BGIOSGA020017
| Gene Name |
BGIOSGA020017 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020017, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20285 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020017-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020017-PA |
| Length |
8558 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:24475533..24484090 |
| Sequence Coding Region |
24475533..24475589,24475998..24476536,24476781..24476934,24477082..24477231,24477739..24477900 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:24475533..24484090 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:24475533..24484090 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGACCCATATTTTTGGTCTTACCAAACAGGCCCTAAATGGGCTACGAGCAACGAAAGCGTCTCCACCGCGCCACTCGAGCGAGGGGTTGGGCCCGGGCCGGCCACCTCCCGCGAGCAGCCGCGCGGCGGCGGGGACCCGGCGCTCGCGGCGGAGCTCGCGCGCCTCTCCGCCCTGCGCGCGCGCCTCCGCGGGGCTCGCTCCCTCGCCGACAAGCTCCGCGCGCTCGACGCCGAGACCCGGGTGGTCGAGTTCTTCGGGGAGGGGTCGAATGGTGGGGTTCTGGGCGCGCTCGAGCCGCGGGAGGTGTTCCTGCTCAAATGCCTAGTCGCCGCCGGCCAGGAACACGTGCTCGGCGCGGAGCTCGACTGGGACGGTCGCGGCCACGAGCACCATCACCACCATAACGGCGGGAGCGATGGTCGGAGCGCCCTGCGGCAGGCGCTGTCTAGCTTGGCTGCTTTGGTCGGCAAGTGGAGCTCGGAGGGAGTGGTGGAGGGTGTGGCGGAGAGCGGGGAATCGGAGCTTCTCCGGCGTCTGCTCAAATTCCTCGGCGACATCGACGTGTTCTATGACTGCATTGGAGGCATCATCGGCTATCAGATTATGGCATTGGAGTTGCTTTCAGCCTCAAAGGACCACAAGCACCGGCCTAGCAAACACAAGTCTATTGACTTCCATGTTCCAAGTGGACTTAATCTATTGGAAGATACGGAATATGCATCTCAAGCTGCTCTGTGGGGGATTGAGGGTTTGCCAGAACTAGGAGAGATTTATCCGATTGGTGGTGCTGGTGATCGTCTTGGTTTAGTGGACTCGGATACTGGTGAATCCCTCCCTGCTGCATTGCTTCCTTATTGTGGGAGATCTCTATTAGAAGGCCTCATACGTGATCTGCAGGCTAGGGAATTTTTGCATTTCAAGATTTTTGGGAAACAATGTATAACTCCTGTCGCGATCATGACAAGCTCTGTGAAGGATAACCATGAGCATATAACTGCAATATGTGAAAGACTTGAATGGTTTGGCAGAGGCCGTGAGAATTTCCGCTTATTTGAACAGCCTTTGGTACCTGTAGTAAATGCTAAGGATGGTAAATGGTTAACCAGCGGAGCACTTTTTCCTGTTGGTAAGCCTGGTGGTCATGGTGCTATTTGGAAACTTGCATGTGATAGAGGTATATTCCAATGGCTTTACCAAAATGGCAGAAAAGGCGCAACTGTACGTCAAGTCAGCAATGTTGTGGCTGCAACTGATTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGTGTAGATATGCTTCTGAGCGATGGGTTCAATGATGTAGAATATATTTCTCTCATTTTGCGTAGTATTGATTACTCCATTTCTTGTGTAAGTGCTGCTGGAGGCAGGTTAGAATGCACGATGCAAAACATAGCGGATAATTTTATGAACACATATAACTACAGGTGCAGTAAAGGAATAGAAAGTGAGCTAGACACATTCATTGTGTACAACGAAAGGAAAAAAGTCACTTCGTCAGCTAAAAGGAAGCTGAAATCAGAAGATAAGTCATTGCACCAGACTCCAGAGGGTTCACTCCTTGACATTATGCGTAATGCTTATGATCTCCTTTCTAGCTGCAATGTAAAGGTTCCCAAGGTCAAAGACAACTGTGAATACTTGCGTTCTGGACCACCTTTTCTTATATTTCTTCATCCTGCTTTAGGTCCATTTTGGGATATCACAAGGCAGAAGTTTGTAGGTGGCTCGGTCTCTCAAGGTTCAGAATTGCAAATAGAGGTGGCAGAATTTCTATGGCAAGATGTTGAGCTCGATGGAAGCCTAATCGTTTTAGCTGACAATATTATGGGTTCAACCAACAAGAATAATACTGGAGAACAAATAATGCACTATGGTGCCAGGTGTGGGAGATGCAAACTGCGAAGTGTTAAAATTGTGAATAAAGGGATCAACTGGAGTTCTGCCAATAATGTCTACTGGAAGCATGATGTCGAGAGATCAGAATCTGTGAAGATCATTCTTCATGAAAATGCCGAATTTGAGGCAAAAGATGTTGTCCTTAAGGGTAACCATATCTTTGAAGTTCCCACTGGTCATAGAATGCGCATTGTTCAAGATGGACCAGAATTTGTTGCTAAGTTAGATCCCATAAGCAAGGAAATGATGGACGGTGGAACCTGGTACTGGAAGTATGCAGTAGATGGAGCTCATGTGAAGTTGGAAATGGTAGAACTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPYFWSYQTGPKWATSNESVSTAPLERGVGPGPATSREQPRGGGDPALAAELARLSALRARLRGARSLADKLRALDAETRVVEFFGEGSNGGVLGALEPREVFLLKCLVAAGQEHVLGAELDWDGRGHEHHHHHNGGSDGRSALRQALSSLAALVGKWSSEGVVEGVAESGESELLRRLLKFLGDIDVFYDCIGGIIGYQIMALELLSASKDHKHRPSKHKSIDFHVPSGLNLLEDTEYASQAALWGIEGLPELGEIYPIGGAGDRLGLVDSDTGESLPAALLPYCGRSLLEGLIRDLQAREFLHFKIFGKQCITPVAIMTSSVKDNHEHITAICERLEWFGRGRENFRLFEQPLVPVVNAKDGKWLTSGALFPVGKPGGHGAIWKLACDRGIFQWLYQNGRKGATVRQVSNVVAATDLTLMALAGIGLRHDKKLGFASCERRPGATEGVNVLIEKENQDGQWAYGITCIEYTEFEKYGIPEPTVTNGSLQANYPANTNILYVDLQAAEEVGSRKNASCLPGMVLNLKKAVSYLDHLGFECSVDMLLSDGFNDVEYISLILRSIDYSISCVSAAGGRLECTMQNIADNFMNTYNYRCSKGIESELDTFIVYNERKKVTSSAKRKLKSEDKSLHQTPEGSLLDIMRNAYDLLSSCNVKVPKVKDNCEYLRSGPPFLIFLHPALGPFWDITRQKFVGGSVSQGSELQIEVAEFLWQDVELDGSLIVLADNIMGSTNKNNTGEQIMHYGARCGRCKLRSVKIVNKGINWSSANNVYWKHDVERSESVKIILHENAEFEAKDVVLKGNHIFEVPTGHRMRIVQDGPEFVAKLDPISKEMMDGGTWYWKYAVDGAHVKLEMVEL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..57#466..1004#1249..1402#1550..1699#2207..2368#2500..2672#2760..2826#2986..3152#3647..3805#4618..4707#4823..4914#5018..5112#5757..5834#6794..6889#7562..7636#7720..7811#7892..8054#8164..8224#8446..8558#ATGGACCCATATTTTTGGTCTTACCAAACAGGCCCTAAATGGGCTACGAGCAACGAAGTTTCAAGAAGCAGCCCACGGCCCCACCAGAAAACAGCAAAAAGATCACCTGACAAGTGACAACCGGCGCGCCGGGCGCGCGTCTTCCGCGACGCCCGCGCGCACGCAGGGGTACCCGAGATTCCGCCCGAGAGCATATGCCCCCTTCGCTTTCGCTCTCGCTCTCGCGGTCTCGCCGTCCTCCTCTTATCCCCTCTCTCCCTCGTTCTCAAGTCTCACCTCTCCCCCCCCTCCTCCCGCCCGCTCGCTCTCCACCACCACCACCTCCTCTGCTCTCAACTCCTCGCATGGCCTCTCGCACGCTGCCTCCACCCAACCTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCATCCCCGTCCCCGTCCTCGGCCTCCCGCTCGCAGAGCGTCTCCACCGCGCCACTCGAGCGAGGGGTTGGGCCCGGGCCGGCCACCTCCCGCGAGCAGCCGCGCGGCGGCGGGGACCCGGCGCTCGCGGCGGAGCTCGCGCGCCTCTCCGCCCTGCGCGCGCGCCTCCGCGGGGCTCGCTCCCTCGCCGACAAGCTCCGCGCGCTCGACGCCGAGACCCGGGTGGTCGAGTTCTTCGGGGAGGGGTCGAATGGTGGGGTTCTGGGCGCGCTCGAGCCGCGGGAGGTGTTCCTGCTCAAATGCCTAGTCGCCGCCGGCCAGGAACACGTGCTCGGCGCGGAGCTCGACTGGGACGGTCGCGGCCACGAGCACCATCACCACCATAACGGCGGGAGCGATGGTCGGAGCGCCCTGCGGCAGGCGCTGTCTAGCTTGGCTGCTTTGGTCGGCAAGTGGAGCTCGGAGGGAGTGGTGGAGGGTGTGGCGGAGAGCGGGGAATCGGAGCTTCTCCGGCGTCTGCTCAAATTCCTCGGCGACATCGACGTGTTCTATGACTGCATTGGAGGCATCATCGGGTGAGAAACTGAGAATTGCTTGTTTGCTGCTTTGCTTTAGTTGTAGACTTAGTAAAACGAGGGATTAACTAAAGTTGCCAAGCAATCCTGTGCTCCTGGCCAAAATCTGGGAGTTGGTAACCTTATTGCCATAGCTTGTTTGTACTCTAGTGCAGTGCTCTTTAAAACATCACTAAAATTTAAACAATGTTTTGCTTTCACCCTGATATCTGAAACACTATCGGTATTCCTTTATTGGTTCCAGCTATCAGATTATGGCATTGGAGTTGCTTTCAGCCTCAAAGGACCACAAGCACCGGCCTAGCAAACACAAGTCTATTGACTTCCATGTTCCAAGTGGACTTAATCTATTGGAAGATACGGAATATGCATCTCAAGCTGCTCTGTGGGGGATTGAGGTTACTTCCTAGTCTACATTACCTAAAATTGACCAAAGAGATCAATAGCATAGTCCGTGCGATTTGTGGTCTGATTTTTTTAGTGCGGGACATTTTGTCAAAGACATTACATTCTCTTTAGATGAACTGAAATTTGACCGTTTCTAGGGTTTGCCAGAACTAGGAGAGATTTATCCGATTGGTGGTGCTGGTGATCGTCTTGGTTTAGTGGACTCGGATACTGGTGAATCCCTCCCTGCTGCATTGCTTCCTTATTGTGGGAGATCTCTATTAGAAGGCCTCATACGTGATCTGCAGGTACTTCTGCTAAGTATATGGAACTTTTGTTTATTTGTAATATTTTTACTGAGGGTATCACTTGAAAGTTGAAAACAATAGGGGATTGACTGGCTTAGCTTTCAGGTTATAAGACTTTCTAGCATTGCCCACATTCATATAGATGTTAATAAATCTAGGCACACGTATATGTCTCGATTCATTAACATATATGTGAATGTGGGCAATGCTAGAAAGTCTTATAATATGAAATGGAGGAAGTAGAAACCACCTGGTTTGCTCCTTCCGCATTCTATTTATGCAGTACACCTCATTAGGTGACACTAACTTCTATATGAAAATTATTCTAGCAAACCACATTTTTGTAATGTTCTTTCACAAGGATTGAAAAGGGTGTAAAGTGTCTATGGTTACATATGTATTACTTGCATAACTTTTCCTTTGTAGCACTCTGTCATGAGAAATTTAAAAAGGTTCAAAGAACTATGACCAGTAATATAATTGTGTGAATGGCACCATATTTGGCAGGCTAGGGAATTTTTGCATTTCAAGATTTTTGGGAAACAATGTATAACTCCTGTCGCGATCATGACAAGCTCTGTGAAGGATAACCATGAGCATATAACTGCAATATGTGAAAGACTTGAATGGTTTGGCAGAGGCCGTGAGAATTTCCGCTTATTTGAACAGGTATATAATCAAGATTTCTAGTATTTATTTATTTATTTATTGGTGTGTGTCTTTCTAGTCTGTAAAATCGGTACTCATTCTGTCCAAAACTATGGTACAGTGCTAACTAAATCTCATCATGACTTTTATAGCCTTTGGTACCTGTAGTAAATGCTAAGGATGGTAAATGGTTAACCAGCGGAGCACTTTTTCCTGTTGGTAAGCCTGGTGGTCATGGTGCTATTTGGAAACTTGCATGTGATAGAGGTATATTCCAATGGCTTTACCAAAATGGCAGAAAAGGCGCAACTGTACGTCAAGTCAGGTTATCCTAAGAATCAAATGTTTGTTAATCATTGTCAAAACATATTATTTGGAAAGGAAGTAACTGTGCATGTCTTGTAATTTTCAGCAATGTTGTGGCTGCAACTGATTTAACACTGATGGCATTGGCAGGAATAGGCCTGCGTCACGATAAGGTAAAAGTTTTCCCAGGGGTAATATGAAACTCTTTTTCATTTTACCTTTTGAGTGTTCCATATTAGCTACTGATGCAAATCCTGGCTGCCATGTTAACTTTGCACCTTTGAATTCAACTATTGTGTTCTCTTTCCATATTCTGACATATCATACTCCAGAAATTAGGTTTTGCGTCTTGTGAACGAAGACCAGGTGCTACTGAAGGGGTAAATGTACTAATCGAAAAAGAAAACCAGGATGGACAATGGGCATATGGTATCACTTGCATTGAATACACTGAGTTTGAAAAATATGGCATCCCAGAACCAACAGTAACAAATGGCAGGTAAATATTTCTTTCAATTTTATCCAACCGCGTACTTATTTTTCTGCTCGTGATGCTTTACCCTTCCTCCTGTTTTAATTTTCCTATATATTAAATTGTTAATCATACTGGAATGTTCATATGATTAGGAAGAAATTTGATGGCTAATTTTAATATCTTAATAAATGCGAGTTATAAACTTAGGTTCTTAGTATCAAAACTGTAACAGAAAGGTTTATGAAGCAGTCTTCGAGAGTGATACTTTCTGTTGGTAAAAGTATCAAGGGGAAAAAAAAATCAAGATTCCAGAACAATACCAATAGTTTGTGTTACTTTGACTTTTGGAAATAGTAAATGCAATGCAAGTATGCAAACCTACCTGAATATTAAAATATTGATGCTGTATGGCAACATATACTTTATCTGCTTCACCCTTTATGTTTGATGCATATGAATAAGGCTGTTTTCCTTTTATAGGTATTGACATTTTATCATCTATACTTTTCTTAATTTAGTTTGCAGGCTAACTATCCAGCAAATACAAATATACTATATGTTGATCTGCAAGCAGCAGAGGAAGTTGGTTCGCGCAAAAATGCTAGCTGTTTACCCGGAATGGTGCTAAATTTGAAAAAAGCTGTGTCATACTTGGATCATCTGGGCTTTGAGTGTAGGTACTTGCTTTCCAGTAAATTCACTTTAGACTTCTGGTCCATCTATAAGCACCGTTGCATTTTATTTGTACTTGTACAGTTTGGGTCATGGTTCTTACTAGTGCACTTAGGCTTATGTTTCTATCTTAAAGTATAATTAATTTCCAAACATATATCAAAATCATGCTGATTTCTGTGGCATCCACATAAAGAAAGAAAAATCCACGTCAAGAAATGATACAGTGGCAAGCATGGGCGCTTCATAACATATTTGCGCGATTGCTTATAATGAAAGCAGTTGTTTTACTCTATTCATGTTGGCATAAACTCCCTGAGTATAGCTTGGTGGTTTTTTGTAGCAAGGGCATGAAACCTGAAATAATTTAGTGACTTCATATAAGAATTCTACATATGCAAGAAAGTCAAATCGGACCAAAGATAAAACTGAATGTTTCTATCAACTGAAGATTGAGTCACCATTTTATCCTAATTGTTTGGTGCAGATTGACCACTTAACTCCTCTTTTGGTTTGGAATGAATTGGTGCATTATGCTTTCTATAGTTGAATCACGCCTCAAAAGCTATCCTTTTCTGTTAGTTAGAGAAAAAAATGGTATCCCACATAATGCTTCAATTTGTTTATCTTTGTGGTTACATGTCAATGTCCCTCTGTCATGCCATATAGAAGTACTGTTAGTTTGAACAGGTGCAAAGATTCAATTTAACAAACATCAAAGGCTTTCCTAGTCTCAATTTCCATAGCTCCTCATTCGTGTCTTAATTTCCCCAGATATTTAGGAACTCTGCTGTTTAAATTATTATTATTGTTTCAGTGTAGATATGCTTCTGAGCGATGGGTTCAATGATGTAGAATATATTTCTCTCATTTTGCGTAGTATTGATTACTCCATTTCTTGTGTAAGGTGGGCATTGGAGGCACATTAAAGATATTACCAAGTCTTGTTTAGTTTATTCAATTTACTACGATAGTATTATAGT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| External Link(s) |
