BGIOSGA019581

From RiceWiki
Revision as of 02:53, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA019581| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019581, complete gene.| tag = OsI_193...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA019581

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019581, complete gene.

LocusTag

OsI_19387

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019581-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019581-PA

Length

8342

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:14765274..14773615

Sequence Coding Region

14765274..14765366,14765448..14765523,14765599..14765684,14765877..14765953,14766724..14766780
,14766880..14766964,14767917..14768003,14768188..14768268,14769333..14769470
,14769547..14769732,14771240..14771324,14771436..14771494,14771625..14771705
,14771787..14771861,14771947..14772030,14772988..14773035,14773448..14773615

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:14765274..14773615 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:14765274..14773615 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGTGATCAGATGTTGTGGTTTGTGTGGGAAGGTTCTTGATGATCAGGTTTACGATGGTGAGCCAACTTTCCAAAAGGGCGCCGACGGGCAGGCCCGGTTGGCTGGTAGTATTCTATCAAGCATTGAGAGTGGTAATTCAGTATCCCATGAAAGAACTATAAATAAAGGAAGAGAGGAGATTAGGCAGATTGTCAGCAGCTTACATGTGGCTGGTGGAGATACTATTATTAGCATGGCTCATCGCTATTATACACTAGCTGTTGACAAGAATTTTACAAGGGGCCGTCGAACAACTCATGTTGCTGCTGCTTGCCTTTATATTGCCTGCCGGCAAAGTAAAAAGGCATATCTTCTTATTGATTTCTCGGACCATTTGCAGATAAGTGTCTTTGCCAAGTTTTGCTACTCGCGGAACATCCAGTTATCCAAAAGCTCATCGACCCCAGCCTTTTCATACATCGTTTTACAGAACACTGGGAGGAAACCAAGTGGATTGTGTGGTGCAGCACTATATATCGCTGCTCTCTCTCATGGATATGATTATACCAAGGCAGATATTGTTGCTGTTGTGCATGTTTGCGAGGCAACACTAACTAAGCGCTTGATAGAGTTTGAAAATACAGATTCGGGTAGCTTAACGATTGAAGAATTTTTGGCAAAGGCTGATGAACAAGTGCTTGTTACTAAAATTTCACCAAAGTCTGGAGAAGTACTTTGCAAGCACAAGGATAAAGCTGAGCATTTTGCTCATGGACTCTGTGAAAAATGCTACAACAAATTTATGAAACTGTCTGGTGGACTGGAGGGTGGCTCTGATCCTCCAGCTTTCCAACGAGCTGAAAAACAAAGGTTGGAGGCTGCTAAAAATGCTAAAGGAACTGCTGCATCTAAAGAGGCAGCACTGGAATCAGTTTGTGAGGCACGCGAATCTGATGTTGAGAATAACATTACGACACCGCCAAAGAATATAATTGGAGATAAGCATTCGACAATTCCTTCTGTGAAAGTTGCTGGTGATTCTGTAGCTACAGAAGATCCTGAAGGGGAAGGTAAAAATGATAAAGCAGATGAAGGTCCTGAAAGTCTCTCTGATATTGACGATGCGGAGGTTGATGGGTACCTTCACAACGAGGAAGAAACACAGTACAAAAAAATTATCTGGGAGGAAATGAATAAAGAGTACCTTGAGGAACAAGCAGCAAAAGCAGCATTAGCAGCTGAGCTGGCAGCTAGAGGAGTGGTTGTGGAAGAGGGGAAGAGGAAAAGAAGAAGACATAATGAAGATGGCAAGAACGCAACACCCGCTCAAACACCAGCAGAAGCAACACAGAACATGTTGAAGCGGAAGAGACTTGGATCGAAGATCAATGATGAAGCTGTTAACAAACTGTACAATACCAAAGATGAAGATGGCAAAGCAGATAAAGAGATGGACTTCAACGATGAGTATGGACAGGACACAGGTGATGGTGAAACATTCGAAGGTGGTTATGATTATCCTGATTACAACTATGATGGCTATGGTGTTGGAGCCTACGGCGATTATGATGGTGTTGATTTTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVIRCCGLCGKVLDDQVYDGEPTFQKGADGQARLAGSILSSIESGNSVSHERTINKGREEIRQIVSSLHVAGGDTIISMAHRYYTLAVDKNFTRGRRTTHVAAACLYIACRQSKKAYLLIDFSDHLQISVFAKFCYSRNIQLSKSSSTPAFSYIVLQNTGRKPSGLCGAALYIAALSHGYDYTKADIVAVVHVCEATLTKRLIEFENTDSGSLTIEEFLAKADEQVLVTKISPKSGEVLCKHKDKAEHFAHGLCEKCYNKFMKLSGGLEGGSDPPAFQRAEKQRLEAAKNAKGTAASKEAALESVCEARESDVENNITTPPKNIIGDKHSTIPSVKVAGDSVATEDPEGEGKNDKADEGPESLSDIDDAEVDGYLHNEEETQYKKIIWEEMNKEYLEEQAAKAALAAELAARGVVVEEGKRKRRRHNEDGKNATPAQTPAEATQNMLKRKRLGSKINDEAVNKLYNTKDEDGKADKEMDFNDEYGQDTGDGETFEGGYDYPDYNYDGYGVGAYGDYDGVDF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..93#175..250#326..411#604..680#1451..1507#1607..1691#2644..2730#2915..2995#4060..4197#4274..4459#5967..6051#6163..6221#6352..6432#6514..6588#6674..6757#7715..7762#8175..8342#ATGGTGATCAGATGTTGTGGTTTGTGTGGGAAGGTTCTTGATGATCAGGTTTACGATGGTGAGCCAACTTTCCAAAAGGGCGCCGACGGGCAGGTTGATCTTTCACTTTGCTTCTAATTTGGTTTGGTTTATTTATTTTTCACTTCTCATGTTGGTTGTTTTGGAGCTTTACAGGCCCGGTTGGCTGGTAGTATTCTATCAAGCATTGAGAGTGGTAATTCAGTATCCCATGAAAGAACTATAAATAAAGGTACGACTTTGAGGTCATTCCTCTATCTCATTTTGCTGCCACTTTGTGGGCTAATTTCATGCTTTGTTTTTCCAGGAAGAGAGGAGATTAGGCAGATTGTCAGCAGCTTACATGTGGCTGGTGGAGATACTATTATTAGCATGGCTCATCGCTATTATACAGTATGTATCTTTGTTACTATTACCTCCGTCCCAAAATATAACAACTTTTAGCTTTGAATCTAGACACACAGTTGTCCAGATTCATAGCTAAAAATGCTTATATTTTGGGACGGAGGGAGTAGTCAGTAGCTTATAATTTCTAAAATAATATGGTACATGGTGATGCTGATGTTTATTCTTGTTGAAGTTTAGCTAGCTGTTGACAAGAATTTTACAAGGGGCCGTCGAACAACTCATGTTGCTGCTGCTTGCCTTTATATTGCCTGCCGGTATGCTACCACCTAATTACTTTGTTGATTTATTGAAAGTCTTCTCACTCATTGTACTTGTTTTTTTTTCTCAAGCAGTACCTTTCAATAGAATTATTTCTTGAGCATGATTCTTTTCTTTGTCATTGAACTTATAAAATGCCTAAACTATAACACAGCTAAGCTATTCCAGACTATAGAGCATGCATGGTGAACATTTGTGATGGGTTTGTTTAATACATATATATTTTACCAAGCACACAATCTGAACATTGCCATGCATGGCCCTCAAATATATCTTCCATGTGGAAAGGAATGCTGTGTCCTAAATTTTCAAGCGCAGAGTACTTAATAGCCTGGTTATGCTATATCTCATTTTTCCCTTTAGGAGAACATAATACTCCCTGTAATTGCAAAACAAATCCTAGGATTTGACACCGGCCAAACTTTTTAACCCTTGATCAATGGTCATATTGGAAAAAATAACTTCCATTTCTTCTAGAGAACATATAACATCCATGATTGTCTTTATCCATAGAAATACATGAGCATGTAGGTGGTTATAGAAACTAGCAGTCAATGTGGCTCATTGTAGATTATGTCCATGTCCCAGATGGTGTGCTATATTTGCAATCATAGGTCGTACACAGTATTTTCATTAGTTATTGCTGTTCTTAAGTTGTCCAGCATTATTTTTTTTTCCTATTAGTTCCCTTGGATATCTGTTGTCAAGTTTCAAACTTTTGTTGATATTCATTCCTGACATTCATTATACCTAATTTGTGTGCTAGGCAAAGTAAAAAGGCATATCTTCTTATTGATTTCTCGGACCATTTGCAGATAAGTGTGTAAGTGCCCCATTCTCCTGCCCTTATCTTGTAGCCCTTAGTGACATGGCTCATCTGGATTTTTCTTTCAGTTATGTCCTAGGTGCTGTTTTTCTGCAGCTTTGCCAAGTTTTGCTACTCGCGGAACATCCAGTTATCCAAAAGCTCATCGACCCCAGCCTTTTCATACATCGTTTTACAGAACGTAAGCCACACTAAAATGTATTATTTAAATTTAGCGGCTGAAAACACATGTGCCATTTCTTGTGTACATCTCTACATTTCCATGCACTTTGAATATGCACATTTGGTTTCTTCAATGTGGGGAGGGGGATTGTTCATGTCATGCAATTATAAGAGGCTGGGCCAGGCTGTTCCAATGTTGGTACCTGCCACATTTGCCATGGAGAACATGTTGGAGTGCAATTCTGTTTGGAAATTGCAATTACAACATGAATTCTGATTCTTAAATCATAGGCGCTGTTTGATTGATTTGCAGAATTGGATCGAAATTGTGGTATTCGAGTCCTGAATCAAATTTTACTCGAAACAGTCATAGGCTCTTGCATTTACACCCCAGTGAGAAGTGGACTGATGGATGGACCATTTGATAATTCTTGCACAAGGATTTATGTAGCTTTTGACTAATTTCTTCACCTTAATTTATCTAATCTATTCAACGTGCTTTTACATTCTTGTGAAAAAATATATAACAATTATTTAAAATCACATATGATATTTATTTTGAACTATTTGATAGATTTGTATATGGTAGAGTCATGTGTAGTAGTCAGACTGGGGCATACTATAGTCAAACTATCTCCTCGCTTGTGTTGCTCATGTGAAGGAGTTCAATTGCAATGCAAGCTCCATCCTTTTATCCCCCCCTTTTCTGAGATCTTTGCAAGGCAATGCCAGAAGGCAATTGCTTGGGTTAGTAAGGAAACCAAACATGTTTAGTCTGATTATTTTTGTTTTTTGTGTCACTTTGTTGGTTTTATCTGTAGGTTTACTGGGGAAGAGGGACAATGCCGTATCAGATACGGCTTTACGCATTGTAGCTAGCATGAAGCGAGACTGGATGCAGGCTAGCATATTTTTCTCCTTCCTTCTTTAGGTTCTTTTTTGTGATTGTAATAACTTGTCTTATGATGCAGACTGGGAGGAAACCAAGTGGATTGTGTGGTGCAGCACTATATATCGCTGCTCTCTCTCATGGATATGATTATACCAAGGCAGATATTGTAAGCCCAAGTACTTTTGTCTGATATACTTATTTAGAATTGTATTCTGAAGTCTTATGCCCTCCTTCTGTATCAGTTAGCATGTATCGGGCACATGCTACATTTTGTATTTTTTATAATTGGACATGAATATGATTCTATGCTACAGCATATAATGACATAATTTCTGTTTTATGTTTTTTAGGTTGCTGTTGTGCATGTTTGCGAGGCAACACTAACTAAGCGCTTGATAGAGTTTGAAAATACAGATTCGGGTAGCTTAACGGTATGGATTCTCTCTCCAGGAAATTGCCAAATTCATAGGCGCTGTTACTTACCGCATACAGATGAAAATTTGTTGCAACGATGTATTTGTAATAAAGATGGGAATGACAGCGCTAAGTTGATTGTTGGTACAACTTTTCCCTCTGAAAGTCATTCTTAAGCTGTCTATGCTGAAACATATTGTAATTACTATCAGTGTATGGTGTCTGTTATGGTGCAAGTATTTGACATTACTCATGACACTAAAGCAAATATTGGCCTAAGCAAGTACTGATTAGGGCAGGGCAGCCCATGTCAACTAGACATGCATTCACTTTCTTTACCCTGTCCATAGAGCTAGTTTTAGGTGCTTATTTTTCCCCGTTGGTTCAGCATGGTCTATCTGGCAAAAAAATTGGGTATTGCCCCCTTTCATGTCTGTTTTTTCATGTCATCAATTCATCATCCACAACTGTTATCTACTACTCCCTCCGTCCCAGAATATAAGAAGTTTTAGGGTTGAACACAGTTATTAAGAAAGTAGGTAGAAGTGAGTGGTGGAGGGTTGTGATTGGATGAGTAGTGAAGGTAGGTGGGAAAAGTGAATGGTGGAGGGTTGTGATTGGTTGGGAAGAGAATGTTGGTGGAGAAGTTGTTATATTTTGGGACGGAGGGAGTATATGAATATTCTTTAAGCAGATGAAATAGTATTATGCTAGATTGTAAACGAAAATGGTCCTTGAGGTGTAAATGTGTCATTGTGAAGCCCATTAGGGGTCCATGCAATGGGCGAAGGATGCTGCCTCTGCCCACTACTGCCTAAGCACTGTTCATGGTGCCTTGTGCTAGTTTTATTTAGTTTAAAAATAAGATGAGATTGAATTATTTATCGGTTTGTTTCCTTAGTTTTAGAGCAAAGGGCAAAGGGTTTTTGCCTCTATCATGCACAGTACATCAGGATTAGGATTAGAGGTGTCTTCATTTCATACTTAAGTGATTGGACACATTTCCAGCTCGCATTCAACGTATTGTATCCATGCCAATTTGCATTTGATTAAACATTATATTTTGCTGCCCTCTTGCTAGATTGAAGAATTTTTGGCAAAGGCTGATGAACAAGTGCTTGTTACTAAAATTTCACCAAAGTCTGGAGAAGTACTTTGCAAGCACAAGGATAAAGCTGAGCATTTTGCTCATGGACTCTGTGAAAAATGCTACAACAAAGTAACAGACCTTTACCATGTTCATAATACATCAGTTTTGGGACTTCATTACTCCTGACACATGCATGACTGTTCAGTTTATGAAACTGTCTGGTGGACTGGAGGGTGGCTCTGATCCTCCAGCTTTCCAACGAGCTGAAAAACAAAGGTTGGAGGCTGCTAAAAATGCTAAAGGAACTGCTGCATCTAAAGAGGCAGCACTGGAATCAGTTTGTGAGGCACGCGAATCTGATGTTGAGAATAACATTACGACACCGCCAAAGGTAATATGTTCTTAACATAGTTAAGCTCATGCTTGTTCCCCTATTTACCATACATTCTTCCTTTGTTAGCCAACTAAATAATGTGCTCTTTTAGTTCATTAACAAGGGCAGAAAAAGGTGACTTTTGATCATCTAGATCCTGTACAAGTACAACAGTTTTGTTATATGAATATGTTGCATTCTCATGCACCATGTATATGAGTATAAATTTACACGAAACTGTATATAGGTCCCGTTTGGAAGTGGCAATCAGTAATAATCCGCCCTGGATTATTTGTTCCATGCACCTAAATTATGATTTCTCGAAAAACTCTCTTATATTGCCTTGCTTAGACAACTTGTTCCTAGCTACTACTCCATCTGTCCACAAATATAAGGGATTTTGGGTTTCTCCATTTGTCCACAAATATAAGAGATTCTGGAGTACTTTCCCAATCCATTGAACCATTGCATTTGTTGCTCACTGGTAGTTGCATCATTAGATGAAATCTTTCCCAATCAAATAAAGTCCCGAGAGCATCAAAGTAATTCCACCTTATGTCACGAGCTCCAGGAAGAGACTGGATTGGATATGTGTGGGATGTGGGCGGACGTGGTTTCGGGAGATTGGACGTGCGATGCCCCATGATGGCGACGCTAGAAGAACGAGATGAGAAAACAGAGAAAGTAGATGAGAAGAGTAGATTGAATTCAAGCTTGATCTTTATTGAATGAAAGATTGCTTATATAAGCTTATATGCCAACTGAATTGCTAATTAAAAGAGATAAGAACTAATGCAACAAACCGGAACCAACTAAACAAACTCGAGATAAGATCCTATTGCCAAGCCGTACTGTAGCGCGTCCGAATCACGCCATTCATGCCGCCGTTGCGCAATCTGATTGATCGCCCTCATCACGCGCCGCCGTTCCCGTGCATCCCGCATTCATACGCCTCCGATGATATCCAATTCTGACCATGATACCTTAACCTTAAACTCTGCTAAAAAAAACCTAGCATACTTATATATTTTCGAACTGAAGGAGTATTTGTTAAGTTTATTTCTCAAAATATTAATTTACCGTGTTAATCAAGTAGATCATCCATTTCATTTCACCCGTGTTTCATCACTTTCAAATGGGGCCTTATTTTGACAAAACTATAGTTTTAAGACACAATACCACAAAGCTAGTATCTATTTAGCATTGAATTTATAAAAAGAACTACATATTTATGTTCTACTATAAAAAAAACTTCAGATTTAGCATCTCATCACAAAGCTATGGATTTATAAGTTCTATTAGGACAACAGTGTGAGGATCTAACTCATAAAATCTATATATCTTTTATGGTCTATTTAGTTCTATGATCTGTGGTTTAATCTGCAGTTTTGTTATAATTTTGTGAAATTTCTGAATTTGTGATTTTTTTTCTCTATTTATTAAAACATCTGCATTTGTTATTTCTGTTGTATACCATATAATGTGTTTTTGTAATTTGAATACTCAATTTAACTTATTTTGACAGAATATAATTGGAGATAAGCATTCGACAATTCCTTCTGTGAAAGTTGCTGGTGATTCTGTAGCTACAGAAGATCCTGAAGGGGAAGGTTTGTTTGTTGCTGTACCATCAACGATGATACTCCACAAGAAAATTCATATTTCCATTTTAGGTCCCTTTTGATAAGTTCATTCCTGCTGCATGCATATTTCATCCTTAGGTAAAAATGATAAAGCAGATGAAGGTCCTGAAAGTCTCTCTGATATTGACGATGCGGAGGTACTTCATCCTATCCATGAGATCACTTCTATATATTTCATAGAGTAACTTATTTATGTCATCTTTAGATCTTGAAAGATAATCAGTTAGGCTCTTTATGATTTACTACAGTGCTACTATTAATTTCTAGGTTGATGGGTACCTTCACAACGAGGAAGAAACACAGTACAAAAAAATTATCTGGGAGGAAATGAATAAAGAGTACCTTGAGGTAGCTAAGCTGATTACATAGTAGCATAAGGACTTTCTTATTTTAACCACATAGTGTGGTTCTCAGCTGGTTGCTTTACAGGAACAAGCAGCAAAAGCAGCATTAGCAGCTGAGCTGGCAGCTAGAGGAGTGGTTGTGGAAGAGGGGAAGAGGAAAGTATGAAATGTTTCTAGTGCTACCAACCTTTCTATGCCGTGTGTTCACTGTAGTTCGTGATTAAGCATGAATATTTCATATGTAGAGAAGAAGACATAATGAAGATGGCAAGAACGCAACACCCGCTCAAACACCAGCAGAAGCAACACAGAACATGTTGAAGCGGAAGGTACTAATGGTCAATACACCCCGATGCTTTGTAAGGTTTTTCATTTACTTTTGATGGAGAATAGGAGAGGCTCCACTACATATTAATTTCATATAAGGGAGTTATATGTAAGCAGTAAAGAATCAGAAGATGATTAGTGCATTTTAATTATACTTCGAATCATAGTTTCACAAGATAGTTTATAGGATAAGTGCATGGCTTTATTCATATCCATAGTATGCCTACTCATGAGACTGTCATGTGGTCCCTGCGCTCAGATGTTCCTTGGCATGTTATAGAAAATGGTTGAAACTTGAAACTGAATGGTTTTAAATTACGATACATCAATACATGGTTAGTCCAAACATGAAAAATTGCAGATTTTATTTTAAATTAGATTTTTTGCTTCCAGCATGACATGCTCTTTAAATGGTCTAAAGAGAAATCTACATTAAACACCTACGGAATGTTCATCTCCACCTTCTTTTGGTGCTTTCCATGTTGTATTAATTAGATCTAATCATGTGCAACAAAATCCAACATTGGTTCTCCAACAATGAAAAAGGAGGGGCAGATGTGCCAATGTTTGTGGTGTTGGTAGGTGAAACAAAGGCCCATAAGAAAGGTATAGAAAACTGTGGACATGTTTGCATCATCTTAATTGGCCCATAAGCGAGGAATTTGCTCCAATAAGCCCATAGCAATTAAGCAGACACCAATTGAATTGAGTAGACACCATATCTTGATTAAGAAAACATGAACACTATTCAGCCCTAAAATTCCTGAGTCTCATATATTTTTCATACCGCCCACCAAATGCCATTTTCCACATAATCCGTCGGTTTTCTAGTCGTCTACTTTTAGCATTTATTCCTTGTTCCCATGGTTTTCCTATTCATGCATTTTCCATCTTCAAAACATATGGACTAGTAACATATAAATTAACTAAAATCTAACATATAATGTTGTTACTTGCAGAGACTTGGATCGAAGATCAATGATGAAGCTGTTAACAAACTGTACAATGTATGTTCTCTCGTTTTTTTCTTTTTACCCACTGGTTTTATAAAATATTTGCTGCTGTGAGTTGAATTGACTATTCTGTTATGCGCTATGTGATATTGTCACTATATCCAGAACAGGAATGAAACAACCATGCCACAAGTAGTGTGCCAAGGGTTCTGCGGACTTAAGCTGTCTTAGATTCTTTCATTCAGAACAAGATTTGTTAGCTCTTTTAGAATTAGGAATGGGTCGCAGGGCACTAGTCTGGGTCTGCGACCCATTCCTAATTCCCTTAACCCATGAACCCATGACAGATGCGCCTTGCTCTACCTTCTGTGGAATTACAGTCAGATACTACTACTGACTTCATTATGGTCTACTTTGTTATTTTCTGACTGAAAATACATATTGAATTATTGATTTTTGCGGGCAGACCAAAGATGAAGATGGCAAAGCAGATAAAGAGATGGACTTCAACGATGAGTATGGACAGGACACAGGTGATGGTGAAACATTCGAAGGTGGTTATGATTATCCTGATTACAACTATGATGGCTATGGTGTTGGAGCCTACGGCGATTATGATGGTGTTGATTTTTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA019581