BGIOSGA024591
| Gene Name |
BGIOSGA024591 |
|---|---|
| Description |
Eukaryotic initiation factor 3e |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024591, complete gene. |
| LocusTag |
P0592C06.125 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA024591-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA024591-PA |
| Length |
3334 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 7:6833644..6836977 |
| Sequence Coding Region |
6836615..6836977,6835939..6836166),complement(6835709..6835830,6835010..6835229),complement(6834412..6834554 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:6833644..6836977 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:6833644..6836977 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGAGCACGACCTGACGGCGCGGATGGCGGGGCAGATGGACTGCCACCTGGTGTTCCCGCTGCTGGAGTTCCTGCAGGAGCGTGCGCTGTACGCGAACAAGGAGATCCTGGAGGCGAAGCTCCGCCTCCTCAGCGGGACCAACATGGTGGACTACGCCATGGACATCCACAAGTCCCTCCACGACACCGACGAGGTCCCCGACGACATGGTCAGGCGCCGCACCGACGTCGTCTCCAGGCTCAGGGCGCTCGACGAGGCCACCGCCCCCATCGTCTCCTTCCTCCAGAACCAGCAGCTCGTCCAGGAGCTCAGGCCAGACAAGCAGTACAACCTCCACATGCTCCAGGACCGCTTCCAGATTGGTCCTGAGCAGATTGAGACTCTGTATCAGTATGCCAAGTTTCAGTTTGACTGCGGTAATTACTCAGATGCTGCTGTCTACTTGTATCAATACCGTGCTTTGTGCACGAACAGCGAGAGGAGCTTGAGTGCCCTGTGGGGAAAGCTGGCAGCCGAGATTTTGATGCAGAACTGGGATGTTGCACTGGATGAGCTCAACCGTTTGAAGGAGATTATTGATTCAAAGAACTTCTCATCACCACTAAATCAGCTCCAGAATAGGATATGGCTGATGCATTGGAGTATTTTTATCTTCTTTAACCATGAAAACGGCAGAAATGGGATCATCGATCTGTTCTTCCAGGATAGGTACTTGAACGCAATCCAGACAAATGCACCCCATCTTCTGAGATACCTTGCTACAGCAGTTGTCGTGAACAAAAGGAGAAGGAACATGCTTAAAGAGTTGATTAAAGTCATTCAGCAGGAGCAGCACAGCTACAAGGATCCCATCACTGAATTCTTGGAATGCTTGTATGTTAACTATGATTTTGATGGTGCACAACAGAAACTCATAGAGTGTGAGCAGGTCATATTGAATGATCCTTTCCTTGGAAAGCGCATTGAGGAAGGGAATTTTGTCACTGTTCCTTTGAGAGATGAATTCCTTGAAAATGCTCGTCTGTTTATCTTTGAAACTTACTGCCGTATTCATCGGTGCATTGATATTGGCATGCTTTCGCAGAAGCTGAACATGAGCTACGATGAGGCAGAATTGTGGATTATGAACTTAGTTAGGAATTCAAAGCTCGACGCCAAGATTGATTCAGTGTCTGGTACTCTTATCATGACGACCAATCATGTTAACATCCATGAGCAGGTTATCGAAAGCTTAAAGAATCTTAACATGCGGACTTTCCTGCTAGCAAAGAACATTGTGGAGCCGGCTCAAGCAGCACAACAGGCAGCTCGGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAEHDLTARMAGQMDCHLVFPLLEFLQERALYANKEILEAKLRLLSGTNMVDYAMDIHKSLHDTDEVPDDMVRRRTDVVSRLRALDEATAPIVSFLQNQQLVQELRPDKQYNLHMLQDRFQIGPEQIETLYQYAKFQFDCGNYSDAAVYLYQYRALCTNSERSLSALWGKLAAEILMQNWDVALDELNRLKEIIDSKNFSSPLNQLQNRIWLMHWSIFIFFNHENGRNGIIDLFFQDRYLNAIQTNAPHLLRYLATAVVVNKRRRNMLKELIKVIQQEQHSYKDPITEFLECLYVNYDFDGAQQKLIECEQVILNDPFLGKRIEEGNFVTVPLRDEFLENARLFIFETYCRIHRCIDIGMLSQKLNMSYDEAELWIMNLVRNSKLDAKIDSVSGTLIMTTNHVNIHEQVIESLKNLNMRTFLLAKNIVEPAQAAQQAAR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..363#812..1039#1148..1269#1749..1968#2424..2566#2956..3093#3229..3334#ATGGCGGAGCACGACCTGACGGCGCGGATGGCGGGGCAGATGGACTGCCACCTGGTGTTCCCGCTGCTGGAGTTCCTGCAGGAGCGTGCGCTGTACGCGAACAAGGAGATCCTGGAGGCGAAGCTCCGCCTCCTCAGCGGGACCAACATGGTGGACTACGCCATGGACATCCACAAGTCCCTCCACGACACCGACGAGGTCCCCGACGACATGGTCAGGCGCCGCACCGACGTCGTCTCCAGGCTCAGGGCGCTCGACGAGGCCACCGCCCCCATCGTCTCCTTCCTCCAGAACCAGCAGCTCGTCCAGGAGCTCAGGCCAGACAAGCAGTACAACCTCCACATGCTCCAGGACCGCTTCCAGGTCGATCTACTTCTCCCCCCACCTTTGCCGCGCTCGTTAGATCTGTTCTTCGTCGCCGCTAGCCTCTGTGTTATGTTAGGTTTGTTTTCTCTGTGCAGAAATGTTTTTGTGATTTGCAGGTGGCGATGCGATGTTGTGAGATTGGTTTAGTTTTATTCACTTGTTGGTTTGGGTAAAATTGGCACAGTTGGTGATTCTTAGCTTGAGATTGTGCTTGATCTTAATATGGTTAGAATAATTTTAAATCGCCGTCAAGTATAGGAGGGTTTGCTTGTAATTGTAGGTATTGGGCTTGTTTATGGAAGCATCAACTCTGTATGTTCCTCATTGCTTCAGTTGTTGAATTTTGTTGTTACCATGATTTTGTTAAGTCGGTTAGCATGCTGTATACTTGTTGCATGTTTTTGTGCGACCCAACTAAATAATCAAACTCCTGTTAATGATGCAGATTGGTCCTGAGCAGATTGAGACTCTGTATCAGTATGCCAAGTTTCAGTTTGACTGCGGTAATTACTCAGATGCTGCTGTCTACTTGTATCAATACCGTGCTTTGTGCACGAACAGCGAGAGGAGCTTGAGTGCCCTGTGGGGAAAGCTGGCAGCCGAGATTTTGATGCAGAACTGGGATGTTGCACTGGATGAGCTCAACCGTTTGAAGGAGATTATTGATTCAAAGGTTTGGCTGAATGACTATATCACTTGTTGTGGTTGGTTAGGTGCTTTACCTAACTATTTTTTTAGGGGAACCACATAACTAATTTTGTTCCTTTTTTTATTCTCCCAGAACTTCTCATCACCACTAAATCAGCTCCAGAATAGGATATGGCTGATGCATTGGAGTATTTTTATCTTCTTTAACCATGAAAACGGCAGAAATGGGATCATCGATCTGTTCTTCCAGGATAGGTTTGTTTACTAAAATCTCAACATTATTGTGACCACTTGTCTTGTGCTGTTACAAATTTTTGAAGTAAGTTTTTCTGGCCAAGCCGAATTGGAAGAAAATAAAAAGAACAGAGTTAAAAAGTTGATTACAGAGCCAAGGGGCTTCTGTTGTCCATACAACACTTGCTTTACTACCTCCGTCTCAAAATGTAGCTACCTAGTACGAGATGTGACACTACCTAGTACTACGAATCTGGACAGCCTCTTGTCCAGATTCGTAGAACTAGATGTGGCACTACCTAGTACTACGAATCTGGACAGCCTCTTGTCCAGATTCGTAGAACTAGGTGGTGTCACATCCCATACTAAATAGCTACATTTTGGGACGGAGGAAGTATTATTTTTACTGTGCTATCTAGTTGCAATGATGGAACTATATTTTATTCTGTATATCAAGATTATCTCAGCTAATTTTCAATTTGCACCTTTCGTCTAACCAGGTACTTGAACGCAATCCAGACAAATGCACCCCATCTTCTGAGATACCTTGCTACAGCAGTTGTCGTGAACAAAAGGAGAAGGAACATGCTTAAAGAGTTGATTAAAGTCATTCAGCAGGAGCAGCACAGCTACAAGGATCCCATCACTGAATTCTTGGAATGCTTGTATGTTAACTATGATTTTGATGGTGCACAACAGAAACTCATAGAGTGTGAGCAGGTATGTTAGCATGTTTTGAACCTTTTGTCCATCCCATCACTATTTTTTTTAACTTGGTGCATTACTAAATATGATATGAAAACATTGAAAGACAATTTCTCCTCACATTTTTTTTTGGCAAAACATCATTTTCCTATATGAATTTTCACTTGCTAGTTCTGTCCTCTGACTAAAATATTTTATGTTTGGCAAGGCAAAGTTCACCTCTGACATCCTTATATCTCTGAGGCCTATGTGGGGGGTTCCTGGCATGTATATATTTCTGGAGTTGAACATTAGCTTATTGTTGTTACTTTATTTTATGTTTTTCCTCAAATGATAACTGTTTCTCTGGGCATAGCTATGATTTTGCATTACCAAATTTTGGGCTATTTCTGTATTATTGTCTTCTCAATGGTGATCATACTGTTACATAACAATCTTGCATTTATCTGTTCTAATGGCTACCTTTGTAGGTCATATTGAATGATCCTTTCCTTGGAAAGCGCATTGAGGAAGGGAATTTTGTCACTGTTCCTTTGAGAGATGAATTCCTTGAAAATGCTCGTCTGTTTATCTTTGAAACTTACTGCCGTATTCATCGGTGCATTGATATTGGGTAGGTGTTTCTGTCTATATACTCTTTTTTTTTTTTGCTGACATGAAAAAAAGTTCACTAAGATGAATGGTAGAAATCGTAGTTATACATTATCATTTCAATAATCATGTGTCGGATATAAGTTGGTTCTGTACCTTGCTTGGGCTTGCATTGTTTTCCAATCAACTGCTTTCCATGTTATAGGGAATACTCAATGTTTATCAGCAAAAAACTGTATCATTACTTTATTTTAGTTGCCGTTGCATCTCTGTTCTGTCTTCTCAGTTAGAAATAGTTTTACTAAATTTGCACACGTTTTATATAGGTTTATTCTTCATATTATATGGACCATGCAGGAATACAGTTTCTTTCATATCTAAGATGTTCTTCCAATGTTTTGCAATGAACAGCATGCTTTCGCAGAAGCTGAACATGAGCTACGATGAGGCAGAATTGTGGATTATGAACTTAGTTAGGAATTCAAAGCTCGACGCCAAGATTGATTCAGTGTCTGGTACTCTTATCATGACGACCAATCATGTTAACATGTAAGTTGCTCAGGCCATACATGCTGCGAGTATATGCCAGTTCATGCTATGTGCTTTTTAACTCATTAAAGCTATGGTTGACCTAAGCTTTCGACAATGGGATTGAATCTAATTAATCATTTATTCATGTTGCAGCCATGAGCAGGTTATCGAAAGCTTAAAGAATCTTAACATGCGGACTTTCCTGCTAGCAAAGAACATTGTGGAGCCGGCTCAAGCAGCACAACAGGCAGCTCGGTGA</dnaseqindica> |
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