BGIOSGA024298

From RiceWiki
Revision as of 06:10, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA024298| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024298, complete gene.| tag = OsI_260...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA024298

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024298, complete gene.

LocusTag

OsI_26027

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024298-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024298-PA

Length

6039

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:16237623..16243661

Sequence Coding Region

16243598..16243661,16243437..16243516,16242969..16243063,16241537..16241688,16239718..16239822
,16239555..16239629,16238994..16239065,16238176..16238331,16238040..16238092
,16237787..16237959,16237623..16237692

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:16237623..16243661 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:16237623..16243661 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCCACGGGTGCTGAGGCCGTCGCCGGTGCCGACGTCATGGGAGTCTTCAAGTACAACTTCACGGCGCAGTTCCTATCCAGGGTCACCCCCTTCCTCTACAACAGCTGGTTCGTGCGCCAGCTCAGCGCCGACGACTGCGCGGCATACGCATTACAGCTTCCTCTCTTCATCAACTGTGTCCTATTTTTAAGCCGGGAGGGGTTTCGGCGTGCATGCTTGCGTAATGATTCTGACAGTGGCAATGCGATAAGTGATGAAGAGATACTAAAGGTAGCTTGGATGATTGTCCCATTTGGCATCTTAGTTTCCTTTATCAGCAGCTTATTTGTGTTGAGGGTAAAGAAACTGCGGTTATCCGATACCTATGCAAAAGCTACATTAATTATTGGACAGACTTTCAGGAAACTGATGCTCCAAGAAGGCGAAAAGTTTGTTCTTGTTTGGTTTGATACTCCATATAACCAGGCTGCCTATGGTCTTGTTGATAAATTAGGGAGTCTGGTTGTTAGAATAGTTTTCCTGCCATTCGAGGAGAGTTCTTATGCTACATTTGCACAGTTGGCATCAGGACAAAATCCTCAGAATATATCCAATTTGGAAGGTTCTTTGCTTGGAGCTCTTAAGCTTATTATGCTGATAGGCACATCTGAAGCTTTCCTTCATGCTGTTGCAAATGAAGACAAGCTTAAGCAGTCAAATGATATGTTGCTCCTGTTCTCGGCAATTTACATTGTGCTAAATGTTGTCCTGATTAAATCTGCTGGTGCAGTTGGGTTGATTGCTGCAAATTCCATCAATATGCTGCTGCGAATCACATATTCAGCGGCATTCATTAAAGACTATTTCAAGGGCTCATTCTCTTTCCGCCACTGCTTGCCGGCAGGCTGGGGTGTGTTGCTCATTTCTGGCCTGACCACAGCTTTCTCTGAAAGGATGTTTCTGAATAGAAACAGGTTCAAGCAGACCCTTCCCATTCACATGGCGATAGGCATAATGTGCCTGGGTTTCTCATCACTCGAGATATACCGTGGTGAAAAGCAGTTCTTGACGAGTATAATCAGATCATTGAAGAGCCGCGACAAACTTGCATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MATGAEAVAGADVMGVFKYNFTAQFLSRVTPFLYNSWFVRQLSADDCAAYALQLPLFINCVLFLSREGFRRACLRNDSDSGNAISDEEILKVAWMIVPFGILVSFISSLFVLRVKKLRLSDTYAKATLIIGQTFRKLMLQEGEKFVLVWFDTPYNQAAYGLVDKLGSLVVRIVFLPFEESSYATFAQLASGQNPQNISNLEGSLLGALKLIMLIGTSEAFLHAVANEDKLKQSNDMLLLFSAIYIVLNVVLIKSAGAVGLIAANSINMLLRITYSAAFIKDYFKGSFSFRHCLPAGWGVLLISGLTTAFSERMFLNRNRFKQTLPIHMAIGIMCLGFSSLEIYRGEKQFLTSIIRSLKSRDKLA</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..64#146..225#599..693#1974..2125#3840..3944#4033..4107#4597..4668#5331..5486#5570..5622#5703..5875#5970..6039#ATGGCCACGGGTGCTGAGGCCGTCGCCGGTGCCGACGTCATGGGAGTCTTCAAGTACAACTTCAGTGCGTGCGCTCTCTCCCTCTCCCTTTGCGTTTGAGGTTGATTTCGGGGGTGGGGATCTAAGTGCGGTCTCGTTGTTGCAGCGGCGCAGTTCCTATCCAGGGTCACCCCCTTCCTCTACAACAGCTGGTTCGTGCGCCAGCTCAGCGCCGACGACTGCGCGGTGCGGGATCCCCTCCCCTCTTCTTGCTCGCTCGCTCGCTCGCTTGATTTTATTTCAGTGCCCAGATGAAGAACTGAATTGTGCTGTTTCCTCACGATAGTAAAGCAAATGTGGCGATTTTATTGGAACCCAAGTTATGCATGATTTTATTGTTGGGGGGGGGGGGTTTATTAGTGTGATTTGGGTTTTGAAGTTTTACTTGGTTGAACTAAAAGAGAACTGCTCTGGGAATCTAGTCCACCAGCAACCGAGTGTGAGAATCCAGTAGATATGAACAAATCAACGTTTTGATAATGCCTTGTTCTTAGGTGCTTCACTTTGTTAAAATATCTAATAGAAACTTAAACTCCTTTACATGTCATCTATCTGGCAGGCATACGCATTACAGCTTCCTCTCTTCATCAACTGTGTCCTATTTTTAAGCCGGGAGGGGTTTCGGCGTGCATGCTTGCGTAATGATTCTGACAGGTATTACAATAACTTTATATGGACTTTCTGAAGCAATTTAGGAGCTATAAGCCATATTTATGATTTCTGAAGCAATAACTAAGCAGTAAGTATTTTTGTTTACACTAGTCATAGCATGGATTTATTTATTTTTGAAGTGAGAAAATCAATCTTTAAAATGACCACGTGCTATAGAACTATAGATACTGGATAGTGATAAAACCCCATTCACAATTTGTTAGTTTTACAAAGAACCATGTGAAAAATTTGTGCTCTAGTTTCACTTGTGCATACAGAATAGTAAATTCAAGGAGAAATGATTTATCATTTGGTAGAGTAATTCAAGAAAGAGAAGAAATGGAGAAAAGAAAGAAATGTGCCTTTATTAGGCAGAGTTTATTTCTCATAAAGAGCTAATTGTAGGAAGAAAGGTAAAAGGAAGAACGATTGCAATTGATGCCACAATTGCCTTGTAAACCAAGGTAGACAAATTTGAATTTATTAGATGAACACTATGTGCTTCATGGACACACGACCCATGATTTGATAAAGCCCAACACTTATGGGGAATGGTCATATGATCTCCATACTCTCATAACTGCACTTCTTTTCACCTTCTTGCTTTGCACGAAAGGGAAATATAAAGTTATATTGTTACTGTGTGCTATTAACATTCACTTTGAACTTTCATGGTAGGACTAGCCCACAACCTCACCTTGTCCATACAGGCTACCTTCAACTTCAAAGTGTGTAGTGGTGAGGGTTAGTTCCATGTTGGAACATGAGTAGTACTATCATGTTATACTTGAGGGTCTTAATGTTTACTGCTGAGGGTTTAATGCAATAACTGTGAGCTATCCTGTTTGAGTGAAATGAGGACGAAATCCCATGTGAGTTGCTCTCTGTCCACAGGCTTATCTTGCATGCGGGTTGTGCACTTGTGAATTTGAGCCCTAGTGTGCTAAAATATAATCAACCAAAATCACATTCTTATTTTGCATACTTGTGAAAATCTATTTTCATATACATATTCTAGATAAACCTTAGAACTGTACTTGTGGCAGAATTACACAATTTCATTCATTTCTTACAAGTCCTAACGTGTCATCTCAACATACTGTTCAAATGGTGAGCAAATAACTGCTTTCTATTAGTAGTTTGTATGCACTATTAAAATTATTTTTCTCAATTTTCAACCACTTGAACATGTTGAAACATGCTCTGGGATTGTAAAGGTCTTTCTAGCAATTGCATTGGAATATACTCTTTAAATGATGATGGTTAAAATACTTATATTACAGTGGCAATGCGATAAGTGATGAAGAGATACTAAAGGTAGCTTGGATGATTGTCCCATTTGGCATCTTAGTTTCCTTTATCAGCAGCTTATTTGTGTTGAGGGTAAAGAAACTGCGGTTATCCGATACCTATGCAAAAGCTACATTAATTATTGGTAAGCTTTGTATTAACCAAGTTTCTGTGCAAGCTTTGTATATTTGTCCTGAATATGGTGACTGATATTTCATTAAGTATAAATTCGTCAGAGTGAATGAGTCAGTTGATTGAGGATAAGCTCTTTGGAATGAATGAATAAGTTGATTAAGTCAGAATATTCCACATATTAACTTGTTAGTGGTGCTGAAATATTATATCTTCCATGCAATTGTTGAACACCTGGCTCTTGATCAATAAAATGGAGATGAGCATTCATGCAAGCATACGGTTATTTGTAGCATTTCAAGATGGTCCTTTTAGACATTTATCTATTTCTTTTTCTCATTGGATATGATCTATAAATGCACGGTATGAATGGCTTTGTCTTTCCTGTTTGTATGATATCACTCCACATGTTTTGCCTTATTTTTTCATATTGTGTGACTTCTGTCCACTTTCCTCACGTTGAGAGCTAATGTATTTAGTTGATTCAATATGACAGCATTAGCTTGTGTACTGGAGCTACTGGCAGAACCTCTGTATATTCTCTCCCAGAGGAAGAAATACTATCAAATAAGAGTGTATACTGAACCTGTGGCTACTCTGCTGCGTTGTTTAACAACTTTTATCTTCATAACAAAAGGACATTCTAAAATGGTAATAGCAGAGGTTTTTACTCTATTGACGTTTTATTCAACTTATTATGCACTTTCTGTCTCAGTTTGTTATCATAAAATAAAATGCTTAAGTTCACATTGTTTTTGTTGTTTACACCTGATACTGGTATAGCCATCTATTTGGTTATGGTTACATTGTGAAAGCTAGCAATCAAAAAGTTCCATTGCCAATTTCATATTGTGTTCTTTTGGTCCATGCACCAAAGAAAATAACTTGGTGTGAGATTTCTCTCTTAGCTACATCTGTTCAGGGTTAACAGGATGTGGGTTAGAGAGGATTAACTTAATCAGGTTGTGACATTTTAACTTTATTAATTAGGATTAAGTTAACCCACAAAAAAAGTGAATATGATAACATAGAACAACTAAACCTCTTTAGAGTTCTATTTTTCCAAATATAAGTGTATAATCTGGCTAACCATCTAATCTAGCCAAACAAAGTCTTAGACTGACCATTCTAATTGCCAAATCGAACAATTAAGCTGTATGTATTTTAGACTTTTAGTGTTACTTAATCTAGTTATTTTCAACTTGAAGCAGATCACCTTATGTTTTTTTGGTTGGTTATGCCTCCATTGTAAATTCCATGTTAAGTTCGTCTTTGACAATAATAGGACTTTACATAACAAAAATATGAATTCTGCTGAGTGATATATCCGATTAATCTTTTCTTTCTTTACTTTTCAATTAAATGGTGTTCATCTCATGTCATTCTTTTCTTATTCAATTGTTGATCAACACAGAACTAAAACAATAATTTATTTCTTGCAGGAAAAGTTGGTTGTATTTGCTTTGTCACAGGTTGTCTATGCAGCTTGCATTTTCTTTGGATATTGGACCTATTTTCTTATATTTACCAATACCAAAATTTCCGATCTCCTTCCATTCAGGTTCTTTCTATGTCTGCCTTTGCATTGTGTTGTATCATTAGGTTTTGTTTGATCCATCACATGTTTATGTTTGTTTCCACTTGATGTTAAAAAACACAAATTGTCAGGTTGTCAGCCTTGATGGACTACGATAAACAGTTGTTGCGCATGTGCATGTTGTTTACAGGACAGACTTTCAGGAAACTGATGCTCCAAGAAGGCGAAAAGTTTGTTCTTGTTTGGTTTGATACTCCATATAACCAGGCTGCCTATGGTCTTGTTGATAAATTAGGTAAGTATGCCAACCGCTGTTTGTTTCAGGTCCTTTTTATCTTCTAATGTTGCCGGGTATGTGCAATTCATGCTTTGTTTATTTTCAGGGAGTCTGGTTGTTAGAATAGTTTTCCTGCCATTCGAGGAGAGTTCTTATGCTACATTTGCACAGTTGGCATCAGGTTCTTCTGCATTTACTTCATTTAGATATGAGAATCACATTCCTTGTCCCTTTGGTGTCTGAACTTGAAAGTTTCTCTGTGAAGTTTTGTCTAACATCTCTTTGATTAGTTATTCAATGAAAATTAACCTATGTTGGCTGGGCAGGCATTGCACCAAACATGAGAGTTCATCCTTTTTTTAAAAAAAAAAATAGTTTATTTTTTATACTCCTTTCAGAAATTGTAACTTTTGGTATATTTCTTGATTATATGATACTTACAATTTAGACTTGATCATTTTCTATATTTCTTACTACCTGAAAATATACCTTTTGGTATTATTGTTGTTTCATATTTCAGCTTTATGATACGATAACTTTTCCTTGAAATGTTGATTTAACCAATACCAGAATTCATAGCAATATTGTTTGTTTCAAAACAATATGTTCCATGCATATGTTTAGATATATATTTCTGTAAAAGCTCTAATAATGGGCCTCTTATCCACAGGACAAAATCCTCAGAATATATCCAATTTGGAAGGTTCTTTGCTTGGAGCTCTTAAGCTTATTATGCTGATAGGTTTGTTATCCAATGTTGAATGCTATATTGATTGCATTTGTGTGTGTTATTTACTGTGTCCTCTAGGGAGTAAGAAGCAAGCAATTGCAGTACATGTAGTGTACAGTAAACATGTTTTAGTAGCTACCAACTTTATTCTCTTCGTTCTCATTTGAATACAGTCATCCTTAAAGTGTCCTAACTTTGCAGGCTTGGTGGTCATCTCATTTGGTCCAAGTTATTCATATACCCTTCTTAAACTACTATATGGGGCAAGATACAGTGATGGAGATGCTACGGTTATTCTTCATTACTATTGTTTCTACATCATATGCTTAGCAATGAATGGTTTGTACTTACTACTTCTATTTACCAGTTATATCATAGTAGAGCAATGTTTTTGTACAGTATTACTGTCTTCATGCTTAAATTATATATTAAAAAAAAATCTGAAATGATGAACTGTAGTTGACCTTTTTGAATTGAGTTAGTGTACCAACAAGTAGCATTGCTTCTTGTGTTGATCAATAGTTAGCTATACTTGGCGATGTGTTCTATATTTAAAAATTGCACATATTAGCCTTTATACAACCCATGTAATTGGGCATGAGTAACACATTCAATTGATTCCTCATGAGGATGCAATATTGAGTTGCACTGATTATGTTAATGTGTACTTTCAGGCACATCTGAAGCTTTCCTTCATGCTGTTGCAAATGAAGACAAGCTTAAGCAGTCAAATGATATGTTGCTCCTGTTCTCGGCAATTTACATTGTGCTAAATGTTGTCCTGATTAAATCTGCTGGTGCAGTTGGGTTGATTGCTGCAAATTCCATCAGTATCCTTTGGTTAATCACTACCATCTTATTTCCTTTAAAGTATCTTTTAAGAACTTTCTTTGTGCCTTGACTGTTTGTAAAGATATGCTGCTGCGAATCACATATTCAGCGGCATTCATTAAAGACTATTTCAAGGTAAGAGGTTCGGTTGATGTTTCACATAGTTTGTTTTAGTTTCTGTTCTAACAAAAATACCTGATGACTTTATTTTACAGGGCTCATTCTCTTTCCGCCACTGCTTGCCGGCAGGCTGGGGTGTGTTGCTCATTTCTGGCCTGACCACAGCTTTCTCTGAAAGGATGTTTCTGAATAGAAACAGGTTCAAGCAGACCCTTCCCATTCACATGGCGATAGGCATAATGTGCCTGGGTTTCTCATCACTCGAGATGTAAGAACACCATTTCATAAAAAAAAAAAATGTCTCGCTCTTTTTATATGCTATAATATAATAATCACCTTGGCATTCGTTTCTCATTCAACAGATACCGTGGTGAAAAGCAGTTCTTGACGAGTATAATCAGATCATTGAAGAGCCGCGACAAACTTGCATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024298

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA024298&oldid=49892"