Os11g0686900

From RiceWiki
Revision as of 09:20, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os11g0686900| Description = NB-ARC domain containing protein| Version = NM_001075011.2 GI:297612404 GeneID:4351144| Length = 9335 bp| Definitio...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os11g0686900

Description

NB-ARC domain containing protein

Version

NM_001075011.2 GI:297612404 GeneID:4351144

Length

9335 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0686900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:29651805..29661139

Sequence Coding Region

29651805..29651973,29654963..29657037,29660315..29661139

Expression

GEO Profiles:Os11g0686900

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008404:29651805..29661139 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:29651805..29661139 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggaggctccgacctgtggtttgtggggcgccgtgttgaacctccccgggaggctcgacggggtcctccttcgccatggcagcattcttcccaagggtgccgaggaggagataccgctcatcaagcgagatctccatcttatgatctccatactcaatggctattacagcgagtcgccggagctggaggatgccacggcgacgacggtggcgaggaggaggtgctggacgaaggaggtgcgcgagctgtcctacgacatcgaggactgcatcgaccactacgagcacgctgccaccgccggttcagcgggcggtcgaaccgccagcggcgggattcctcctcgccgtaagatcaccaggcggcggtggcagcgtacgactcctctctggattccagagaggctgaagcagcggttatggatggctaacaagatcagagaattcagcctacgtgcccaggacgcgctcaaacgccatgccatgttctgcagcagcgtcggtggcaatggcatagccaccagtactgcttcttcctctactgccgctacaggtgacgcatcgtcttcttcttctaccatatgttggcacaccacgcggttcagggaacgcgacttctgcgtccctcatgtcggtatcaacgtcgccatgaacaagctcgaagactggctcactgcgtgtgatgatgaagatcagaagaggctgagggtggtgtccattgtaggagtcggaggaataggcaagaccacgctcgccaacgagctgtaccgcaagcttcggcggcagttcgaatgctgggcatttgtgcgttcctcccagaagcctgattgtgctttaccagatggtacaagtagcagcagagtactaacaacgacacaatatgatgatctagcagtccaatcatgtggttatgacaccaagtatgttttcaagatgaaatctctttctcaacacgactcaagatatttatttttcaatacagtttctggcagtcgctttatttattctccaggatccactgaagtttcagatgatattataaggaaatgtggtagtttgccactagctattgtatctattaccagtattctagagaagtcgaggaaaatggagcaatggggttatgtaaacaaatccttaggctacaatttgatgaaaaaccctaccttggaggggataaaacaagtgttggaccttagttacaataatctttctgagcatttgaagccatgtgtgctgtatcttagtatatatcaagaggactacttaatttgtaaggatgatttggtgaatcaatggttggctgaagggcttatctgtgcaacaaaagatcacactaaggaagaaatttcagaggcctgttttggtgagcttgtcagtagtaaaatgatccaaccagtacatattgatggcaatggtgacgttatgtccttcgttattcaacatatggtactcaattttattagttacaagtctatagaagagaacttcgtcactgtaatacatcattctcagacagctaccaaactttctgacaaggttcgtcgattgtctcttcactttggtaatgttaaagatgcaaagttaccaataaatatgagactttcacaagttcgaacacttgccttctttggggcctacaagtattggtggcgttcaatcaaagatcaattcccacttctccaagttcttatccttcatttttggcatgatgaggatattatcagttttgacctcactataatttcacagctttttcgactgaaatatttaaagatcacatctgatgttactttagaactgcaaaccaagacaagaggcctgcaatgtttggaaacacttaagatagatgcaagaataagtacagctccattagacacaactcatttgtcgggtttactccatctgagtcttcctgctgatacaaacttggccaatggaattggccacatgacatcgcttcacacatttgggtattttgatctcagctataactctgtagagaacgtgcttagccttggcaagctgaccaatctccgaaatcttcagctcacttgttccaccatacgacctaacagtctggagattaaattgcagtgcctgggtttcattcttcaaaaactcagcaacctcaagtctgtaactatgtcaactgcaggctcctcttgtgtaaattctactgatgcgagttctgcaaacgttagcgttagaatttctggtgatggcttgagcagcatgtcctctcccccggcacttgttgagaggcttgagttgttgccacgaatttgcatattctcctacctcccgaagtggatcagtctactcagcaagctccgtattttgaagattggggtaagggaactagtgagaaatgatattgatgttctcatgggattgcgtgctctcactgatctctcgctacatgtccacaccaagcctacagaaattattttctttggcggtataggattcaaggctctcaagtacttaaagatcaattgctgtgtagcttggttgaaatttgatatgggtgcaatgcatagtctctataagctcaagcttggttataatgtcgatggagttgatcaagaaagtacgataccagttggcattcagtacttatatggcctcaaagagatctccgtaaaaattggtggtgctgatcctgagaaatacgacagaagggctgaagagttggcgttcatgatcgactcaggtctgcatgacagatgcatgagcatcactttacaatgcgtgaggcagatgtttgatttcaacgaagataagagtagcctgacacatgaagaacaaaggaaattgaaacaacaggagatcctggaggatgactctgacgaagaatatgacgaaattattcaggactctggggagcaagaagtgaaacagtcaaccttatctgaatgggacattgtgcacctgttgagaaacaagctgaacaaccagcaggatggcacgacgtgccatttccccgttgtcgcctcctactatgttgacacgtgtcagctcacaggtggttcctcctcagtcacatccatcaaagtattttcaacgtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAPTCGLWGAVLNLPGRLDGVLLRHGSILPKGAEEEIPLIKRD LHLMISILNGYYSESPELEDATATTVARRRCWTKEVRELSYDIEDCIDHYEHAATAGS AGGRTASGGIPPRRKITRRRWQRTTPLWIPERLKQRLWMANKIREFSLRAQDALKRHA MFCSSVGGNGIATSTASSSTAATGDASSSSSTICWHTTRFRERDFCVPHVGINVAMNK LEDWLTACDDEDQKRLRVVSIVGVGGIGKTTLANELYRKLRRQFECWAFVRSSQKPDC ALPDGTSSSRVLTTTQYDDLAVQSCGYDTKYVFKMKSLSQHDSRYLFFNTVSGSRFIY SPGSTEVSDDIIRKCGSLPLAIVSITSILEKSRKMEQWGYVNKSLGYNLMKNPTLEGI KQVLDLSYNNLSEHLKPCVLYLSIYQEDYLICKDDLVNQWLAEGLICATKDHTKEEIS EACFGELVSSKMIQPVHIDGNGDVMSFVIQHMVLNFISYKSIEENFVTVIHHSQTATK LSDKVRRLSLHFGNVKDAKLPINMRLSQVRTLAFFGAYKYWWRSIKDQFPLLQVLILH FWHDEDIISFDLTIISQLFRLKYLKITSDVTLELQTKTRGLQCLETLKIDARISTAPL DTTHLSGLLHLSLPADTNLANGIGHMTSLHTFGYFDLSYNSVENVLSLGKLTNLRNLQ LTCSTIRPNSLEIKLQCLGFILQKLSNLKSVTMSTAGSSCVNSTDASSANVSVRISGD GLSSMSSPPALVERLELLPRICIFSYLPKWISLLSKLRILKIGVRELVRNDIDVLMGL RALTDLSLHVHTKPTEIIFFGGIGFKALKYLKINCCVAWLKFDMGAMHSLYKLKLGYN VDGVDQESTIPVGIQYLYGLKEISVKIGGADPEKYDRRAEELAFMIDSGLHDRCMSIT LQCVRQMFDFNEDKSSLTHEEQRKLKQQEILEDDSDEEYDEIIQDSGEQEVKQSTLSE WDIVHLLRNKLNNQQDGTTCHFPVVASYYVDTCQLTGGSSSVTSIKVFST</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9167..9335#4103..6177#1..825#atggaggctccgacctgtggtttgtggggcgccgtgttgaacctccccgggaggctcgacggggtcctccttcgccatggcagcattcttcccaagggtgccgaggaggagataccgctcatcaagcgagatctccatcttatgatctccatactcaatggctattacagcgagtcgccggagctggaggatgccacggcgacgacggtggcgaggaggaggtgctggacgaaggaggtgcgcgagctgtcctacgacatcgaggactgcatcgaccactacgagcacgctgccaccgccggttcagcgggcggtcgaaccgccagcggcgggattcctcctcgccgtaagatcaccaggcggcggtggcagcgtacgactcctctctggattccagagaggctgaagcagcggttatggatggctaacaagatcagagaattcagcctacgtgcccaggacgcgctcaaacgccatgccatgttctgcagcagcgtcggtggcaatggcatagccaccagtactgcttcttcctctactgccgctacaggtgacgcatcgtcttcttcttctaccatatgttggcacaccacgcggttcagggaacgcgacttctgcgtccctcatgtcggtatcaacgtcgccatgaacaagctcgaagactggctcactgcgtgtgatgatgaagatcagaagaggctgagggtggtgtccattgtaggagtcggaggaataggcaagaccacgctcgccaacgagctgtaccgcaagcttcggcggcagttcgaatgctgggcatttgtgcgttcctcccagaagcctgatgtaaggaggattctcatcagcatcctctcacagctgcgcttgcagcagccacctgaaagttggaaggttcatagcctaatttccagtattagggcgcatctgcaggataagaggtacaacctccgttctaaattagtggtcgctttgatttttttcgtgcaacgtttaaccattcgacttatttgaaaaattagtgcaaatataaaaaatgataagtcatacttaaagttttttttgataataaagcaaatcacaaacaaaacaaataataattccataattttttgaaacatttaccatttctgttgtcagctattttctatttttttacaactgtgcaaacaaatgaattaacatgcaatcgagttcatgaagtccatgttgccattacttacacacacacacaaatttgcaatactatgaacttagcacatatgccatctagtcccggttggtggagaaaacttttttactccgggttggtaaccccctttagtccagggttccaaccgggagtaggaatccgggactaaagatgcccatctttagcatactggtgaagaaatcttttttactcctggttggtaaccccctttagtcccgggtttccaaccgggagtagaaatccgggactaaagatgctcatctttagcacactggcgaagaaatcttttttactcccggttggtaaccccctttagtcccgggtttccaactgggagtaggaatctgggactaaagatgtcccggttgaaataaccgggactaaaatccatctttaatcccaattggtaacaaaaaccgggactaaagagagggatctttagtcctggttggtagagagggatctttaatccccgttagtgttaccaaccgggactaaagagagggtagcggcagtccagatggtttccttttctttttttttcttttttattttctcccaaatcgagtggcatgcatatcccaaatcaaaccccaaatccccaaatcaaagtaacatcccaaatcttaaagttacttatacacacaaatcaaatacatcacaaatcctaaaaaaattacacacaaatcaaatacatcacagattatacatcttagatccatacaatgaatcacaaaattatacatctcagtgaatcacaaattatcaaaaaaagaaaagaaaagaaaacaacgttggctgtcggctgccgccgcctgcggccccgctggccacaggccacctgcccgccaccacccgccaaccgcctgcccgccgccgcagtgggcgaccctgcctgccgccgccctgccgccgtctgccgcagccaccgcctgcggccccgccggccgccggtcgcctgcccaccgccgccgggaggaaaggggggataggagaggggaggagaggaggaaggggaggagggggaggagatctgtgtaagatctatgtaggagaggggaggggaggatgaaggggaggatcaatctatgtgaggaagtggttgcgattgtggaggagaggataattgctagggattatatactacgcgttaaattttagttccagttggtaataccaattaagagtaaagatctacatgatctttagtcccggagtggtgatctttagttagatttctgattttgggaggaatttgaattgaaattttccatttgaatttagagaatttggggaattcatggaaggaaatctgattttaaatgttttgtgcattcaaattattatttcaatccagtttatgtgtggggaattaagagaaaaggatttggaaggatttccgaataactaaatgaattggaataccaaatttataaaaatctaggtgaaaggatcttgatgttgcctaatgggaaggaatatgtgttgcttaagacttcttcgcagtagatcagtacatggccaggcagaacttctagtcaaatagccaggatttctatctttgtgtccagatgttccgatcaacagaaaacaaatctctcaaaggggatactgttggatcgttaatggtctttcccatctcaaaagctagctaatgagttgaggagctcccccacttatatattaggtattttgcatttccacactaaacttctaagtcaaatggctaggatttctagcttgtgtccagatgttccggtcaacaaaaaacaaatctctcaaaagggatactataggatcgtaaaaggcatttcccaccctaaagctagctaataaggtaaggagctccctcacttgtatattaggtcttttactctttcacaaccaatgtgggactattcaacaatctcctccttcacacattggggactctcagccgttcattgccccttcacaaattggtgtcccttagccgttcaccgcccttcactgtacaccgacgatacctcaggtatacaagccccgcagacaccaacggttcatcaggccttctgtgacattctagcctagggcttaataggattaatagaatactcataccaacaagttacaactttttttccggaagccgatctccagagaactctgaggttaagcgtgcttggcttggagcaattaattttgggatgggtgtgcttggcctggagcaattttgggatgggtgaccgactgggaaattcttctcgggtgcacacgagtgaggacaaagtgtgtagaaaagacttgtgttggtctgtgaaggcaatctatgtccaagaaaagttgccagatgtaagtgggctcggcgggctcgacctgggagaggcgggacgttacaaaggaggaggggaggcatgtgcgtctgcctttttcttaatctttggtccccgttgatataaacaaccgggactaaagatagtgggggaggacctgacaacgttttgaactgggactaaaaatgattaccaaccgggactaaagattataaagtgtcgtgccgcttttgaaccggggctaaagatcttctttagtcttggttcctattcaaaccgggactattgtagttttcggatcaccgagcaaaaatcatttctccagtagtgcattaaaaaatacactgtaaaatttggcgatgagttcatactagctttagtttttacttagtacttcccccgtttcatattataaaactttcacacattgcccatgtttgctagaaagtcttataacctgaaacagagggagtatttattactagtttgacacaatgcatttattgtacaaaaaatatttgacaggtacttgatcatagttgatgatatatgttttatatcaacatgggatattattaagtgtgctttaccagatggtacaagtagcagcagagtactaacaacgacacaatatgatgatctagcagtccaatcatgtggttatgacaccaagtatgttttcaagatgaaatctctttctcaacacgactcaagatatttatttttcaatacagtttctggcagtcgctttatttattctccaggatccactgaagtttcagatgatattataaggaaatgtggtagtttgccactagctattgtatctattaccagtattctagagaagtcgaggaaaatggagcaatggggttatgtaaacaaatccttaggctacaatttgatgaaaaaccctaccttggaggggataaaacaagtgttggaccttagttacaataatctttctgagcatttgaagccatgtgtgctgtatcttagtatatatcaagaggactacttaatttgtaaggatgatttggtgaatcaatggttggctgaagggcttatctgtgcaacaaaagatcacactaaggaagaaatttcagaggcctgttttggtgagcttgtcagtagtaaaatgatccaaccagtacatattgatggcaatggtgacgttatgtccttcgttattcaacatatggtactcaattttattagttacaagtctatagaagagaacttcgtcactgtaatacatcattctcagacagctaccaaactttctgacaaggttcgtcgattgtctcttcactttggtaatgttaaagatgcaaagttaccaataaatatgagactttcacaagttcgaacacttgccttctttggggcctacaagtattggtggcgttcaatcaaagatcaattcccacttctccaagttcttatccttcatttttggcatgatgaggatattatcagttttgacctcactataatttcacagctttttcgactgaaatatttaaagatcacatctgatgttactttagaactgcaaaccaagacaagaggcctgcaatgtttggaaacacttaagatagatgcaagaataagtacagctccattagacacaactcatttgtcgggtttactccatctgagtcttcctgctgatacaaacttggccaatggaattggccacatgacatcgcttcacacatttgggtattttgatctcagctataactctgtagagaacgtgcttagccttggcaagctgaccaatctccgaaatcttcagctcacttgttccaccatacgacctaacagtctggagattaaattgcagtgcctgggtttcattcttcaaaaactcagcaacctcaagtctgtaactatgtcaactgcaggctcctcttgtgtaaattctactgatgcgagttctgcaaacgttagcgttagaatttctggtgatggcttgagcagcatgtcctctcccccggcacttgttgagaggcttgagttgttgccacgaatttgcatattctcctacctcccgaagtggatcagtctactcagcaagctccgtattttgaagattggggtaagggaactagtgagaaatgatattgatgttctcatgggattgcgtgctctcactgatctctcgctacatgtccacaccaagcctacagaaattattttctttggcggtataggattcaaggctctcaagtacttaaagatcaattgctgtgtagcttggttgaaatttgatatgggtgcaatgcatagtctctataagctcaagcttggttataatgtcgatggagttgatcaagaaagtacgataccagttggcattcagtacttatatggcctcaaagagatctccgtaaaaattggtggtgctgatcctgagaaatacgacagaagggctgaagagttggcgttcatgatcgactcaggtctgcatgacagatgcatgagcatcactttacaatgcgtgaggcagatgtttgatttcaacgaagataagagtagcctgacacatgaagaacaaaggaaattgaaacaacaggagatcctggaggatgactctgacgaagaatatgacgaaattattcaggactctggggagcaagaagtgaaacagtaataaattttctaacttcctttttttggtgatattttttaaccttttttactagaagtttttattataattctaaaaggtccaaataaaaaaattcctatgttaattggtagaaagaaaatatctaagagttctcactttaaccagagaaaaaaaatataagatcgaccaattaaattggttaatctggacatgaaaggcacgtacttattagataatggataatggacaaaaaaaaaaggttatggattttcatccctcgaggagatatcccttcattgtttatatatcatctaaatagttatcaaaaaaaattgacaacatagattaatatgaaatatattactccacaaacatgcaagatcaaattcaacttctacaagttgcaacaaaaataacaaattaaattgaaaatagttatcgtacatttgcatctatatttgttatttttgttaaaacttgcagaagttaaattttaacttgcatgtttgtgaagtaatatacttcatattaatctatcttgccaattttttttcaatttttttgataactttttaggtggcatgcacgaaataaggggatatcccctcgagggatgaaatcactttcccaacaaaaaaaaaaacttccttcgctggcatggctcagaaaaaaaaatttcaaatcaacttatcaactttttagcactatttaattcatttaatttttttatcttgaatgattattataaccttattttcatccctcttatatcatctttaaagaattcgccctaagatgcctcagatttaattacttcaagacacatactccctctttcaaaaaaaaaaaaaaaggcaaaccgtgggttcccgtaccaacgtttgactgtccgtcttatatgaaatttttttataattagtattttcattgtatttagatgataaaacatgattaatactttatgcgtgacttatctttttaattttttttataattttttcaaataagacgaacggtcaaacattggacacggaaaccagggtttgtctttttttgtgacggagggagtatggttcaagatatgaagttttccatgctatcatggacattgcttcattctctctttatttttctccgtttcaccacacttgaatttttcaggatttcaaaatattgaaaaagatttaatttttctaagtatactgtatacattatgctactcatttcacaatacttaaacttctatgaatatactactatcaaataatgttagaacttcagcgaatcataaattcttaaaatacttgtaatatataaaaaaaatatgttacatgacaaatataacaacatatctttcgttcatagtaatatgatattttagaagttttggcacttgaggttgaaatagtaatggttattttggaacgaaagaagtatatactccctccgttttaaaaaaaggcaaaccctggatttccgtgtccaactttgactgtccgtcttatatgaaatttttttgtaatttatattttcattgttgttagatgataaaacatgattaatattttatgcgtgacttgtcttttaatttttttcataattatttgaaataagacagacggtcaaacgttgggcacggaaaccagggtttgtcttttttggatggagggacggaaggagtacgtattcaatttcaaataactagcatggaggcccgcgcagattgcgcggctagcatcattatattttctctcatataatagcatatatgttttctcattatattattaaaatatattacaatgacaacataattttaaattttgcaataactttacgaaactactaatgtgtaatattcatattgtattttatatacgtgttagttattaattatttttactatcaaattttagttatctataaattatatatattcctttatggactctagactcgtcttttatttttttttaattctaaatttttattatttctaattgtatttctatgtggactctaaactcatctttcaatattctttaatttttaatttcaaatttcagttacttctaaattgtattcctatattgactttaaactcttcttcccatgtttttcttaatttcgaattttagttatttgtaaattgtatttttatacggactctaaactctacttttaattttatcacatttattccgaattttagttagtttcaaattcatgtatggactctatactctacttctaatattccttattttttaattccaaatttcctttttttcttcattgtatttctatatggactctatactttacttctaatattccttattttttaattccgaatttcagttattttctaattgtatttctatatggactctagtcttctcttttaatattccttattttttaattccgaattacagctatttcctaattgtatttctatatggactctagtatcctcttttaatattccttattttttaattctgaatttcagctatttcctaattgtatttctatatgaactctatactctacttctaatattccttatttttaattccgactttcagttatttcctaattgtatttctatatggactctagtctcctcttctaatattccttattttttaattccgaatttcaactatttctaaattgtatttctatatggactctagtctcctcttctaatgttccttaatttttaattccaaatttcagctatttctaaatgtatttctatatggactctgctttttctttttctccgattaacgtgagaatttctaggccatgagagcaaacgtggaggctcctttttctattcctttaataatataatagatatggcgttatatatttttttaaagaaaaaacattatgctcgagctaactgtccgttatctttaaagaaaatggtcatgtatatatgtttctgatctctttttttttttgaaaggaaatatatgttgctctcttcaggtcaaccttatctgaatgggacattgtgcacctgttgagaaacaagctgaacaaccagcaggatggcacgacgtgccatttccccgttgtcgcctcctactatgttgacacgtgtcagctcacaggtggttcctcctcagtcacatccatcaaagtattttcaacgtaa</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0686900, RefSeq:Os11g0686900