Os11g0629200
| Gene Name |
Os11g0629200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Vacuolar sorting protein-like |
| Version |
NM_001074844.1 GI:115486336 GeneID:4350961 |
| Length |
4270 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0629200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:26485158..26489427 |
| Sequence Coding Region |
26485323..26485325,26485401..26485475,26485581..26485655,26485873..26485945,26486304..26486348 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaattacatcatcggagcattcaaggcgccctgcgacgtcttcatcaccttcgccgatgagaggagccggaagcaggtggcgatcaagaaggataacgggaagacgttgatggtgccggccttccagagcctggagactattgcaggagaggtgtcggtagcgcccgttccaggtaaaagggtggagcaccaaggtgtcaagattgagctgctgggtcagatagagctgtaccatgagagaggtcacttctatgacttcacttcgttagtgcgagagttagaggttgctggtgaaatctatgaaaggaagacttatccatttgaattctctactgttgagatgccttatgagtcgtataacggaacaaatgtcagattgaggtacatcctgaaagttacaattggcagaccatatgctactagtgttgtggaatgtcgagatttctgtgtaaggaattacactcctcttccttcaattaacaatagcatcaagatggaagttggaattgaagattgtttgcatattgaatttgagtacagcaaaagcaagtaccatctcaaggatgtgatcgtgggaaaaatctattttcttctagtcagaataaagataaagaacatggagcttgagattcgtcggcgggaatcaacaggatctgggcctggcacatatattgagactgagacacttgcaaagtttgagttgatggatggcgctcccgtaagaggtgagtctattccggtaagactcttcttgacaccatatgagttgaccccgacttaccgcaacataaacaacaagttcaatgtcaagtactacctgaacctggttcttgttgacgaggaagaccggaggtacttcaagcagcaagagatcacaatgtaccgccttcaagaaactccgcaatcttcataa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNYIIGAFKAPCDVFITFADERSRKQVAIKKDNGKTLMVPAFQS LETIAGEVSVAPVPGKRVEHQGVKIELLGQIELYHERGHFYDFTSLVRELEVAGEIYE RKTYPFEFSTVEMPYESYNGTNVRLRYILKVTIGRPYATSVVECRDFCVRNYTPLPSI NNSIKMEVGIEDCLHIEFEYSKSKYHLKDVIVGKIYFLLVRIKIKNMELEIRRRESTG SGPGTYIETETLAKFELMDGAPVRGESIPVRLFLTPYELTPTYRNINNKFNVKYYLNL VLVDEEDRRYFKQQEITMYRLQETPQSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>166..168#244..318#424..498#716..788#1147..1191#1580..1691#1822..1888#2192..2236#3320..3375#3462..3637#3766..3953#cccgatcccccttcacacgcggcggttgacgtctccgacgccggcgatctcctccgccccctcccctcccccgccgccgccgccgaccctcctcagctcggccgccacctcctccgccagagggagagccccctccacctcggctcctgctcctccaacgccgccatggtaatccctcgtgatcgaatctagttgcttccaccggatcccgctctgatttgcgctgctggggggtggttgcagaattacatcatcggagcattcaaggcgccctgcgacgtcttcatcaccttcgccgatgagaggagccggaagcaggtaggggaggggaggggaggagccggcgttgttcttggtggctaaggattagctggctagctatcaggttgtttgaaagattgggatcgtgtgtggttcttgcaggtggcgatcaagaaggataacgggaagacgttgatggtgccggccttccagagcctggagactattgcaggagaggtagtgcctacactctgtctgcttttctgtatatttttttctagtgttggagatgggagtgtctaattgtgattaaatggtgtggtgttggagatgggagtgtctaattgtgattaaatggtgtggtgttggagatgggagatgggagtgtctaattgtgattaaatggtgtggtgttggagatgggagtgtctaattgtgattaaatggtgtgcaggtgtcggtagcgcccgttccaggtaaaagggtggagcaccaaggtgtcaagattgagctgctgggtcagataggtatgatgcacccttgatctgtttgattctgaatatgagtgccctaatgcctatggtgactgcatcgaatataagacatgttatttcaggttgctgaaaatgcgatttgtttgtagaaaaacaagtgtgaacggaaaaggttcttcgttgttctgaaaattcattgcattattttcccagctaatgttgtttcaaaatctcattaccatgacaaagtataggatttcattgcttgagagactgcaaaaagtacccgcatgaattgtttcttctaccactatcggcagcattgatcttcaatagttcaggtccttccaagttctaacattattattacctgtgatcttttatattgcagagctgtaccatgagagaggtcacttctatgacttcacttcgttaggtatgctctttctgttaagatagtcttgatctttttgcagccctccctgtatgcgctattcctttaggttctttgcactcttcaaatcttatatattggggctttacattgtcgattgaccccaagaacactatcttgcaagttaaatgggaaaaattaaccctctgagaaaactttgttgttgtcataccattgtttgtttcatgtgcgaactattctcactaaagcattagtgaggtgccaaatgtttatttgtgctatctctattctacaaataatggaatataacttagcatctttcgatttagattagctcgctgttcagttgtaagccagtaaagctattcattatcttaagtgcttctcttttctttttttgtctgtgtagtgcgagagttagaggttgctggtgaaatctatgaaaggaagacttatccatttgaattctctactgttgagatgccttatgagtcgtataacggaacaaatgtcagattgaggtaagaaggctaacatgcttccattatgcattgcacaggtcataacaagaacagcttgcatgacttgtagcatcgacagctttaataacactatcttgaagatcaaaagtcatgtttgtaatgcttgcaggtacatcctgaaagttacaattggcagaccatatgctactagtgttgtggaatgtcgagatttctgtgtaagtctgtaactcctacaattgcatttggcagaccatatgctgctcctaacagtcatgctttatttcactaacttcatatatgtaaatagtctgtaactccagcattttttgtcattctagttggacttgttaaaattagatgtctcgtctatgttgtgttgatagtcacgtatgcatccgcatccgttgttctatttcatcttttcttgttattaatcggttcaaagggaatgcgtttcagatttcattattaaaacatttcagggttaattagctatgtttctttctcttttttttcaggtaaggaattacactcctcttccttcaattaacaatagcatcaaggtgagtgctatagtaactagatggctggacattcagagttaacctgtcttggcattatattatgggttaagtgataactgtaagataagcctactatgccttgatcattatctttattcccttagtgatggtgttgcatgcttgaaatattcttcaaattatttgaattaccatttaataccatttaaccaaatttttttaataaaaaatatagtaaccttaatagcttaagggaagggaggggagggagaacacaaaccttacaattttaagggcccctttgaatcaaaggatttatgtaggaatttcataggattcaaatcctataggaaattttcctatttggccctttgattcaaaggattgaagctttccaaatcctatgaaattcctatggaatggcacattgcatgtggattttggaggaaatttagtaagagctccaacctcttggaaaaattcctttgagtctatctctctcatccgattcctgcgtttttcctatgctccaatcaaacaaccattcctgtgtttttcctgtgttttgcaatcctctgttttacacttcaattcctgtcagaatcctgtgtttttcctattcttccgttttttctaccctgcaattcaaaggggcccgacgtcatggtgaaatggccatagtaccatgccaacaatttgacattattcctgaagcccagcagtaacaggaaaagtgaacaatgctgtttgatctacttcagaaccatgtttccaggcagcaattttttttttcaaaaaaaaaaaaagattccagacagcagtaaatgaaatacaagaagaatgaaggattcattagattacaaagatatcctttcctggtttttatgttgctcatttaattttggagtagctcagtcaatttatcttaatcatatgcaacatgagagagtggctaattttttcccaatttcccctttattttctcaaaatgggaatgaactggtcacttctttaaatccttctcatgtgactccaattgttctatgtggtaattgggtgtacttaatagtaatgtgagtatttaaattgttccttcctttacagatggaagttggaattgaagattgtttgcatattgaatttgagtacagcaaaagcaagtaagaacagtcccatgttccaatttgccgcttgttctgttaaccagagttctgatattctttcttctgggccaaaccatattcaggtaccatctcaaggatgtgatcgtgggaaaaatctattttcttctagtcagaataaagataaagaacatggagcttgagattcgtcggcgggaatcaacaggatctgggcctggcacatatattgagactgagacacttgcaaagtttgagttgatggatggcgctcccgtaagaggtaatgtcttttgtggcattaggattaaaataactgctgcatacttgcctataagtctaatatggcaatatttcttagttcaagcaaagtatttacattaaattgagctggaccaaatcattttacaggtgagtctattccggtaagactcttcttgacaccatatgagttgaccccgacttaccgcaacataaacaacaagttcaatgtcaagtactacctgaacctggttcttgttgacgaggaagaccggaggtacttcaagcagcaagagatcacaatgtaccgccttcaagaaactccgcaatcttcataaactcctgttgccttgacttggtaacgaccagaaaaacttgggtctgtctggcataggagagcaccggagtagcaacttagcatgatgcgccttcctgtatataactctccagaggagcgatgccctttgtgatgtaccgtgtactgtttttgcctatgctcttttcccccccattttctccttcattctgatcaggaaacaaaccatgacaacgctggcattgttgcccttttcgccttgttcatttgagctttcttgttagactttgtgggataaccatatatttgttgatattttgcttcattgttttacccttt</dnaseqindica> |
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