BGIOSGA018078
| Gene Name |
BGIOSGA018078 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013134L02, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018078, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA018078-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA018078-PA |
| Length |
7569 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:20965980..20973548 |
| Sequence Coding Region |
20973462..20973548,20973104..20973256,20972850..20972987,20971239..20971401,20970886..20971121 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:20965980..20973548 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:20965980..20973548 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTCCGGCTCAATGTGCTCGTGTGCAGAGGGTGTTCCACTTCGGCAAGGGCAAGAGCGAGGGCAACAAGGCCATGAAGGACCTGGCGTGCCAGCAGTACCAGGCGGCGGGGAAGACGCTGCCGGCGGGGCTGTGGGAGGAGATCGTCGAGGGGCTCCAGTGGGTGGAGGAGTACATGGCGGCGCGCCTCGGTGACCCCGCCCGCCCTCTCCTCCTCTCCGTCCGCTCCGGCGCCGCCGTGTCGATGCCGGGGATGATGGACACGGTGCTGAACCTGGGGCTGAACGACGAGGTGGCGGCGGGACTGGCGGCCAAGAGCGGCGACCGCTTCGCGTACGACTCCTACCGCCGTTTCCTCGACATGTTCGGCAACGTGGTCATGGACATTCCTCATGCACTGTTCGAGGAGAAGCTCGAAGCCATGAAAGCAGTCAAGGGGCTGCACAACGACACTGACCTGACTGCCACTGACCTCAAAGAACTAGTGGCACAGTACAAGGATGTCTATGTTGAAGCTAAGGGAGAGCCATTTCCCTCTGATCCCAAGAAGCAACTGCAGCTGGCCGTGTTGGCCGTGTTCAACTCATGGGATAGCCCAAGAGCAATCAAGTACAGAAGCATAAACAAGATCACTGGGCTGAAGGGCACTGCTGTAAACGTGCAGACCATGGTGTTTGGAAACATGGGGAACACCTCTGGCACGGGTGTGCTCTTCACTAGGAACCCAAGCACTGGAGAGAAGAAGCTTTACGGCGAATTCCTTGTGAATGCTCAGGGTGAAGATGTGGTTGCTGGAATCAGAACTCCAGAGGATCTTGATGCTATGAGGGACCACATGCCGGAGCCTTATGAAGAGCTCGTTGAGAACTGCAAAATTTTGGAGAGTCACTATAAAGAAATGATGGATATTGAATTTACTGTTCAGGAAAATAGGCTTTGGATGCTTCAGTGCAGAACAGGAAAGCGCACAGGAAAAGGTGCTGTAAAGATTGCTGTAGACATGGTTAACGAGGGCCTTGTTGAGCGCCGCACAGCACTTAAGATGGTAGAACCAGGTCACCTGGATCAGCTTCTTCATCCTCAGTTTGAGAACCCATCAGGGTATAAAGACAAAGTTATTGCCACGGGCTTACCTGCATCACCTGGGGCTGCTGTGGGCCAAATTGTATTCACTGCCGAGGATGCTGAAGCATGGCATGCCCAAGGGAAAGATGTTATTCTGGTGAGGACAGAGACCAGCCCAGAGGATGTTGGTGGCATGCATGCAGCTGTTGGAATTCTTACAGCAAGAGGTGGTATGACCTCTCACGCTGCTGTTGTTGCGCGCGGATGGGGCAAATGTTGTGTGTCAGGATGCTCAAGCGTCCGTGTAAATGATGCGTCCAAGATTGTAGTGATTGAAGACAAGGCGCTGCATGAAGGTGAGTGGCTATCGTTGAATGGATCAACTGGTGAAGTGATCATTGGCAAGCAGCCACTCTGCCCACCAGCCCTTAGTGGTGATTTGGAAACTTTCATGTCTTGGGTGGATGAAGTTAGGAAACTCAAGGTTATGGCAAATGCTGATACCCCCGAGGATGCAACAACAGCCAGACAGAATGGGGCAGAAGGAATTGGGCTATGCCGGACTGAACATATGTTCTTCGCTTCAGACGAGAGGATTAAGGCTGTCAGGCAGATGATTATGGCTTCAAGTCTTGAACTGAGGCAGAAAGCACTAGATCGCCTTTTGCCTTATCAGAGGTCTGACTTTGAAGGCATCTTCCGTGCAATGGATGGGCTTCCGGTAACTATTAGACTCTTGGATCCTCCACTTCATGAGTTCCTTCCAGAAGGCCATGTTGAGGATATGGTGCGTGAGCTATGCTCTGAAACTGGAGCAGCTCAGGATGATGTCCTTGCAAGAGTAGAAAAACTTTCCGAAGTAAATCCAATGCTTGGTTTCCGTGGGTGCAGGCTTGGTATATCATACCCTGAATTGACTGAAATGCAAGCCCGTGCCATCTTTGAAGCTGCTATAACCATGACCAACCAGGGTATTCAAGTCTTTCCGGAGATAATGGTTCCCCTTGTTGGAACTCCTCAAGAATTGGGGCATCAAGTGGATGTTATCCGTCAAATTGCCAACAAGGTGTTCACAGACATGGGAAAAACTATTGGCTACAAAGTTGGAACTATGATTGAAATTCCCAGGGCAGCTTTAGTGGCTGATGAGATAGCAGAGCAGGCTGAGTTCTTCTCCTTTGGAACAAACGACCTAACACAGATGACATTTGGTTACAGTAGGGATGATGTGGGGAAGTTCCTTCCCATCTATCTGTCTCAGGGTATCCTCCAGCATGACCCCTTTGAGGTGCTTGATCAGAGGGGAGTTGGGGAGCTGGTTAAGCTGGCTACAGAGAGAGGCCGCAAAGCTAGGCCTAACTTGAAGGTGGGCATCTGTGGTGAACATGGTGGAGAGCCTCTGTCAGTCGCTTTCTTTGCGAAGGCTGGGCTGGACTATGTTTCTTGTTCGCCTTTCAGGGTCCCAATTGCTAGGCTAGCTGCAGCTCAGGTGCTCCTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAPAQCARVQRVFHFGKGKSEGNKAMKDLACQQYQAAGKTLPAGLWEEIVEGLQWVEEYMAARLGDPARPLLLSVRSGAAVSMPGMMDTVLNLGLNDEVAAGLAAKSGDRFAYDSYRRFLDMFGNVVMDIPHALFEEKLEAMKAVKGLHNDTDLTATDLKELVAQYKDVYVEAKGEPFPSDPKKQLQLAVLAVFNSWDSPRAIKYRSINKITGLKGTAVNVQTMVFGNMGNTSGTGVLFTRNPSTGEKKLYGEFLVNAQGEDVVAGIRTPEDLDAMRDHMPEPYEELVENCKILESHYKEMMDIEFTVQENRLWMLQCRTGKRTGKGAVKIAVDMVNEGLVERRTALKMVEPGHLDQLLHPQFENPSGYKDKVIATGLPASPGAAVGQIVFTAEDAEAWHAQGKDVILVRTETSPEDVGGMHAAVGILTARGGMTSHAAVVARGWGKCCVSGCSSVRVNDASKIVVIEDKALHEGEWLSLNGSTGEVIIGKQPLCPPALSGDLETFMSWVDEVRKLKVMANADTPEDATTARQNGAEGIGLCRTEHMFFASDERIKAVRQMIMASSLELRQKALDRLLPYQRSDFEGIFRAMDGLPVTIRLLDPPLHEFLPEGHVEDMVRELCSETGAAQDDVLARVEKLSEVNPMLGFRGCRLGISYPELTEMQARAIFEAAITMTNQGIQVFPEIMVPLVGTPQELGHQVDVIRQIANKVFTDMGKTIGYKVGTMIEIPRAALVADEIAEQAEFFSFGTNDLTQMTFGYSRDDVGKFLPIYLSQGILQHDPFEVLDQRGVGELVKLATERGRKARPNLKVGICGEHGGEPLSVAFFAKAGLDYVSCSPFRVPIARLAAAQVLL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..87#293..445#562..699#2148..2310#2428..2663#2848..2976#3270..3449#4060..4197#4386..4550#4685..4846#4986..5075#5254..5392#5759..5936#6089..6218#6501..6629#6875..7012#7187..7264#7354..7445#7527..7569#ATGGCTCCGGCTCAATGTGCTCGTGTGCAGAGGGTGTTCCACTTCGGCAAGGGCAAGAGCGAGGGCAACAAGGCCATGAAGGACCTGGTAAAAATAATCGCTGTTGATACGAGATGATGATGTTATGAACTTGGAATTTTGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGCGAGCATCGGTCTGTCGGTGCCGCCGGGGTTCACGGTGTCGACGGAGGCGTGCCAGCAGTACCAGGCGGCGGGGAAGACGCTGCCGGCGGGGCTGTGGGAGGAGATCGTCGAGGGGCTCCAGTGGGTGGAGGAGTACATGGCGGCGCGCCTCGGTGACCCCGCCCGCCCTCTCCTCCTCTCCGTCCGCTCCGGCGCCGCCGTGCGTATCACTTACTTATATTTACTCTCTCTCTCTCTTCCTCTCTGCCACGCCGGCGATGTGACAGATCGATTGATCTCCGTTGCTGATCGATCCGTGCGTGCGTGTGTGTGCAGGTGTCGATGCCGGGGATGATGGACACGGTGCTGAACCTGGGGCTGAACGACGAGGTGGCGGCGGGACTGGCGGCCAAGAGCGGCGACCGCTTCGCGTACGACTCCTACCGCCGTTTCCTCGACATGTTCGGCAACGTGGTACGTACTCCTCATCAGATCACACTCTCCCGGCTCGCTGACTCGGCAGCTAGCTGCCTAGCTCGTCGGAGCTCACGAGCTTAATTTTACTTGTTCTCTGCTACTTTCGTGTGCGTCAACACTGCCACGGCTGCATCGACGTGGTGGGTAAGTTATTTATGCTGCGTCAGCGACGCGACGGTGGTGGCTGCGGATGCGCATACTTTTGTGCGTTGGGTGGGGCCCGGTTCTTCCGTCTCATCCTATGTGGGGGGAATTTGTCCGCACTAGAGTCACTCCAACTTCCCAAAGCTTATTGTTCTTTTGTGGCTCTATTTTACTATTAGAAAATAGGGAATAATTTTAGTAGTATTTGACTTTAGAAAAGTTACAAGGAGAATATTTTAGTATTGTGTCAAGAAAAAAAAGGAAAAAAAAACAAGAGATAGTATGTCCCTCTCGATCGTATATGCGATTATGTGCTAGCAAGGGATTAACATGGAACTTGCTGTCAATATTTGATCTCCTCGTACAAAGAATACAAGATGTTTTCTTAGGAGACCTGTACGGCACTATTGCCGTATTTTGACCATAGTTCTTTAATTTTATTGGAAAGGATGACTGGTGAAGGCGATGGGTGGTTAGCAGTACAATTTGACACTCCTTACTAGCTCAGCTCACATATACTCCTATTTCATGTAATAATTAAATTAATCAGTACAGGGTCCTCCAACATAGTACCTGATAACATCTGCAATATGGAAATATCTGTCTTCCTAGAAGTTCAAAGACAAGTTGGTTGCTAGTCCAGTCATACAACCAATTACTTTTTTTTCACCTATATTCATCAAAGCTTATTTTTTTTGGAAAAAATGTTCTTAATTTTATTCTTTTTTAGCAAATTTAATTTAGAGTAAAAAACAGTAAGTTTTATTATATTTTTCAAGCGCACCGTTCACCACACCGGTCTCGGCGGTCTGCACAACTTTTGCCCTTTGCTTGGGGTGCGCAACCGGTCGGTCGGTCACCTTGCACCGGACCGGACCGGTCCGGTCGCTGGAGTCGAAGTGGTTCGAACTCCACTGCGCCCCGAGCCCTCGACCACCTCCCTCCTCCTACCAATCCCAGCCATGGTTCGACTCATCACAAGCGCTGCCATGGTTCGACTCATCACAAGCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGACCGCGCCTGAGCCCATCATGGATGCTAGACCTATACCAGCTTCGATTGCCTTGGCCGCGATTCGCTGGTAAGATAAGGCCAGAGGGTTTCGGTAGGATGTCGCAAGGATGAGCCGCAGAATCGTGAATTTGTGATGGGTGTTAGTTGTTACTCAATAGAGGGGAATTTTGCCTTTATTCAGCCCAAAAATTGGTTACAGGTCATGAATGCTTCCTGGTTCTTGAATGCTACAGAGATCAGTTCTTAGAATTTTTTTCTCTCTCTTTTCCAGGTCATGGACATTCCTCATGCACTGTTCGAGGAGAAGCTCGAAGCCATGAAAGCAGTCAAGGGGCTGCACAACGACACTGACCTGACTGCCACTGACCTCAAAGAACTAGTGGCACAGTACAAGGATGTCTATGTTGAAGCTAAGGGAGAGCCATTTCCCTCTGGTATGCCCATAAAGTTTCACTCTTCGTGATATCTGAAATTAATTAGTGTTTTGATGAAACTGAGCCTTTTCTTTTGGCGTCTGAATGCTAATGTACTGTGTTGTTTGCTTGCCATAGATCCCAAGAAGCAACTGCAGCTGGCCGTGTTGGCCGTGTTCAACTCATGGGATAGCCCAAGAGCAATCAAGTACAGAAGCATAAACAAGATCACTGGGCTGAAGGGCACTGCTGTAAACGTGCAGACCATGGTGTTTGGAAACATGGGGAACACCTCTGGCACGGGTGTGCTCTTCACTAGGAACCCAAGCACTGGAGAGAAGAAGCTTTACGGCGAATTCCTTGTGAATGCTCAGGTATGGCTCACACCCTGTTGCTCCTATTTGCATCTAGCTGCTAACTGTTGCACACCTGTGGTTTGTGTGTATGAATCAATGTATGAGCAATATGTTTCCTGCTGATCGTATTGGGTTATGCAAGCGGCGATAATTCATATATACCCGAACGATTTCTTATAATGCAATATTATTTCTTCTGCAGGGTGAAGATGTGGTTGCTGGAATCAGAACTCCAGAGGATCTTGATGCTATGAGGGACCACATGCCGGAGCCTTATGAAGAGCTCGTTGAGAACTGCAAAATTTTGGAGAGTCACTATAAAGAAATGATGGTACAATATTCTAATTTGCTTTATGCATCAATACCTTATTAGATAATGGGATTAAGGCAGTTCTAGAGGCATAAGTGTCCTACTTTTCCCTCAAACTGAAACTTAAAAGGAAGCACGATCGTCTGATCATATACTCGAGCATTGTCTTGGTGATATCTCATTACCTCCAATAGCTTGCACACAGAAATAAGTGATTTGAAACGATCTTGATCATGCTCTTGGTTTAGCAACTAGGTAATGTGCCTCCATTATTTTTTTTTGGGGGACTAACTTAATTTTCATGTATAATGCAGGATATTGAATTTACTGTTCAGGAAAATAGGCTTTGGATGCTTCAGTGCAGAACAGGAAAGCGCACAGGAAAAGGTGCTGTAAAGATTGCTGTAGACATGGTTAACGAGGGCCTTGTTGAGCGCCGCACAGCACTTAAGATGGTAGAACCAGGTCACCTGGATCAGCTTCTTCATCCTCAGGTATTGTATAACTAAGAGGCTCTAATGGTCTATAAACTCATGCACCACATAAATGGACACGTACAATTTCATAATACCTCTGTTATCCCAAAATGCCGTGTTGCTCTTTTAGAACAATTTTGTTGGGTTGGTGTATTGATGTCATAGAAGTTACCACATCGATTGCGTGCTTAGAATAAATCAGTTAATACTTAATAGTAAGCTAGAATAATCAAAGATTAAATGTGTGTTTGCGATCTATTAGTGAAATTTGATACGCATGTCTGCTTTAATTCTGAACATCAAAATCTTTATGTTATATTTTTCCACAAAATAGGTAGAGTGTTTGTTACTTGAACTCTGAGCATTTTGAATTATTTGGAATGAGTTTTAGCAAACAACAGAGATTATCTCATTACGTCTTGTGTAGTAAAGTATAATACTATTATCATAACTAACAAATATCAAACATAATCACACAAGTATTGATGTTGGTAACTGTTGTTTTAAAATTTTGTTGCCTGCTAGTTTCTGCACAGGTCTTGGACATTGCGTACTTGAGTTTCAGTTCACAACTAAATTAATGGCAGTTATTGATATCTCACTTTTAATCTTTTGTTATGAAAACCAGTTTGAGAACCCATCAGGGTATAAAGACAAAGTTATTGCCACGGGCTTACCTGCATCACCTGGGGCTGCTGTGGGCCAAATTGTATTCACTGCCGAGGATGCTGAAGCATGGCATGCCCAAGGGAAAGATGTTATTCTGGTACGTCCTGATCATCTGTCTTTCTAGGACAAATTTGTTTGTTTCGTCCATGTTAGAATATTAAACAGCTGCTTATAGGAAAAAAAATAGATTTATCACAGCTTTATTCAAGCTGCACTTGAAAACTCCACATTGCATCGTTGCATTTGGTGTATCTTGACATTTTCCTGTCCATTATGAATGTAAAGGTGAGGACAGAGACCAGCCCAGAGGATGTTGGTGGCATGCATGCAGCTGTTGGAATTCTTACAGCAAGAGGTGGTATGACCTCTCACGCTGCTGTTGTTGCGCGCGGATGGGGCAAATGTTGTGTGTCAGGATGCTCAAGCGTCCGTGTAAATGATGCGTCCAAGGTGATTATACTAGATTCTTGCACCACACAAACATTTAAGAGTTCTCTTATGTACAAAGGCTGCCTTTCACACATCGAGTTTGCAATTACCATTTTATACTGCAGATAGTTGCTTAATTTGCTGTGTCTCTACAGATTGTAGTGATTGAAGACAAGGCGCTGCATGAAGGTGAGTGGCTATCGTTGAATGGATCAACTGGTGAAGTGATCATTGGCAAGCAGCCACTCTGCCCACCA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