BGIOSGA017666
| Gene Name |
BGIOSGA017666 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017666, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20770 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017666-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017666-PA |
| Length |
4864 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:27972882..27977745 |
| Sequence Coding Region |
27977629..27977745,27977299..27977485,27976422..27976484,27975729..27975816,27975365..27975469 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:27972882..27977745 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:27972882..27977745 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGTCCCCTTCCTCCTCCGCCTCGTCGCTACTCCTACCTCGCCGAGGCCACCAGCTCCAGGAGCCAGCCATGGCCGCGTCCCAGATGCGGTGCGGGGGCAGGAGGGAGAACCAGAAGGGGCTTGTGCAGAGGTGCGCCGAGACGATGATGCTGTGCTGCGGCGTGGATTGCGGGTGCGGCGCGCTGCGGCTGTGGCGCAGGGTGGTGCTTCGCAAGTGGCTCAACGTCGGCTCCGGGTCGGGCGACTCCGACTTCAGCGCCGACGAGTGCGACGCCAGCGACGGCGAGCTCGACGGCGAAGACAGGGATAATGAATCATATGGTGAAGGGACGAGTTTAGATGGACTTGGTGCAGGAACAATTGGGGATGAAATTAAATCTATGCCTTACAGGCCTAGAAGACGCAAATCAGAGACCCTTCGCGCTCAGTATATTGACATCAGAGAACTCAGGATTTGTGTAGGGACATGGAATCTTGCAGGCAAGTTTCCACCCAGTGATCTGGACATTCAAGACTGGTTGGATAAGGAGGAGCAGGCTGATATTTATGTTCTTGGATTTCAAGAAATTGTTCCATTAAATGCTGGAAACATATTTGGTTCTGAGGATAACAGTCCAATTGCAGTATGGGAGCATATTATTCGTGAAACTTTGAATAAGATTTGTCCAGATAAGCCGCAGTATAAATGTCACAGTGATCCTCCTTCACCATCAAGGTTTAATCCATCAGATTATGTTATGGTGATGAAAGATGAATTGCTTAGCGAGTCTGACAGTGACAATTATGGTGAGCTTCATCCATTGATTAAACAAAATGATGATATAGCTATTGACAATGATGTAGTTCATGATAAAACATATGAAAACTTCAGTGCTGCTTCCAACGGAAGAGTTCATAATGGCAAAGATTTCAGCAGGATGGATTCAGTAAAGACTTCTGATCAGTCCCCCAACTTAAGTTATGAAAAAGACAGATCAAAACTGGAAGAGACAACAAAATTACTCTATCATCCAGAAAGGCTTGGAATGATTTGGCCTGAACAGCCATTGGATATGATGGCTCAGTGTCTTCGGGCTAGCACTTCACTGAAGGCTCTAGCAACTCCAGCATCTTTGAAATCAACAGTGAATTTTCCAAATGATGATTTATCCCATCAAGTTAACAGTGACAATGGAGTGATTAAAAGTAAAAGGCCATGCTTTCTGCGAATAGTAAGCAAGCAAATGGTGGGAATATATCTTTCAATATGGGTTCGGAGAGACTTGCGGAAGCACATTCAGAATTTGAGAGTATCAACTGTCGGTGTAGGTGCAATGGGTTATATGGGCAACAAGGCAAGTATCAACTTTAATCCACTGCTCTTATTATTCAATTCAACAGCACTCAAAACATTCGCAAATCATTTAGTCAAGAAGTCCCATAGGTTAATCAGTTTGGTGTTGGGGTCAATATCAGTCAGCATGTCTATACATCAGACACATTTTTGCTTTGTATGTTGCCACCTAACTTCTGGAGAAAAGGATGGTGATGAACTGAAAAGAAATGCAGATGTTGAAGAAATCCTCCGAAGAACAGTATTTAACCCACTTCCTGGACTTAGCACGCCTAAGGGAATATTGGGCCATGAAAGGATCATATGGTTTGGAGATCTCAACTACCGAATCAACTTATCATATGAAAGAGCACATGAACTTATCTCCAAGCAAGATTGGGATGGATTGTTTGAGAATGATCAGCTAAAAAGAGAATTGAGTAAAGGACACACTTTTGATGGTTGGATCGAAGGAGATATCAGCTTCCCCCCAACATATAAATACGAGTTTGACTCAGAAAAGTATGTAAGTGATGAGCCAAAATCTGGAAGGAGAACACCAGCATGGTGTGATAGGATTCTTTCACGAGGAAAGGGAATCAGGTTAATTTCCTACAGGAGAGGAGAGCTTAAGCTTTCTGATCACCGCCCTGTGACTGCAGTCTTCATGGCAGATGTTGAGGTTCTCTGCCACAGAAAGTTGCAGAAAGCATTAACATTTACGGATGCAGAGGTTGAGTATCATCTGGCAAGTTCTTCAGCTGAAGGTCGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASPSSSASSLLLPRRGHQLQEPAMAASQMRCGGRRENQKGLVQRCAETMMLCCGVDCGCGALRLWRRVVLRKWLNVGSGSGDSDFSADECDASDGELDGEDRDNESYGEGTSLDGLGAGTIGDEIKSMPYRPRRRKSETLRAQYIDIRELRICVGTWNLAGKFPPSDLDIQDWLDKEEQADIYVLGFQEIVPLNAGNIFGSEDNSPIAVWEHIIRETLNKICPDKPQYKCHSDPPSPSRFNPSDYVMVMKDELLSESDSDNYGELHPLIKQNDDIAIDNDVVHDKTYENFSAASNGRVHNGKDFSRMDSVKTSDQSPNLSYEKDRSKLEETTKLLYHPERLGMIWPEQPLDMMAQCLRASTSLKALATPASLKSTVNFPNDDLSHQVNSDNGVIKSKRPCFLRIVSKQMVGIYLSIWVRRDLRKHIQNLRVSTVGVGAMGYMGNKASINFNPLLLLFNSTALKTFANHLVKKSHRLISLVLGSISVSMSIHQTHFCFVCCHLTSGEKDGDELKRNADVEEILRRTVFNPLPGLSTPKGILGHERIIWFGDLNYRINLSYERAHELISKQDWDGLFENDQLKRELSKGHTFDGWIEGDISFPPTYKYEFDSEKYVSDEPKSGRRTPAWCDRILSRGKGIRLISYRRGELKLSDHRPVTAVFMADVEVLCHRKLQKALTFTDAEVEYHLASSSAEGR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..117#261..447#1262..1324#1930..2017#2277..2381#2690..3575#3749..3933#4184..4292#4365..4507#4605..4785#4838..4864#ATGGCGTCCCCTTCCTCCTCCGCCTCGTCGCTACTCCTACCTCGCCGAGGCCACCAGCTCCAGGAGCCAGCCATGGCCGCGTCCCAGATGCGGTGCGGGGGCAGGAGGGAGAACCAGGTACCAGTTCTTGGCCGGGGTGGAGTTGGGTTCCCTTGCATTTTTGCTCGCGTTCTTGGATCAAATCGGTTATTATTGCTGTTCTTGTTGTTGCTGCTGTCTGATTCTGAAAATTCTCTCGTCTGCTCCGGGTGGTGGTGGAGAAGGGGCTTGTGCAGAGGTGCGCCGAGACGATGATGCTGTGCTGCGGCGTGGATTGCGGGTGCGGCGCGCTGCGGCTGTGGCGCAGGGTGGTGCTTCGCAAGTGGCTCAACGTCGGCTCCGGGTCGGGCGACTCCGACTTCAGCGCCGACGAGTGCGACGCCAGCGACGGCGAGCTCGACGGCGAAGGTTAACCTGCCTCACCGAGTCACCGTCCCCTCTCCTCTTCCTTCCTAGCTGCTCTGATTTGATCCAGTTTACTCAAGCTTTGCTCTTGTCTGGAGGAAAAATGGGGGGAGAATTTGGTGTGCGAATTTGTGTTGTTTTGATTGCTAGGCAATGAGGGGAATGCTGACCAGCATACTGCAATGGAAGCTCTTTCTTGTACGCCTTTGTGATTTGACTCTCCTTTTTTTTTCAGAAGATTAAAAAATAATCCCATTCAAAGAATTGGTTAGTTTTTTTTTTCTTTAGAACTAGGAGATGTCATGTTTAATTTTGTGTGTAAGTTGATGATCTTGCAATTGCAAGTGCCGGCAATTTGGTATGGTCATTAATATCTCTGAGAAAGACTTCCATTGTGATGTGTGGCTAGGCTAGTACTCTCTGCATACCAGCGGCTTTCTTTTGGTATATTCAACCTTTTTAAGGAAAGGAATGTTAGGTCAGGGAGTTCAAGGATTTGGCGAAAGCATGATACCTTTTCGATTCTTTTCTAAGCTTGCTTGAGCAAAATGGGTAGCAAAAAGTGAGGATAAAGCAGGCAACTTTTGCCTAACTCATAGCCTCGTTTTTTTCTTATTGCTTCAATGAATGGTAATGTGACCATCTTATCTAGTTGACTTTACTATCTAATGACAGCTGCTCCCTTTGATAAAAGTCCTGTAGGTGTTGTTTTTAGTGAACAACATGTCCTTATCAATTGCTCTTCTTGCACTTAACTTGCATATGTTATTGAATCATGCATATTCTGATTGTTCTCTTTATTATGCCATTTGTGCAGACAGGGATAATGAATCATATGGTGAAGGGACGAGTTTAGATGGACTTGGTGCAGGAACAATTGGTAATTTCATTATTAGCTCCTCATTTTTTTTGGAGAGGTCTGCTGAAGATCTGCACATTCGGTTTTTTGATAAGTCTATTTCTTTCTACATGTTCTCTCTTTTAGATGAGTTGTCCCTAGTTGATTTTCATACAAGGGAAGGGTCTTGCATATTGGTGCTAAAATACTAATCTGAGCAGTAAAGGCTAGTTTGGTTTTGTAGACAGAACATATGAGTCCATTGACCAAAGAGGAAAGACCTTATGTTTGGTAATCATTTACATACGAGAGACTGTAGCCTCGAATTTCAGTTTCCCTGGGGTGATGATGCCTCTAGATCGGTTTATCTTAAACTGTTCTACAAAATAGTACATCATGCTTTTCTTGTTTTTATTAATAAACATTTGATGTTATCACAATGGATGAAACAGAATTGAATATAATTAGCAAGCATTCAGCTTTCAATATTTTTTCAAGTTACTCTGAAGTCCATGTTTAGTACATTAAGTGCCTATTTGAAAAGGCAGGGCTGATTGGTTGCCTTATGTGCAGCACAAGCACTTGTTTGATAAAACTGACATGGCAGGTTTGCCTTATATGCTAATGCAATCAACTACACAATGTAGGGGATGAAATTAAATCTATGCCTTACAGGCCTAGAAGACGCAAATCAGAGACCCTTCGCGCTCAGTATATTGACATCAGAGAACTCAGGTATAGCCGTATAGAATTTTCTCCATCTTTGCATTTTTTTTCCTGGTCCTAGTTATGTTCTTCCAGTTACAGTGAGTATTGTTCCTATCATCTTATGTCACTATGTAATTAATTAATGTGATGTCAGCCACTCATTTCACCGTATTCCTATCACACAAATCATTTCAGGTTAATGCTACAATTGAACCCAATTGTTACCGGCTGAAATAAATAAAATATGATACTTTTGTATATGTTTCAAACTGTTTTCTATATGCAGGATTTGTGTAGGGACATGGAATCTTGCAGGCAAGTTTCCACCCAGTGATCTGGACATTCAAGACTGGTTGGATAAGGAGGAGCAGGCTGATATTTATGTTCTTGGGTAAATCACTATTCACAAATTTTTTTCCCCCTATTTTGTAAGGTAAAAGATTTGTGCCGCAGATTCGCATGAAGCACTCCACTTCTTATCTTTGAAAACTAAAAAAATGTTTCTGGATCATGATTTGAAATTATTTTGGCATCACAGTTTCTTCAAAAGAGACAGACATTATTTTATTATTTAGCTATGGTATGGTGTTGGTTCTATTTGTTTTCGTGTATGTCATGATGTTGGTTGGTTGTTCTGTTGTCAGCACTACAACTTAAGTATATAAAATCCATTGTCATAAATTTATGTTTATCTTTCAGATTTCAAGAAATTGTTCCATTAAATGCTGGAAACATATTTGGTTCTGAGGATAACAGTCCAATTGCAGTATGGGAGCATATTATTCGTGAAACTTTGAATAAGATTTGTCCAGATAAGCCGCAGTATAAATGTCACAGTGATCCTCCTTCACCATCAAGGTTTAATCCATCAGATTATGTTATGGTGATGAAAGATGAATTGCTTAGCGAGTCTGACAGTGACAATTATGGTGAGCTTCATCCATTGATTAAACAAAATGATGATATAGCTATTGACAATGATGTAGTTCATGATAAAACATATGAAAACTTCAGTGCTGCTTCCAACGGAAGAGTTCATAATGGCAAAGATTTCAGCAGGATGGATTCAGTAAAGACTTCTGATCAGTCCCCCAACTTAAGTTATGAAAAAGACAGATCAAAACTGGAAGAGACAACAAAATTACTCTATCATCCAGAAAGGCTTGGAATGATTTGGCCTGAACAGCCATTGGATATGATGGCTCAGTGTCTTCGGGCTAGCACTTCACTGAAGGCTCTAGCAACTCCAGCATCTTTGAAATCAACAGTGAATTTTCCAAATGATGATTTATCCCATCAAGTTAACAGTGACAATGGAGTGATTAAAAGTAAAAGGCCATGCTTTCTGCGAATAGTAAGCAAGCAAATGGTGGGAATATATCTTTCAATATGGGTTCGGAGAGACTTGCGGAAGCACATTCAGAATTTGAGAGTATCAACTGTCGGTGTAGGTGCAATGGGTTATATGGGCAACAAGGCAAGTATCAACTTTAATCCACTGCTCTTATTATTCAATTCAACAGCACTCAAAACATTCGCAAATCATTTAGTCAAGAAGTCCCATAGGTTAATCAGTTTGGTGTTGGTTTGTACTTCCTTCTATCTGCTCTATATGTTTGCATAAAAATTTAGTTTCATCTACTTTGTTATTCTGCAAATCATTGGCTTGACGATGCTTCTTCATGTTGCACCTTTTCTTTTTTCAAAATTTAGAAAATAATTGGTGCACCGTGCACATGTGCTTCTTGAATGTTCCAGGGGTCAATATCAGTCAGCATGTCTATACATCAGACACATTTTTGCTTTGTATGTTGCCACCTAACTTCTGGAGAAAAGGATGGTGATGAACTGAAAAGAAATGCAGATGTTGAAGAAATCCTCCGAAGAACAGTATTTAACCCACTTCCTGGACTTAGCACGCCTAAGGGAATATTGGGCCATGAGTAAGTTCACAAACTTGTTTTTATTTTTTTTGACCAAGGGCTGAGCGCCCCCATTTCCATTACAAGTTCACAAACTTGTGTCTTATGAAAACCTTTTACTATCCTCGAGAGGCTTGCACCCAACCAGAATTTATTCTTCTATGGTTTCATCTACTGTTTGTCGCTGGACACTACTCATGATAATGCCTTGTTTACGATATAACCATCTTTTCCCTTGATTTCTTATGGTTATCCATGTCATCATTTTCAGAAGGATCATATGGTTTGGAGATCTCAACTACCGAATCAACTTATCATATGAAAGAGCACATGAACTTATCTCCAAGCAAGATTGGGATGGATTGTTTGAGAATGATCAGGTAATTTGATGGTGTGATACATTCATTACCATTATAGATTTCTGAATCATGCTTTTCCTCCCTTTGTATCAGCTAAAAAGAGAATTGAGTAAAGGACACACTTTTGATGGTTGGATCGAAGGAGATATCAGCTTCCCCCCAACATATAAATACGAGTTTGACTCAGAAAAGTATGTAAGTGATGAGCCAAAATCTGGAAGGAGAACACCAGCATGGTAGTTTTTCATAGCACTGCCTTCTTTTTTTTGCATAATTAACCTTAAAAGATTAACTCAAGTTCATGCTTAGAAATCATATCTGTTGCCTGTTCAGGTGTGATAGGATTCTTTCACGAGGAAAGGGAATCAGGTTAATTTCCTACAGGAGAGGAGAGCTTAAGCTTTCTGATCACCGCCCTGTGACTGCAGTCTTCATGGCAGATGTTGAGGTTCTCTGCCACAGAAAGTTGCAGAAAGCATTAACATTTACGGATGCAGAGGTTGAGTATCATCTGGTAACGGAAGAAGATAGAACTTGAGTGAAAATATATATATTTGATTGTGCAGGCAAGTTCTTCAGCTGAAGGTCGCTGA</dnaseqindica> 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