BGIOSGA024501

From RiceWiki
Revision as of 06:14, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA024501| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024501, complete gene.| tag = P0046D0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA024501

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024501, complete gene.

LocusTag

P0046D03.138

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024501-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024501-PA

Length

5331

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:9250364..9255694

Sequence Coding Region

9255521..9255694,9252171..9252287),complement(9251016..9251186,9250699..9250911),complement(9250364..9250558

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:9250364..9255694 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:9250364..9255694 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAACATCAAGGGCGGAGGCCGGGTCCCGGTGCCCCCGGCCGGCGCGGGCACGCTCGTCAAGCTGGTGGTGCTCGGCGGCACGGCCGTGTACGCCGCCGTCAACAGCCTCTACAACGTCGAGGGTGGCCACCGCGCCATCGTCTTCAACCGCATCCAGGGAATCAAGGACAAGGTATACCCTGAGGGGACTCACTTTATGATTCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATTTATGATGTCCGTGCTCGTCCCAATCTTGTGGAGAGTACTTCTGGAAGCAGGGATCTCCAGATGGTGAAAATTGGTCTCCGTGTCCTTACAAGGCCCATGCCAGAGAAGCTACCAACTATCTACAGGACTCTGGGGGAGAACTTCAATGAGAGAGTTTTGCCTTCAATTATCCATGAAACACTTAAAGCTGTTGTCGCACAATACAATGCGAGTCAGCTAATCACACAGAGAGAGACCGTGAGTAGGGAGATAAGAAAGATACTGACTGAGAGGGCCAGGAATTTTAATATTGCCCTTGATGATGTGTCCATCACAAGCCTGAGCTTCGGAAAGGAGTTCACTCATGCTATTGAAGCCAAACAGGTTGCTGCGCAAGAAGCTGAGCGTGCTAAGTTCATTGTTGAGAAAGCTGAGCAAGACAAGAGGAGTGCGATTATCAGGGCACAGGGTGAAGCTAAAAGTGCTGAGCTGATTGGTCAAGCCATTGCAAACAACCCTGCTTTCCTTGCCCTCAGGCAGATCGAAGCTGCCAGGGAGATCTCTCATACGATGTCATCTTCAGCTAACAAGGTGTTCCTGGACTCCAATGATCTCTTGCTCAATCTCCAGCAGCTCACCGTGGCAAACAAGTCGAAGAAATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MNIKGGGRVPVPPAGAGTLVKLVVLGGTAVYAAVNSLYNVEGGHRAIVFNRIQGIKDKVYPEGTHFMIPWFERPIIYDVRARPNLVESTSGSRDLQMVKIGLRVLTRPMPEKLPTIYRTLGENFNERVLPSIIHETLKAVVAQYNASQLITQRETVSREIRKILTERARNFNIALDDVSITSLSFGKEFTHAIEAKQVAAQEAERAKFIVEKAEQDKRSAIIRAQGEAKSAELIGQAIANNPAFLALRQIEAAREISHTMSSSANKVFLDSNDLLLNLQQLTVANKSKK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..174#3408..3524#4509..4679#4784..4996#5137..5331#ATGAACATCAAGGGCGGAGGCCGGGTCCCGGTGCCCCCGGCCGGCGCGGGCACGCTCGTCAAGCTGGTGGTGCTCGGCGGCACGGCCGTGTACGCCGCCGTCAACAGCCTCTACAACGTCGAGGGTGGCCACCGCGCCATCGTCTTCAACCGCATCCAGGGAATCAAGGACAAGGTAACCGGACACGCCCATCCCCCCGCCCCTTCCCTGTTCCATTTCGTTACTTGGATGTGCCGCGTGGTTTGGTTGCGGCGTTAACGATTCGGTCGTTTAGGGGAGAGATTGGTTGGAAATAAATATTTGGTCTCGCGCGCTATCTTATGTTAGGTTGCAGGGTAAACTGTGTTTTGAAGCAAATCTATTTGGGTTTATAGGTGCTATCTGGTAAATCTGAACTAACCAGGTGGTCTTCATGATGTGTGAGATACCTGCCTATCTTTAGATAACTTGTTTAGCTGCAGCGATTTATCAGGCTGAAAACATGACAAGTGTTCCCTTTCTTGTGGGTGATATCATTTGTTGAGGTTTGAGGATTAAAAAGGTCAACCATTGCGTGTGCTGGAACTGATTCCAAGTTCTTGGTAAAAAATCCAATTTGTAGTATGATTGACTGCTGATTCCAGTACCTTATGCCTTGAAAAGAGAATTACCTCTGAAACAACACGATCGCTCTGTACCAATGTGTGTGGTTTCCAGTCTGGCTTGCACTGAGGTTATGAAATTTTCCTGCGCTAGATACCTGTAATTGGTTCTAGAAAGCAGCTGCTTTGTCTTATTTATTGGCCTGCGGCAGGTGCACGAGTACCATGCCGTGGTGTAGTTCAGAACAGATAGTCACATGATGTTTCTACCTTCATTTTTTATGTTGTTTGTTGAAATGATCTGAATGTGGTAAACACTTATTGAAATTAAATTGTAAATGAACACGACTACTTTTGTTTTATCATTCCTTAAAAACCATTTGAAAATATGGTAACATTCATCACAGTCCAGTCGATTTAATGCACACGAGACCACTGCTGGTTGGAAGATGGTGCCAAGATCAACTGAAAACCATTGACTTCTTTCAGTGTTTGCCGCATTGTGGTTTTTTTATACCAAATTTACCATGGACAAGTGCAATCGCATTATTTGATTTTAGTCTGGCAGTCTGGCTGTGACCATTATATATGGCTCGCCATCAGTACAATCAGGGCATATTGAAGTTGTTTGTGTTCACAAAAACACACATTCTTTTCTGTACTCACAATGAACTGCACATTTAGTTCTGTCACACATGCACCTTTTTCTTGTAATTTCTTTAAATGTGGTTCATGGGAGTAACGCATTTCCTTTTAAAATATGTATCTTTATTTGATCACTATGTGGTTTCTTATGCTCTTTCTTTCTCTCTTTTTTCCTTTTCAAAAAGTAATAAAATGTATTGTTATTAATGGCATTCAATTGTGGTTCTCTGTTTCATAATGCAACTTAAATAGCATTAAATTTGTTAGATTTGTTGAAAATATCTGTTATCATATATCTTCTGCTCTAACTATCTTAATCGACCTTAGATGGCCGGTTCCTAGCAATCTACTCAGGAACAGCCTAGATAACGACAGAGGCTGCTTTCACCTTCTTGCCCATAGGTTACTTCGCCCAAACCGACGACACTTCCCCCCACCTTTTTGAGCAGCTTTGATACAGGATATGGCGACTCTTTATTGCGAGTATAGCATGACTATGAAGCTGACATGCACACACAGGTGCAAACAAATCATAACAAGGAGTAGTGTCTTTTACATTCTGGCTCCTTGCATTATTTTGGACTAAAAGTAAATTTAGGGTTGTATTGTTTGCTGTGCCATCCTTCCGTCGCCAGCTGTAGATGGACCCCAGACATCTAATGCCCCCTTTGATATCTTCCTCGCCCAAATGTGTCATGCCTGAGTTAGTCTCCTAGATTCCTTCTTGACATGATCTCCTGTTCCTTTAAAAATAACATGTCCATATTTCTTGCCTAGAAAAGTAGGTTTCAAATGGAAACGGAGTTACGTATGTATATAGCATGCATGACTTGGTTTCCTTTATATCCCCATAGCTTGATCTTTGTAGTTACCAAGGCAGGTGTTGATGCCGAGAATAGCTCTAATGTAGTGTCTGTCCGCTCCGTGAAGCGGGACCAAATTTGCAGCCCCACACGACCAGATCGTCATTGGGTGCAAACTCTGTCACTTTTGGTATCACCAAGCGGCACCATCTATCAGGTGTTCTGTTGCTGCCAGTCCTGTTTTTCAATTTTGGCTGCTTGCTGAAGAATCGCTCAAAGCAATTGAACTAAGGTTGTGGATCTTCCTTGCTGTTTTAAATGTCATAAACCCTAGATGATAAAATTGTGAAGCTAAAGCTTGCTTGCAAACAGAATTACCGAACCCTGCAGCAAACCATAGATGGCAGAGCAGCTATTAGCTCAGATAGCAAGTTGTCATGAACCGAAATCATGATGTGGCCAATGTCAGCCGGGAGGATTGCTGAATGGTGCAGGCTGCTACTGATGAGTTGAGGGCTTAGACTGGGATCATGAACATTAGGGGAAAGATTAACAGTTTAATTTTCTTCATTGAATCCTCTCCGGTAGACCAGCTCATTGCCTCTTATAGGGCCAGCTCCTAACAGTGTAATCTAACTAATTTAAATTGATTTTATCAGCTAATTAAAAGGAACAACCTAGATAACTATGGCTGCTGCTGCTGATCTTCTTGGTCCATGCCCATGGTAACCAATATTATGTTTTTATCTTTTAAGATATAATTTGTGATTGTGAGTTATTTCCTTGCTGTTCTTGATTTTCGAATGAGATTTGTTGTGTGCATGCTATTTATTAAAAAAGAGGCATGGAATCAGATTTTACTTCAAAAAAAGAGACCACATGTTTGCATGTTATGTCCACCTCTCACTGTTTACTGTGTTTGGTTAGTCATTCCAAAGTGAGCTTTAGAATTTCCTTATTTTATTTCCTAAATAGGATGGTAGTATTTATCTAAAGTTGTGTTAACAATGCTTGTATAGCTAGATGCTCTATTCTTTCATTGTTAGTGCTGGAGCATTAAATGTTTTATGCTTGTTTAAAGTGTATTATGAAATATGCAAGAAGCTTGCCTATGTCTTCATCATTATAATTATTGATCTTATTTAGTATAAAAAAGAGCTGTTGTGAGTCTTCCCTTTCCTGTGCATCAGAGCTTTGCGTGGATCTTTCGCACTAGGTAAACCTGTATTCTTATTGTGTAAAGTAGTTCTCAAGGTTTTGTTGCTATCATGTGAACTAAGTTTTGGTGCCCTTTCCTTGTGCTGCGCTTAATACTTCAGTTCAATCCACCTTAACATAGCTGGATGACTAATATATATTTAACATGTACTACCTACAGGTATACCCTGAGGGGACTCACTTTATGATTCCATGGTTTGAGAGGCCAATCATTTATGATGTCCGTGCTCGTCCCAATCTTGTGGAGAGTACTTCTGGAAGCAGGGATCTCCAGATGGTACGTTTGCATCTTTTTAGTTCTATATTTTCATCGTTGGAATGTGTGTATACTTCTCATCTAATGATAGATATACTTGATTTGATTTGCATGCTCTATTTTCATTGTCATTGCACAATCAAGTTAAATTGAATTTAAAGCCAAAATATGTGCTGCTTAGTGCTTACATGGTTTCATTGTTGATGATGATGAATCATCACATCCTACATTGAATCTTTGCATACATTAAAGTATTGTGTCATTCATAATCATTAACATCTTTGACTGTTAGTTTGTTTCAGAAGCTATTACCACATTTTGCAACTAACCAACCTTTTGCTGATGGTTACTAGGGTTCTATAGCCTTTTGCTATATTTTTTTGTCTGTTTTTTTGCATGTTTGTTTTCATAGCTATTTAGGTTATGATATTAAGTTTGGAGCATACCTAAAGTGGTGTGATTACTCGGAGTTCATTTTGGCTCATGGATTTTAGTAAATTAATTATTGGAGGCAAATGTTAATTGGTCATTCTGTTATTGTTTATCGATAGGTACGTTTAGGGGTAAACCTTTTTTGTGGGCTAACAACCAGACAGTCCTTTTTTACTTATGGCTATATTCCAAATTCTTTCCTACTTTATGATTGCATGTTACTCCCTGTAAAGATATTTGATTGTGGACTTATTTGGTGATTAAAACTGTTCTACTAAACATGCCAGGCATATGTGGTCAGGTTTTAGAAAAAAAATTGAACTAGTGAGTAGTGAGCCAATTAGAAGGGATGTGCCAAATTTTGGAAATAAACACAGTCGAAGAAAATATGCAATTTCGGAAATAAACGCAGTCGATGTTTTAGTTTATGGTTGTGCCATGTGCTTTTATGCTTGGAGTTCCATTTGCTGAACATAAAACCCTTCTTCATATTTTTTATGCATCTATTGTACTCTATTTTTGGCAGGTACCCTTTATATTTTTTATGCATGTATTGTACTCTATTTTGGGCAGGTGAAAATTGGTCTCCGTGTCCTTACAAGGCCCATGCCAGAGAAGCTACCAACTATCTACAGGACTCTGGGGGAGAACTTCAATGAGAGAGTTTTGCCTTCAATTATCCATGAAACACTTAAAGCTGTTGTCGCACAATACAATGCGAGTCAGCTAATCACACAGAGAGAGGTTAAGACCAGAACATATGCTTTTTATAGTCTTTTTTTCTTATATTTGATGGGGGTCAACATTACTTGGGGGCGCTAACTGTTTGTTTCACTCTCCAAATCCAGACCGTGAGTAGGGAGATAAGAAAGATACTGACTGAGAGGGCCAGGAATTTTAATATTGCCCTTGATGATGTGTCCATCACAAGCCTGAGCTTCGGAAAGGAGTTCACTCATGCTATTGAAGCCAAACAGGTTGCTGCGCAAGAAGCTGAGCGTGCTAAGTTCATTGTTGAGAAAGCTGAGCAAGACAAGAGGAGTGCGATTATCAGGGCACAGGTAAGAAATCTGTTTTATAGCCATTGCCTGATGTCATGTGCCGGAGATACAGTTTGACAGTACATATTATATAATGGTTTTGCCATTGCATGTCTAGTTAACATTGTCTCTTAAACATGGCCTTTCTCTTTTTTCAACAGGGTGAAGCTAAAAGTGCTGAGCTGATTGGTCAAGCCATTGCAAACAACCCTGCTTTCCTTGCCCTCAGGCAGATCGAAGCTGCCAGGGAGATCTCTCATACGATGTCATCTTCAGCTAACAAGGTGTTCCTGGACTCCAATGATCTCTTGCTCAATCTCCAGCAGCTCACCGTGGCAAACAAGTCGAAGAAATGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024501