BGIOSGA019463

From RiceWiki
Revision as of 02:51, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA019463| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019463, complete gene.| tag = OJ1115_...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA019463

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019463, complete gene.

LocusTag

OJ1115_B04.11

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019463-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019463-PA

Length

8908

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:10326763..10335670

Sequence Coding Region

10326763..10327019,10329103..10329171,10329284..10329349,10329444..10329522,10330829..10330949
,10331045..10331140,10331963..10332075,10332172..10332249,10334337..10334453
,10334754..10334853,10335023..10335123,10335653..10335670

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:10326763..10335670 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:10326763..10335670 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGCGGCCAGGGCCCTCCTGCCCGTCGGCGGCGCCGCCGCCGTCGCCGTTCCTCGACGGCTGCGCTCCGGGGAAGCCTCGTCGACGTCGCTCAGCGGCCCCGTATCGGATGGCGCCCGCCTCGTCCGCCGGATGCAGCTCCGCCCTGCTCCCCTCCTCGGTTCGTCAACTTGCGCGCTGCCTTCCCTGCGGGGTAAGCGGCTCATCCGCACCCCGGCTGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGTTGGACTCCACCGGGGAAGCAAAGCCTGTGGGATTTGCAGAGAGATACCCTGCTCTTGTCACCGGTTTCTTTTTCTTCATGTGGTATTTTCTGAACGTGATATTTAACATCCTTAACAAGAAGATCTTCGACTACTTCCCCTATCCATATTTTGTGTCGGTGAGCCATCTTTTGGTAGGAGTCTTGTACTGCCTTGTCGGCTGGAGTTTTGGTCTCCCAAAGCGCGCGCCGATCAACTCAACGGTTCTGAAGCTACTGTTCCCAGTTGCTGTCTGCCATGCTATTGGTCATGTAACAAGCACCGTGTCCTTTGCTGCTGTAGCTGTCTCATTTGCCCACACCATTAAAGCTCTTGAACCATTTTTCAATGCGGCTGCTTCACAGTTTATCCTTGGCCAGCAAGTTCCATTGACGCTGTGGTTATCTCTTGCTCCGGTTGTGATAGGTGTTTCAATGGCATCTCTCACTGAACTTTCATTCAATTGGACTGGTTTCGTTAATGCCATGATTTCTAATATCTCCTTCACATTACGGAGCGTTTATTCCAAGAAGGCTATGACTGACATGGATAGCACCAACCTGTATGCGTACATCTCAATAATTGCTCTCCTTGTCTGCATCCCTCCTGCAATTATTATTGAAGGACCTCAACTAGTGCAGCATGGATTCAAAGATGCTATTGCTAAAGTTGGATTAGCAAAGTTGGTTTCTAATCTCCTTGTGGTGGGCTTGTTCTATCACCTTTATAACCAGGTTGCTACAAACACATTAGAAAGGGTGACCCCTCTAACACATGCTGTTGGCAATGTGTTAAAACGTGTCTTCGTCATTGGCTTCTCAATCATTGCATTCGGCAACAAGATCACCACACAAACAGGAATTGGCACTTGCATTGCCATAGCTGGTGTTGCACTCTATTCTTATATCAAGGCTAAGATTGAAGAAGAGAAAACGCAAATGAAGAGCGCATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAARALLPVGGAAAVAVPRRLRSGEASSTSLSGPVSDGARLVRRMQLRPAPLLGSSTCALPSLRGKRLIRTPAASSSSSSLDSTGEAKPVGFAERYPALVTGFFFFMWYFLNVIFNILNKKIFDYFPYPYFVSVSHLLVGVLYCLVGWSFGLPKRAPINSTVLKLLFPVAVCHAIGHVTSTVSFAAVAVSFAHTIKALEPFFNAAASQFILGQQVPLTLWLSLAPVVIGVSMASLTELSFNWTGFVNAMISNISFTLRSVYSKKAMTDMDSTNLYAYISIIALLVCIPPAIIIEGPQLVQHGFKDAIAKVGLAKLVSNLLVVGLFYHLYNQVATNTLERVTPLTHAVGNVLKRVFVIGFSIIAFGNKITTQTGIGTCIAIAGVALYSYIKAKIEEEKTQMKSA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..257#2341..2409#2522..2587#2682..2760#4067..4187#4283..4378#5201..5313#5410..5487#7575..7691#7992..8091#8261..8361#8891..8908#ATGGCGGCGGCCAGGGCCCTCCTGCCCGTCGGCGGCGCCGCCGCCGTCGCCGTTCCTCGACGGCTGCGCTCCGGGGAAGCCTCGTCGACGTCGCTCAGCGGCCCCGTATCGGATGGCGCCCGCCTCGTCCGCCGGATGCAGCTCCGCCCTGCTCCCCTCCTCGGTTCGTCAACTTGCGCGCTGCCTTCCCTGCGGGGTAAGCGGCTCATCCGCACCCCGGCTGCTTCCTCCTCCTCCTCCTCGTTGGACTCCACCGGGTTAGTGCCCCCTTGCAGCCTGCCGCTACGGTCCCACCTTCTCCGTCCTCGTTCAAACATTCTTATGCAAAGAGCATTGTGCTGTTTGGTGTTTGCTGAATGCTGATAACTCGGTCCTAGCCGAAGATGATAGTTGTATTATCTCTTCGAAAGCATACCTTGATCGTTTTCAAGAGGCAAAGATAGTTTTCTTTTTCTGTCTATTGGGCAAATGGTTTATGGGATTATAGTAGCACCTCATAAGCTGAAGAGTAAAGTCCATCACCGGTCCCTAAACTTATACCGCTGTGTCATCCCGGTCCTTAAACTCACAAATCGACCGTTCAGGTCCTCAAACTTGTTCGATCGTGTCATCCCGGTCCCTAAACTTGCAGATCACTCGTTTAGGTCCTCCAACTTGTTCAGTTGTGTCACCCCGGTTCCTAAACTTGGATTTGAATATCATCTGGGTCAAATAGGACGGTTTAAAGACTTTATATTTAAAAATAATTCATAACTTTTTCATGTGAACTCTAATGAAGACAAACTCTATACCGAACTTGTAGCCCTCGACGCGATCTATAAAATTTCAAAATCTATAAACATGCAACAATATTTTGGGACCCTAAACAGTTTTAATTCAAAAACTTTTCAACTACAAAGTTGTAAGTCGCGTCGAGAGCTATAATTTTGATATAAAGTTTGTCTTCATTAGAGTTCACATGAAAAAGTTATGAATTATTTTTTATATAAAGTTTTTAGACCGTCCTGTTTAGGGACCGTTGTGACACAGCTGAACAAGTTGGAGGACCTAAACGAGTGATCTGCAAGTTTAGGGACCGGGATGACATAGTCGAACAAGTTTGAGGACCTGAACGGTCGATTTGCGATTTTAGGGACTGGGATGACACAACGGTACAAGTTTAGGGACCGGTGATGGACTTTACTCTAAGCTGAATGAGTAGTGTAGCGATGTTCATTACTGGACCAAATATATGTATGAGGAATTGGTTTCTTATATATTTCACTATTGAATTAGGAGAAGAGTCAAATACTAACTAAAAGAGCATTCAAATTAGATAACTGGCAAGGAACAATGTATGGGTCGATTTTAGAGTAGCTGGCAAAATATGCCGCTAGGCTATGCATGGACAATTACTTGCATTTGGGACCTTGAAATTCCCTTCGTGATTTCTATTTGTATTCCATCATGAACCAATGGAGGTCAGATAAGGCTGATTTGAGTTTTTCAGAGTCGTGTGCACTTTTTAAGGTCTGTTTTGGAGTTTACATTAACTTAGTGTTAACCATAATTTCTATATAGCACATGAGTCCTTTACTGAAAAATGAATACTTTTAAAAAGAAACAAATAAGGAAAGTTGGCATTGTTCATGAATACATCTGATGATTGGTCCAATTTATTTGTGACTGCAAAATATCCACTCATTTATAATTATTGTTGGACAAATGGCCCATATCACAAAGACACAAACATATAGTGCTTTCCCCTCTCGGATAAGTGTTCTTTCACCGATTGTAGCAATTGGAATGGATGAATAGGCCAGATTCCTTTGAAGTTTTGCTCTTTCATGTACTTCACAAAGGAAAATAAAAATGAACTGAAGACAAGGGAAATATTCCATTGGAATGATGGATAACAATTCCTGTGTCTCAAACACCAAGTTTCTATGCTTTCTCATCTTCTGTTTTGTTTTTTTTCTGCATTTATATTCTTGTTATGTTCTCATATGTTCCAACACAGGTTCTGATTGTGGCAAGTTTTTAAGACAGTAGAGTCTAGGCGATGGAGTTACTTTATTCTCAGTGGATATTTGTAGATATGCATTTTCTTTTTGAATCAATAGGCTAGCATGCTCTTTCATTAATGGAAAGTTAAGAGCTAGGAAGATAGGTTTGCAGCAATTAGGGACAAGCTATGAATCCGGTAACTTTTTCACTAGTTGGACAACGCCTCCTAAACAAAAGAACCGTGCCAAACTTTTAAGTGATCATTCTCTATTTGAACTAATTCCAATTCTTCTCACCACCCTGTATATGTAACTTCAATTTCGGGAACTGAGAAATTGCTATTACACTTTACAGGGAAGCAAAGCCTGTGGGATTTGCAGAGAGATACCCTGCTCTTGTCACCGGTTTCTTTTTCTTCATGTGGTATGCTTACTCACCTGAGCGCACTTTAGAATTTACAATTGCAGGTGAGCGAACTGAGAAGTTGCTGCCTAATGTGGTTTAGCTATTGCCAATTCACAATATGATTTTGTAGGTATTTTCTGAACGTGATATTTAACATCCTTAACAAGAAGATCTTCGACTACTTCCCCTATCCATAGTACGTTTGCTTTATATGTGTGCCTCCTTTTCTTTTTCCTTTCATGTGACAACATGCATCTTCATGATCTAAAACCTCTTTCTTGTTAATATAGTTTTGTGTCGGTGAGCCATCTTTTGGTAGGAGTCTTGTACTGCCTTGTCGGCTGGAGTTTTGGTCTCCCAAAGCGCGCGGTATTCTCATGCCCATGCCCTTCTTCAACCATGATTCCTTTCAATAATGAGCATGAATACACAAAATTATTAGGGGTTGTTGGTCAACATATATCATTGCCAATGGCAATTGTCAAATAATGTGCAGCCATGATAGAGCAAAATTGCTGGTCTTTTACATCTCCATTAGCTGAAAACCTATAATGAAATGCTTTATGGCCCTCAAAATATAACAAAATCACTTATTCATTCTTATGTGTGATGTTTCTGACTGACAAGCGTTCTGGACGAATACGTAAATTGGATTTAAACAGGCCAGGAATAATTTTTTTCTGTGGCTTTACCTGTTTGTGTTCAATTAGGATCAATATTACCTGATCTCCTACATTAGGGCATTTTCAAGTATTTTGGTTATATGTCTACCTTGTAGAGGGGAAGGGAGGATCGGCAGCCAGCTACTAGATTTCAAGTCTTTGACTTGCTACTGGTGTCCGCGAACTTTAGATGTCGATGAAAATCATGTGAAGAGCACTTGTAAAAGAAAGGGTTAAGGCTGTGTTTGCAACCCCTTGTTCCCAACCCCTCTTCCTCATTTTCCGCTTGCACGCTTTTCAAACTGCTAAACGGTGTGCTTTTTGCAAAAAGTTTCTATAAGAAAGTTGCTTAAAAAAATCAAATTAATCCATTTTTGAAAAACAATTAGGTAATACTTAATTAATCACGCGCTAATGGACCGCTCCGTTTTCTGTGCGGAGGGAATAAGTTCCCATCCACCACATGCGAACACAGCCTAAGGGCTCATTTGGTAAATTGCTGCAGTTTGCCACTCTTTCTCTACTTTTAATATTGGAGTAATTGGTGGTGATAGCCGTTCTACATTCTCATCCTTGCTCCGACTTCACATCAACTTACTGATACATATATAAAATCTTATTTCCTGTTGGAAAATTAGTTTTTTTTATGCTTTTAGTATAAGGAAAATAAATTTCCGTCTAAACACATATGCGCACTTCTAGTTGTCCCAATAATGTGGCATACCATGATTTTTGTGGCAAGAAAATTGATGCGCAAAATTTGAGAACTTGTATCAATGGCATATTGGACATGGGGTTAAGAAAGTGTGGCATCCCAAGTTTGGCAACAAATTGCCAAACTTATCAAAGTAGAATCCACAAAAAACTCCCTAAATACATCAAGCTAGTATACATACTGAAAAAGTTGTATATTTGTATGTATCATCAGTTGTTTCATATCCAAAATTTTTTACGTTAATGATATCATTTCTGGAAGGCAATAGTCAAACTTGGGAAAGTTTGAACTTTTGTAGCCGATCAACTCAACGGTTCTGAAGCTACTGTTCCCAGTTGCTGTCTGCCATGCTATTGGTCATGTAACAAGCACCGTGTCCTTTGCTGCTGTAGCTGTCTCATTTGCCCACACCATTAAAGGTACTGCAACAGTATCTTGATTTTATTTTTGTATTTTTGGCCTTTTGCGTTTCTTCTTTATGCTGAGATTTTTCCTGCAAATAAAATGAATGCAGCTCTTGAACCATTTTTCAATGCGGCTGCTTCACAGTTTATCCTTGGCCAGCAAGTTCCATTGACGCTGTGGTTATCTCTTGCTCCGGTTGTGATAGGTAATCTCATTATGCCTTTTGCTTGTGTTCCTAGCAGTACATCACTTGTATCTTAACATCAATGCAAATAAGGACATATGAAAGTAGGTTTCATGGTTGTCAAGGCCCCTGTGCAGGTGATGCCTCAGCATCCAAGCACTCCAGTAACATTTCCATGATCAGATGCCTTGCCTTATGATGAGGGCAAATGAGAAAGAGCCAAATTGATACTTATAGTCCTTTCTGTTGTGCAGAGTGGACACATGTTCCTAGTAGGTTGGGCCTTGTGCCTTCTTTATTTCTTTCTTATTTCTCTCTAATTCCTATAGCGTAATGACCATTTCTTTCTCCTGAATTCTGGTCATCATGATATTACAATGGCATATCAATAAGTGGTGTGCTACACGATGGCATGCTTAATGAAACCTACCTTATCGTGCGATAAACGCAACTCTGTGTGTGGGCTTTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTAGGCTGAGCTGCCTTGGTTATTCGGGAGGAGGGAACAGACTAAAGATGAGATTGAAGAACCTTGGAGAAACTACAGTTTGATTATTTCACTGTTTATTGCTTAATTCCACAGATTCCTCCATGACATGCTTAGATAGGAAATTAATATTAATATTCTAGATATTATATAAGATGACCAGGGAACCAGGGATACTCTTTACTATCAGTTGTCTCAGTAACATTCCTCACAGCCTCCATGCATCTTTAATCATTTCAAGCATATTATGTTTTAGGACTTTCTAGTTGTCTCTATAGCATCTCTACTTCTGTGCATTGGTAATCATTTGGAGTATATTCTGTTTTGAAATAATCAGGTGTTTCAATGGCATCTCTCACTGAACTTTCATTCAATTGGACTGGTTTCGTTAATGCCATGATTTCTAATATCTCCTTCACATTACGGAGCGTTTATTCCAAGAAGGCTATGGTTTGCTTGTTACCTCTAATGATCTGCATGCATATTCACTCTTCCTTTTGATACTCCCGTTTCATTTTTTTACTTTGTTGCTGTTCTTTATCACAGACTGACATGGATAGCACCAACCTGTATGCGTACATCTCAATAATTGCTCTCCTTGTCTGCATCCCTCCTGCAATTATTGTAAGTCTAATTTTATCTTTATGCATGTTTGTTACATATTTAACACTTCAGCTGTTGGTAGCATATAGGTCTATAGATACCTAAAAAGGCATATCGCAACATAGCCGATGTTAAGCATAGCATATTTATCAAGTTCTCACCATCTTGTTGTTTATCACTGTGCTGATGATATTTTGTCGTTGATTTATTGGAGAGGATTTGAAATACAGTAGAAAATTATTCAGTATTCACTATGTAGGAAAACAAGTAAAGGAGTGTAATGACCAGAGTCTACAGTTCGAATCCATGGAGAGAACTAGTAACTAGTAGTTACCAGTTTTTCTGACCTGGCCTGGATTTTGTGCACTGACCATATTGCGTATGTTACAAAAAAGGCAAATTTTGATTATATGAATTTGAAGAAACTACGAAAGAATATCATGCATGTGTTCTACAATTGCCAACCACCAAGGATAGAATTTGATCCATAAACCAGTAAACCACTACATAATTTAGCAATTTTTAGGAGTTCATTGTTGTGAGTAACCATGTTTTGCAATACTCTTGCAAGTAGTTGTGATTTATGCATGCATGCAACTCTTGTGTTTGTTGGTAAATAATATAAGGCATTTTTTCAATTCAGACTAATGTGGGGGCATAAAGAAAGATGGTCACAATGATTGTATTCATTTGACAACAATTCCTGATTTTCCTCCTAAGGTCAAAACTACCTAGTGTATGCAACACCTCCATTTCTCTAATTACCCTAATCATGTGTTCTGACATGGTAAAATCCAATTTTCCCTTTCATGCTCAAACCACTGTTCCTCTATCCCTTTGAAAAACTGCACAACATTTGAAAATTTAGTTCCATCACGAAACATCGCTTCATGTGCTTGCACATGATCTTTTGCAGTAAGCAAGTAACTGCATTTACTTTTAAAATTAGAAATTTAAGATATTACCTGCGTGGAATACCAGCCTAGGAGCAGGATTTTACTCAAAATTGTTGTTGTTTTTCTATAACCCTGATAATAACCATTTATTACAGTTTGCGAATACATATTAGAAAAAGTGATTTTAGCAGTTTACTTTTTGCAAAGCTCCTGTTGTTTTCTCATTCCAGATTCCATGTTGCAGCAGAGCACAATGCCTTCAAAGTTCAAACTGGGTCCAAAGCGCAGAGCGGTAGAGAAATAGTCTGAAAATAATCGGAGATCCACTGTAACCTTGCTACTAAAGTAATTTGAACATCATGATTGACTACTAAGAAATGAAAATCACTCTGCTTGTGAGGTTGAGAAAACTTGAAACTGATGTCACAGCTTCCTGTTAATTAGCTGTGGTTGGTGGCCACATTTGGGAGGAAATTGGACAAACCAAATAATATGTTTTGTATTCCTGCCCTGCTAACTAACCTGGCCTGTACCGGCCTCTCCCTGTCCCTCCAGAGGAAATTGGAACGTCTGTTTAGAAATGTGCTCATGCTTATATGCTGTTTGTATAGGTGTATGTATGGTTGACAGGCCTGCAAGTGGCCTAATCCAATTTTGATGTTCGCCTGTACATGTCTTATGCATTTGTCTTTGGTATTAGTCCCTGGACTGATGGTACAATGTACTGGTTGTGAGGATCAAGGGTAGGGATTCCCACTCATCTAGCTATTGGCAGGTCCCTTGCATGATGTGGTACAGGCTCTTGAGGCAAGGCAAGGTTAAACCATAGATGTAGGTACTGCTCATGTGAACTAACCGTACTGTAGGAAGGCATGCTCAGCTACCCGCAGGGCCTTAGCCCATAGTAGTGTGGTTAATAAAATTCTTTTATATGATTTCTTTTTTTTAGAGAAGGTATTTTTTACCCGGCCTCTATATCCAATCGGATATATATAACCATTTAAATTAGGAACTTAGCCCCTCAAACAATACAATCTGAAATTCGCTCCTATGAAGATTTGAACTCAAGACCTTGGGGTACTACTCAGGTCACTGCAACCACTAGGCTACATGCCCTTTCTCATGATTTCTTAAGTCCGCAAGATACCTTTAAAGTCACCTACGCATTATCATTGACTTTCATGTTGATTCTTTATAACACAAATTTTGCAGATTGAAGGACCTCAACTAGTGCAGCATGGATTCAAAGATGCTATTGCTAAAGTTGGATTAGCAAAGTTGGTTTCTAATCTCCTTGTGGTGGGCTTGTTCTATCACCTTTATAACCAGGTAAATAGCTTAATGTCATAATTTGCCCATAGATCAAGAATATCATGAAACAACATGGTTTATAGATGAAGGTTAAAAACAACTTTAATCACTATTACAAACAACATCCTCAAATAACTTAGTCCACATGTCAAGAATAAAAACAAGCATTTCCCACATCGTAAGTTCGTAACTATCAATATTTTGAAACTAAAACTTTTTATAGTTGTTCAGATATAGAAATAAATCATAGTATTAGGCAAATATGGATAAATTTTCTGCCATTTTGTGATGATAGTTGGTATTCTCTCTTTTATCCAGGTTGCTACAAACACATTAGAAAGGGTGACCCCTCTAACACATGCTGTTGGCAATGTGTTAAAACGTGTCTTCGTCATTGGCTTCTCAATCATTGCATTCGGTACTTTTAATTTTAATCTTTCATAATGATTGTCGATCAGTATGCATATTCTTGTTCTTGCCATTGGCAAGTGTTGTACTCTTTTTTTGTAGAACTTCATATACATAGTTTTAGTGTGCAAATGATCTGATGTTTTTGTGTAATACTTGGTGAACTTAATGTTGAACAGGCAACAAGATCACCACACAAACAGGAATTGGCACTTGCATTGCCATAGCTGGTGTTGCACTCTATTCTTATATCAAGGCTAAGATTGAAGAAGAGAAAACGGTATGTGTGTATACTATATACATTCTAAATCTCAATATTTGCAATGCACCCTAACGTTACTTCTTTTTTTTAGAGGAACCATTGCAACTGAAAGTAACATAAACTACACTAGTACACACATTTGAAGCAACCTGAAAATTTTTGGGTTTTGTTTGGAAATTTTGTAAACTTTTTTCAACATGGCAAGAATCAGAAGATACTTTGGTTGCTAATACAGCCAAGCATGAAAGCACAAAATGTAAAAAAAGAAAGACCAAGAGTTTCCACTATCATCTTTTGGGGTTTACAAATAAACATCACTTGAAGGGTAAATGAAATTAATATGGATATATGTGCACGTCCTGTTTTGGGGTTTGGAAAAGAACATCATTCAATAGACAATTCGAACGACCTTAGCTTATATCTTGATCTTCTAAGTGAAACTCCATTGCCTGAGTGGTTGAGCATACATGACATGCTAGTCCAGTTTGAGTTTGTGCGCCTAATTGATCTTTGAGCTGGTTCCATCTTGTTCTTGTGATTGATGCAGCAAATGAAGAGCGCATAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA019463