BGIOSGA017473
| Gene Name |
BGIOSGA017473 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017473, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0009C07.13 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017473-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017473-PA |
| Length |
4136 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:30527611..30531746 |
| Sequence Coding Region |
30531580..30531746,30530326..30530374,30529895..30530058,30529630..30529667,30528427..30528539 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:30527611..30531746 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:30527611..30531746 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCATCGGAGGACGTGGTGGGGAAGAGCAGGGGGGACACCGCGGTCACCACCATCGTCAACCTGGCGGAGGAGGCCAAGCTCGCGCGGGAGGGGGTCAAGGGGCCTGGTTACCAGGTGCTCTCCATCTGCAAGTCTCTCTTCGCCGGTGGCGTCGCCGGTGGAGTATCACGTACTGCTGTTGCTCCGCTCGAACGAATGAAGATTCTGCTTCAGGTCCAAAACCCTCACAGTATCAAGTACAACGGTACAATTCAAGGTCTTAAGTACATATGGAGAACAGAGGGTCTCCGTGGACTTTTTAAGGGCAATGGTACCAATTGTGCCAGAATTGTTCCAAATTCTGCCGTGAAGTTTTTTAGCTATGAGCAAGCATCAAGTGGAATTTTATGGCTTTATCGGCAACAAACAGGGAATGAGGATGCTCAGCTTAGTCCACTATTGCGCCTTGGAGCTGGTGCTTGTGCTGGTATCATAGCCATGTCTGCTACTTACCCGATGGATATGGTTAGGGGTAGGATTACCGTGCAGACGGAAAAGTCTCCTTATCAGTACCGTGGTATGTTTCATGCATTGGGTTCAGTATACCGTGAAGAAGGCTTCCGTGCTCTATACAGAGGGTGGCTTCCATCTGTTATCGGAGTGGTTCCGTATGTTGGCCTCAACTTTGCTGTGTACGAGTCTCTGAAGGACTGGCTGCTTCAGACAAATCCATATGATCTTGGCAAGGACAATGAGTTGCATGTAGTTACAAGGCTTGGATGTGGAGCTGTGGCTGGAACCATAGGCCAGACTGTTGCTTACCCTCTTGATGTCATCAGGAGGAGAATGCAGATGGTTGGTTGGAATAATGCAGCATCTATTGTTACTGGAGAAGGCAAAGAGGCGCTCCAGTACAATGGTATGATCGATGCATTCAGGAAAACTGTTCGCTATGAAGGTGTTGGTGCTTTGTACCAGGGTCTTGTGCCCAATTCAGTGAAGGTGGTGCCTTCTATCGCTATTGCATTCGTGACATACGAGTTTGTGCAAAAAGTTCTAGGAGTAGAGATGAGGATATCAGACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASEDVVGKSRGDTAVTTIVNLAEEAKLAREGVKGPGYQVLSICKSLFAGGVAGGVSRTAVAPLERMKILLQVQNPHSIKYNGTIQGLKYIWRTEGLRGLFKGNGTNCARIVPNSAVKFFSYEQASSGILWLYRQQTGNEDAQLSPLLRLGAGACAGIIAMSATYPMDMVRGRITVQTEKSPYQYRGMFHALGSVYREEGFRALYRGWLPSVIGVVPYVGLNFAVYESLKDWLLQTNPYDLGKDNELHVVTRLGCGAVAGTIGQTVAYPLDVIRRRMQMVGWNNAASIVTGEGKEALQYNGMIDAFRKTVRYEGVGALYQGLVPNSVKVVPSIAIAFVTYEFVQKVLGVEMRISD