BGIOSGA019307
| Gene Name |
BGIOSGA019307 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019307, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_18752 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA019307-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA019307-PA |
| Length |
8184 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:5786260..5794443 |
| Sequence Coding Region |
5786260..5786292,5786381..5786552,5787808..5787920,5787996..5788088,5788253..5788416 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:5786260..5794443 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:5786260..5794443 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACGAGACCCTAGCCTCCCTGCGCCGCCCGAAGCGCGGGCGGCCGCCGCGGCCGCGGGAGGACCACTTGGCCGCCGAGGACTTCGAGGAGGAGGGGGAGGATGAGGAGGCCGAGGCGGAGGCGCTCGCGTGGCCCCAGACGAAGCGCAAGCGCGCGGCCAGCGCCGCGGCCGCGGCCGCGCTGGAGGACCAAACCCTCATCGATATTATTAAACATAATGGCAGGCTTATCAGCCATGCTGTCAAAAAATTGGTCGAGGATTATGAATCAGATCCAAAATCTGTGATGTTTCAGATATTAGCGATGCTATTTGAGGCTTGTGGAGCTAGGCATAACTTTTATGCAGACTACCTGTATGAGGCAGATGTGGATGGTGTTGTGTTTTCCCTTGTCGAGCTAGCAAAAAAGGGAATGGTTGAAGATAATTACAACACCAAACAGAAGGATCTCAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCCTTTTGGGATACCTTGGTCCATGAGTGTCAGAATGGCCCTTTATTTGATGGTAGCTTATTCCAAAAAATCAAAGACTATGTGGTTGCTTTGTCATGTACTCCTCCAAGGGTTTATCGCCAAGTAGCTTCATTGGTTGGGCTCCAGCTTGTGACGTCCTTAATATCTGTTGCTAAGACTCTCAGTGGACAGCGTGAGACCACTCAAAGACAGTTGAATGCAGAGAAGAAGAAGCAGACTGATGGACCGATTGTTGAATCTCTAAACAAAAAGCTAGCTCATACTCACAAAAGCATTACTTACTTGGAGGAACTAATGCGGAAAATATTCAGTGGGTTATTCATGCACCGCTATCGTGATGTTGACCCTGAGATCCGGATGTCGTGCATAAAATCACTTGGTATTTGGGTTGTCTCGTACCCATCACTTTTCTTACAAGATATATACCTGAAGTATCTAGGATGGACACTTAATGACAAGAATGCTGGAGTTAGAAGAACTTCTATTCTTGCCTTGCAAAGCCTGTATGAAGTGGATGAAAACATACCTTCTCTTGGTCTCTTTACTGAGAGATTTTACAGCAGGATGATCCAGCTTGCAGATGATGTTGATATTTCAGTAGCTGTGTCAGCTATCGGACTCATCAAGCAGTTACTGAGGCATCAACTTTTGAGCGATGATGATTTAGGTCCACTATATGATTTGCTTATTGATGAGCCTCCGCTGATCAGGCGTGCAATTGGGGAATTGGTTTATGATCATCTGATAGCACAAAACATCAAAACCTCCCAGTCTGGAGCAAGAGATGGAAACAATGATTCATCAGAGGTTCATATTGGTCGAATGCTGCAAATCCTGAGGGAATTTTCAGATGACCCAGTCCTGAGCTCTTATGTCATTGATGATATTTGGGATGACATGAAGGCTATGAAAGATTGGAAGTGTATAATCTCCATGCTTCTGGATGAAAATCCATTAACCGAGCTTACTGACATGGATGGAACCAATCTAGTTCGGATGCTGCGAGCCTCTGCAAAGAAGGCTGTTGGGGAAAGGATAGTTCCTGCAACAGACAATAGAAAGATGTACTACAATAAAGGCCAGAAGTGTTGCTGCCTTAGTGGTTATTTAGGACTTAAAATAGTGGTCAAAGTTGCACACCCAAGACCAAAGAAAATCAACAGTGTCATCTATTTAAATACGGAGGAAATATTGGAAAACAGCAAGCATGAAATAACTACTGCTTTGCTGAAGAAATATCCACAGCTTTTAAGAAAATACATATCTGACAAAGCTAAGATATCACCTCTAATTGATATGATGATGCTTATGAAACTTGAGCTGTACTCACTAAAAAGGCAAGATCAGCATTTCAAGGCTGCCATAGATCTCATTGCGGATGCCTTCTTTAAACATGGTGACAAGGAGACCTTGAGGTCTTGCATCAAGGCAATTACTTTCTGTTGCACTAACTGTCAGGCAGATCTTCAAAATTATGCTGAAAACAAACTGAAGGATCTTGAAGACGAGTTGGTTTTGAAAGTCAAAACTGCAATCAAGGAAGTAGAGGCAGGTGATGATGAATACTCCCTCATGGTTAATTTGAAGCGATTTTATGAGCTTCAGTTGTCAAAACCTGTCAAAAATGATGGTTTATTTGAGGACATGTGCAGAATCCTGAGTCATCTAAAAGATATGGATAATGAGGTGAAGAGCTTTCTCCTCCTTAACATGTACCTTCAATTAGCATGGTGCCTGAATGCTATTGATGGTGAAAACCCATCTGAAGCTTCCATTGACGAACTTTTATCCAGGCAAAGCTCTCTTTTTGAAAAACTCTATTATTACTTGGTGGTTCTGCCTACTTATCAGAAAGAGGGAAGGAGCACCACTATACTTTCCTGCAGAGTCTGTGTCATTACTGCTGAGATGTGGTGCCTGTTTAAGAAGCCAAAATATTCTTCAACAAGGCTCGAGAGTTTGGGATATCTCCCGCAACTAGATGTTGTCCAGAATTTCTGGAAACTATGTGAACAACAGCTCAACATACCAGATGAAATAGAAGATGAAGATGCAAATGAAGAATATATTGAAGACACAAACAAGGATGTTGTCATGATTGCAGCTGCAAAGCTAGTGCTAGCTGATACAGTTTCAAAGGATTACCTGGGCCCAGAGCTTGTTTCTCACTATGCATCCCATGGAACAAGTACTACAGAGATAATCAAACATCTAATCACCTCGCTTCGGAAAAATGCTGACAACAACATGGGTGCCTTATTTTTCGAGGCACTGAAAAGGGCATATGAGCGGTATATGGCCCATGTAAGTGATGGGGAAAATCAAACCCTCATTGGCAAGTCTTATTCAGAATGCCAAGATCTTGCTGGTCGGCTCGCGGGGTCCTATGTTGGTGCCTCGCGCAATAAAAACAAGTCTGAGATCTTGAAGATAATCCAAGACGGTGTTTCTTTTGCATTTGTGGACCTTCCAAAGCAATTGTCTTTCCTCGAGGCTGCTCTACTGCCATTTGTTTCTAAACTTCCATCGTCAGATATACCAGACATCCTGATAGATGTACAGAAGAGGACTCAAGATACTAATACTAATGAAGATCCAAGTGCTTGGCGCCCGTACTTTACGTTTGTAGAGCATCTACGCGATAAGCATGCAAAGAATGAGGTTTTGCAGGAGGAAAAGGAGGAAAAACCTGTAAAGCGCAGGGGTCGGCCAAGGAAGGTTAGAGATGTACCTGCAAGGAATCTTTTTGATGGACACAAGTCTAGCGATGAAGAGTCTGTTAGTGACTCTGACCAGCAAGGGCATGGTGAAGACAATGACGACGATGACGCAGATCAGCCTCTGATCAACACGTTTAGGTCTTCCGCATCCAAGCTAAGATCACTGAAGGTTTCTCAGCAAGGAACAAGCGGTCAGAAAGGACCTTCGAGGGCATCAGGAAGCAATAGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDETLASLRRPKRGRPPRPREDHLAAEDFEEEGEDEEAEAEALAWPQTKRKRAASAAAAAALEDQTLIDIIKHNGRLISHAVKKLVEDYESDPKSVMFQILAMLFEACGARHNFYADYLYEADVDGVVFSLVELAKKGMVEDNYNTKQKDLKNFKENLVSFWDTLVHECQNGPLFDGSLFQKIKDYVVALSCTPPRVYRQVASLVGLQLVTSLISVAKTLSGQRETTQRQLNAEKKKQTDGPIVESLNKKLAHTHKSITYLEELMRKIFSGLFMHRYRDVDPEIRMSCIKSLGIWVVSYPSLFLQDIYLKYLGWTLNDKNAGVRRTSILALQSLYEVDENIPSLGLFTERFYSRMIQLADDVDISVAVSAIGLIKQLLRHQLLSDDDLGPLYDLLIDEPPLIRRAIGELVYDHLIAQNIKTSQSGARDGNNDSSEVHIGRMLQILREFSDDPVLSSYVIDDIWDDMKAMKDWKCIISMLLDENPLTELTDMDGTNLVRMLRASAKKAVGERIVPATDNRKMYYNKGQKCCCLSGYLGLKIVVKVAHPRPKKINSVIYLNTEEILENSKHEITTALLKKYPQLLRKYISDKAKISPLIDMMMLMKLELYSLKRQDQHFKAAIDLIADAFFKHGDKETLRSCIKAITFCCTNCQADLQNYAENKLKDLEDELVLKVKTAIKEVEAGDDEYSLMVNLKRFYELQLSKPVKNDGLFEDMCRILSHLKDMDNEVKSFLLLNMYLQLAWCLNAIDGENPSEASIDELLSRQSSLFEKLYYYLVVLPTYQKEGRSTTILSCRVCVITAEMWCLFKKPKYSSTRLESLGYLPQLDVVQNFWKLCEQQLNIPDEIEDEDANEEYIEDTNKDVVMIAAAKLVLADTVSKDYLGPELVSHYASHGTSTTEIIKHLITSLRKNADNNMGALFFEALKRAYERYMAHVSDGENQTLIGKSYSECQDLAGRLAGSYVGASRNKNKSEILKIIQDGVSFAFVDLPKQLSFLEAALLPFVSKLPSSDIPDILIDVQKRTQDTNTNEDPSAWRPYFTFVEHLRDKHAKNEVLQEEKEEKPVKRRGRPRKVRDVPARNLFDGHKSSDEESVSDSDQQGHGEDNDDDDADQPLINTFRSSASKLRSLKVSQQGTSGQKGPSRASGSNS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..33#122..293#1549..1661#1737..1829#1994..2157#2241..2477#2652..2796#2895..3073#3918..4063#4160..4287#4362..4535#4627..4656#4946..5014#5140..5301#5381..5581#5654..5791#5895..6095#6225..6369#6496..6602#6751..6891#7195..7460#7542..7666#7764..8030#8171..8184#ATGGACGAGACCCTAGCCTCCCTGCGCCGCCCGGTAACCCTAGCCCCTCCGCCGAGCTCTCACCCCCCTCGACCGCTGGATTCGCCATTTTTTTCTGATTTTTTTTTTGGATGAATTGCAGAAGCGCGGGCGGCCGCCGCGGCCGCGGGAGGACCACTTGGCCGCCGAGGACTTCGAGGAGGAGGGGGAGGATGAGGAGGCCGAGGCGGAGGCGCTCGCGTGGCCCCAGACGAAGCGCAAGCGCGCGGCCAGCGCCGCGGCCGCGGCCGCGCTGGAGGACCAAACCCTCATCGGTTCGCCTTCTACCCGTTCTTCCCATTCTCCTTTGCGCGTTGGTCGCCGTGGTCTCGCTGGAGTGTGGGGGTTGGTTGTGCTTGGGGATGCACTGCTTAGTGTGTAGCTGCTGAGTTGACGAGAGTGAGAGCTAGTTCGCAGTGACGCGGGATAAATTAGTCTATGTGTCTCTCTGGGTGGTGAATTGGTGATTCCTAAGGTTGAACTGAGGTTGGGCTAGTTTAGTTCATCAAGCAGTGTGATTTTCTGCTTTTGTAGTTGGTCTAGAGAATTTTGTTAGGATTGTTTCTTTTTTCAATCAGGAAATTCTAGGTTGTTAGCTGAACAAAAGACCATTGATTTCGATTGGACTGTTAGTTACCTTGGTACTCCCTCTGTCCCAGTTTAGAGGGCGCGCGTAAATTTTTTTGACGGTTTACCAGTTTAGAGGGCGTGGTTCGTTTTTCACTGCTTTTCTTCCTGGAGTACCCTCCGCATGCATGCACATGACGCTTGGATATGCCCGCTCAATAACTGATCAAGCGACGCAACCGGCCGGCGCGTGGAGCTGCACATGTGTGGGACCACAAGATTACATGCATGCAGCTGTTACTAATCTGCATGTGTTTGGATCAAACCCGTTTTATTAGGGGCAGTTTAGGAAAAAATAACTCTGCATGTGAGCTGGTCTCGGTGAATTTATTTGTGCGCCCTCTAAATTGGGACGGAGGGAGTACTATCACCTGTTACTGGTTCAGTACCCTATCAATTCATTGGTAGTGCCAAAACCTAGCCAAATTTTGGCTCTACCAATTATTTGGTAGGGTAGAGTTCAGATTATATATGTTTGATTAGCTACCAATTTGTTTGATATAGTGAAGAAAGTTCTAGAGTGTTGCCAAATTAAATATGGGCATTACCGCTTTGGCTCTAATCCAAACAAATCACACTACTATTTAAGCTGCCAAATATTTGGTAAGGCACATTTTGGCATCAATCCAAAATGACCCATAGTATCACAAGCCGATCTTGAAACTGCATGGAGAGTCATGATTTATAAAGATATGTGCTGACCTCAGCTGGGGTTGCCCTAACCATAGTCCTGCCAGTACTGTAGTGCCTGCCCAGAATGATGCCAGAGGCTTGTGGATTATGCATCGAGATTTAAAAGATCCTATCATAACATGCTGCTCAAAATCTATGACTTAGACACTTACTCAGCAAGTTATTTTATCTTCAATTTGTGTCTTATTCCTAAAAACTTGGAACTTGCAGATATTATTAAACATAATGGCAGGCTTATCAGCCATGCTGTCAAAAAATTGGTCGAGGATTATGAATCAGATCCAAAATCTGTGATGTTTCAGATATTAGCGATGCTATTTGAGGTAATAGATGTTAACTTCTTAATGCAGTTTCTTTTGGTTGCTTATTTCATAAACCAGTGAATCTTATAATGACAGGCTTGTGGAGCTAGGCATAACTTTTATGCAGACTACCTGTATGAGGCAGATGTGGATGGTGTTGTGTTTTCCCTTGTCGAGCTAGCAAAAAAGGTATCCTGCTGTGATTTTCCCTAGAAGAGTGAATGGAGAATAATTTTTTGCAGCCTTGTGATTATCCAATGTGCATGCTATGTTTATCCTACATGTTACTAATCTTGAAATAATATGCAATGCTCTCTTTTGGATGATTTCTTTTAACCTTAACTTGAAAATAGGGAATGGTTGAAGATAATTACAACACCAAACAGAAGGATCTCAAGAACTTCAAAGAAAATCTTGTTTCCTTTTGGGATACCTTGGTCCATGAGTGTCAGAATGGCCCTTTATTTGATGGTAGCTTATTCCAAAAAATCAAAGACTATGTGGTTGCTTTGTCATGGTAATTTATCTAAGCTATACCTTTTATTTTCTTTGTGTTAGACACTTGGATGCATGTATCTAATGTGCTGTGGTGTATTTCAGTACTCCTCCAAGGGTTTATCGCCAAGTAGCTTCATTGGTTGGGCTCCAGCTTGTGACGTCCTTAATATCTGTTGCTAAGACTCTCAGTGGACAGCGTGAGACCACTCAAAGACAGTTGAATGCAGAGAAGAAGAAGCAGACTGATGGACCGATTGTTGAATCTCTAAACAAAAAGCTAGCTCATACTCACAAAAGCATTACTTACTTGGAGGAACTAATGCGGAAAATATTCAGTGGGTGAGGACCTGAACTTGCATTTTAATGTACACTGTTTACTTTCATATTTCTCAAATTTGCCATTCTGATGTGGTTCACTTACTGGTATCTGGACAAAAATATTTGCATGTGGCTATTTTCTGTACATATCTCAGTCTACTATGTCCACTTAATATATTATTTTACCACTTGCAGGTTATTCATGCACCGCTATCGTGATGTTGACCCTGAGATCCGGATGTCGTGCATAAAATCACTTGGTATTTGGGTTGTCTCGTACCCATCACTTTTCTTACAAGATATATACCTGAAGTATCTAGGATGGACACTTAATGACAAGGTACATATTTTAGTTCTATGATTTTTGGTTGAACCTTGTCTGACCAATGAGATGTGCAAGTTTTGTTATGTCATTTTGTGCAATCTTTGTTTTTGTAGAATGCTGGAGTTAGAAGAACTTCTATTCTTGCCTTGCAAAGCCTGTATGAAGTGGATGAAAACATACCTTCTCTTGGTCTCTTTACTGAGAGATTTTACAGCAGGATGATCCAGCTTGCAGATGATGTTGATATTTCAGTAGCTGTGTCAGCTATCGGACTCATCAAGCAGTTACTGAGGTGAGTTTTGGGCAAAATCTTTTGCCTGTGAAGAGATCATTTGGTCACTGCTGGGCAACCTTACTTTTTTTTACCAGAGCTTTCCTAAGATATGGTAGTGAGTTTGGGGTGTATAACTTTCGATTGTACAGTTTGCTATTAGGGTTTTTGTAGATTGGCCATGCCGCTATGTTTTGAGAACTAAATTTTCAAGCAATAAATTGTATTTTTTAGCATTTTCCAGCATAATGGAATCATGGATTTTAGCCAGGAACCGGTGAATTAGCTTCCTTTCATCAAATACCATAGAGAAATAGGGGATAGTCATCACTAGTGTTATCATTAGCTTTAGGATGCAATAGCGCAGTTCAATAAATATTCTCAGTATTCACAATTCAAAAATATTTTTGACCTGCACCATTGTAGAAATACATTCAACATGCATTTACACAAGCTTTTGATTTGGAACCACCATAAATACTCGCTTGACTCGCTAGTAGAATGAAAATTGGTCCAAAGAAATTTGCAGAAACACAGGCTTAAATGTGCACTCTTAATTCACAATAAAATACATAAAAGTTGCATATTCAAAACAATGTGCTATGGACGAATGGATCAGTACGAGTGGTATATGGTATTTGACTTGGCATTAATCTACTCATGTGGTAATTGATTGACTTGTTGGGCACCATGTGTGCCTTGTCTATCCTGAACTTTACCTAGCAATCACCCTTGTTATTATTTACTAATATCAGTATTTGTCTTACCAAAGTGTGCTAGGGGACCATGCATTTTTTTCAGCTTTAATTTTTTACATGCATTACTGCAGCAAAACAAATAACTTTTCTGTTTATTCCTTTTGCAGGCATCAACTTTTGAGCGATGATGATTTAGGTCCACTATATGATTTGCTTATTGATGAGCCTCCGCTGATCAGGCGTGCAATTGGGGAATTGGTTTATGATCATCTGATAGCACAAAACATCAAAACCTCCCAGTCTGGAGCAAGAGGTACTTGTCTCTGGAATGTTTCTGCTTTTATGCCACCTTATCTTGCTATCAAATAACTTTCTTAGTTCATCTACTGATTGTACTATCTAATTCCAGATGGAAACAATGATTCATCAGAGGTTCATATTGGTCGAATGCTGCAAATCCTGAGGGAATTTTCAGATGACCCAGTCCTGAGCTCTTATGTCATTGATGATATTTGGGATGACATGAAGGCTATGAAAGTATACTCAGTTTTGTTTCAACTTATATTATCAGTATGACTTAACCGCTATAACTGCAATGTCCTATTCTGTAGGATTGGAAGTGTATAATCTCCATGCTTCTGGATGAAAATCCATTAACCGAGCTTACTGACATGGATGGAACCAATCTAGTTCGGATGCTGCGAGCCTCTGCAAAGAAGGCTGTTGGGGAAAGGATAGTTCCTGCAACAGACAATAGAAAGATGTACTACAATAAAGGCCAGAAGGTGTCAATGTCATTTCTGTCGTATCATATGTTGCTGCTGCAAGTTGATTGTTTATTTCTTGATCGTATCACTTGTTGTATTGCTTGTTTAGTGTTGCTGCCTTAGTGGTTATTTAGGACTTGTAAGTACTATGCGTAGAATGTAGGTTTATTTTGTTGGATATTGGCAATGTCCTACACCTTTGAAAGTTAGTC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|
| External Link(s) |
