATCAGACACCCCCGTTCAAGCATGCATTGAACTCTTATGCTTGAACATAGATTCTAATCGCTCTAGAAAACGTGCGTACGCCTTAATTACATCTTTCTCAAAGCAAATGATTCTTCATTTCAGATTCTTTTATATCTATTTAGATGATTTTTTTAGAAGAGTAAAATACACCAGCGGTCCTTAAACTTGTCAAGATGTTTCACTTATGTGCACGAACTTGTAAAGTGCACATCGAGGTCCCTAAACTTGGTTTATTGTATCATCCCGGTCCAAAGCCGCGTTTAACTGTGGTCTTCCCTACGTGGCACGCCACGTGGATAATGACATGGAATTTTTTTTTATTTTGTTCTTCCTTCTTTTTTTTCTTTCTTCCTTCTTTTTTCTCGGTGGTGAGAGGTGGCACGAGAGGAGGGGTCGTCGCGGTGGTGAAAAAAGAAGAAGGGAGAAAAAAATAAAAAAAATTACATGTCATCGTTCACGTGGCGTGCCACGTAGGCAAGACCACGGTCATACACGGCTTTGGACCGGGATGATACAATAAACCAAGTTTAGGGACCTCGATATGCGCTTTGCAAGTTCGTGAACCTAAGTGAAACCTTCCAACAAGTTTAAGGATCGCTGGTGCATTTTACTCTTTTTAGAAAGTAGATTAAAATCCGGTCTCTATATTCAAACTGGAGAAACACGGTTTTCCGACTAGCTACACAAGGTGGTGGGCTATACGACTTGGATTTGAAGCCTCATCCCTTCTAATTATTTGATATTAGGTATTTCGTTAATATTCGCGCCTCTATATTCAAACTGGATACATATACATAGCCTAATTTGGATGATATTTGAGCAAATGAGGAAACATCCTCTGATCCCCACGAGCGATTAAAGAGTTTCCCATGCATGGCTGCGTCTTCTTTGGTCTGGATTTAATTTGCTTTTGAAAAACTAGAGAAGCTTAATTGTAAAGAAGCGCACGGAATTTTCATGCTCACATCGCTGTGCTTAAAATGTGACTCGAGTGAGTTTTGTTCGCTCCAAGTAGCTAGAGTCCAAATCCTGTATCCACTGATTAATCACAAAGAATCACAAGCTCGATCACAATGCTGCCTTCCCGTGAAACATGGGGGACGTGTCTGGTACGGCCGTATCCGTTGTGTTCACAGTAATCTCAACAAGCGCACGCACCTGTTCACTGTAATCACAAGGCAAAGTAGTGGGCGCATTCCCTTTGGCTAATCTATTAGGAAACTCGGCAAGGATGTACCTGGAACAAATCATGTTGAAATTAGGCTTTGATAGCCGCTGGGTTCAGTTAATAATGTCTTGTGTTTCTTCAGTTCAGTACAGGG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