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..167#1373..1421#1689..1852#2080..2117#3208..3320#3409..3522#3614..3952#4053..4136#ATGGCATCGGAGGACGTGGTGGGGAAGAGCAGGGGGGACACCGCGGTCACCACCATCGTCAACCTGGCGGAGGAGGCCAAGCTCGCGCGGGAGGGGGTCAAGGGGCCTGGTTACCAGGTGCTCTCCATCTGCAAGTCTCTCTTCGCCGGTGGCGTCGCCGGTGGAGTGTGAGTTTCCCTCACTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTATCTATCCCCCCTGTTCTTCTCCATGCCCGCGTCTCATCGTCTCCGTGTTGAATTCTCTCTGCGCGGCTCCCGGATTAGATTCAGTGGTTTCCTTTAGATTCGCGTTTGATCCTTGATGGATTTGTGGTTCTCGTGTCCTACCATTTTTTTAATTCCTCGTCGCGATTTGTTTCGGCTATGTTGTGTGTGTGCGGTTATAAGTTTTTGCATGAACATCTGTTCCGGAGATGTGTGATCTATGGACTCTTATGATGAGTTCGCCACGCTTAAACCCTAACGAGGTAACCAGATCTCGTTTCGTTGACTCGTTAGTTGATTCGGTTCACTGGGCCATGTGGACGAATGCATTTACGGTCCAACTCGTTGTCATGGTATAGCCTGGCCATCTGGTGGATTAAAATTTCCGTCTTGTTGGTTCGGTTTGCCTGTGATCTAACCAAGTTCCACTTGAATTATTGTATTCAATGCAAAATATATTATCTGGATAAGTACACCAACACCCTAGCAATATATTGTGTCTGACAAGGTGGTGTTGGCTTTTTCATCCTATGGCTCTATTAAATTTTCAGCCTTTATCTTATCTGTTATTATCTTATAGTTTTACGACAAATCATCTGGGCGGCTGGCCTGGACATTTCAATATCTCAGTTTGGTTTCACTAATAGCTGTCTAATTCCTCTAAATAAGAGTCATTTCTCACTTTATGCATCAGACCCTTTACATGTTTGTGTCGCACTCCAATTAGTTTTCACCTTTATGGTTTAATAATTTAGGTGTCATGGAGTATGTTGTTCTTTATAATGTCATGCACTTGCATCTAAAGCTGAACAATAATCAATTATATGCATAATTATGTCATCTGATATAAGATCGGTTTAAGAGTATTGCAACTTGTTTTATTCTTGGGCTAAAAATGTTGCTATCAGGTGTTGTTATAGTCAGCTGAAGTCCACGCATAAATTATTTATTTTATGTTTGAGCAAAACACACGGATCAACTAGAATGTTTACCTGGTGCAGGTTTTCTTTTCTCGTTATCCATTCTGGTGCATTTTGTCGAGCTTGACCAGCAAATGACAATCTACTTGGACCAATCGTTTCTAACTAACTACACAATTATGCTTATAATATTTATTTACTTTTTTTGTTGAACAGATCACGTACTGCTGTTGCTCCGCTCGAACGAATGAAGATTCTGCTTCAGGTGATATTTTCATTGCTGTTGCATTTCTTATCTGGTGGCATGCTACTGTTGTCTACTTTGCGGAGCTTGCTTGAAACATAACCTCTTTCACTACATATATATAGCCATTTGTATTAATAGTTGAAGTACAGACACTGCACTTGGTGCTAGACCCTAGTCCAGTTCTTGTTAATATTGTAAATTTGTACAAGTACTTTGCGTGGAAATGTGTGGGCAATTGTATGAGTTGGTTCTAACACCTGATTCGTGTTATCTTTCCTAATGCAGGTCCAAAACCCTCACAGTATCAAGTACAACGGTACAATTCAAGGTCTTAAGTACATATGGAGAACAGAGGGTCTCCGTGGACTTTTTAAGGGCAATGGTACCAATTGTGCCAGAATTGTTCCAAATTCTGCCGTGAAGTTTTTTAGCTATGAGCAAGCATCAAGGTTTGTTATTGTTTCCAATTACTGTCATCCTACATTACTGCTTGCTCTCTTGCCACCTACTTGCTATTTGTCCTTTGCACTTTGCAGACCTTTTCTCTGTTGCATGATGAGTCTTCTTTGACCTGATCTTGGTCAGAAGCATTTCCTTTTTACTCTACTGTTAATATGGTTTTGTTTCATGAAAGCACTAGTAATTGTATTCTTGCCTTCTTTGTTATTTTATGCAGTGGAATTTTATGGCTTTATCGGCAACAAACAGGGAATGGTATGCTTCTCTCCGTTATTACCATACTACACATTAGTTTTCCTGTGTATGCATCTTAGTTATTTTGAAAGTGTTTACACACCATGTTGTTATTGCAGACCTTTGGTTGTTGACTACGTAATGAGTCTCATGACTGCTCTACGGTTTTTTCCGTTTATCTATAGGAAAAATACAATTGTAGACTTTTTATACTCAGCTTGCCCATCTCTTGTTCAGTTTTTAGTTTCAATATATATTATGATCGTTTTCAAGATTGTGAGGCCTGGTATAATAAGTCAAAAACCTTCATTCGTCTAGATGGCCCAGTACAGCTAAATCATGTGTTATTTCTGCTAGAAACCTTATTAGTCCTGATATGAAGTGATGAGCGCAAGAAAAGCTGTTGCTCACCAGCTTGAACTTGGAAACAAAGTCTTCCTTGTACAGCTAATTATTTGTTGTTTCTGCTAGCGACCTTTGTAGTCCTGCTTTAGGACGATAAAGCACACAAGAAAAGTTGTTGGTCATCCGCTTGAACTTGAAAACAAGCCTTTTACTTTTTAAATCCCTATTAGAGGACAGGCTTATGTAACTGAATCACCTACCAAACTGGAATCCATTAGCAACTTTGAAAGATTGAATACCTCACCTCCAAAGAGTAGTACAAAGCAAGTAGTGCAATACTCTGAGCGCACGTTATCTCCAGTGTCTGTTCTCGTTATCTCAGTCCGTGCTCACTGTATATCCACACTGAGTCCAAATCATTTTGTATGCTGTAGAGTTGTCAGTAATATGACAACGTGTGCAACACTGCTGGACATGCTGTGAGCCTGTGACGGATCTTAGAGCTTACACAATATCCAATGTTCCTTATGTATAGTATTGTTCTAAAAATGTAAATTAACAATTTAAATGCTGGGGAGCAGAGTTCCTGATGTTTTTTTTTTTGACTGGAAGGGTTCCTGATGTTCATGTCTTTTTCTGTACAAATAGATTTCTTGAATGTTCTGCTTCAATCGAACAAGAGAATTTATATTCTTGTTGATGTATTATATAAAGTTGATAACAGAAAATTCTGGATTCAGCACTGACATGTTCCTATGCTGTACAGAGGATGCTCAGCTTAGTCCACTATTGCGCCTTGGAGCTGGTGCTTGTGCTGGTATCATAGCCATGTCTGCTACTTACCCGATGGATATGGTTAGGGGTAGGATTACCGTGCAGGTAATGTATCAACAACGTCAACACAGCATAACTCAATCTACTTCTGTTTCATATTCTGTCTATTGACCTCTAAATGTCATATATGCAGACGGAAAAGTCTCCTTATCAGTACCGTGGTATGTTTCATGCATTGGGTTCAGTATACCGTGAAGAAGGCTTCCGTGCTCTATACAGAGGGTGGCTTCCATCTGTTATCGGAGTGGTAGGTCTCTTCTTTAATTAGTTAACAGCTTTGCCTCGTTAGTGCCTTGCTGACAAGTGCTTTCCACATTATCTTTGTCATCTTCTTGCAGGTTCCGTATGTTGGCCTCAACTTTGCTGTGTACGAGTCTCTGAAGGACTGGCTGCTTCAGACAAATCCATATGATCTTGGCAAGGACAATGAGTTGCATGTAGTTACAAGGCTTGGATGTGGAGCTGTGGCTGGAACCATAGGCCAGACTGTTGCTTACCCTCTTGATGTCATCAGGAGGAGAATGCAGATGGTTGGTTGGAATAATGCAGCATCTATTGTTACTGGAGAAGGCAAAGAGGCGCTCCAGTACAATGGTATGATCGATGCATTCAGGAAAACTGTTCGCTATGAAGGTGTTGGTGCTTTGTACCAGGGTCTTGTGCCCAATTCAGTGAAGGTAATGTTTCCTACGACAAATTCAAATATTTGCAACCTTAATGGATCATCATCGTAGTGCTTGTTTATGACATGCTGACCTTTGCTTGCCTCTTCATCAGGTGGTGCCTTCTATCGCTATTGCATTCGTGACATACGAGTTTGTGCAAAAAGTTCTAGGAGTAGAGATGAGGATATCAGACTGA</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
