BGIOSGA017606
| Gene Name |
BGIOSGA017606 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017606, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017606-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017606-PA |
| Length |
4541 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:28760541..28765081 |
| Sequence Coding Region |
28764858..28765081,28763487..28763511,28763287..28763379,28762789..28762970,28762540..28762612 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:28760541..28765081 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:28760541..28765081 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTGCGGCGGCGGTGGCGCGCCGCGTCGTCCTGGTGCTCGTCCTCGCCGCCGCCTCCCTCGCCGCGGCGCCGCGCGGGGCGGCCGCTCGCTCGCTCGGCGGCAGGGAGGGCCCCGGGGAGGTCGACGCCGACGCCGCCGTCGACCTCAACGCCACCAACTTCGACGCCTTCCTCAAGGCCTCGCTGGAGCCCTGGGCCGTCGTCGAGTTCTTCGCCCACTGGTGTCCAGCTTGCAGAAACTACAAGCCTCATTATGAGAAGGTTGCAAAACTATTCAATGGTCGGGACGCTGCACATCCAGGGTTAATACTGATGGCTAGGGTTGATTGTGCATCAAAGGTGAACATCGATCTTTGCAATAGATTCTCAGTTGACCATTACCCTTTCCTACTTTGGGGTCCACCAACAAAATTTGCTTCTGCTAAGTGGGATCCCAAGCAAGAGAATAATGAAATAAAGTTAATTGATGATGGAAGAACAGCAGAACGTTTACTGAAGTGGATAAATAATCAGATGAAAAGCTCTTTCAGTTTAGAAGACAAAAAGTACGAGAATGAAAATATGCTTCCAAAGAATGCTTCGGATCCTGAGCAGATTGTTCAAGCAATTTACGATGTTGAGGAAGCAACAGCTCAAGCGTTACAGATAATTTTGGAGCGCAAGACGATCAAACCAAAGAATCGTGATTCGCTCATCAGATTTTTACAAATTTTGGTGGCTCGTCACCCATCCAAGAGGTGCCGAAGGGGATCTGCTGAGCTACTTATTAACTTCGATGATCACTGGTCATTGAATCTGTCGTTAAGTTCACAAGAGGGTTCTAAATTGTTGGAAAGTGTTGCGGAAGAGAACCACTGGATCTGTGGAAAAGAGGTGCCACGTGGATATTGGCTGTTCTGCCGCGGCAGTAAAAGTGAAACAAGAGGATTTAGCTGTGGTCTATGGGTTTTGATGCATTCACTAACCGTCCGAATTGGGGATGGAGAGAGCCAGTCAACCTTTACATCAATATGTGATTTTATTCACAACTTCTTCATCTGTGAGGAATGCCGCGAGCACTTTTATGAAATGTGTTCAAGCGTGTCAGCCCCCTTCAGAACTGCTCGTGAGCTCAGTCTCTGGTTATGGAGCACACATAACAAAGTCAATATGAGATTGATGAAAGAAGAAAAGGATATGGGAACTGGTGATCCCTTGTTTCCGAAGGTTACCTGGCCTCCAAATCAGCTCTGCCCATCTTGCTACCGCTCAAGCAAGGTCACCGATGGAGCTGTGGACTGGAACGAGGATGCAGTGTATCAATTCTTGGTTAACTACTATGGAAAGAAGCTTGTATCATCCTACAAGGAGACCTACATGGAGTCTCTTCAGCAACAAGAGAAGAAGATAGTTTCAGAGGATTCATCGATTTCTAATGCTGCAAGCGTCCCAATTGGAGCTGCCCTGGGTGTTGCGATTGCCAGCTGTACATTTGGGGCGCTGGCTTGCTTCTGGAGGGCCCAGCAGAAGAACAGAAAGCAAAGAAAGAACTGGAACTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAAAVARRVVLVLVLAAASLAAAPRGAAARSLGGREGPGEVDADAAVDLNATNFDAFLKASLEPWAVVEFFAHWCPACRNYKPHYEKVAKLFNGRDAAHPGLILMARVDCASKVNIDLCNRFSVDHYPFLLWGPPTKFASAKWDPKQENNEIKLIDDGRTAERLLKWINNQMKSSFSLEDKKYENENMLPKNASDPEQIVQAIYDVEEATAQALQIILERKTIKPKNRDSLIRFLQILVARHPSKRCRRGSAELLINFDDHWSLNLSLSSQEGSKLLESVAEENHWICGKEVPRGYWLFCRGSKSETRGFSCGLWVLMHSLTVRIGDGESQSTFTSICDFIHNFFICEECREHFYEMCSSVSAPFRTARELSLWLWSTHNKVNMRLMKEEKDMGTGDPLFPKVTWPPNQLCPSCYRSSKVTDGAVDWNEDAVYQFLVNYYGKKLVSSYKETYMESLQQQEKKIVSEDSSISNAASVPIGAALGVAIASCTFGALACFWRAQQKNRKQRKNWN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..224#1571..1595#1703..1795#2112..2293#2470..2542#2652..2720#2809..2882#2957..3110#3552..3592#3709..3855#3937..4374#4520..4541#ATGGCTGCGGCGGCGGTGGCGCGCCGCGTCGTCCTGGTGCTCGTCCTCGCCGCCGCCTCCCTCGCCGCGGCGCCGCGCGGGGCGGCCGCTCGCTCGCTCGGCGGCAGGGAGGGCCCCGGGGAGGTCGACGCCGACGCCGCCGTCGACCTCAACGCCACCAACTTCGACGCCTTCCTCAAGGCCTCGCTGGAGCCCTGGGCCGTCGTCGAGTTCTTCGCCCACTGGTTCGACTCTCGCCTTTGACTCGTTTTTTTCTCCCCGATTCGTGACTGAGGCGTTAGTTGTAGTACTTGGTAGAATCGATAAGTGGATGAGAATCGTGGTAGTCCGATGGCGTGAGATGCGACTGCGGGGTTTCGTCGTCTTCCCCGATGTATGGTTTATAGAATCGAAATGATTTACTCGTTTCGTCGTCTGTGAGCAAGTGAATGCCAATATAATCCACAATTTTTGGGGTTTCAAGCATGTAGGGTTGTGTAGGTGTTGCAAGGTCTGATTGGTGGGATGGATGCGTGTTGTTTTTTTTTTTGAACGAATCGGCAAGCTGCCAATTTCATTGAATAGAGAAGGAGTAAGGATGCGTGTTGTTCAAAACTCGATGAGAGTAACCAATAAATGCTTCGCTCGTACTACCTTGAAATGTCATGTGAGGATGCGACCCTGGGAGTGTTGTCCGTGTTGTAGTACTGTGACCTGTGAAGTTGTGAGCTAGAAGAAAGGTGCAGACATGAATGAGCCCCGAAGCTTGGAAATTTGTTATATGTAGGACTAAATCGGATGTAGGCCAGCAGTTAATTATGGAAAATCAGTGGAGCATTTACTGTAATGATGAAAGAGGAATTGACTGGGTTGTAAGTTTATCACTATATAGTTTCTCAGTGTTGCCACTTACTCAGAGTATTGCTTCGATGCGATATTTCTCGTGTGATTTCGGGTGTGCGGAACTTTCTCAAAAGCATAAGTACGGTCATTTTTGCTCTATGTAAGTTCCACTGTTCACCCACATTGGGCGTATAAATGCATGCCTGTTTAATTCTCATTTGCAGAGATCATCTCTTGTTTGAAATTTTAGCTGTCATGAGATTGAGTTATATTTAAATGCTTCTTTTGGATGTTAACAGGAAAAATAATACACTTATATGAGCATTGATACTGTACCTCACATGATTTAATGGAACTTGACGATTTGATTAATACACACGGACCTGTTTATGGGGAATCAAGGACTTGAATGATTAGCATCCTTTTGTTATCCTTTTCACTCTAATGTCCATGTTCTGGTCTTCCAAATATTCCATGTCAAGTTATTTTGATATTATATTCCATTGGTTAATCATTATAAGTCGTCACTATTCAGAATAGGTTAGTCCATATGCATTAGATATGAACTATGAAGTGGCGTATAGTTTCTCCAGAGCCTCAAGTTTTCACTTACTCGAGATAATTTTAATTGGAATGAACTTCTATTGGTCATATCGGTATACTTTTTTTTTTCTTTTGAGGCTGCCTAGATGGCATTTGTTTTATTGTTGAATTGATGCTAATTGAAATACGTACCGTGTTTGCTCAGGTGTCCAGCTTGCAGAAACTACAAGGTATGAAGCTTATTGTGGTAGCTGTGTACTTAATTTAAAAAACAGTGGTGCACAGTGTATTTATGAACAGCAAATTGACTCTTGCTAAATTCCTTCCTTACATCCAGCCTCATTATGAGAAGGTTGCAAAACTATTCAATGGTCGGGACGCTGCACATCCAGGGTTAATACTGATGGCTAGGGTTGATTGTGCATCAAAGGTACAGTAGCTCTGGTGAAGAGTGATAACTTTCGTCAGTCTCCTAAATGTAGACAACTAAAGCACTTACAAAAGGGATTAGGTTTGATGGAATGGTCCAGTTAAATCCTTAACTGGATGATGAGATTATCCACAGGAGTATATCTTCAATCCTTTGATATCTATTTTTCGTTACCAAACTGAAAGCTATATTGCAATGAAGCTTTGGTACCTCTTATTTTGACTGATTTTAGCTTCCATGTTTTGTCAAAATGTCCAATAATTTGGTAATTTCAATGGAGTAATACTTTATTTCTTTTGATTGTTTGACAGCACAGGTGAACATCGATCTTTGCAATAGATTCTCAGTTGACCATTACCCTTTCCTACTTTGGGGTCCACCAACAAAATTTGCTTCTGCTAAGTGGGATCCCAAGCAAGAGAATAATGAAATAAAGTTAATTGATGATGGAAGAACAGCAGAACGTTTACTGAAGTGGATAAATAATCAGATGAAAAGGCAAGTTATTATCCTAGTCTTTCCTGCTCTACCTAAAAGTTCAGTAGATATGGAAACAGGAGCTACCTGTACTATGCTCATGCCTCTCTCTATTGACTGTTACCTTTTTGGTTTGTTTGACCATTATAGGCATGTTGGTATTTTATTGATGCATTGTTTATTTATGGTATCTGCAGCTCTTTCAGTTTAGAAGACAAAAAGTACGAGAATGAAAATATGCTTCCAAAGAATGCTTCGGATCCTGAGCAGGTTCAATTATCAGATATTTCTTTGAAACAATTTGCATGAGATACTGCTATGTGCACTATGTTTCAATTTTCTTTAACGTTTGTTGACTTAATTCGATCTTTTGTTTTAGATTGTTCAAGCAATTTACGATGTTGAGGAAGCAACAGCTCAAGCGTTACAGATAATTTTGGAGCGCAAGGTGAGTTAACGATGAAATTTCACAGCAGATGTGATGTTTGCTCTTCTTTTTCTGACTATGGCCTAATAATGTTACTTGCAAACTGTAGACGATCAAACCAAAGAATCGTGATTCGCTCATCAGATTTTTACAAATTTTGGTGGCTCGTCACCCATCCAAGAGGTACGAGTGAACCTTTAAATTCCTAGTAGAGAAAATGCATATAACTTTCTTTGTGCATTTGGTTGATTCTTTAGGTGCCGAAGGGGATCTGCTGAGCTACTTATTAACTTCGATGATCACTGGTCATTGAATCTGTCGTTAAGTTCACAAGAGGGTTCTAAATTGTTGGAAAGTGTTGCGGAAGAGAACCACTGGATCTGTGGAAAAGAGGTGCCACGTGGATATTGGGTATGTTGTCTAATGCTAGGCCTAGCGGTTGGCAATGAATTCTTCATTAGGCATTCTTTTATACTAAACTAGAAAATGCAACTTCATATGAATCATTCTTAATTTTGATTTTGAGATATTCTCATTAAATGTTGCAGTAAATCCGTTATATGAATGATAGCATTAGGAGCAAGCAACATCTTGTATCTTTTGACATAGTTTACTTCAACAGCAGCATTATTTGCATGTAGCTTCTTTAGTACTGAGTTAATCTAGTTTCATTGCAGACAGAGGATCCTTAACCACTGTAGAATTGTTTAGTAGACACACGTGATCCACATATTTAGATCCCACAGCCCATATTTATTTACGTATCTTGATCTTATCACAAGTAATATCTGTACCTAGCAATAGTTATTCCCTTGAATTTTCTCTTCTTATTTCTGTGTGCCAATGTTGCAGCTGTTCTGCCGCGGCAGTAAAAGTGAAACAAGAGGATTTAGGTGACGCCTCTCTCTCTCTGCAAATGCTTCGAACATATATCTTTACAGCACCTTTACTGAAAGGCCATAGGAGTTGATAAACTATAACACACATACATCTTTTTTTATTGTATCAGCTGTGGTCTATGGGTTTTGATGCATTCACTAACCGTCCGAATTGGGGATGGAGAGAGCCAGTCAACCTTTACATCAATATGTGATTTTATTCACAACTTCTTCATCTGTGAGGAATGCCGCGAGCACTTTTATGAAATGTGTTCAAGGTTTGGAAAACTAACTTTGTGTTGTACCATCATTCAAAAAATATATCTACGACATGCCTGACTGTAGCCATTTACCTGTAGCGTGTCAGCCCCCTTCAGAACTGCTCGTGAGCTCAGTCTCTGGTTATGGAGCACACATAACAAAGTCAATATGAGATTGATGAAAGAAGAAAAGGATATGGGAACTGGTGATCCCTTGTTTCCGAAGGTTACCTGGCCTCCAAATCAGCTCTGCCCATCTTGCTACCGCTCAAGCAAGGTCACCGATGGAGCTGTGGACTGGAACGAGGATGCAGTGTATCAATTCTTGGTTAACTACTATGGAAAGAAGCTTGTATCATCCTACAAGGAGACCTACATGGAGTCTCTTCAGCAACAAGAGAAGAAGATAGTTTCAGAGGATTCATCGATTTCTAATGCTGCAAGCGTCCCAATTGGAGCTGCCCTGGGTGTTGCGATTGCCAGCTGTACATTTGGGGCGCTGGCTTGCTTCTGGAGGGCCCAGCAGAAGAACAGAAAGTACTCACACCATTTACGCTCTTTAAAGAAAATATGATTAGGAAAAAACATTTTAGGTTGGTAGGGTACCATTGTTACCGCGTGACTACGTGGAATTTCATATCACAGAGAAGTGATTAGGTTCTATTTGTCAATTTTTTTACAGGCAAAGAAAGAACTGGAACTGA</dnaseqindica> |
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