BGIOSGA020320
| Gene Name |
BGIOSGA020320 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020320, complete gene. |
| LocusTag |
OSJNBA0079H23.4 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020320-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020320-PA |
| Length |
8063 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:28664213..28672275 |
| Sequence Coding Region |
28664213..28664482,28665515..28665674,28666280..28666329,28666743..28666937,28667014..28667363 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:28664213..28672275 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACCCCGTTGGCCGACGAGGGCTCGATCGCCGCCGCGGTGATGCCGCGCTCGCCTTCTCCACCGGCCGCCGCCGCGGGGTCGGCGGCCGAGGCGCCGATGCTGATATTCGTCTACTTCCACAAGGCGATCCGCGCGGAGCTGGAGAGGCTGCACGCCGCGGCCGTGCGCCTCGCCACGGAGCGGTCCGGCGACGTGGGGGAGCTCGAGAGGCGGTGCCGCTTCCTCTTCTCCGTCTACAGGCACCACTGCGACGCCGAGGACGCGGTTATCTTTCCAGCACTTGATATTCGAGTGAAAAATGTAGCAGGCACGTATTCCCTTGAACATAAGGGGGAAAATGATCTGTTTGCACACCTGTTCTCTCTGTTAAAGCTTGATGTGCGGAATGATGATGGTCTTCGGAGGGAACTCGCGTCCTGTACAGGCTTTGTAATCCAGAAGCCAACTGCAGAATGCTTGAGCATATATAGGCTGGTCTTCCCACTGCTCATTAAGAAGTTTTCACATGAAGAGCAAGCTGATTTAGTCTGGCAATTCTTATGCAGCATCCCTGTCAATATGATGGCAGAGTTCCTTCCATGGCTTGCTACTTCTGTTTCATCTGATGAGCACCAAGATATTCTTAACTGCTTACATAAAATAGTTCCGGACGAGAAACTTCTCCAACAGGTTGTATTTGCGTGGATTGGAGGGGAAGCAGTGAAAACAATATCACACGATTTTTGTAGTCCTTGTTCAAAAAGCAATGTTAGATGCAAGGATGCTATTGATCAAACAGACAAGTATGGATGCTCACATGAGCACTTTAAAACTGGAAAGAGAAAGCGTGCAGAATCTAGTTATGGTCAGCTTGTTATGCATCCAATAGATGAGATTTTGTGTTGGCACAATGCTATCCGAAAAGAATTGAGCGATATAGTAGAAGAAACAAGAAGGATCCAACAATCTGGGGACTTCTCGGATATATCAGACTTTAATGTGAAACTTCAATTTATTGCGGATGTGTGCATCTTCCACAGTATTGCAGAGGATCAGGTTATATTTCCAGCAGTCAACGATCAAGTGTCCTTTGAGCAGGAGCACGCTGAAGAAGAACGGCGGTTTAATAAATTTAGATGTTTAATTGAACAAATCCAAATAACAGGAGCCAGATCAACAGCAGTGGATTTTTACTCTGAGCTATGTTCACAAGCTGATCAGATAATGGAGAAAATCGAGAGGCACTTCAAAAATGAGGAAACAAAGGTACTTCCTCAAGCTAGGATTCATTTTTCATCAGAGAAACAAAGGGAACTTTTATATAAGAGTCTCTGTGTCATACCGTTGAAGTTATTGGAGCGTGTTTTACCGTGGTTTGTATCGAAGCTGAATGATCAGGATGCAGAAGCTTTTCTTCAGAATATGTTTTTGGCAGCACCTTCCTCTGAAGCTGCATTGGTCACTCTTCTCTCTGGTTGGGCATGCAAAGGTCGCTCAAAGGGCACCTCTAACTCTGGAAAATTCATATGCTTGACACCAAGGGCACTGAGCAGCCCATTGGATGAAAATGGGTTTAAAGACTGCCAGTTATGTCCATGTTCTTTACAATCAGATATTTGTTCTAGGCCAGCCAAGAAATGGAATGACACAGAATCTAGTAACATAAGCAACTGCTCACAAACGGCTGATATAGCATTGACATGTAAAAACAGTCCTTGTCACATTCCTGGGTTAAGGGTAGAAATTAGCAATCTTGCTGTCAATTCGTTTGCTTCTGCAGAGTCCTTCCGATCGCTGTCTCTCAATTATTCTGCTCCTTCATTGTATTCAAGTCTTTTTTCATGGGAGACAGATGCAGCCTTTTCTGGCCCAGATAACATTTCAAGGCCAATTGACACAATATTCAAATTTCATAAGGCGATTCGCAAAGATTTGGAGTTCTTAGATGTGGAATCTAGAAAGCTCATAGATGGGGATGAATCTTCCCTTCGCCAATTCATCGGAAGGTTTCGTTTACTGTGGGGTCTTTATAGAGCACACAGCAATGCTGAAGATGAAATTGTATTTCCTGCTCTTGAATCGAAAGAGACACTGCACAATGTCAGCCACTCATATACTCTTGACCACAAGCAGGAAGAAGAATTATTTAAAGATATATCCACTATTCTTTTTGAGCTTTCACAATTGCATGCTGATTTGAAGCATCCTCTTGGTGGTGCTGATGCAGTTGGAGCGAACCACATTCATCCATATAATAGGATCGATTGGTCCAAAAAGAATAATGAACTTTTGACAAAGCTTCAAGGAATGTGCAAGTCTATCCGGGTTACTCTGTCTAATCATGTCCATAGAGAAGAACTTGAATTGTGGCCACTATTTGATAAACATTTTTCTGTAGAGGAGCAGGATAAGATTGTAGGCCGTATAATTGGAAGTACAGGAGCTGAGGTTCTGCAGTCAATGTTACCCTGGGTTACATCAGCACTTAGTCTAGATGAACAGAACAATATGCTGGACACATGGAGGCAAGTAACTAAGAATACAATGTTTGATGAATGGCTAAATGAATGGTGGAAGAGATCACCTACTTCTTCTGGCCCTTCAAGCGATGCCTCCCATCCAGAAGAAGATCATTTCCAGGAAAAGTTCGATCAGAGTGAACAGATGTTTAAGCCTGGTTGGAAGGACATCTTCCGAATGAACCAGAGTGAGCTTGAGGCTGAGATACGAAAGGTTTCTCGTGATTCTACTCTTGACCCAAGGAGGAAGGCTTATCTAATCCAAAATCTCATGACCAGCCGCTGGATAGCTGCTCAGCAGAAATCGCCCCAACCTCAGTCAGAAGATCGCAATGGATGTACAGTATTACCTGGATGTTGTCCTTCATACCGAGATCCAGAGAATCAGATTTTTGGCTGTGAGCATTACAAAAGGAAATGCAAACTTGTTGCTGCATGCTGCAATAAACTGTTCACATGCAGGTTTTGTCATGATAAAGTTAGTGACCATACAATGGAAAGGAAAGCAACGGTGGAAATGATGTGCATGCAATGCCTGAAAGTTCAACCAGTTGGTCCAAATTGCCAGACCCCTTCTTGCAATGGGCTATCCATGGCAAAGTATTATTGCAGCGTATGCAAGTTTTTTGACGATGAAAGGAGTGTGTACCATTGCCCCTTTTGCAATTTGTGTCGTCTTGGGCAAGGATTGGGTATTGATTTTTTCCATTGCATGAAGTGCAACTGTTGCCTGGGCATGAAATTGATAGAGCATAAATGTCGAGAAAAGATGCTAGAGATGAATTGCCCAATCTGCTGCGACTTCCTATTTACATCGAGTGCAGCAGTTAAAGGTCTACCTTGTGGCCATTTCATGCATTCAGCTTGCTTTCAGGCGTACACCTGTAGTCACTACACCTGTCCAATCTGCTCTAAATCCTTGGGAGATATGACAGTATACTTTGGCATGCTTGATGGCTTGCTGGCCGCCGAAGAGCTTCCTGAGGAATACCGGGACCGGTGCCAGGATATACTTTGTAACGATTGTGAAAGAAAAGGAAGGTCTCGGTTCCATTGGCTGTATCACAAATGCGGCTTCTGCGGTTCATATAACACTAGAGTTATCAAGATTGATAGAGCTGATTGTTCAACATCAGATTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATPLADEGSIAAAVMPRSPSPPAAAAGSAAEAPMLIFVYFHKAIRAELERLHAAAVRLATERSGDVGELERRCRFLFSVYRHHCDAEDAVIFPALDIRVKNVAGTYSLEHKGENDLFAHLFSLLKLDVRNDDGLRRELASCTGFVIQKPTAECLSIYRLVFPLLIKKFSHEEQADLVWQFLCSIPVNMMAEFLPWLATSVSSDEHQDILNCLHKIVPDEKLLQQVVFAWIGGEAVKTISHDFCSPCSKSNVRCKDAIDQTDKYGCSHEHFKTGKRKRAESSYGQLVMHPIDEILCWHNAIRKELSDIVEETRRIQQSGDFSDISDFNVKLQFIADVCIFHSIAEDQVIFPAVNDQVSFEQEHAEEERRFNKFRCLIEQIQITGARSTAVDFYSELCSQADQIMEKIERHFKNEETKVLPQARIHFSSEKQRELLYKSLCVIPLKLLERVLPWFVSKLNDQDAEAFLQNMFLAAPSSEAALVTLLSGWACKGRSKGTSNSGKFICLTPRALSSPLDENGFKDCQLCPCSLQSDICSRPAKKWNDTESSNISNCSQTADIALTCKNSPCHIPGLRVEISNLAVNSFASAESFRSLSLNYSAPSLYSSLFSWETDAAFSGPDNISRPIDTIFKFHKAIRKDLEFLDVESRKLIDGDESSLRQFIGRFRLLWGLYRAHSNAEDEIVFPALESKETLHNVSHSYTLDHKQEEELFKDISTILFELSQLHADLKHPLGGADAVGANHIHPYNRIDWSKKNNELLTKLQGMCKSIRVTLSNHVHREELELWPLFDKHFSVEEQDKIVGRIIGSTGAEVLQSMLPWVTSALSLDEQNNMLDTWRQVTKNTMFDEWLNEWWKRSPTSSGPSSDASHPEEDHFQEKFDQSEQMFKPGWKDIFRMNQSELEAEIRKVSRDSTLDPRRKAYLIQNLMTSRWIAAQQKSPQPQSEDRNGCTVLPGCCPSYRDPENQIFGCEHYKRKCKLVAACCNKLFTCRFCHDKVSDHTMERKATVEMMCMQCLKVQPVGPNCQTPSCNGLSMAKYYCSVCKFFDDERSVYHCPFCNLCRLGQGLGIDFFHCMKCNCCLGMKLIEHKCREKMLEMNCPICCDFLFTSSAAVKGLPCGHFMHSACFQAYTCSHYTCPICSKSLGDMTVYFGMLDGLLAAEELPEEYRDRCQDILCNDCERKGRSRFHWLYHKCGFCGSYNTRVIKIDRADCSTSD</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..270#1303..1462#2068..2117#2531..2725#2802..3151#3509..3734#3837..4005#4113..5303#5960..6131#6247..6468#6990..7127#7234..7468#7559..7618#7780..7851#7929..8063#ATGGCGACCCCGTTGGCCGACGAGGGCTCGATCGCCGCCGCGGTGATGCCGCGCTCGCCTTCTCCACCGGCCGCCGCCGCGGGGTCGGCGGCCGAGGCGCCGATGCTGATATTCGTCTACTTCCACAAGGCGATCCGCGCGGAGCTGGAGAGGCTGCACGCCGCGGCCGTGCGCCTCGCCACGGAGCGGTCCGGCGACGTGGGGGAGCTCGAGAGGCGGTGCCGCTTCCTCTTCTCCGTCTACAGGCACCACTGCGACGCCGAGGACGCGGTACGTACGGGGTGAATGCCGCCGCCGCGGCCGTAGCCCCTCTCTTCCTCTCTCCTCTCTCGCGCGGGATCGCTGTTCCGGCGTTGTTTATGGTAGAATTGCGGGGAGTGACACCATGCGGTGTGTGTTATGCGTGCAGAATTGGGTAGTGTGAGGCTCTGGGTTCGGAAATCGTGGCATTGGTTGGAGGATTTGGGTTGGATTTGTGTTGAATTGAGGTGAAACCAACATTATCTCAAAATGAATGAAGTTTGCAGGCATGATTGGTTGGTTGTACAACTTAGTTGTGGACACACTGTTATGTTCATGTTGATCTTCTGAGATGCATTTGCATCTACTTAGCCATGTGATTGCGAACAGTATACTGCATTGTTTTTTTTATCCTTTTGGTGATGTCCCCATCAGTGGCCTATACTGTCTTAGACTGAATATGCAAAAGTACATGTTAAAATTTCTGAGTCCTGAACATTATGCAATTATGCATCAAAGTCACAGGGTTTCATCTCGGATTACATCGTTAGCTTATGTTAACCGGACTACTGTAGCCAATATGAACTGCCTACTCATGCAAAGGGTAAATTCTACTCTATTTAAGTTCCTTCAGATTAGTGGCTGAGAGTCAGGAACCAATGAAGGATCCCATCCATTTTTTATTGAAGACTATTCCGTTCCGAACATGAAAAGTTGAATATTGTTCTGCACTGAATGAAAATGAATTTTGCTGGAGTTCACGACAGTTGCTGTGGTATTTCATAGGTAAGGTAGGGTATTTTAGTTCTCTTTGCATTTATGTTGTGCCAGTAGTAAGCTTTTTGGTTCTGCACTGCAAAACTCTTCTATACATAAAGGACTGCACCAGCGTCGTGTTGATTGTTTAGAACATAACACTTACTAGTTTGACTTCTAGCTAATTCTCCCCCAAACCTATAGATTGATATATTTGTGAAACAGTTCCAGACCTTTCTCATAATTCATGATATATAACTATATTGAACGTTTGGGGGGGCATAAGATCTGTTTTTTTGATTGCAGGTTATCTTTCCAGCACTTGATATTCGAGTGAAAAATGTAGCAGGCACGTATTCCCTTGAACATAAGGGGGAAAATGATCTGTTTGCACACCTGTTCTCTCTGTTAAAGCTTGATGTGCGGAATGATGATGGTCTTCGGAGGGAACTCGCGTCCTGTACAGGTGCAATTCAAACGTTTATAACCCAACATATGTCCAAGGAAGAAGAGCAGGTTTCCTTTTCCCCTGTTTACTCTGTTAATTCCTTTGTATGTCATTTGTCGAAATAAGACCAACATGCCTTTCTATTTCTCATGAGCAACAATATGAGAGGCGCTGACATGATGCAATAGTCTAATTGGGTGCACTAGAGTTCTATATTAGTATATTGAAATTTATCATATCAAGCTGGCAACTGTTTGATAAAAGTATTTGGAATGATGCTTCTGGATCTATTTTTTATTTGATATATTTAATCTTAGAGATAAGGGGCTACATAAGAGAAGAATATATAGCATATGTAGTTATGAAGAGTACAGTACAATACAGACCATATAAAGAGCAACTTCATTTCTACATTTGCTTGAAGGTGAGACCCTGTAGAAAGTTATTTCTTACCAATGTTATGCGCTTCTGCTTATTGGAAGTCTGCTATCTATCCACTTCACAAGTACTTGCTTGCTACTTGGTACTCACCATGCAAGTAGAACGAACTATAGTGTTGACTCCAATTATTTATCTACTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAAGGCTTTGTAATCCAGAAGCCAACTGCAGAATGCTTGAGCATATATAGGCTGGTATTTTTTTATGCTCACCAATTTCTGTGTTCTATATATGACACGGAGCTATCTTGTTATGTGTCTTCACTTGCATTTACTGTTCAAAACTTGGCTTTAAGCAGTATAAGGACATTGAGCTTGCATTGTATATAAGCTTTGATTAAAGTGTTTTTAAGTTTTGATAGCCTAGAGAACTAAATGATAAGCTAAACTATAAAGATCAACATTGGCCGATGATAGTTTCTCAAATGCTGCAGCAATTAATTTAGACCATGTACTTGATGACAATTCCTCATGCACTTTTTAAAATCATACGTATATTATTAATCAGTATATTGGTATATTATGTGTCCTCTATCATTATCAGTTCCTCTCAGCATAGGGCGTACAGCTATACACTGTTGGTGTCTAATCATTTCTGAATGTTTCAGGTCTTCCCACTGCTCATTAAGAAGTTTTCACATGAAGAGCAAGCTGATTTAGTCTGGCAATTCTTATGCAGCATCCCTGTCAATATGATGGCAGAGTTCCTTCCATGGCTTGCTACTTCTGTTTCATCTGATGAGCACCAAGATATTCTTAACTGCTTACATAAAATAGTTCCGGACGAGAAACTTCTCCAACAGGTCTCGTGTTGATGCATCGTTTTCTATCAATAATGTTGCCATGCTTTACTTAACTATAGTTTCGAAATTTGTGAAGGTTGTATTTGCGTGGATTGGAGGGGAAGCAGTGAAAACAATATCACACGATTTTTGTAGTCCTTGTTCAAAAAGCAATGTTAGATGCAAGGATGCTATTGATCAAACAGACAAGTATGGATGCTCACATGAGCACTTTAAAACTGGAAAGAGAAAGCGTGCAGAATCTAGTTATGGTCAGCTTGTTATGCATCCAATAGATGAGATTTTGTGTTGGCACAATGCTATCCGAAAAGAATTGAGCGATATAGTAGAAGAAACAAGAAGGATCCAACAATCTGGGGACTTCTCGGATATATCAGACTTTAATGTGAAACTTCAATTTATTGCGGATGTGTGCATCTTCCACAGGTATGTGGCTCTGAATCTCAACTCATGCGCCACTTTGTTTCAAAAGCTTGCATGTAAACACTTTCTTATTCAATGTGCAACATAAGAATTGATTAGCTCTTGTTTCTATCATGTTAAACACATTTACTTCTTCAGTTGTACATTACACAGCTTAGAAGAACATGAGCAATCGAGATACTGGGAAGCACAATAAATGTGTGGTACCAGTTCCCTGCTATAACATATTCTTTGTTTTATGTGGCTAATAGTAGAGCTTACATCTTCTTTTTCAAAAGAACTGGAATTTCTAGAATTGTGGCACAAATATTGATTTTGCCAAGCATAGTGGCCTAGCCGATTTTATATGTTGATCTGCAGTATTGCAGAGGATCAGGTTATATTTCCAGCAGTCAACGATCAAGTGTCCTTTGAGCAGGAGCACGCTGAAGAAGAACGGCGGTTTAATAAATTTAGATGTTTAATTGAACAAATCCAAATAACAGGAGCCAGATCAACAGCAGTGGATTTTTACTCTGAGCTATGTTCACAAGCTGATCAGATAATGGAGAAAATCGAGAGGCACTTCAAAAATGAGGAAACAAAGGTTAGTATTTTAGACATAAACTCTGTAGTTAAGGAGTGGAATGTTGTCTACTTGGGTCACGTGACCAATGTAGTCTAACATGTAATTCATCTAAATATCCAGGTACTTCCTCAAGCTAGGATTCATTTTTCATCAGAGAAACAAAGGGAACTTTTATATAAGAGTCTCTGTGTCATACCGTTGAAGTTATTGGAGCGTGTTTTACCGTGGTTTGTATCGAAGCTGAATGATCAGGATGCAGAAGCTTTTCTTCAGAATATGTTTTTGGCAGGTTATTTTCCAAGTTTACTATTTTCTTCTTTAAAACACCAGTTTTTTTTTTTCCAAAAAAAAAAAATCTCAACATTTTACTGTTTACTAATAAGTTGAACTGAACAGCACCTTCCTCTGAAGCTGCATTGGTCACTCTTCTCTCTGGTTGGGCATGCAAAGGTCGCTCAAAGGGCACCTCTAACTCTGGAAAATTCATATGCTTGACACCAAGGGCACTGAGCAGCCCATTGGATGAAAATGGGTTTAAAGACTGCCAGTTATGTCCATGTTCTTTACAATCAGATATTTGTTCTAGGCCAGCCAAGAAATGGAATGACACAGAATCTAGTAACATAAGCAACTGCTCACAAACGGCTGATATAGCATTGACATGTAAAAACAGTCCTTGTCACATTCCTGGGTTAAGGGTAGAAATTAGCAATCTTGCTGTCAATTCGTTTGCTTCTGCAGAGTCCTTCCGATCGCTGTCTCTCAATTATTCTGCTCCTTCATTGTATTCAAGTCTTTTTTCATGGGAGACAGATGCAGCCTTTTCTGGCCCAGATAACATTTCAAGGCCAATTGACACAATATTCAAATTTCATAAGGCGATTCGCAAAGATTTGGAGTTCTTAGATGTGGAATCTAGAAAGCTCATAGATGGGGATGAATCTTCCCTTCGCCAATTCATCGGAAGGTTTCGTTTACTGTGGGGTCTTTATAGAGCACACAGCAATGCTGAAGATGAAATTGTATTTCCTGCTCTTGAATCGAAAGAGACACTGCACAATGTCAGCCACTCATATACTCTTGACCACAAGCAGGAAGAAGAATTATTT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