BGIOSGA020039
| Gene Name |
BGIOSGA020039 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020039, complete gene. |
| LocusTag |
P0486C01.11 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020039-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020039-PA |
| Length |
4051 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:24741110..24745160 |
| Sequence Coding Region |
24741110..24741219,24741514..24741643,24742021..24742551,24743087..24743194,24743362..24743907 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:24741110..24745160 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAAGGGGCTCGCGACCCGGTGCGCGGAGGCCGAGCGGGGCGTGGCGGTCGCGCTCGAGGCGTTCCCCTGCGACCTCCAGCAGCAGCTCGACCAGTTCATGGACGGAAGGATTGATGGTAGCATCCTAAAGTTGTACACGTTGCACTGGCCACAAGACCGGTGGGAGGAGTATGAACCTCTTCTGAATTATTGCCGTGATAATGGAATTAAGCTTATTGCTTGCGGAACTCCACTTGAGGTGAAAAGAACTGTCCAAGCAGATGGGATTAGAGGCCTTTCAAAGGCAGAAAGACAAGAATATGCCCCTCCAGCAGGCTCTGGCTTCATCTCTGGCTTTTCATCTATCTCAGGCCGGTCATTGATAGACAAAATTTCATCAGCTCGTGATTCTCCTTTTGGTCCTACCTCATATTTATCAGCACAGGCAAGAGTAGTTGATGATTATACCATGTCACAAATTATTCTGAAAGAGCTTAATGGCGGGGATACTTCAAGGATGCTAATTGTTATAACGGGTGCAAGCCATGTTATTTATGGGTCACGAGGAATCGGTGTTCCTGCCAGAGTATCTAAAAAGATGCCAAAGAAAGACCAAGTTGTTGTACTACTTGATCCTGAGAGACAAAGCATAAGGAGGGAAGGTGAAATCCCGGTTGCTGACTTCTTATGGTATTCAGCAGCTAAACCTTGCAGTAGAAACTGCTTTGACCGTGCTGAAATTGCACGAGTTATGAATGCTGCTGGTAGGAGACCTGAAGCTTTGCCTCAGGATCTTCAGAAAGGAATAGATCTTGGTGTAGTTTCTCCTGAGATACTGCAGAACTTTTTCGACCTTGAGAAATACCCTGTTATGTCTGAACTGATTCACAGATTCCAAGGTTTCCGTGAAAGATTGCTGGCAGACCCCAAATTCCTTCAAAGGTTGGCTATTGAAGAAGCTATATCAATAACGACCACTCTATTAGCACAGTACGAAAGACGGAAAGGGCGATTTTTCGAAGAAATTGATTATGTACTCACCGATACAATTAGAGGCTCTGTGGTTGATTTCTTTACAGTGTGGCTTCCTGCTCCTACTATTTCAGTCCTTTCTTATGCTGATGATGGTTCTGGTGAGAGTTTGGAGTTCGTCAAAGGCCTTTTAGGATCATTGCCAGATAATGCATTCCAAAAGAATGTATTGGGTCAAAATTGGAATATGAAGCAGAGAGTTGCAGCAGTGTTAGTTGGTGGTTTGAAACTTGCTAGCGTTGGGTTTATTTCTAGTGTGGGGGCTGGAGCTTCCTCGGATCTCCTGTATGCTGCTCGAGGTGTGCTGAAATCTTCAGTGAATGCAGAAGCAGGACGGAAGAGATCTCCTATTTGGAAGTCAGCAGCTGTTTATAGTTGCTTTCTTGGAACGTCAGCAAACTTGCGGTATCAGATCATTGCTGGTTTAGTGGAGCATCGGCTAGGAGAGAGTCTAGCTACTAGCTACAATCAGCCACTTCTTGCTAGTTTGTTGTCCTTTGTGGCAAGGACAGTGAACTCATACTGGGGAACACAGCAATGGGTTGATCTTGCGAGATATACTGGACTACAAAAAACCAAGGAAGTTCCTCCTGTTGAGGCCACAGCACCACCTGCTGAAACGTCACAGTTAGCCACACCGCCCGCTGAAACATCACAGTTAGCCACACCACCCGCTGAAACATCACAGTTAGAGGATGGTAGAACAGAAGTACAAAATTTGGATGACAACAGCAACCAATCAAGTGGTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKGLATRCAEAERGVAVALEAFPCDLQQQLDQFMDGRIDGSILKLYTLHWPQDRWEEYEPLLNYCRDNGIKLIACGTPLEVKRTVQADGIRGLSKAERQEYAPPAGSGFISGFSSISGRSLIDKISSARDSPFGPTSYLSAQARVVDDYTMSQIILKELNGGDTSRMLIVITGASHVIYGSRGIGVPARVSKKMPKKDQVVVLLDPERQSIRREGEIPVADFLWYSAAKPCSRNCFDRAEIARVMNAAGRRPEALPQDLQKGIDLGVVSPEILQNFFDLEKYPVMSELIHRFQGFRERLLADPKFLQRLAIEEAISITTTLLAQYERRKGRFFEEIDYVLTDTIRGSVVDFFTVWLPAPTISVLSYADDGSGESLEFVKGLLGSLPDNAFQKNVLGQNWNMKQRVAAVLVGGLKLASVGFISSVGAGASSDLLYAARGVLKSSVNAEAGRKRSPIWKSAAVYSCFLGTSANLRYQIIAGLVEHRLGESLATSYNQPLLASLLSFVARTVNSYWGTQQWVDLARYTGLQKTKEVPPVEATAPPAETSQLATPPAETSQLATPPAETSQLEDGRTEVQNLDDNSNQSSG</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..110#405..534#912..1442#1978..2085#2253..2798#3299..3421#3836..4051#ATGAAGGGGCTCGCGACCCGGTGCGCGGAGGCCGAGCGGGGCGTGGCGGTCGCGCTCGAGGCGTTCCCCTGCGACCTCCAGCAGCAGCTCGACCAGTTCATGGACGGAAGGTTCTCCCTCTCCTCTGTGTTGTTTCACTTCAGTTATCCGAACACTTGCTTGGGAGAACAAAATTTTCCTGTTTACTTTCTGTAGATGAATCCATGTTGTGAGTTGTGACGCATTGATAACTCGATATGTCATTTTATGGAATAAAATAATATCATAGGCGGCACATTGGATTTCAATGCAGACCATGTTTAGTTCGAGCCTAATAGCGATTCCATGTTTGATGTCGTAAATGCATTTGTTCAGTAACAAAGATTTCCTTTCAACAGATTTTGACAAGCTTATGCTTTATCCAGGATTGATGGTAGCATCCTAAAGTTGTACACGTTGCACTGGCCACAAGACCGGTGGGAGGAGTATGAACCTCTTCTGAATTATTGCCGTGATAATGGAATTAAGCTTATTGCTTGCGGAACTCCACTTGAGGTGATTGATAGCTTCTACTAGTTGATGAACTTAGATATTCAATGCCATGCTTTACCAGTGATTTAAGTTGTTGAATGCTTGATGCCTGCAAAGTATTTCCCTCAATACATGTGTCTTGGAAGTTGAAATTAGATTTTGGTGGTTCACATATCAATTTTCCTGCCACGCACAAGAAAATCTCTTTGCAGCTTGTTACATATAATTGCTTTTCATGATTAGTTATAGTGTGGTATGAACTAATGGAACAATCTCACTCTGCAGAATCAAGATACAACTTTCTTAATGTTGCATTCTATTGAATTTTAGGCTTATTATTTGTATACCTCCAAGTTCTATCACAGCATACTTGTACAATATTATGCTTCTTTCTTGAGCAGGTGAAAAGAACTGTCCAAGCAGATGGGATTAGAGGCCTTTCAAAGGCAGAAAGACAAGAATATGCCCCTCCAGCAGGCTCTGGCTTCATCTCTGGCTTTTCATCTATCTCAGGCCGGTCATTGATAGACAAAATTTCATCAGCTCGTGATTCTCCTTTTGGTCCTACCTCATATTTATCAGCACAGGCAAGAGTAGTTGATGATTATACCATGTCACAAATTATTCTGAAAGAGCTTAATGGCGGGGATACTTCAAGGATGCTAATTGTTATAACGGGTGCAAGCCATGTTATTTATGGGTCACGAGGAATCGGTGTTCCTGCCAGAGTATCTAAAAAGATGCCAAAGAAAGACCAAGTTGTTGTACTACTTGATCCTGAGAGACAAAGCATAAGGAGGGAAGGTGAAATCCCGGTTGCTGACTTCTTATGGTATTCAGCAGCTAAACCTTGCAGTAGAAACTGCTTTGACCGTGCTGAAATTGCACGAGTTATGAATGCTGCTGGTAGGAGACCTGAAGCTTTGCCTCAGGTTTGCTGCTTGATCTTCGTTTTAGTCCATTGCTTGTTAACTTCATGTCGTGATAGACCTTTGAGAAAAATCTGTAAAATCGTGTATTTAGTGAAGGTAACCATGAACAGGCTCTTCTAGATATTGCTGCCCTACTATCTTCAGGAGAAGAAATATTGAATGAGTAATACTGAGCAAGATTTGACAAGAAACCTTCAGATTACCTAAATATCTTGTGTTGATTTGTATTAAGCTTTTTATTCTGGTTTTCGAGTTCCAGAAATGTGCCCCAGAGTAGTACAGGTAGCACAATAAAACCTAAGCCTCTAGCATTTTCTGAACCCTGGCTGTGACACAGATTAGCTAATAAAATGCATCACATTAGTCAATATGCCCAGTGCAGTAACATCTTTTTCACATGACCCAAAAAATTCTTGTAAGTCATAGAGCAGGAGCTTTCTTCTGTGGCCAAAATGTTTCTATACAATGGTAAGCATCATTTTTTAGTACTAGAAGTCTGGCTAATGGAACTCTTGCGTTTTGCTGGAAATTGCAGGATCTTCAGAAAGGAATAGATCTTGGTGTAGTTTCTCCTGAGATACTGCAGAACTTTTTCGACCTTGAGAAATACCCTGTTATGTCTGAACTGATTCACAGATTCCAAGTAAGAAACTGCTCTATTATTTTCGTTTTACTCCTTAGACCTTATCAGTTCATTTAATCTATGCTTCTGAATAATTCTCCTTGAAACATATGCTTGCATTAACTTAATATCTGTACATGATTTCTGCATATGGGACTCCATGTAAATAAATAAAATAAATTCCTCAGGGTTTCCGTGAAAGATTGCTGGCAGACCCCAAATTCCTTCAAAGGTTGGCTATTGAAGAAGCTATATCAATAACGACCACTCTATTAGCACAGTACGAAAGACGGAAAGGGCGATTTTTCGAAGAAATTGATTATGTACTCACCGATACAATTAGAGGCTCTGTGGTTGATTTCTTTACAGTGTGGCTTCCTGCTCCTACTATTTCAGTCCTTTCTTATGCTGATGATGGTTCTGGTGAGAGTTTGGAGTTCGTCAAAGGCCTTTTAGGATCATTGCCAGATAATGCATTCCAAAAGAATGTATTGGGTCAAAATTGGAATATGAAGCAGAGAGTTGCAGCAGTGTTAGTTGGTGGTTTGAAACTTGCTAGCGTTGGGTTTATTTCTAGTGTGGGGGCTGGAGCTTCCTCGGATCTCCTGTATGCTGCTCGAGGTGTGCTGAAATCTTCAGTGAATGCAGAAGCAGGACGGAAGAGATCTCCTATTTGGAAGTCAGCAGCTGTTTATAGTTGCTTTCTTGGAACGTCAGCAAACTTGCGGTATCAGGTAACTTTTCCTATTTTCAATCGAGGGACTTGACGGTTTTTGTTGCTAAGTTGCATGAGCAACTGTATGGTACTATGTTACCAAGCATAACTAGTAGCAAGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCAGAAATTCGTAGTACAATTATTTTGCCTTACACATCTTCGATTGTTCTTTAGGAGGGAATCCTCAGAAATTCCCCAAAAGACTGATGGTGCCAGTGTAAGGAAAACTTCCTTTTGGTTACACGATGGTGCCATATAGCCTGTTTTTATTAGAGCACAGGGTTGTCGATTTGTCTTTTAACACAGAGAATACAATTTCCCCTATGTATTCTTATCTTTTTCCACTGCAACCATAGTTCACTGAAATATTCACAATCCATAACATGGCCTAATGCAGCAACCTTTTAACCTAGGGAACTATTTACTCAATTCTTTTTTAGCATTTCTTTTTTTTTGTTTGGTACAGATTATCTGAGTTTCTCTAACAATTGTGTTTCAGATCATTGCTGGTTTAGTGGAGCATCGGCTAGGAGAGAGTCTAGCTACTAGCTACAATCAGCCACTTCTTGCTAGTTTGTTGTCCTTTGTGGCAAGGACAGTGAACTCATACTGGGGAACACAGGTTGAGCATTCTCTGCACATTTCTAGTTATATGTTTGTGTTGGTAGCATAGTGCAGACTCAAGATGTTTAGATCACTTTAGACTAAAGAACTCTTCAGGGAATCTGGCTATGAGTAATGGCATTGCACTTTCCCATCCTACATCCCGATTTATATTGTTTATTTAATTCAATCAATGGTCACAGGAACCTTAACATTCACATACATCCATTAAAGCTTTACTGCTATTAAAGGAATATTTTAGTTGAGCTTTACCTCGGAGGCTTCAAGCAGCTTTCCTATGATAATTTACGCATTTAAACTCCTTAATATATTCATAGTGCTTTTATGGTTTTGAAGCTTATATTTTACACAAGATAGGAGCTTACAGTAAACCTATCCCTTCTCTCCTTACTGGTTATTCTGTTTGGTGCAGCAATGGGTTGATCTTGCGAGATATACTGGACTACAAAAAACCAAGGAAGTTCCTCCTGTTGAGGCCACAGCACCACCTGCTGAAACGTCACAGTTAGCCACACCGCCCGCTGAAACATCACAGTTAGCCACACCACCCGCTGAAACATCACAGTTAGAGGATGGTAGAACAGAAGTACAAAATTTGGATGACAACAGCAACCAATCAAGTGGTTGA</dnaseqindica> |
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