Os12g0110000

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Gene Name

Os12g0110000

Description

Regulatory associated protein of TOR family protein

Version

NM_001072493.1 GI:115486947 GeneID:4351289

Length

7328 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os12g0110000, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:540262..547589

Sequence Coding Region

540969..541310,541447..541531,541683..541768,541843..541941,542041..542180
,542262..542386,542484..542604,542717..543043,543163..543774
,543887..544067,544147..544500,544597..544707,544811..544893
,545233..545335,545468..545546,545629..545773,545871..546025
,546122..546279,546412..546528,546622..546780,546857..546939
,547525..547588

Expression

GEO Profiles:Os12g0110000

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>attagtgttgatccgccggatgtgatcaaaatctccccttgtgcaagaaaggagtgctggatagatccattttctatggcacctccaaaagcccttgaaactattgggaaaacattacactcacaatatgagcgctggcagccaaaggctcgttacaagcttcagctggatccgacattagaggaagttaagaagctatgtaatacttgccgtaaatttgctagaacagagagagtcctttttcattacaatggtcatggtgtaccaaagcctacagctaatggggagatttgggtatttaacaagagttacacacagtatattccgcttcctattactgatcttgattcatggctgaaaacaccctctatatatgtttttgactgctcagcagctggaatgatcgtgaaagcttttctggagcgcctagactggagttctagctcgtctgcatcttcatcgaaggactgcattctccttgcggcctgtgaggcacatcaaactctcccacagagcgcagaatttcctgctgatgtgttcacagcttgcctcaccacacccatcaaaatggcactgcactggttttgtaaccgatcgttactccgtgattccatggaacacaatcttatcgaccaaattcctggaaggcaaaatgaccgcaaaactcttctaggggagttgaactggattttcactgctatcacagacactattgcatggaatgttcttcctcatgatctattccaaagacttttcaggcaggatcttttggttgctagtctctttcgcaacttcttacttgctgagagaatcatgcggtccgcaaattgttccccaatttcataccctttgttgccaccaactcatcagcaccatatgtgggatgcatgggacatggctgcagagatctgcctttctaagcttcctcaattaattgctgatcctaatgcagagtttcagccgagtccatttttcacggagcaattgacagcatttgaagtttggcttgatcatggctctgaagacaagaaacccccagaacagctacctattgttcttcaggttttgcttagtcagtcacacagatttagagcacttgttctgcttggaagatttcttgacatgggaccttgggcagttgatttggctttgtccgttggcatcttcccttatgtacttaaactgcttcaaacaagtgcaatggagttgcgccaaattcttgtgttcatatggacaaaaattctctctcttgataagtcatgccaggttgacttggtgaaagatggagggcatgcatactttatcaggtttcttgacagtttggatgcttacccagagcagcgtgcaatggctgctttcgttttagccgttattgtggatgggcataggattggtcaagaggcttgtgctaatgcagggcttatagatgtctgcctgagacatctgcaacctgaaaatccgaatgatgctcagacagagcctttgctcttgcaatggctttgtttatgccttggcaaactttgggaagatttccctgaggctcagttacttggtctgcaatcaaacgcaccggaaattgttatatgcttattgtcagagcctcaacctgaagtcagagcttctgctgtttttgcacttggaaatcttgtggatattggatctccatcactgaatggagctgacgacgattctgatgatgatgaaaaggtgagagctgaaataaatgttgtccgaagccttctgcagatctcttcagatggtagccctcttgttagatctgaggttgccgtagcgcttacccgctttgcaatggggcacaataaacatatcaaatctgttgccgccgagtactggaaacctcaaaccaattcactgctcaagtcattaccatcgttggctaatattaattcgagcaatgtttacagtcccagcagcttaatacaaggtagcagtggccttgcctcacatattggtcctgttttaagggttggcagtgataacagtgccactgctcgtgatggaagaatctctacgagcagcccgattgcaacaaatagcatcatgcatggttctccacagtcagatgattcttcccaacactctgattcaggcatattactgagagagaatgcaagtaatggtggtctcaactactcaagatcgaggcctattgataatgggatctattcccaatttatagcaactatgtgcaatgttgctaaagatccttacccaagaattgcaagtattgggaaaagggcattgtccctcataggtgttgagcaagtaagcatgagaaacagtagacttagcaatggaggtgcacacccaggagagacatctgtgcccccttcatcaaactttggaatggcacgctcctcttcctggtttgatatgaactctggaaatttctcggtggcctttaggactcctcctgttagtccccctcagcatgactacctcacaggattgcgccgagtgtgctcgatggagttcagaccacatgttttgaactcacctgatggcttagctgatccgcttttaagctccagtgcagcccccagcaacatggggctctatatacttccccaatcattaatttacagatggagttgtggtcacttttctaggccacttctaactggttctgatgataacgaggaagcaaatgctagaagagaagagcgagaacgaattgcaatggattgcattgctaaatgccaacgatcatcttgcaagatgaccagccaaattgctagctgggatacgaggtttgagttgggtacaaaagcatcattgttgttgccattttctcctattgttgttgctgcggatgaaaatgagcaaatacgagtatggaactatgacgatgcgctgccagtgaatacttttgaaaaccacaagttatctgacagaggcctatctaaacttttgctgatcaatgagcttgatgatagcttgttgttagttggctcaagtgatggaaatgtccgcatatggagaaactatactcaaaagggaggacaaaaacttgtaactgctttttcatcagttcaaggctatcgaagtgctggtcgcagtattgtatttgattggcagcaacagtcgggttatctgtatgcatctggtgacatgtcctctatccttgtatgggatcttgacaaggaacaagtcaacaccatccagtcaactgctgatagcgggatttcagctctttctgcatctcaggttcgatgtggccaattcgctgctggttttcttgatgcatctgttaggatatttgacgtgcgtacacctgataggctagtatatacagcaagaccacatgccccaagatcagaaaaggttgttggtataggatttcagcctgggtttgatccctacaagattgtaagtgcatctcaagctggagacattcagttccttgatgttagaagggcatctgaaccctacctcactattgaagcacataggggttcattaacggcattagctgttcatcggcatgccccagttattgcaagcggctcagccaagcagatgatcaaagtgtttagtcttgaaggagaacagttgacaataattcgctaccagccatcttttatgggtcaacgaataggcagcgtaaactgcctttctttccaccgatacaaatcactccttgccgctggtgctggtgataatgctcttgtttctatctacgcggaggacaattaccaagtacgatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>ISVDPPDVIKISPCARKECWIDPFSMAPPKALETIGKTLHSQYE RWQPKARYKLQLDPTLEEVKKLCNTCRKFARTERVLFHYNGHGVPKPTANGEIWVFNK SYTQYIPLPITDLDSWLKTPSIYVFDCSAAGMIVKAFLERLDWSSSSSASSSKDCILL AACEAHQTLPQSAEFPADVFTACLTTPIKMALHWFCNRSLLRDSMEHNLIDQIPGRQN DRKTLLGELNWIFTAITDTIAWNVLPHDLFQRLFRQDLLVASLFRNFLLAERIMRSAN CSPISYPLLPPTHQHHMWDAWDMAAEICLSKLPQLIADPNAEFQPSPFFTEQLTAFEV WLDHGSEDKKPPEQLPIVLQVLLSQSHRFRALVLLGRFLDMGPWAVDLALSVGIFPYV LKLLQTSAMELRQILVFIWTKILSLDKSCQVDLVKDGGHAYFIRFLDSLDAYPEQRAM AAFVLAVIVDGHRIGQEACANAGLIDVCLRHLQPENPNDAQTEPLLLQWLCLCLGKLW EDFPEAQLLGLQSNAPEIVICLLSEPQPEVRASAVFALGNLVDIGSPSLNGADDDSDD DEKVRAEINVVRSLLQISSDGSPLVRSEVAVALTRFAMGHNKHIKSVAAEYWKPQTNS LLKSLPSLANINSSNVYSPSSLIQGSSGLASHIGPVLRVGSDNSATARDGRISTSSPI ATNSIMHGSPQSDDSSQHSDSGILLRENASNGGLNYSRSRPIDNGIYSQFIATMCNVA KDPYPRIASIGKRALSLIGVEQVSMRNSRLSNGGAHPGETSVPPSSNFGMARSSSWFD MNSGNFSVAFRTPPVSPPQHDYLTGLRRVCSMEFRPHVLNSPDGLADPLLSSSAAPSN MGLYILPQSLIYRWSCGHFSRPLLTGSDDNEEANARREERERIAMDCIAKCQRSSCKM TSQIASWDTRFELGTKASLLLPFSPIVVAADENEQIRVWNYDDALPVNTFENHKLSDR GLSKLLLINELDDSLLLVGSSDGNVRIWRNYTQKGGQKLVTAFSSVQGYRSAGRSIVF DWQQQSGYLYASGDMSSILVWDLDKEQVNTIQSTADSGISALSASQVRCGQFAAGFLD ASVRIFDVRTPDRLVYTARPHAPRSEKVVGIGFQPGFDPYKIVSASQAGDIQFLDVRR ASEPYLTIEAHRGSLTALAVHRHAPVIASGSAKQMIKVFSLEGEQLTIIRYQPSFMGQ RIGSVNCLSFHRYKSLLAAGAGDNALVSIYAEDNYQVR</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os12g0110000, RefSeq:Os12g0110000