BGIOSGA024128
| Gene Name |
BGIOSGA024128 |
|---|---|
| Description |
cDNA, clone: J075093E01, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024128, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024128-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024128-PA |
| Length |
4897 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:19858150..19863046 |
| Sequence Coding Region |
19862884..19863046,19861576..19861762,19860911..19861078,19860510..19860545,19859011..19859088 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:19858150..19863046 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGTGACCGACGCCGCCGCGATGGCCGTCGTGAAGGCGGCGCGCCCGGCCTTCCGCGGCGCCCACGACGGGGTCGCCTTCGCCGCCAACGCCGCGTTCCTCGCCGCCGGCTACTCCCTCTGCGCCGTCGGCCCCGCCGCGCTCACCGACCCCCCGCCCTCAGGTGAAGAGGAGGTGGGGATTGATGGTTGGAACAGCATGGATAATTGTTATGCATTTTTGTACATCAAGGAGGAGAGGGGCAAGAAGAAACGGGTATTGGTAAAATGTCTGGTGATCGGTGATGTCCTTGCCATTGATGTCCTGGATCTTGAGGCACAGAATAAAGGCCCTTATAATATCCAGATCAATGTGAAGGATTTCTTCTCCGAGGAGCAGCCAAAGAACTACGGGAACATGTACAAAAACTTTGCAGGCTTAATTGAGACCATGAACTCAAATGCATTGAGCAAATTGGATGAGAAGGATGCTGGTGCTGCCAAGAACCCTGAGGTTGAGACTAGCTCATCAATACACAGATCTGAAAATCCAGGCCTGAGAACTACTGAACCTGGCTTGGTTTATCCTCCAATAGCTCCACTTGGTCATGATGATGCCTTCCCTGGCCCTGGCGCAGGCTTCTATCCTCATAGTGGTATTGGTGGGGGTGGCAGCATGCATGTTGGTCCAAACGATCCACGCTTCTTTCCTTCTAATCCCTTCCCTGTGCCCTTTGGTGGCCCTGGGAGTGTTCCACCGGGTGGTCGTTATGATCCAATTGGTCCACCAGATGTTCCAGGATTTGAACCTTCTCGCTTTGTGAGGCGTCCGAGGCCTCCAGCTGGGACTACTCACCCAGACCTTGAGTTCTTCCAGCCGGGGCCGCAGGGGCCCTTCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVTDAAAMAVVKAARPAFRGAHDGVAFAANAAFLAAGYSLCAVGPAALTDPPPSGEEEVGIDGWNSMDNCYAFLYIKEERGKKKRVLVKCLVIGDVLAIDVLDLEAQNKGPYNIQINVKDFFSEEQPKNYGNMYKNFAGLIETMNSNALSKLDEKDAGAAKNPEVETSSSIHRSENPGLRTTEPGLVYPPIAPLGHDDAFPGPGAGFYPHSGIGGGGSMHVGPNDPRFFPSNPFPVPFGGPGSVPPGGRYDPIGPPDVPGFEPSRFVRRPRPPAGTTHPDLEFFQPGPQGPF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..163#1285..1471#1969..2136#2502..2537#3959..4036#4111..4142#4235..4295#4384..4461#4822..4897#ATGGTGACCGACGCCGCCGCGATGGCCGTCGTGAAGGCGGCGCGCCCGGCCTTCCGCGGCGCCCACGACGGGGTCGCCTTCGCCGCCAACGCCGCGTTCCTCGCCGCCGGCTACTCCCTCTGCGCCGTCGGCCCCGCCGCGCTCACCGACCCCCCGCCCTCAGGTGCGCGCGCGCTCCCTCGCTCCCGCCGCCCCTTCCGCCCTAGCCCTAGGGTTTCCTACTTTCCTTCCTCGTGTGTCGATTAGGTTTTTTTTGCACCTCCCAAGTTTAGAGTTCGCGCGTTTGGGTTTATGGAAATTGGAATACCCAGGTTGGTAGATGTCGATGTGCTACGAGTGGTACTCCGCTGTGTAGAATTAGGGCGTCGTGGTGTAAGGCCTGATTGAATTGGTAGCAATTCTAATGTGCGTGTGATTTTCTTCAGGATAACTTGTCACGGCGAGTTTAATGGGTTCCATGGATTGGATTTCTATAGATTCTAGTGGGTTTTGCATCAGTTCCTTGACTACAACTTAGCACTTACCTGGATCTGCTTATAGTACAGAAATTTTGGACTGGGAAATAGGAATCTCACTGAGTATCTCTGTTTGCTAATGGGTCTCCAAGTGTTTTGTGCATTTCTATGTATAGGATGGCTGTGGTATATACACATATTTAGATGTTCTGAAAACATTTCTCTCCCTTACTATTTCTCTTGTTCCACCATCCCCACTTATCCGATAATTAGTGGATAATGTGGATAGTATGCGTAAAATGCATAGTTTACATACACGTTTACCATAGTTACTCTCTTCTGTATGTTCGTCAGAAAATATAGCAGCTAGTTTAATCGAAGCATTAACTGAGATAAAATTAATACATATATGCAGGTGATTGAAATTTCTTTACCAATACTGCAATCTCAATGTGCGTTTATGTCCACCATAATGTATTTGGTTCCTTTGTTTAAATTCCAAATTCTTGCACTGAAGATTAGGGGTCAGACTGAAGATTTTAGTTCTGTGCTACAGCTTGCAGAGTAGGGGTTAGATAACCAAGGTGTGAAATATTTGGAAGCAAATGCTTTATCATAAATATGGTTTTGTGTATTTGACTCATAATTCTTAAATTCCGAATAATTTTAAGTCTTAGTCAGTCTTCACTAGTTAAATCTTGTTATGTGGTCAGAGAGATGTGACTTTAAGCAAACATCTTACCACCTGCTTGCATTTCATGGTTACGCTCAGTAATTCTCCTGAGTTCTTAGTCTTATAGTAAGTTTTGTATTGTACCTATAACTTTAGGTGAAGAGGAGGTGGGGATTGATGGTTGGAACAGCATGGATAATTGTTATGCATTTTTGTACATCAAGGAGGAGAGGGGCAAGAAGAAACGGGTATTGGTAAAATGTCTGGTGATCGGTGATGTCCTTGCCATTGATGTCCTGGATCTTGAGGCACAGAATAAAGGCCCTTATAATATCCAGATCAAGTATGTTTCAAAGCTGCACCTTCTTGCTTTGTTTTGTACCATACTTATGTTTCTGGTGCGATTTAAGTATGTAAAGAAGCAGAAGCAGTAATCTATTTCCTCCGTCCCAAAATATAAGAATTTCTAGCATTTGAAATTTGTCCCCAAATATAAGGACTTCTAGATATTATTTTGCCCAGCAACCACCCCTCATTTAGTTTTCATCACATCTTATCCCCAACGAGCCCTCATATGATAAGGGGCATCATAATCTTTTCCCTTCATCCTTAGTCTCTCCAAAAAATCCTGAAGTCCTTATATTTTGGGACGGATGGAGTGCAAATAAGTGTAGAACCATTATATGGTTATTAGCAACGAACACTGTCTTGTAATCTCGTATTATGCAGATGCATTATTTTGTTCACTCTGCGATTTGCCAGTTCCATTAAACTGTTCCTTTCTCATCTTGAAGGTTCTGGCTTATTTTTGGGTATCTTACTTTTGTTTCTTGTGTGCAGTGTGAAGGATTTCTTCTCCGAGGAGCAGCCAAAGAACTACGGGAACATGTACAAAAACTTTGCAGGCTTAATTGAGACCATGAACTCAAATGCATTGAGCAAATTGGATGAGAAGGATGCTGGTGCTGCCAAGAACCCTGAGGTTGAGACTAGCTCATCAATACACAGGTAATTGATAATTTTCTATGCTTCCTTTTTGGCAATACTCCCTCTTCTCCAAAACACATGCGTGTGCACGCGCGTGCATATTTTGTTCACGTACATTGGACTAGACGCTACTGTATTGCTTTGGACCTTTGGTCTTAAAACAATAAAATGGGAAACTGGTAATGATATTTCACATCATTAATATAAAATTATGTTATAATCTGAATATTCTTCTAATCTTAGCTGCCTGCTAGTTTAGGAAAATGCTAGTGAAACGTGTCATTGAAAGCTGAAGCTTCTCAAGGGATAAAATAACTTTTAATTAAGTGCCTTAACTGGTTGTCTCCAAGATTTTTTTTTTCTAACATAAGGCACTTGTGTTCCAGATCTGAAAATCCAGGCCTGAGAACTACTGAACCTGGGTATGACCTCAAGACATTTGTATTTCTCCTTTTGCTTTTATATGTGCACATTCTTCATTATTCAGCCCGCCCTTTTTGCTTCTCTCTACATTGTTACATGTTATCAAACTTTACTATATTGTTCCTGCTTTTCCCACAGTTATTAATGGTATTTATACACGGATTAAATTCTGAAAACCATTGGCATATAGATAGAAATGAAGAGCCACAGTAATTCCTTTGCCTTTCTGGAATAGATTGCTAAATTGACCACCAGCAGTGTGATTCCTTTTTTAAGTTGCCACTAGCTGTATTATTTTCTCAAACTATTTTGGACAAGTTAACAACACAATGCTACATTATGTCAGTTAAGATTACAGATATATGAATGTTTGGACCTATTGTGAGCAGAATGCATTTTTAAGGTAGCCATGATTATGACAGATGTATCTGTTATTATTACCAAAATTATCTTAATCCATTGCCTTCTCATGTACCATCAAATTTTAATGTAGTCAATTCTAAGGTCATGTTGCCATTTTATGTCTTGTATTTCTTTCCTTGGTCATTTCTGTGATGCTTGTCTACGCAAATAATGAAAATAACATGAAAATATATGTTTGTAAATATTTAAATAAGGTGTGTGGTGTGCCTATTTTAGCACTGAACCAACATGTTGAGGCCCATATAGTGGTAGTAATGTGTACTCTGCAATTTTTCTCGCCCAAAATATCACAATTATAAGCTTATTTTCTAGGTTTCATTGAATGAATCATTGTTGGTTCCTTATATGAACTTGTCTCTTTTGCCGGGTCGGCGGAAGAATGCTGACCAAATTTCATTAAGATTGGGAGTATAATACATGTATCCCGACATTAAACTGTCGAGTCAAGGCAAAAGCTTTGAAACAAAGCGAGAAAAAGCAAAGGGGAAAACTATTTACAGAAGCAGCAACTCAAAGGTCTACTCCTCACTAAACTGAAAAATACTGGCAGCTCTCCAGACCATCACATCTTCTTTAATGTCTGCAACCAGCGACTCCACAGTTTTCTCCTTTTGATCGAAGACTTGAGCATTTCGTTCTTTCCAAATCCGCCAGCAAACCAACATGAAGGAGTCAATATATGTTTATATGAACTTGTCTCTTCAGTGCATTACATTGACTGAACAAGTTGTGTTTTTGTTGAAAGTCAACTAAACATAAGCCAGAGCTGAGTAATTATTGATGGAATTTTTTGATTCATCATTAACCTACTGATATATATGCACTGATATGCCATGAACATCGAAGTTCATCATAGCATTAAAGAGATGTAAAAAAAATGTACATATGCACTTAATAATTGTATTGCTATGTGTGTGCAAATTTAGTAAAAAGAGTAATTAGAGTGGTTTCATGATAGTTAATTAGTTGTTCTTTCTTGTGAATTCTGTTGTTACAGCTTGGTTTATCCTCCAATAGCTCCACTTGGTCATGATGATGCCTTCCCTGGCCCTGGCGCAGGCTTCTATCCTCATAGGTTTGTTTACGATTATGTAAAATATCAATGAAGCATATGCTAACATAATTAATAGTTTCTGTTTTTGTTTGCAGTGGTATTGGTGGGGGTGGCAGCATGCATGTTGGTAATATGACACCCACAGAACACACCCTAGAATCTTTCTGTTTTATCTTTGTGCATCTCGGCAGTCTGATTTACATTTGTTTCATACAACAGGTCCAAACGATCCACGCTTCTTTCCTTCTAATCCCTTCCCTGTGCCCTTTGGTGGCCCTGGGTAATCCACTTTATCTTCCACTTTGTCATTTCATTACCCATGCTGTCCTTTTTATTCTGTTATAAATGGACTTAATATTTGAAAATAGGAGTGTTCCACCGGGTGGTCGTTATGATCCAATTGGTCCACCAGATGTTCCAGGATTTGAACCTTCTCGCTTTGTGAGGTAAGATAGTTCAGCAACGTTTTTCATACAATTATTCTTAGCTTATCTCTGATTTCCAAGATCACCGACTACTGTACTCAACTCAGTTTTTAAAACCCATGACCAACAGATCAAACCGTAAACCTTCAGACACTGTCTCAGCTGCAGTTGTAACAATAGTTTTTTATTAACATAATGATATTAGATTAGTGATATCCTACATATTTTTATGTTCCTTTTGCATCGCAAAAGCTCTAAAACAGTGCATTTGCATCTAGTTAAAACTGTCAATGCTTACAGGCAATTCTATTTTAATTGGGAGATACTCTCTGACGCTCTGATCAACGGGCAATGCTAACCTATGAATTTCTTTTCACACAGGCGTCCGAGGCCTCCAGCTGGGACTACTCACCCAGACCTTGAGTTCTTCCAGCCGGGGCCGCAGGGGCCCTTCTGA</dnaseqindica> 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| External Link(s) |
