Os12g0125400
| Gene Name |
Os12g0125400 |
|---|---|
| Description |
Similar to Homoserine dehydrogenase-like protein |
| Version |
NM_001072576.1 GI:115487113 GeneID:4351381 |
| Length |
3805 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0125400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:1215712..1219516 |
| Sequence Coding Region |
1215892..1216026,1216393..1216462,1216623..1216786,1217418..1217471,1217856..1217896 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:1215712..1219516 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggcgccggtgaggtcggtgctccccgtcgtgctcctcggctgcggcggcgtcggccgccacctcctccgccacatcctctcctgccgccctctccacgccaaccagggcgtcgccatccgggtgctcggcgtcgccgacagctcctctctgctcgtcgccgacgacctccactccaacggcttcgacgacgcgctcctcgctgatctctgcgccgccaagtccgccggctcgcccttatcttctctgctctctcgagggcaatgtcagctattcaacaaccctgaggctaggaggaaagtcattgacactgccagcgttcttgggaaaacaactggtcttgtactagttgattgttctgcaacttatgatactgttggcatgctaaaggatgccgtggatcgtggatgttgtgttgtattggcaaacaagaaaccgcttacttgtgcttatgaggatttcgaaaagttggtttccaacttccgtcgcatgagatttgaatctactgttggagccggtttgcctgtaatagcttctgtgacccgtattattgcctctggagatccagtttctcgtattgttggcagtctgagtggtacacttggttatgtgatgagtgagctggaggatggaaagagatttagtgaagttgtgaaaactgccaagtctcttggctatacagaaccagatccacgtgatgatctcagtgggatggacgtagctagaaaggcattgatcttagctaggcttctggggcaacggatcagcatggagaatattaatgttgagagtttataccccagtgaatttggacctgatgcaatgtccacaaaggacttccttgaaagtggtttagtacagcttgataaaagcattgaagaaagagtaaaggcagcatctttgaaaggaaatgttcttcgctatgtctgtaagattgaaagcacagggtgccaagtgggccttgaagaactcccgaaaaactctgcactgggaaggttgagaggaagtgacaatgtggtggagatatacagcagatgctacgagagcgcccctctggtgattcagggcgctggagctggcaatgataccactgcagctggagttcttgctgacatacttgatctccaggatctcttccacaaaacggcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAPVRSVLPVVLLGCGGVGRHLLRHILSCRPLHANQGVAIRVL GVADSSSLLVADDLHSNGFDDALLADLCAAKSAGSPLSSLLSRGQCQLFNNPEARRKV IDTASVLGKTTGLVLVDCSATYDTVGMLKDAVDRGCCVVLANKKPLTCAYEDFEKLVS NFRRMRFESTVGAGLPVIASVTRIIASGDPVSRIVGSLSGTLGYVMSELEDGKRFSEV VKTAKSLGYTEPDPRDDLSGMDVARKALILARLLGQRISMENINVESLYPSEFGPDAM STKDFLESGLVQLDKSIEERVKAASLKGNVLRYVCKIESTGCQVGLEELPKNSALGRL RGSDNVVEIYSRCYESAPLVIQGAGAGNDTTAAGVLADILDLQDLFHKTA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3491..3625#3055..3124#2731..2894#2046..2099#1621..1661#1381..1473#1204..1291#944..997#746..861#476..553#196..346#8..118#ccaacaaatggcggcgccggtgaggtcggtgctccccgtcgtgctcctcggctgcggcggcgtcggccgccacctcctccgccacatcctctcctgccgccctctccacgccaaccaggtacgtacctcgtctgaccgcccctccctctccccctcctctccgattggatgctctcatcgccgatacttgtatagggcgtcgccatccgggtgctcggcgtcgccgacagctcctctctgctcgtcgccgacgacctccactccaacggcttcgacgacgcgctcctcgctgatctctgcgccgccaagtccgccggctcgcccttatcttctctgctctctcgaggtatccccattctatttcgttattccttttttttcttttttagaattctccatagcttactttgtcatgaatttgcatttgtacacgtgacatgtaaagtaatggatggttggattgtgcaattttcagggcaatgtcagctattcaacaaccctgaggctaggaggaaagtcattgacactgccagcgttcttgggaaaacaactggtctgtgatccttctccctaagcagaatacattgccggttaagttttttaaaattttctatgggatagaaaccagtggggaaaaagatggaatctttgatatgctgtatgattgttgattagttctttgtttttttaaaaaaaaggagtattaatatcttcttcggttcttatcttacaatcctttttgcaggtcttgtactagttgattgttctgcaacttatgatactgttggcatgctaaaggatgccgtggatcgtggatgttgtgttgtattggcaaacaagaaaccgcttacttgtgcttatgtaatgtcctccttaagtcttccgtctggtatgtttttgtcattttgacatgcttaccaaatgtgttttttttttcatgcaggaggatttcgaaaagttggtttccaacttccgtcgcatgagatttgaatctactgtatgcatacgccactagtaattccttcgtttcactattgaatgttattatatttgtttttcatggaaattctttcctttatttgatctgggattgtatgatatgactctggccatatgattaagcacagcctttttttggaagtttcttttattattgcaaaggagttgagggtctctgctgatatttactattcctactcttaggttggagccggtttgcctgtaatagcttctgtgacccgtattattgcctctggagatccagtttctcgtattgttggcagtctgagtggtacacagttattatcttatttgtttgtaaaaggtgtttgttttccaaatagcagagcaatgtaccacttccattctatgattctgcaggtacacttggttatgtgatgagtgagctggaggatggaaagagatttagtgaagttgtgaaaactgccaagtctcttggctatacagaaccaggtctaaaaatttattcattcatttgacattataacatcaatgtgtactcagtattcattccttatctgtaattacagatttcatgtttacagaaagtctactgatgcttgtgataagtgcacttactcagttgtttaattttggtagatccacgtgatgatctcagtgggatggacgtagctagaaaggttaatttttcatctgatgaattacatgctactctacataattcactttatctgtgcctttgttaaccattgccacaattttattctactcctaagtccatgaactaatatatcatgagctgctgctgtgtatctattttttgtgcttaattgtatcatactatgatttgatccaaaatatattcagtaccacatcaatatcataaatactacagttcaggaaggcctatatcatgcactgaccctatttggaatttcaataataaccttgcaaatagacattggcataagggaggtttatgttcaggttcagatgttttatttgattatttcattctttgtcaattaggtgatgaggtctaacaagttcatctttgaatgcaggcattgatcttagctaggcttctggggcaacggatcagcatggagaatattaatgtatgcatataattaatcttgatggtatttgttctaatgttttgtgtaaacatagcttggtgtgcacgggcttatgttttcactaacataaatgaggctggtagcaagtgttttcctgttattctggctgttcaaaaaaacctagttggtttaaaatgatacatttcttgttgataccattcttggtgatagtttgcaagcattacttggaaccatccttttctctttagttctacttctataatatcttggcacatggattctatggataaggacagacactcttctacaatatcaggtcactggatatcaccatagatttgtgttcaggattattggggatcccgatgaattatacaccttatgtatcttatagtctgaaaatgaaatgaatgtcctccaaatcttggaagttgttatttagtttatgtagccattagctttgttgagtggccgctagttcagttgttttctatgatacaagaactttgattttgagatattttaacccctaaatcacttattcagaaattttctaatcatgcatagcctatttatgcacatgttctgttgtacatccctgttcatagaaaaaagatcaggtctgctaagtttttgtaattatcttcaggttgagagtttataccccagtgaatttggacctgatgcaatgtccacaaaggacttccttgaaagtggtttagtacagcttgataaaagcattgaagaaagagtaaaggcagcatctttgaaaggaaatgttcttcgctatgtctgtaagattgaaagcacagggtacgtatccttttattgtgctatgcccatctgaatcactaagtagtgttttgatactcaaagcatactattgtcagagacacgtaggcctattctgtgcattttgtaaaggtacttttaatggtagtgtagactgtagagtaacatccccattttgtaggtgccaagtgggccttgaagaactcccgaaaaactctgcactgggaaggttgagaggaagtgacaatgtggtatgctaatccttttttttcctttctctatttctattttattcaatgtcaagcggcactgtgcagttggtagccttaagggctggttattttcaggtgaaaacaaaagagcctacgagtgtgagcagggtctgtattggcataccattccccatttcttctttgcgttgttcaaacgagcttggaagttggaacactaaaactaccaaagacattgtttgtgttggcctataacacgttagaagtagattgatgaaatccatttttctgttttgagaggattaaagaatgtttgatatgtgattttttactgttggtagtgagtgatgtgaaacgtaaaagtgacgctgctttgttcttgggcaggtggagatatacagcagatgctacgagagcgcccctctggtgattcagggcgctggagctggcaatgataccactgcagctggagttcttgctgacatacttgatctccaggatctcttccacaaaacggcttgaaacctatgtcttctaggtcgaaccgcagagttgattatgagtcttgtgacttgtggggttgttttggtcacagtattacttaaataaatcttgagcagatatcaatttttgtactgtacgcagaaggtttttgaacaaatttggaagttggaaccaatgagcagtgtcatccttttgctt</dnaseqindica> |
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