BGIOSGA023559
| Gene Name |
BGIOSGA023559 |
|---|---|
| Description |
Auxin responsive protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA023559, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA023559-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA023559-PA |
| Length |
7319 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:31509080..31516398 |
| Sequence Coding Region |
31509080..31509125,31509630..31509751,31511135..31511233,31511320..31511376,31511485..31511640 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:31509080..31516398 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:31509080..31516398 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCAGCCGCTGCGGCGGCGGCGGTGGTGGGGAGCGGGTGCGAAGGGGAGAAGACGAAGGCGCCGGCGATCAACTCGGAGCTGTGGCACGCCTGCGCGGGGCCGCTGGTGTCGCTGCCGCCGGCGGGCAGCCTCGTCGTCTACTTCCCCCAGGGCCACAGCGAGCAGGTTGCAGCCTCTATGCAAAAGGATGTTGATGCACATGTTCCAAGCTACCCAAATCTGCCTTCAAAGTTGATTTGCCTTCTGCATAACGTCACTTTACATGCGGACCCAGAAACAGATGAAGTGTATGCACAAATGACTCTTCAGCCAGTTACTTCATATGGGAAGGAGGCCCTGCAGTTATCAGAGCTTGCACTCAAACAAGCGAGACCACAGACAGAATTCTTTTGCAAGACACTGACTGCAAGTGATACAAGTACTCATGGAGGCTTCTCTGTGCCTCGTCGAGCTGCAGAAAAGATATTTCCTCCACTGGACTTCTCAATGCAACCACCTGCACAAGAACTACAGGCCAGGGATTTGCATGATAATGTGTGGACATTCCGTCACATATATCGGGGTCAGCCAAAAAGGCATCTGCTTACCACTGGCTGGAGTCTATTTGTAAGTGGCAAGAGGTTATTTGCTGGAGATTCTGTCATTTTTGTCAGGGATGAAAAGCAGCAACTTCTATTAGGAATCAGGCGTGCTAACCGACAGCCAACTAACATATCATCATCTGTCCTTTCAAGTGACAGCATGCACATAGGGATTCTTGCTGCTGCAGCCCATGCTGCTGCCAACAATAGTCCATTTACCATCTTTTATAACCCTAGGGCCAGTCCTACTGAATTTGTTATCCCATTTGCTAAGTATCAGAAGGCAGTCTATGGTAATCAAATATCTTTAGGGATGCGCTTTCGCATGATGTTTGAGACTGAGGAATTAGGAACACGAAGATACATGGGAACAATAACTGGCATAAGTGATCTAGATCCAGTAAGATGGAAAAACTCGCAGTGGCGCAACTTACAGGTTGGTTGGGATGAATCCGCAGCCGGTGAAAGGCGAAATAGGGTTTCTATCTGGGAGATTGAACCGGTTGCTGCTCCATTTTTCATATGTCCTCCACCATTTTTTGGTGCGAAGCGGCCCAGGCAATTAGATGACGAGTCCTCGGAAATGGAGAATCTCTTAAAGAGGGCTATGCCTTGGCTTGGTGAGGAAATATGCATAAAGGATCCTCAGACTCAGAACACCATAATGCCTGGGCTGAGCTTGGTTCAGTGGATGAACATGAACATGCAACAGAGCTCCTCATTTGCGAATACAGCCATGCAGTCTGAGTACCTTCGATCATTGAGCAACCCCAACATGCAAAATCTTGGTGCCGCCGATCTCTCTAGGCAATTATGCCTGCAGAACCAGCTTCTTCAACAGAACAATATACAGTTTAATACTCCCAAACTTTCTCAGCAAATGCAGCCAGTCAATGAGTTAGCAAAGGCAGGCATTCCGTTGAATCAGCTTGGTGTGAGCACCAAACCTCAGGAACAGATTCATGATGCTAGCAACCTTCAGAGGCAACAACCTTCCATGAACCATATGCTTCCTTTGAGCCAAGCTCAAACCAATCTTGGCCAAGCTCAGGTCCTTGTCCAAAATCAAATGCAACAGCAACATGCATCTTCAACTCAAGGTCAACAACCAGCTACCAGCCAGCCCTTGCTTCTGCCCCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAACAACAGCAGCAACAGCAACAACAACAAAAATTGCTACAACAGCAGCAGCAACAGCTTTTGCTCCAGCAACAGCAGCAATTGAGTAAGATGCCTGCACAGTTGTCAAGTCTGGCGAATCAGCAGTTTCAGCTAACTGATCAACAGCTTCAGCTGCAACTGTTACAAAAACTACAGCAACAACAGCAGTCATTGCTTTCACAACCTGCAGTCACCCTTGCACAATTACCTCTGATCCAAGAACAGCAGAAGTTACTTCTGGATATGCAACAGCAGCTGTCAAACTCCCAAACACTTTCCCAACAACAAATGATGCCTCAACAAAGTACCAAGGTTCCATCACAGAACACACCATTGCCACTGCCTGTGCAACAAGAGCCACAACAGAAGCTTCTACAGAAGCAAGCGATGCTAGCAGACACTTCAGAAGCTGCCGTTCCGCCGACCACATCAGTCAATGTCATTTCAACAACTGGTAGCCCTTTGATGACAACTGGTGCTACTCATTCTGTACTTACAGAAGAAATCCCTTCTTGTTCAACATCACCATCCACAGCTAATGGCAATCACCTTCTACAACCAATACTTGGTAGGAACAAACATTGTAGCATGATCAACACAGAAAAGGTTCCTCAGTCTGCTGCTCCTATGTCAGTTCCAAGCTCCCTTGAAGCTGTCACAGCAACCCCGAGAATGATGAAGGATTCACCAAAGTTGAACCATAATGTTAAACAAAGTGTAGTGGCTTCAAAATTAGCAAATGCTGGGACTGGTTCTCAAAATTATGTGAACAATCCACCTCCAACGGACTATCTGGAAACTGCTTCTTCTGCAACTTCAGTGTGGCTTTCCCAGAATGATGGACTTCTACATCAAAATTTCCCTATGTCCAACTTCAACCAGCCACAGATGTTCAAAGATGCTCCTCCTGATGCTGAAATTCATGCTGCTAATACAAGTAACAATGCATTGTTTGGAATCAATGGTGATGGTCCGCTGGGCTTCCCTATAGGACTAGGAACAGATGATTTCCTGTCGAATGGAATTGATGCTGCCAAGTACGAGAACCATATCTCAACAGAAATTGATAATAGCTACAGAATTCCGAAGGATGCCCAGCAAGAAATATCATCCTCAATGGTTTCACAGTCATTTGGTGCATCAGATATGGCATTTAATTCAATTGATTCCACGATCAACGATGGTGGCTTTTTGAACCGGAGTTCTTGGCCTCCTGCCGCTCCCTTAAAGAGGATGAGGACATTCACCAAGGTATATAAGCGAGGAGCTGTAGGCCGGTCCATTGACATGAGTCAGTTCTCTGGATATGATGAATTAAAGCATGCTCTGGCACGGATGTTCAGTATAGAGGGGCAACTTGAGGAACGGCAGAGAATCGGTTGGAAGCTCGTTTACAAGGATCATGAAGATGACATCCTACTTCTTGGCGACGACCCATGGGAGGAATTTGTCGGTTGCGTGAAATGCATTAGGATCCTTTCACCTCAAGAAGTTCAGCAGATGAGCTTGGAGGGTTGTGATCTCGGGAACAACATTCCCCCGAATCAGGCCTGCAGCAGCTCAGACGGAGGGAATGCATGGAGGGCTCGCTGCGATCAGAACTCCGGTAACCCTTCCAATGGTTCATATGAACAATTCGAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAAAAAVVGSGCEGEKTKAPAINSELWHACAGPLVSLPPAGSLVVYFPQGHSEQVAASMQKDVDAHVPSYPNLPSKLICLLHNVTLHADPETDEVYAQMTLQPVTSYGKEALQLSELALKQARPQTEFFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKIFPPLDFSMQPPAQELQARDLHDNVWTFRHIYRGQPKRHLLTTGWSLFVSGKRLFAGDSVIFVRDEKQQLLLGIRRANRQPTNISSSVLSSDSMHIGILAAAAHAAANNSPFTIFYNPRASPTEFVIPFAKYQKAVYGNQISLGMRFRMMFETEELGTRRYMGTITGISDLDPVRWKNSQWRNLQVGWDESAAGERRNRVSIWEIEPVAAPFFICPPPFFGAKRPRQLDDESSEMENLLKRAMPWLGEEICIKDPQTQNTIMPGLSLVQWMNMNMQQSSSFANTAMQSEYLRSLSNPNMQNLGAADLSRQLCLQNQLLQQNNIQFNTPKLSQQMQPVNELAKAGIPLNQLGVSTKPQEQIHDASNLQRQQPSMNHMLPLSQAQTNLGQAQVLVQNQMQQQHASSTQGQQPATSQPLLLPQQQQQQQQQQQQQQQQQQQKLLQQQQQQLLLQQQQQLSKMPAQLSSLANQQFQLTDQQLQLQLLQKLQQQQQSLLSQPAVTLAQLPLIQEQQKLLLDMQQQLSNSQTLSQQQMMPQQSTKVPSQNTPLPLPVQQEPQQKLLQKQAMLADTSEAAVPPTTSVNVISTTGSPLMTTGATHSVLTEEIPSCSTSPSTANGNHLLQPILGRNKHCSMINTEKVPQSAAPMSVPSSLEAVTATPRMMKDSPKLNHNVKQSVVASKLANAGTGSQNYVNNPPPTDYLETASSATSVWLSQNDGLLHQNFPMSNFNQPQMFKDAPPDAEIHAANTSNNALFGINGDGPLGFPIGLGTDDFLSNGIDAAKYENHISTEIDNSYRIPKDAQQEISSSMVSQSFGASDMAFNSIDSTINDGGFLNRSSWPPAAPLKRMRTFTKVYKRGAVGRSIDMSQFSGYDELKHALARMFSIEGQLEERQRIGWKLVYKDHEDDILLLGDDPWEEFVGCVKCIRILSPQEVQQMSLEGCDLGNNIPPNQACSSSDGGNAWRARCDQNSGNPSNGSYEQFE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..46#551..672#2056..2154#2241..2297#2406..2561#2643..2727#2998..3088#3230..3394#3487..3609#3757..3832#3936..4065#4374..6244#6760..6950#7118..7319#ATGGCAGCCGCTGCGGCGGCGGCGGTGGTGGGGAGCGGGTGCGAAGGTAGGACGAGTTCTTGCTCTGCTTGCTGCTTCCAATGGCGGTTCGGGATGGAGCAGTGGTTGCCTTGCCGTGTTCTTGTTTCTGCAATCTGGTCCCTGTTTTATCGCGTTATTATTTCGCCACAAAATTAGGCAAATAAATCCTTTCTTATTCTTCTTGGATTTTGGATTACTGCATTTTTTTTCTCTGCATTTTTGTTCCTGTGATTTCTGGCGAGCGTCGCAGCATTTACTGTTCCACATTTATGCCCCCTCAAAGTTTGAGTAATCGCAACATAGGAGTACGAGTAGCTGCTACTGCAGTGCTAAGCCATGTGCAGAGATTAATTGGTTTGTGTAAAAACCTGGTCGTTTAGGGGGCGAACTGCAAATTACACACAAGCTCGCCGGCGGCGTAGGGCAAAATGCATTTGGTCATTTGGATCATCCAGCTTACGGCGAGATTATTAGGGAAAAAAGTTTTTACTGTTTTGTTTGGTTACTGATTGGCCGTGGTGTTTTGCAGGGGAGAAGACGAAGGCGCCGGCGATCAACTCGGAGCTGTGGCACGCCTGCGCGGGGCCGCTGGTGTCGCTGCCGCCGGCGGGCAGCCTCGTCGTCTACTTCCCCCAGGGCCACAGCGAGCAGGTGACTTCGAAGTTCTATTGATTTTTTTTTCATCTTTGTTTCATTTTCATAGCCATGGATGGCCTCGTTTTGAGACCCTTTTTAATTGACTTTTTGTTCTTATGATTCTAGTTTTTTTTTGGTTTGCTTTTTTTAAAAATAAGAATTCTAATTCGTCTAGTTCTGAATGTTGATGATTCTTGCACGAATAAGTTCACAACTTGCTGTCCTTTTATGAGTTCTTGAGAGGTGGAATGCTTTTTTTTTTGGTTTGGTGTTCCATTTTGTTCAGTAGTGGTGGCAGTTATAATTATATGATGGGAATAATGGGATGTGTTTCTAGGGCCAAAATGATATATTTTGTTCACATCTTTATTTCTGGGAATGTTTCACTTATCGCCTAGGAGTATATGTCTCCTGGAATCTTTTCTGAATTCATGTATCTTCTGTTGCCGAAAAGTAGTAGTATTATCTTTTCATGAATTGTTTTTTTTGGTTCTTTGATATTACAGCCATCATTGATCTATTTGGTAATTTGATTTTCTATGTTTTATACGATGTGGGAGATCTCGATTGGTCTGTTTGTTCATTGTACTTTATTTTGTTTCATTAGCTACCAATTTTTAGCTTATGGCCAAAGTGGTTGGAAGTATTGGGCATACTGGACCCCCTTCTTTTATGGGTTTATGGTGTGTGGCACCATTCTCTTGCTCTGTCGTTTGGTAGATGAAGCAGCCAAGCAGCTTCGATTTTTTTTTCGCATTTAATGGTAATTACATTCAGTAGCTTCTTTTGCAACTTTCTTGGCTTTGGTGTTGGGGCTACCTTATTTTGAGCAAGTTTGAAGTATGGGGTGATGAACTGTTTGGATTTGGAAAAGATTCTTTATCTAAAAGCTAGTGCTGGAAGGTGCCTAATTCTGTATTGGTTTTTCCTATCCCTTTTGTGATGATGAGAAAAAGGGAACTTTTTTAGTAACCGTGTGATGGCTATGTCCTCATAGCACATGCCGATGTGAGGCAAGAGAAAGTTTTGCTGTGGCTTAATTAATATAAAACGAATTTATGCTTTAAACTTAAATTCAGCCTAATGTTGGTCATGCTTTTTTGTGTGGGGAAATTGCTGTGGTTGAAGTAGGGAACATTTTGTAAAAGGGAGAAGAGTTACATAGAGAATTTAAAATAAAACTTAAGCAACATAAAAATAATATTTGTAAAAATTCGGTTGCCATTTTTTCCTGTGATTTTCATCGTGATCGAGCACCCTTTGGCCTTTGTTTCCCTGTGACTGATGATTTTTTGTTTGTAAGGTCCCAGTATCAACAGATTTATATCTGCATCCTTCTGATTCCAGTGTGAAAATTGTTGCTTAGAGCCACAGATTTAAGTATCTTTCATATTGCAGGTTGCAGCCTCTATGCAAAAGGATGTTGATGCACATGTTCCAAGCTACCCAAATCTGCCTTCAAAGTTGATTTGCCTTCTGCATAACGTCACTTTACATGTAATCTACAGACGTGAGATGTTATTATAGTTTCTTTTTACCTTTAACCATCTATGCTGAAAGTATGGTCCATCTATATTTCTTAGGCGGACCCAGAAACAGATGAAGTGTATGCACAAATGACTCTTCAGCCAGTTACTTCAGTAAGCATCTGATGCCCTTGCAGATCCCCAACAAATTTTCATCGATTTCCCTTTTGTTCATGGATTGTAACCCACCTTTTGTGTTTCAATTGATTGTGTATTGAAAAGTATGGGAAGGAGGCCCTGCAGTTATCAGAGCTTGCACTCAAACAAGCGAGACCACAGACAGAATTCTTTTGCAAGACACTGACTGCAAGTGATACAAGTACTCATGGAGGCTTCTCTGTGCCTCGTCGAGCTGCAGAAAAGATATTTCCTCCACTGGTATGCAAAGATCAGAGTCATATGCCATTGTTTACTTCATTTTCTGCATCTTTATTATTAAATCACTGGTGCTTGCTGTAGGACTTCTCAATGCAACCACCTGCACAAGAACTACAGGCCAGGGATTTGCATGATAATGTGTGGACATTCCGTCACATATATCGGGGTAAGCAAACAATAGCAACGATAAAAATAAAGAAAATATATAGTATAACAAATGAAAAATTCTGCTGTTGACATCCTACTTTATAGTTGTTGATACTTAATATTTGGCATGATTGGCTGAAATTGTGTGCATATGCATGTTTTGTTCTTTACGCATGGCAGTTCCTGTATTCAAACTTCAAATTATTGTGTTTTTATGTAATATATGTGGCTCGATATGTATTTTGTCCAGACAAAATATTTAATCGCCCATGTGTTTTGATATAAACAGGTCAGCCAAAAAGGCATCTGCTTACCACTGGCTGGAGTCTATTTGTAAGTGGCAAGAGGTTATTTGCTGGAGATTCTGTCATTTTTGTCAGGTATGCTACAGCTTATATGCTATATCTTTAAAGTTTGAACTAAATGATGAGAACAAGAGATACATGATGTTTTCTTGTTTTTTGTGGTTATTCACATCGATTTAACGGTGGTCTTCTTTCTTTTTCCTTTTTATTTTTTAGGGATGAAAAGCAGCAACTTCTATTAGGAATCAGGCGTGCTAACCGACAGCCAACTAACATATCATCATCTGTCCTTTCAAGTGACAGCATGCACATAGGGATTCTTGCTGCTGCAGCCCATGCTGCTGCCAACAATAGTCCATTTACCATCTTTTATAACCCTAGGTCAGTTCTGTACTAAAGTATGTTTTGATAATTCTCTAGTAGTAACTACTGGAGAGCTGTTGAAATGATGGTATGCAAATTCCGTATTTCAGGGCCAGTCCTACTGAATTTGTTATCCCATTTGCTAAGTATCAGAAGGCAGTCTATGGTAATCAAATATCTTTAGGGATGCGCTTTCGCATGATGTTTGAGACTGAGGAATTAGGAACACGAAGGTACTTTTTTCTCACTTTTCCATAAATGGAAATAATTGTGGACTGAATTGCCATATTATATGATTATACATGTCAATGACAAAGCTGGGAATGATTCTTAATTTTCTTTTTAAATTTTTTGTTGTTGTTTTCTTGCCCTTATTGCAGATACATGGGAACAATAACTGGCATAAGTGATCTAGATCCAGTAAGATGGAAAAACTCGCAGTGGCGCAACTTACAGGTTTGTTCTCTGGTTAATTTTGGCAGCACTATAACCTAGTATTTCTTGTGCCCATTTTCTGCTGCTGATACAATATATTTTGTGTTTTTTCATTCTTGAACAGGTTGGTTGGGATGAATCCGCAGCCGGTGAAAGGCGAAATAGGGTTTCTATCTGGGAGATTGAACCGGTTGCTGCTCCATTTTTCATATGTCCTCCACCATTTTTTGGTGCGAAGCGGCCCAGGCAATTAGGTGAGCTCTCATGTTACATTGCCATTACTTCTTTTATATTCTTTAACTGCTCTTGAATCCAGTTATTGATCCAGGAGAATACCCCTTAGTCATCTGTTATGTCTAGCTACTAGCTTGGAAAATATACCTGCAACCAAGCTTTACCTTTGAGATGACAATCTGGATAACATACCTTTTGAGTTGTACGCACCCAACTGATTTGAGCTAATTATCGAATTCTAGTGGTGTTGTGAATTCAAATAGATGAATTGTTTCACTAAACTGCTTGTATGTATGCTTAACTTTTGATCCCTACCATGTAATTACAGATGACGAGTCCTCGGAAATGGAGAATCTCTTAAAGAGGGCTATGCCTTGGCTTGGTGAGGAAATATGCATAAAGGATCCTCAGACTCAGAACACCATAATGCCTGGGCTGAGCTTGGTTCAGTGGATGAACATGAACATGCAACAGAGCTCCTCATTTGCGAATACAGCCATGCAGTCTGAGTACCTTCGATCATTGAGCAACCCCAACATGCAAAATCTTGGTGCCGCCGATCTCTCTAGGCAATTATGCCTGCAGAACCAGCTTCTTCAACAGAACAATATACAGTTTAATACTCCCAAACTTTCTCAGCAAATGCAGCCAGTCAATGAGTTAGCAAAGGCAGGCATTCCGTTGAATCAGCTTGGTGTGAGCACCAAACCTCAGGAACAGATTCATGATGCTAGCAACCTTCAGAGGCAACAACCTTCCATGAACCATATGCTTCCTTTGAGCCAAGCTCAAAC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| External Link(s) |
