BGIOSGA017624
| Gene Name |
BGIOSGA017624 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017624, complete gene. |
| LocusTag |
OS05G0549000 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017624-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017624-PA |
| Length |
6309 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:28551620..28557928 |
| Sequence Coding Region |
28557839..28557928,28557607..28557676,28557314..28557411,28555988..28556126,28555773..28555900 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:28551620..28557928 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGATGCAGAGCTGGCGCAAGGCGTACGGCGCGCTCAAGGACTCCACCACCGTCAGCCTCGCCAACCTCAACTCCGACTTCAAGGATCTGGATGTGGCGATCGTGAAGGCGACTAACCACGTGGAGTGCCCTCCCAAGGAGCGCCACCTGCGCAAGATTGTTGCCGCGACGTCCATCGCTCGGCCTCGGGCAGACGTCGCCTATTGTATCCACGCGCTTTCCCGCCGGCTTGCAAAAACACGCAATTGGATTGTAGCCTTGAAAACACTTGTAGTGATCCATAGACTTCTTCGAGAGGGTGACCCTACTTTTCGAGAAGAGCTTCTTAATTTTGCACAGAGGGGGCGTATTTTGCAGCTCTCAAACTTCAAGGATGACTCCAGTCCAATTGCTTGGGACTGTTCTGCATGGGTTCGTACATATGGTCTGTTTCTGGAGGAAAGATTGGAATGCTTCAGGGTCCTCAAGTATGACGTTGAAGCTGAACGTTTGTCCAAACAAGGTCAAGGTCCTGAAAAGGGGCACAGCAGAACCAGAGAATTGGAGTCCCAGGATCTGTTAGAGCAGTTGCCAGCTTTGCAGCAGTTACTATATCGACTTGTTGGATGTCGGCCGGAAGGAGCTGCAAATAATAACTACTTGGTGCAATATGCTCTAGCTTTGGTGCTAAAAGAGAGCTTCAAAATATATTGTGCAATAAACGATGGGATTATTAACCTTGTTGATAAGTTTTTTGAGATGCCAAGACATGAAGCACTCAAAGCCCTTGAAATTTACAGGAGGGCAGGCCAACAGGCTGGGAGCCTATCTGACTTCTATGAAAATTGCCGGGGTCTAGAACTTGCTAGGAATTTCCAATTTCCCACTCTGAGGGAGCCGCCACAAACATTTCTTGTCACTATGGAGGAGTATGTGAGGGAGGCTCCACGCATGGTTCCAGTGCGAGAAACATTGGAATTACCTGAGAGGCTTCTTCTGACATATAAACCTGAAGAACAAGAGGAAGATTCTGTGCCTGATCCTGTCGAAGAGGAAAAACCACCTGTTGAAGAACCTGTTCCAGTACCACCTGTTACTGAAGCTGTTTCACCTCCTCCTCCTCCCAAGACTAAGGTGGCAGATACTGGTGATCTACTGGGATTAAATGATCCGAACCCTAGTGTATCAGCGATAGAAGAAAGCAACGCTCTGGCTTTGGCCATTGTTCCAGCAGATGCTGGTGCTTCAACATCCAGCACCGCTACATGGCAAGATAAAGGATTTGATCCAACAGGGTGGGAACTCGCCCTTGTTACCACTCCAAGTAACACGAATTCATCTGCTGCAGATAGTCAACTGGGTGGTGGGTTTGACAAGCTCATCTTGGAAAGCCTATATGACCAGGGGGACTACAGGCAGAGACAGCAACAGCAGTTATATGGTTCTTCAGCTCCCAACCCGTTCATGTCAAATGATCCTTTCGTAATGTCGAACCAAGTTGCTCCTCCATCATCGGTTCAAATGGCTGCCATGTCTCAGCAGCATCAACAGATACCAACTATGATGCAAGCGAATCCCTTTGGACCACCAATGCAACCGCAGCATGTGGGCATGGGCCCTGCAACAAACCCATTTTTGGATTCTGGTTTTGGCCCATTCCCAATGGCGAACAACGGGCATCAGCAAGCCAACCCATTTGGTGGCACCCAACTTCTGTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAMQSWRKAYGALKDSTTVSLANLNSDFKDLDVAIVKATNHVECPPKERHLRKIVAATSIARPRADVAYCIHALSRRLAKTRNWIVALKTLVVIHRLLREGDPTFREELLNFAQRGRILQLSNFKDDSSPIAWDCSAWVRTYGLFLEERLECFRVLKYDVEAERLSKQGQGPEKGHSRTRELESQDLLEQLPALQQLLYRLVGCRPEGAANNNYLVQYALALVLKESFKIYCAINDGIINLVDKFFEMPRHEALKALEIYRRAGQQAGSLSDFYENCRGLELARNFQFPTLREPPQTFLVTMEEYVREAPRMVPVRETLELPERLLLTYKPEEQEEDSVPDPVEEEKPPVEEPVPVPPVTEAVSPPPPPKTKVADTGDLLGLNDPNPSVSAIEESNALALAIVPADAGASTSSTATWQDKGFDPTGWELALVTTPSNTNSSAADSQLGGGFDKLILESLYDQGDYRQRQQQQLYGSSAPNPFMSNDPFVMSNQVAPPSSVQMAAMSQQHQQIPTMMQANPFGPPMQPQHVGMGPATNPFLDSGFGPFPMANNGHQQANPFGGTQLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..90#253..322#518..615#1803..1941#2029..2156#2276..2368#2478..2528#3098..3163#3242..3307#3415..3495#3577..3654#4550..4732#4802..4877#4979..5103#5950..6309#ATGGCGGCGATGCAGAGCTGGCGCAAGGCGTACGGCGCGCTCAAGGACTCCACCACCGTCAGCCTCGCCAACCTCAACTCCGACTTCAAGGTCCGGATCCGGAACTCCCGGGGGATGGATTTTTTTTTCTCTCCCCTTCTGGCCGAGTTTGGCCGATTCGTGGGAACCCTAGATTTTTTTTGATGTGGTGTGGAGGCTTTTAGATCTGTGTGGTTCTGATTGGAAATTCGTTTGGGCGTGTGCTTTTTGTAGGATCTGGATGTGGCGATCGTGAAGGCGACTAACCACGTGGAGTGCCCTCCCAAGGAGCGCCACCTGCGCAGTGCGTTGATTCGTTCTCACACCGTATATTTCCGTGTATTAGGTTTTTGATTAATTAGGTATTACTGGGGTTTTATAATTAGATCGTGCCTGAAAGTCGGGAGGCTCCTGAGAGGGGAGGCTATTAGGGTTCTATTTTTCGGTTGGCCTCGGGTGGTGTTTTCCGTGTTTGATGGCGTGTATGCTGTTGTTGCAGAGATTGTTGCCGCGACGTCCATCGCTCGGCCTCGGGCAGACGTCGCCTATTGTATCCACGCGCTTTCCCGCCGGCTTGCAAAAACACGCAATTGGATTGTAAGTGCAACACTATCTTCCATGTTTATCATCTCTTTTGATGTTGTTTTGGGATGATGGGTTAATTGTATGCATTGTGGATGTTCGAATGGTACCATACTGTCCTGTATAACGAGACTACAAAAGTGATGCTTGTGTCTGACTGTTGAGTTGATAGTATATGCCTATATGTTTCAAGATTATGTGTTGTTTCCATGAACAGTTGTATGGATGACCTATTGTGTTGATTCAGATAATATATCTATCGTGCTCCTGGATGCTGCTATGCTGCTAATAGTCTGGCTGATGCTATGTAGACGTTTCTTATAATATTAATGACTGCTCTTTGTATGGATGGCTTAAAAAATCTATAACTTGAAACATTATCTAGGCTGATTCCATGATTCAAGTAATTTCTACAAGTCGGTTAGTATTACTGTCCTATAGCTTCCAGTAACATAGACCGATCGTCATAATTTCTCACAAGAAGTTCAGTGGAGTCAAGTTCTGACTGGGCCCTGTTGTGCGTTGATACCAATGGATTTTCTGCTGATATGTTCATCTTCAGGAGCTTTCTAGGCATGTTGACAGTAATTCCGTTCTAGGTCTTTCCTGGGTGTCATACTGCTTAGGATTTTGGTCTGGACATTTAAAAATAGACACTATATGCTAATTTATAGTTGTACAGTACCAGCTACATATTTTAGTCTTGCTAATTTATGTAGTTTTTTGAAATGAAACTGAGGATTGCCCCCTCTTCTAAATAAATAATAGTGACAAAATAAATATATAATCCTACATGTTTACTGAGCAGGCTATGAATTTGCATTGTTCCAATCCTTAAGATCACTTGCTTGCCGCGTTTCGGAATCTAGCTATTGATTTTCAAAGTTACATCTTTTGCATGAAGATATTAGCTATTAATGTTAATGCAATAAAAGAAAGGAAAATCATACTCATTGCTAGAGTCAAAAGTGCTATGCTAAAATTTCAGTGTTAATTGAGCATCAGTAATTCTTTGTTGCCAAGTCCACTATTCAATTCATTAATTCCTTGTTCTCACAGCCATATGTCACTATTGTGCGTCCTGTCTAATTAGCAAATTTAAATCTTATGCTTGCAAAAGAGAAAGCCCTAGAATGTAAGGAAAAGAAAATCATACACAGGAGCTGATTAGTTGATTTTTCTTTGTTTTTTGTAACATGCAGGTAGCCTTGAAAACACTTGTAGTGATCCATAGACTTCTTCGAGAGGGTGACCCTACTTTTCGAGAAGAGCTTCTTAATTTTGCACAGAGGGGGCGTATTTTGCAGCTCTCAAACTTCAAGGATGACTCCAGTCCAATTGGTTAGTATTTTATCTAGGTGACTGGAAGTTGCTGCTGACATGCTTGTTTCCTCTTTATTTCCCTGTGTAATATTGAGTACTGTCCAGCTTGGGACTGTTCTGCATGGGTTCGTACATATGGTCTGTTTCTGGAGGAAAGATTGGAATGCTTCAGGGTCCTCAAGTATGACGTTGAAGCTGAACGTTTGTCCAAACAAGGTCAAGGTCCTGAAAAGGTCTGAAACACTACAATCCCAACCTTGGTATAACTGATCAGTTTTGAGGATCAGATGTATTACACTTCTCTACCAATACAAGATTGTCCATGCTTCACCTAATTATGTTTTATCATCAGGGGCACAGCAGAACCAGAGAATTGGAGTCCCAGGATCTGTTAGAGCAGTTGCCAGCTTTGCAGCAGTTACTATATCGACTTGTTGGATGTCGGGTGATTATCTCCATACTCCATGCCAATACATATTAGATATGACACACACTCATTTTCAATCATTTTCTGCTCTATGTATACATATCATTGTTTGCTTTTGTCATTGCAGCCGGAAGGAGCTGCAAATAATAACTACTTGGTGCAATATGCTCTAGCTTTGGTAAGTTATATATATTTTTAGTTGTACTCCGTATAATTTGTTTTCACTCTATTCTCTATTATATGTTTCTTCTAAGCTTAAAATAAAGATTTGATTTCACCTGAAGGTTGTTCTTTTTGTAAATTCAGTTCTCAGTATCAGCTTGTTAACAATCTAAAATGGCATTGGTGAAAATGGTGCAATTTTTTAGATACCATTGCATCACAATAATTGCCTTTATCCATCCACCCTTTGCTAATGAAAATACACCCTGTTGAAGGCTTGAAGCATATGGATAGAAGGATAGGTGTCTGTATCATTCATTGACGTTAGTAGTTAGCTGCCTTATGTGGAAATTTTCAATTATAAACTTGCTTTAATTTCCTGAAATTATCTTTGAACCAACAAATTGTTTGTGTTCACTTTTGTATATTTTTGTTCCATCCAAATAATCAAACAAGAATATATCATGTACTCTTACCAGCTTAAAAAAGTAAAAACTCATCCTATATTTATCTGAACACCAATATCCACATTGTTGATTGGGCTAATAGAGGAATGGCTAAGTAGTGTGGCCTATTTTTTCACAGGTGCTAAAAGAGAGCTTCAAAATATATTGTGCAATAAACGATGGGATTATTAACCTTGTTGATAAGGTAAAAGCTGTTCTTCCAGTAGTACTTTATAATGATCAACAATCTGCACATGTGTAATTTCCTTTTTCATGTGTTCAGTTTTTTGAGATGCCAAGACATGAAGCACTCAAAGCCCTTGAAATTTACAGGAGGGCAGGCCAACAGGTAGCTCCAAAGCCTGGACAATTATTTTGTGGAGTATATCTTGGTTCCATAAAGTATGGGGGTGATGCATTTTATTCATTCTTATGTTGTTTTGTTATTCTATACAGGCTGGGAGCCTATCTGACTTCTATGAAAATTGCCGGGGTCTAGAACTTGCTAGGAATTTCCAATTTCCCACTCTGAGGGAGGTGAGGGATTGACCCTTGTTGAATTGTTTCACTTTTATTAGATATCTTTCTTGAGAAAACATCTTTTTTTTTTCTTCTCAGCCGCCACAAACATTTCTTGTCACTATGGAGGAGTATGTGAGGGAGGCTCCACGCATGGTTCCAGTGCGAGAAACATTGGTTAGTACTTGCACATTTCTTTGTTTTATTTATTATTTCAGTGATCAGGCTGTCTAATTTGGATATTAGATACATGAACTGTGAGCCTTTTTGTGTTTCTACTTGTTAATATAGCAGTTTTTATCCCATGTTTCGTGTTAAGTATAATAATTTGAGAACTTTTGGTATCTAGACAAGAAGAAATAATTGAATTATTCAATAGTTTAGTGGTGCTTGTAGTGTCATTGGAATTTTCTACAGTGCGGACACGTACCTAAAAAAAATGTCCAAAAGGAAAAGAACAATATATTTTTTTGTGAATTTCAACATTATACATTATACAGTAGATCTTGCAGCATACATGTGGTTCATGATGGTATGTGGGAAATGAGAGAACAAATATGAGGAAAACAATACCAGTTCCTCTAATTTCTTTTCCTTGAACACGCAGGAGAGCTGCGCATCGTAGTTTCTGTAATTTAGAAGGTAACAAATAACTTGTTGCTACCCATCTAAAGGATAAAAAAAATCCCATACTACATTGAAAACTTGAAATAGGTAAATCAGCTTACAGGTGTACCTGCTTAATTTAAAAGAGGGAGGAAGAGAGGGAGATTCCATCTTAATTAATGACCTTATATAATGGATCATGCAAGTGTATTGCAGTTCATAGGCATATATATGCATATCTTTTAGCTTGAAACATAAGATAGCTATTTATAAAAAAGAATATGAATTATTATATAACTATTTCGAATTTAAATTCTCTCTACTTTATTTGCCCATAGGTGTTGTATTGATCACATGGAATGAGTTCTGTCCATTAATTATTCGTATTAATATAGCCCAGTGGGAGACTCTCCCACTGCTACGCATAAAAAAAATCCAGTCCATTGAATCGAATCATTCTGATCAGGAATTACCTGAGAGGCTTCTTCTGACATATAAACCTGAAGAACAAGAGGAAGATTCTGTGCCTGATCCTGTCGAAGAGGAAAAACCACCTGTTGAAGAACCTGTTCCAGTACCACCTGTTACTGAAGCTGTTTCACCTCCTCCTCCTCCCAAGACTAAGGTGGCAGATACTGGTGATCTACTGGTAAGTAAAGTAAAGAATGCTGTTATTCAATGCTTTAATTTTTCAATCTAAATTTTGTTTACTCCATAGGGATTAAATGATCCGAACCCTAGTGTATC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