BGIOSGA019793
| Gene Name |
BGIOSGA019793 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019793, complete gene. |
| LocusTag |
AP2LP |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA019793-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA019793-PA |
| Length |
4963 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:19987735..19992697 |
| Sequence Coding Region |
19987735..19987787,19988461..19988543,19988846..19988934,19989585..19989658,19989734..19989784 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:19987735..19992697 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGCCCTGCGCCGCCGGGAAGCGCAGCTCCATCTACCGCGGCGTCACCCGGCATAGGTGGACAGGCCGATATGAAGCTCACCTCTGGGATAAAAGCACATGGAATCAGAATCAGAACAAAAAAGGGAAACAAGGTGCATATGATGATGAAGAGGCTGCAGCAAGAGCTTATGACCTTGCTGCATTGAAATACTGGGGAGCTGGGACACAAATAAACTTTCCTGTCTCTGATTATGCAAGAGATCTTGAGGAAATGCAGATGATCTCCAAGGAGGATTATCTTGTGTCTCTTCGGAGAAAGAGCAGTGCCTTTTCCAGGGGTTTACCAAAATATCGCGGCCTTCCTAGGCAGCTCCATAATTCCAGATGGGATGCTTCTTTGGGACACTTGCTTGGCAATGACTACATGAGCCTAGGGAAGGACATCACGCTGGATGGGAAATTTGCAGGAACCTTTGGCTTAGAGAGGAAAATTGATCTGACAAATTACATAAGGTGGTGGCTCCCAAAAAAGACACGGCAGTCAGATACATCTAAAATGGAAGAGGTTACTGATGAAATCCGTGCTATTGAAAGTTCAATGCAACGGACTGAGCCTTATAAGTTTCCTTCCCTTGGCCTCCATTCTAACTCAAAGCCCTCTTCCGTGGTCCTATCAGCATGTGATATCTTATCTCAGTCTGATGCCTTCAAAAGCTTCTCAGAAAAATCTACAAAACTATCTGAAGAATGTACTTTTAGCAAAGAAATGGATGAAGGAAAGACAGTTACCCCAGTACCTGCAACTGGACATGACACAACTGCAGTTAACATGAACGTGAATGGGTTGCTTGTGCAAAGAGCTCCATACACATTGCCCTCTGTTACTGCACAAATGAAAAATACCTGGAACCCTGCTGATCCTTCTGCGGACCCTCTTTTCTGGACCAACTTCATCCTGCCAGCAAGTCAACCTGTCACGATGGCAACAATAGCAACAACAACGTTTGCAAAGAATGAGGTGGGTGATAACATCCTGCACGTCTATGGGTTTCCTTCTTCCTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPPCAAGKRSSIYRGVTRHRWTGRYEAHLWDKSTWNQNQNKKGKQGAYDDEEAAARAYDLAALKYWGAGTQINFPVSDYARDLEEMQMISKEDYLVSLRRKSSAFSRGLPKYRGLPRQLHNSRWDASLGHLLGNDYMSLGKDITLDGKFAGTFGLERKIDLTNYIRWWLPKKTRQSDTSKMEEVTDEIRAIESSMQRTEPYKFPSLGLHSNSKPSSVVLSACDILSQSDAFKSFSEKSTKLSEECTFSKEMDEGKTVTPVPATGHDTTAVNMNVNGLLVQRAPYTLPSVTAQMKNTWNPADPSADPLFWTNFILPASQPVTMATIATTTFAKNEVGDNILHVYGFPSS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..53#727..809#1112..1200#1851..1924#2000..2050#3252..3319#3432..4000#4099..4113#4919..4963#ATGCCGCCCTGCGCCGCCGGGAAGCGCAGCTCCATCTACCGCGGCGTCACCCGGTACGGCTCCTCCCCCCTTTGCCCTCTCCCTCCTCCGTGTCTCGAGTCGCGGAGAAGTTTTACTTGGATGCTTATTAGGGGATATGCAATCGTTCTCTGCTTGGATTGATCTGTGGCGCTAAATCCGTTCGTCAGGTCTCCTTGTATGCTCAAAATGGTACCGTCGATTCGGGATCTAGATTTTTCTTTTTGTTTACTTGGTTATATACGGATTAGCTGTATTCATCGGATTACCTGTTGTGTCTCCAAGGGGACGATCTGAAATAATTAGGAGCTTCGCTTGATCTAAATAAATATAAAAGCTAATGAATGATTTTCACTTGACCAGTACATCCAACATCATGCTTGATTTAAGTTGTGTCAAACTGGGTTGACAGGGTTTAGCTCTAATCTGGGTAAGAAGCAAGTTTTGGACCCTTTTCGGTCCAGACAAGTGTGGGGCTCAACTAAAAGATGAATTTTCAAACTATATGTGTATTTACATACTTAAATCTTTTATTTGGTGTTTAATCTGATCCAAAAGTAGTATTTGTTCTATATTGTTATTCAACTGTTCTTGTACCACCATATGCTACTTCTTTCTTAATTTTGTTGTAATTTGTAAGCAAGATTTTAACTTTCAGCTGTTATTATGTATGAATTTGATTTGACACTTGTTTTGTATCATCTATAGGCATAGGTGGACAGGCCGATATGAAGCTCACCTCTGGGATAAAAGCACATGGAATCAGAATCAGAACAAAAAAGGGAAACAAGGTCTGTATACCCAATGCAAATTAGCAGCTATATTTTACATGTTTTGAAAAGTTGACCAAGGGACGTTGGAAGCTAGGTGAATTTTAATTGTATTTCATAGATAATCCATGCACGTCATTTCCTTTTATATCTAGCTATAATTAATCTGATTTAATGGAATTGTCTCTTTTGCATGGGAAATTATCACCCAAAATGGCCCTGCAAGTGCAGTATATTTAGGTAAGAAATCTTTGGTGTTAACTGTAAAATGTGCAATTGTATAAACTTCTTTATCCACATCAATTCAATGCGCAAATACACAGGTGCATATGATGATGAAGAGGCTGCAGCAAGAGCTTATGACCTTGCTGCATTGAAATACTGGGGAGCTGGGACACAAATAAACTTTCCTGTGAGTCATCTATACTTGCTAATTATAATTGGTTTCTTAGCTTCCATTTAGTTCTTCTACAATTATTAACCACACACTGCCTTTTCTTCAAGACCTTCATTTGGTTAAATTTAATCATTTATATTTTGCATCACCTGAGCTCAATTTCGAAGACTGATTCTCTTAGGATGCAAATTGAAAACCAAAAGATATCTTAGAGAGTGTTGTACCAAACTTTGGATCATACTAGTCCAAACATATCCTATGCAACTGTTGTGTGATGTTTGAAAAATCTGAATACTCTTGACTATTATATTATGTTCTTTTGTATGCAAAGGTTAGGGATTTATTCAGTTTACACTTGACGATTCGGAGATGGATGTTTGTGTCCTTGACAAAAAAAATCTCTTGTTTTCAGAAAATTCATCTCTGAGCATATAAGCGACATTGAAAAATCATTGTCTCAGAAGAATATTGGCAAAACAAACATATGCATACATGCCATCTCTTCAGTTTGGTATCTATATGCCTATACATCTCGATGGAAAATAATTGCGATGTTGCTTATGAATTATTGTACTATGTTTTTTCCATTCTATATTTTGCACTAGTTAATTTGATTTGTGGTAATCTTTTTCAGGCTTATGTTCATTATGTATTTGCTTATTTAGGTCTCTGATTATGCAAGAGATCTTGAGGAAATGCAGATGATCTCCAAGGAGGATTATCTTGTGTCTCTTCGGAGGTATATTTGTGAATTTATAATACGTGCATATTACTTTGTTTCTTAAGTACTAACTGTAAGACACATGCACTGCAGAAAGAGCAGTGCCTTTTCCAGGGGTTTACCAAAATATCGCGGCCTTCCTAGGTACTTATTAGCAATGAGAAATATATTTGGAAGTTAACTCTATGTTCAGTTATTATATTTGCATGCATGTTTGTGATGCTAATTCAGTAACAAGTCTCATGTCCAATTTTCTTTTCTATTGTGCACAAACTATCATTGTCCATGTTTTGTTTATTTCGGTAACATTTTCCATCTTGCTACAAATATTTATGGCAAACCAAGTAGTAGTATGTAAAGATGATGCCCTGTGGTATATTACATTAGAAATTATTTTCAGCAACTTCATGTATTTCTGCTATGAATTAAATTAGTAAGCTCAGCAGATTTTTGGAGGTAGATAGCTTAGATACTAAACTACTAGCTCTTATTCGTGTGTCATTGGTCTTCATTTAGAGAATTTTAAAATAAAGTGTCATTTAGCAAAGATGCAAACCTTCAAGTTTTGCTGAACATTAATTCTTTCCAATAATCACTCGATTGCACAGCCACAGTCCCTCAACTGTACTCGTGATGCTGAATGTGCGTCATCGAAATTCTGTGTTTCCTCACTGATTACTGTTGTCAATGGAAATTCGGCATTCAGTGCCTTCGTTCTTTGTATGGTTACAGCTATCCTGCTTTCTGTGGGATCTCAACCAACCAAAACATAATATTCTCAACAGAATATCCTTTCAGAGGAGAGTGATTACTTGTAGCTGAGATTTTGAAGAGATCGACATACTTGAAATTTCCTTCTAGGATAGGATCCCGACTTAATAGTGTCCTGAGGACCACTAGAAATTAGTTTAGGAAAGTTTATTATTTGGACATATAAAGTAAAACTATACTCCCTCCATACTCATAAAGGAAGTCGTTTAGGACAATGTTTAAGTCAAATCTTGGGAATATAAATCATTAATAACTCTTAAGTTGTTAAGTTTGACAATGCAAAAATTATATGAATAGATTTGCCTTGAAAAATACTTTCATAAAAGTATACATATATCACTTTTCAATAAATATTTTTATAGAAACAAGAAGTCAAAGTTGTGTTTTGAAGACCATCTCGCTGTCCTAAACGACTTCCTTTACGAGTACGGAGGGTGTACGTAATTCTGTTTTACTTAATTATTCACCAGATGTCAGTCTTCGACTAATCATTACAGTGCACTACACTGCTGGACACGTACAGTCACATTGATATAAATTTTATAACTGCAACCGTTGTGACATTATCATGCAGGCAGCTCCATAATTCCAGATGGGATGCTTCTTTGGGACACTTGCTTGGCAATGACTACATGAGCCTAGGTTGTGGTGTCTCCATAAAAACTTCTACACTGCTGTTTCTGGTTAACAAACTACAGAGGAGAAAGACAAATTCTATGTGGTTTTGTAACCAGTCTTTCTATTTAAATTACAGGGAAGGACATCACGCTGGATGGGAAATTTGCAGGAACCTTTGGCTTAGAGAGGAAAATTGATCTGACAAATTACATAAGGTGGTGGCTCCCAAAAAAGACACGGCAGTCAGATACATCTAAAATGGAAGAGGTTACTGATGAAATCCGTGCTATTGAAAGTTCAATGCAACGGACTGAGCCTTATAAGTTTCCTTCCCTTGGCCTCCATTCTAACTCAAAGCCCTCTTCCGTGGTCCTATCAGCATGTGATATCTTATCTCAGTCTGATGCCTTCAAAAGCTTCTCAGAAAAATCTACAAAACTATCTGAAGAATGTACTTTTAGCAAAGAAATGGATGAAGGAAAGACAGTTACCCCAGTACCTGCAACTGGACATGACACAACTGCAGTTAACATGAACGTGAATGGGTTGCTTGTGCAAAGAGCTCCATACACATTGCCCTCTGTTACTGCACAAATGAAAAATACCTGGAACCCTGCTGATCCTTCTGCGGACCCTCTTTTCTGGACCAACTTCATCCTGCCAGCAAGTCAACCTGTCACGATGGCAACAATAGCAACAACAACGGTTTGTTCCTCTTTGGCTCTACTTGACAATTTGAATTAAATCTGTAACATATTTTCAATTTTTCTTCTTGTGCTTAATTTGATGCTGATTTGTGACAGTTTGCAAAGAATGAGGTGAGTTCAAGTGATCCATTCCATGGTCAAGAGTGACCGTACGAGCTTACCAAAGTGCATGCAGGATTTGCTTTTTGGCTTGGTAAGTAGAGACTGTAGGCATAGTAAATTTTACATTTTTTCATATATTTTCTTTCTGTGTATCGCCTAAATTATCTGCTTGAAGAACTCAATGCATCACGAGATGTCCAGATTTGCATTCAAATAAGAACATGCAAGCAATGGAAATATGTTTATGTCTAACTTACAAATATCTAAGGATTTATTTTCCCTTGATTGACAGGTGCCAGTCTTGAAAAGAAAAGAATATACCTGACAATATGACACTCCGTTGAAAGAACACAATGAAAATGAACTGAGACAGTTTAAATCTAATCAATTAAACCAAACAAAAATACTGTTGTGAGATATTTATGTGTGCATAAATATTTTTATAAGGATGAAAATATAGGATTATGTTGTGTAAGTGGTGCATCGAGTATTTGAGACATGATAAATCAACATTGTTTATGTGCGTGTGCCCACGCGTGGACAGTGCTTTCAGCTTTCCCTCCGTTAAAATTTCAGTAACACTGACATGTGGGTGTCAAATTCTTAATTTACTATAGCTACCCAGGAAGATCCACTTTGCATATGCTTTGCACTCGCAGTCACAGTGATTTTACTGGCACATCCTTTTGTAAAATTGTTAGTTTTATTCCTTTTGAACGAACTAATTGTTAATTTTATGAAAAACAGCACGGTAGTTATAGGACATGTTTGCATTCCTCTTTTCTGCTTAACTGAAACCTTTTGCATATTTCAGGTGGGTGATAACATCCTGCACGTCTATGGGTTTCCTTCTTCCTAG</dnaseqindica> 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