BGIOSGA018014
| Gene Name |
BGIOSGA018014 |
|---|---|
| Description |
Beta-galactosidase 6 inactive isoform |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018014, complete gene. |
| LocusTag |
BGAL6 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA018014-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA018014-PA |
| Length |
8406 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:22244007..22252412 |
| Sequence Coding Region |
22252251..22252412,22248267..22248362,22248046..22248158,22247827..22247893,22247631..22247723 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:22244007..22252412 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:22244007..22252412 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCCATCACGGCGGCGCTCGTCGTCGTCGCGGCGGCGGCGGAGAGCCGGTGGGCGGAGTTGGGAAGGGAGATCACGTACGATGGCCGGGCTCTGGTGGTGAGTGGCGCACGGAGGATGTTCTTCTCCGGCGACATGCACTACGCCAGGAGCACCCCTGAGATGTGGCCAAAACTCATAGCAAAAGCAAAGAACGGTGGCCTCGATGTGATACAAACCTATGTCTTCTGGAACGTTCACGAGCCTATCCAGGGTCAGTATAACTTTGAGGGAAGATATGATCTTGTAAAATTCATCAGAGAAATTCAAGCTCAAGGGCTTTATGTAAGCCTCAGGATTGGTCCCTTCGTAGAAGCAGAATGGAAGTACGGAGGGTTTCCATTTTGGCTACATGATGTTCCCAGCATTACCTTCCGAAGTGACAATGAACCCTTTAAACAACACATGCAAAATTTTGTCACAAAGATAGTAACCATGATGAAACATGAAGGGCTTTATTACCCACAAGGAGGCCCCATCATCATTTCTCAGATTGAGAATGAATACCAGATGATTGAGCCTGCATTTGGCGCAAGTGGACCACGTTATGTCCGTTGGGCAGCTGCAATGGCTGTTGGTCTCCAAACAGGTGTTCCATGGATGATGTGCAAGCAGAATGATGCTCCAGATCCAGTTATTAATACCTGTAATGGGCTCATTTGCGGAGAAACATTTGTTGGACCAAACTCACCTAACAAGCCTGCATTGTGGACAGAAAATTGGACATCTCGCTACCCTATATATGGTAATGATACAAAATTGAGAGATCCAGAAGATATTGCGTTTGCGGTTGCACTTTATATAGCAAGGAAGAAAGGTAGCTTTGTGAGCTACTACATGTACCATGGAGGGACAAACTTTGGGAGGTTTGCTGCTTCATATGTAACAACAAGCTACTATGATGGAGCTCCTCTTGATGAATATGATTTCAAGTGTGTGGCTTTTCTAGTAAACTTCGATCAGCATAACACACCAAAGGTAGAATTCCGTAATATATCTCTGGAGCTGGCCCCTAAGTCCATCAGTGTTCTCTCAGATTGCAGAAATGTAGTTTTTGAAACAGCCAAGGTAAATGCTCAGCATGGTTCAAGAACAGCTAATGCAGTACAGTCTCTCAATGACATTAATAATTGGAAGGCATTCATAGAGCCAGTTCCTCAAGACTTGAGCAAGTCTACGTACACTGGAAACCAACTATTTGAACAGCTCACAACAACTAAAGATGAGACAGATTATCTCTGGTACATTGTCAGCTACAAAAATAGAGCAAGTGATGGCAACCAGATTGCCCGTCTCTATGTCAAGTCACTAGCACATATATTGCATGCTTTTGTCAACAATGAATATGTAGGGAGTGTACACGGCAGTCATGATGGACCTCGCAATATAGTGCTCAACACGCACATGTCTCTTAAGGAAGGAGATAACACCATATCATTGCTTAGTGTAATGGTTGGATCACCGGATTCTGGCGCCTACATGGAAAGAAGAACATTTGGGATTCAGACAGTGGGTATACAGCAGGGACAACAGCCAATGCATCTCCTCAACAACGACCTATGGGGATACCAAGTTGGCTTATTTGGAGAAAAGGATAGTATCTACACGCAAGAAGGACCAAACAGTGTTCGATGGATGGATATCAACAATTTGATATATCATCCGCTTACTTGGTATAAGACAACCTTTTCCACACCACCGGGCAATGATGCAGTGACACTAAACCTTACTAGCATGGGAAAGGGCGAAGTATGGGTCAACGGAGAGAGCATCGGACGGTATTGGGTCTCCTTCAAGGCTCCAAGTGGGCAGCCCTCTCAATCACTATATCACATACCACGAGGCTTCCTGACACCTAAAGACAATCTCCTCGTCCTTGTTGAGGAAATGGGAGGCGACCCGCTACAGATTACCGTGAATACAATGTCTGTCACAACAGTATGTGGAAATGTCGATGAGTTCTCCGTCCCTCCTCTCCAGTCTAGAGGAAAGGTTCCAAAAGTGCGAATCTGGTGCCAGGGAGGCAAACGTATCTCATCAATTGAGTTCGCAAGTTACGGGAACCCCGTGGGAGACTGCCGAAGCTTTAGAATTGGAAGTTGCCATGCAGAATCATCAGAATCCGTCGTAAAGCAGTCTTGCATAGGCAGGAGGGGATGTTCTATTCCCGTAATGGCAGCCAAGTTTGGAGGTGACCCGTGCCCCGGGATCCAAAAAAGTCTTCTAGTTGTGGCGGATTGCAGGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAITAALVVVAAAAESRWAELGREITYDGRALVVSGARRMFFSGDMHYARSTPEMWPKLIAKAKNGGLDVIQTYVFWNVHEPIQGQYNFEGRYDLVKFIREIQAQGLYVSLRIGPFVEAEWKYGGFPFWLHDVPSITFRSDNEPFKQHMQNFVTKIVTMMKHEGLYYPQGGPIIISQIENEYQMIEPAFGASGPRYVRWAAAMAVGLQTGVPWMMCKQNDAPDPVINTCNGLICGETFVGPNSPNKPALWTENWTSRYPIYGNDTKLRDPEDIAFAVALYIARKKGSFVSYYMYHGGTNFGRFAASYVTTSYYDGAPLDEYDFKCVAFLVNFDQHNTPKVEFRNISLELAPKSISVLSDCRNVVFETAKVNAQHGSRTANAVQSLNDINNWKAFIEPVPQDLSKSTYTGNQLFEQLTTTKDETDYLWYIVSYKNRASDGNQIARLYVKSLAHILHAFVNNEYVGSVHGSHDGPRNIVLNTHMSLKEGDNTISLLSVMVGSPDSGAYMERRTFGIQTVGIQQGQQPMHLLNNDLWGYQVGLFGEKDSIYTQEGPNSVRWMDINNLIYHPLTWYKTTFSTPPGNDAVTLNLTSMGKGEVWVNGESIGRYWVSFKAPSGQPSQSLYHIPRGFLTPKDNLLVLVEEMGGDPLQITVNTMSVTTVCGNVDEFSVPPLQSRGKVPKVRIWCQGGKRISSIEFASYGNPVGDCRSFRIGSCHAESSESVVKQSCIGRRGCSIPVMAAKFGGDPCPGIQKSLLVVADCR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..162#4051..4146#4255..4367#4520..4586#4690..4782#4859..5002#5116..5210#5302..5410#5519..5603#5943..6085#6182..6366#6459..6556#6787..6899#7281..7388#7470..7577#7654..7799#7890..8199#8296..8406#ATGGCCATCACGGCGGCGCTCGTCGTCGTCGCGGCGGCGGCGGAGAGCCGGTGGGCGGAGTTGGGAAGGGAGATCACGTACGATGGCCGGGCTCTGGTGGTGAGTGGCGCACGGAGGATGTTCTTCTCCGGCGACATGCACTACGCCAGGAGCACCCCTGAGGTAGCTGCATTTCATCTGCTTTGATGCCAATCTGCTGACAGCATTAGCTCCCGGTTTTCATTTAATTAATTAACGTTCAAGGTGGTCGTGTAGCTAAGTACTTCCTCCAACTTCCTCCATTTCAGGTTACAATCTTGATTTTAGCCAAAGTCAAACTGTTGTAAATTTAACTAAGTTTATAGATAAATATAATAATATTTATAATACTAAAGTAGTTTCATCAAATCAATAATTGAATATATTTTTATAATAAATTTATCTTGGGTTAAAAATGTTATTGATTTTTTCTATAAATTTGGTCAAAATTAAAGCCGTTTAACTTTGACTAAAGTCAAAACGTATTATAACCTGAAACAGAGGGAGTAGTCCTCGTAGAGTTCATAGATGGTCGTGTAGTTTTCAGGGCTAAACTAGGTTCGGCTGTCCAGTTTTTCTTTTTGAAGGGAATTTTTTTAAAGGGAAATGTCACAGTTTTTCTTTGATTGCGATGGAGGTGATGGAGACTTTATGTTTTCTTGTTTTCCTTTTTCTATTCTTGAAAAGAATATATAGCTTGTTCACATGAGCCTGTCATAACCTACTCTCAGTGCTTATTGATATGGATGACTGCAACTACTATTTGTTACCTTATTTCGTCCGACCTAAAATAACTCGATTTTTTATTATCTTATTTGTACCAAAATAACTTCTTTTAAGCAATCATAGCATTGGATTTTATAGAAGTGAGAGACAAATGCATTAAGGTTTGTTAAGCAGGGACAATTACATTAGGATTTGTTAAAGTGTAAGGCATTCTAGTTTCTTTTCTTGTATTGGTATGTAGGGAATGGATAAAAAATAAAGACAATTTAGGAAGGCGGTAGTACATCCAATAACTCACTGGCAGTTAGTCATAACATATAATTTAGGCCCAGTTTAGTTCTCACCTAAATTTTTTTCACCCTGTCACATCAAACGTTTGTCACATCGAATGTTTGAACACATGTATAAAGTGATAAATATAGGCTAAAAAAACTAATTGCACAGATTACAACTAATTTGTGAGACGAATCTTTTAAGCCTATTTATTCCATGATTTGACAATGTGTGCTACAGTAAACATTTACTAATGACGAATTAATTAGATTTAATAAATTTATCTCGCGGTTTACTGATGGATTCTGTAATTAGTTTTTTTTATTAGTGCCCGAACACCCCATGCGACACTCTATATAATACCCGATGTGATATGCCAAAACTTTACACACCGGATCTAAACACCCCCTTACATGACATGTTATCATGTTGTGCCAGTTTATATTCATTTTACAAAACACTGACAGTCATGTAGGAGTAGTTCCTAATACAATATTTAATAGTGGCTTCAAGACACACGCAAAGTTTTGTATCACTCTCTGGGTTCTCAATATATAGGCCTATACAGGTGTCAGGATTTAGGACCAAAATTGTTCAACTGCAAATGTCTCCGTCATCTTAATCGGATTTGATAGTAAGTTTGTGCAAGCTTTTTTCCTTCCCTAGCTTCCGAATTTTCAGTCGTACGATGTTATGTCAAGATTCATGCTACACTAGTTACATATAAGTTAAATTATAGTTACAACTAGTTATAATAATTTTAACTCATTGTAACTACATTACAACTTTATATAATTTAGGTATAAAAAGTTGCCTATATTTTTATACTTATATATAAGTTATAGTATAATTATGATGGAATTATATTATATAGTTACAATTGAAAGTTTTCCATTTTAAAAAACTCGCGAGAAGAGTCCAGAGTCTATATAAAAATATAATTTATAAATAACTAAAATTAAAAATTTTAAAAATAATAATGGAAAAAAAGTCTAGAATCCATATAGGAATACAAATTACAAATAATAGAAATTTTAAGTTAGAAAATAAGGAATATTGAAACAAGAGTTTAGAGTTCATATAAAAATACAATTTACAAATAACTAAAATCCAAAATTAAGAAAAAAGAATATTGGAGGAGGAGTTTAGAGTACATATAGAAATAAAATTTATAAATAACAGAAATTCGAAATTAAAAAATAGGGAATAGTTAAAGAGGAGTTTAGAGTCCCATATAGAAATAACTAAAACTAAAAATTTTAAAAAGAAATTGATAACTATCACGTATATCCAATACAAATGAATATTACACATTGGTTAGTTTGGTTAAGTTAGTACAAAATTTAAAATTATGTTATCATTTTAATATAGTTTAACAATAAAATATGAAAATATTTAAGCTATTATATGAGAAAAAAATATAATTGTACTAGCCGTGCAATCTGCGAGAGCCAGCATACTAGTTCATTATATTTTAGCCTTAAAAAATGGAAAATCTGATAATTTTAAGGGCATAAATTTGTTAGAATTTTACCTTTTCCCCCTCCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGAATTTAAACACGAGACTTTATACATAAGTGGAATATTATTGAAAGTTCACGTACAAATTTTTCTCGAATTTTCAATAACACTTGTAAATTGGTGTGTATACCTTAAATTTGGCAAATTTTGCTATGGGATATTTAAAGTTTGTGTAATTTGCTTATGGACATCGAGAAAATGTGTTACGGCTAAAAGATACCCTAAAAACCTGTTAATTTGCTAGCGGATACTTCTGACTCAATTGAAAAGATAAATTTTAAGAAAGACGAGGATGCCCCTAGGACCACATGCTTCAAACATAATGTTAGAGTGAAAATCTAGAAATCATGCAACTCTAAATTCACCATCACCCAAAGTAAATCACTAGCATACGTCGTACTCCATCTTCACTCCAATCTCAAAAGCTTTTAACCCTAAGGGTATTCTTGTCTTTTTGAAGAATTTTTCTCTCCAATTAAACCGGAAGTGTCTTTCAGCAAATTACCAATTTTTCACAATATGTTTTAGCCGTGATACAGTTTTTAGATGTCTACCAGCAAATTACATAAATTCTGAGTGTCATGTAGCAAATTTTACCCTGAAATTTATATGCACAAGATACATTCATCACACTTGTAGTGCAACTAGGTGCTGCTATAGTTGTCATCTATATTTTCTAAGTGAATTTGGTGATGAAAATCGAAAGGAAAAGGGAGAATTAAAGAGCTTACAACACTATACTTCTCAATTTTTAAGCATGCATGACCTTAAAGAAAACAAAAGAGAAACATACATGAACTTGTTCTGAGGAACGATTCCTAACAAGTTAACAAATTTTCCTTTTTGCGAGGAACGAAGTCAATAACTTGAATGCTACTTCACCCTTGTGCACGTTTATGTCACAACTATAATCTGTGGCTTTGTGCCTTGCCTTCCACATATCCTTCGTATTATCTCTTCTATTAAAAGAATTTTTTGGTTTATAAATATATAGTCCCGGCCCCTTGGTAAGACATCAATTTTCCACAGCTTGAGCCATCAGGGGAAAAATATTAGACCTGTGATTTCCAAAAGGTGTAATATCTACGAAAAAAGGGAATCTTAAATTGACGAGGATGAATAGATATTGGTTTCCTCTTTTCAGATAACTAACAGCTTAATAGATATTGGTTTCCTCTTTCCAGAGAAGTAGCAGTTTTGAGACATGCATCTATTTCCCAGAATTACATTCTAGCTCAGCGTGTTATATAAAGTGGAAAGCACAAATAATTACACTCAGCGTTTGAGTCATCAAAAACATGCACCCTATATAGCCTAAAGGTCTGGTTATTTGGGACAATTTTCAAGCAACAATCACTATGAACTTCGATAGCAATTCCGGCTTTCCTTGGAGCAATTCTCTGGTTTGCCAAGCTTTCCGATTCATCACATAAATCATTTATTAGGATGTTTGTGCACAATAAATTGGCAGATGTGGCCAAAACTCATAGCAAAAGCAAAGAACGGTGGCCTCGATGTGATACAAACCTATGTCTTCTGGAACGTTCACGAGCCTATCCAGGGTCAGGTATTCACTCTTTCCAGTCTGATATGTTTGTCTGTCAAAAGAGCATTGAAGATATTCAGTAAAAGAATTTCCATAACTAAGATATGCTTAAATGTACCATTGTAACAGTATAACTTTGAGGGAAGATATGATCTTGTAAAATTCATCAGAGAAATTCAAGCTCAAGGGCTTTATGTAAGCCTCAGGATTGGTCCCTTCGTAGAAGCAGAATGGAAGTACGGGTATGAATGAATTGAAATATTTTCCTATGCAGATAACAGGTTATCTTTTGAGAAATGCTCTGGTATATAGAACTCAAGGAAGCAATATGTTCAAATCAGAGCACAAGTTCTCATCTTTCATAAACTACCTTAACAAGTCTTTGTTAGTACAGAGGGTTTCCATTTTGGCTACATGATGTTCCCAGCATTACCTTCCGAAGTGACAATGAACCCTTTAAAGTAAGTGCATACAAGATAAGATTCTTCAATCCCATAATCTTAAAACTGTTTCCATTTTCCAGTCATGTACACCGCAATAAGTTACATGTTTTTATCCATGCAGCAACACATGCAAAATTTTGTCACAAAGATAGTAACCATGATGAAACATGAAGGGCTTTATTACCCACAAGGAGGCCCCATCATCATTTCTCAGGTTAGAAATG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|
| External Link(s) |
