BGIOSGA024634

From RiceWiki
Revision as of 06:15, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA024634| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024634, complete gene.| tag = OJ1119_...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA024634

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA024634, complete gene.

LocusTag

OJ1119_B04.6

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA024634-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA024634-PA

Length

6974

Source

Oryza sativa Indica Group 

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:5762252..5769225

Sequence Coding Region

5769196..5769225,5768717..5768842),complement(5768505..5768624,5767689..5767964),complement(5767081..5767253
,5766119..5766394),complement(5765129..5765280,5763957..5764147),complement(5763689..5763797
,5763441..5763595),complement(5763230..5763322,5762895..5762975),complement(5762252..5762314

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:5762252..5769225 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:5762252..5769225 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGACAACAGAAAGTAGTGCAGAAATGAGCGAGTTCATCGCAGAATGCTTCATGAGGCGTGCTTACCTGACTGGGTTCACTGGTAGTGCTGGTACGGCTGTGGTCACAAAAGATAAAGCTGCTCTCTGGACTGATGGCCGGTACTTTCTCCAGGCTGAGAAAGAACTGAGCCATGATTGGACACTCATGCGCAGTGGAAATCAAGGTGTTCCTACCACTAGCGAATGGTTGAACGAGGTGTTACCATCTGGTTGCCGAGTTGGCATTGACCCGTTTCTTTTCTCATTTGATGCAGCTGAAGAACTAAAAGATGCTATTTCCGAGAAGAACCATGAGTTAGTTTTGATCAAGGATTTGAATCTAGTTGATGAAATATGGGGAGAATCAAGGCCAGAGCCCCCAAAAGAACAAACTAGAGTGCATGGAATCAAATATGCTGGCGTTGACGTGCCATCAAAATTGTCCTTTGTTAGATCACAGCTTGCTGAAAATGGGTGTAATGCTGTGGTCATTTCGTTGCTTGATGAAGTTGCATGGTTGTTAAACATGAGAGGAAGTGATGTTCCAAATTCACCTGTATTTTATAGCTACCTTATTGTGGAGGATACCGCTGCTACATTATTTGTGGATAACAACAAAGTATCTGAAGATGTTTTAGAGCACCTCGAAAAGGCTGGAGTAAAACTAAAACCATATGAAGCGATTTTGTCCGATGTTGAGAGATTGGCAGAGAATGGTGCAAAGCTTTGGCTGGATTCTTCAAGTATAAATGCTGCCATAGTTAATGTGTTTAGATCAAGCTGTGAGAGATACGTGAAAAAGAGAGGAAAAGCAGGGAGACAAATTGGAAAAGAATCATCTCAAGGTGACCCAGCTACTGGAAGCTCTGGTGTTCAGAATGGAACTGTAAATGCTCTATACAAAGTTTCACCAGCCACCCTAGCCAAAGCAGTTAAGAATGAAGCAGAAGTTGAGGGTATGAAGAGTTCACACCTAAGAGATGCTGCTGCTTTAGCAGAATTCTGGTGCTGGCTAGAAGGGCAAGTTCGTGAAAGTGTACCACTTACAGAAGTGCAAGTTGCTGAAAAGCTTCTTGAATTTCGTCAAAAGCAAGATGGCTTTATAGATACAAGCTTTGACACTATCAGTGGTTATGGTGCAAATGGTGCTATAATACACTACAGACCAACTCCAGAGAGCTGCAGCTCTGTCGGAAGCGACAATCTCTTTCTGTTAGATAGTGGTGCTCAATATATTGATGGAACTACTGACATAACAAGGACTGTTCACTTTGGTGAGCCAACCCCAAGGCAAAAGGAATGCTTCACAAGGGTTTTGCAGGGACATATAGCTCTCGATCAGGCGGTATTTCCAGAGAGAACTCCTGGCTTTGTATTAGATGTTCTTGCACGCTCTTCTCTGTGGAAGATTGGGCTGGATTACAGACATGGCACAGGTCATGGAGTTGGAGCTGCACTAAATGTCCATGAGGGCCCTCAGAGCATAAGCTATCGATATGGAAATTTGACAGCTTTACAGAAGGGCATGATCGTAAGCAATGAGCCTGGTTATTACGAAGACAATTCCTTTGGCATTCGTATAGAGAATCTTCTTCTGGTCAAAGAGGTTAATTTGCCAAATTCGTTTGGTGGCGTCTCGTACCTTGGTTTTGAAAAATTAACTTTTGTTCCAATTCAGAGCAAGCTTGTTGATTTGTCCTTACTATCACCTTCGGAGATCAATTGGATCAATGAATACCATGACGAAGTCTGGGAAAAGGTTTCCCCTTTGTTGAGTGGCCATTCTCTCGACTGGCTCCGGAAGAACACAAGACCTCTTTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>METTESSAEMSEFIAECFMRRAYLTGFTGSAGTAVVTKDKAALWTDGRYFLQAEKELSHDWTLMRSGNQGVPTTSEWLNEVLPSGCRVGIDPFLFSFDAAEELKDAISEKNHELVLIKDLNLVDEIWGESRPEPPKEQTRVHGIKYAGVDVPSKLSFVRSQLAENGCNAVVISLLDEVAWLLNMRGSDVPNSPVFYSYLIVEDTAATLFVDNNKVSEDVLEHLEKAGVKLKPYEAILSDVERLAENGAKLWLDSSSINAAIVNVFRSSCERYVKKRGKAGRQIGKESSQGDPATGSSGVQNGTVNALYKVSPATLAKAVKNEAEVEGMKSSHLRDAAALAEFWCWLEGQVRESVPLTEVQVAEKLLEFRQKQDGFIDTSFDTISGYGANGAIIHYRPTPESCSSVGSDNLFLLDSGAQYIDGTTDITRTVHFGEPTPRQKECFTRVLQGHIALDQAVFPERTPGFVLDVLARSSLWKIGLDYRHGTGHGVGAALNVHEGPQSISYRYGNLTALQKGMIVSNEPGYYEDNSFGIRIENLLLVKEVNLPNSFGGVSYLGFEKLTFVPIQSKLVDLSLLSPSEINWINEYHDEVWEKVSPLLSGHSLDWLRKNTRPL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..30#384..509#602..721#1262..1537#1973..2145#2832..3107#3946..4097#5079..5269#5429..5537#5631..5785#5904..5996#6251..6331#6912..6974#ATGGAGACAACAGAAAGTAGTGCAGAAATGGTGAGCAATGGTGATTATGGTGCAGTTGCAGATTGACTGTTTCGATCGTGCGTTGATATTAGTGGAAACAACTACTGATGCGTATGTATGCTTTTTGTATCTGGCAAGTAGTCATGTTCTATGGCCTGATTTTGATGTCAGGGCCTTTCAGTAAACCATCGTTAGCTAGCTATCTGAAACAAGGATTCATGTATGCATGGGAGCACATGATATATAGTGTCTACACTGTTTGTTTGTGAAGCTATTGATGCTCCATGATACTAGGAAGTAGAAAAACCTCAATGCATTCTTGATCTCATGAAACTACATGCCCCTCTCCCACTTACCTGCTTTTGTTAATATCTTATTCTCAGAGCGAGTTCATCGCAGAATGCTTCATGAGGCGTGCTTACCTGACTGGGTTCACTGGTAGTGCTGGTACGGCTGTGGTCACAAAAGATAAAGCTGCTCTCTGGACTGATGGCCGGTACTTTCTCCAGGTACTCAATTCCCACACGGCAAATTAATTTCTTAGCAACCATGGTTTTATGTGGCTATTGGCTAATCATTCATCTGTTCTTCTGTTGAGTAGGCTGAGAAAGAACTGAGCCATGATTGGACACTCATGCGCAGTGGAAATCAAGGTGTTCCTACCACTAGCGAATGGTTGAACGAGGTGTTACCATCTGGTTGCCGAGTTGGCATTGACCCGGTGAGATCTTGTTTTATCATCAACCAAACTAAAAATGGATTATTTTGCTAATATGCCTTTTCTCATGCCATTATCATGTGATAAATAATTATCTTTTCTTTTAGTTGGGCTTCTTTTCATGCAGTTTTTGTACTTCAAATTCTTACATGCCCATGAAATGACAAACTAGTGTATGGATGTTAGAAGTAAAGAATAGATTGATGTTTAAATTAAATTGCAAAATCGTATCCTGAAACTGCTTTGTGGCACACATGCATCTTAAAATTTGAGATCTTATTTTTTTATCTAAATTTTATATCTCCCTCACAAGAAGTTAACCGTTTTATGAATGTGTACTGTTGGTAAAATTTACAGTCATTTGAAACCTTCTTGTGTTTACTTTGTAAATGTTACATTCTGACCAAGAACTTTATTCCATTTAGTCTTCCTACTAAGTTTCAGATAAATGTGCATTCTGAAAAATTGTTTATGTTTTGATATTTTTGTTTCATTTTATTCTTGTCCTAATACTTTATTTCTTACTTTGTTTGAAGGATGCAGTTTCTTTTCTCATTTGATGCAGCTGAAGAACTAAAAGATGCTATTTCCGAGAAGAACCATGAGTTAGTTTTGATCAAGGATTTGAATCTAGTTGATGAAATATGGGGAGAATCAAGGCCAGAGCCCCCAAAAGAACAAACTAGAGTGCATGGAATCAAATATGCTGGCGTTGACGTGCCATCAAAATTGTCCTTTGTTAGATCACAGCTTGCTGAAAATGGGTGTAATGCTGTGGTCATTTCGTTGCTTGATGAAGTTGCATGGTTGTTAAACATGGTACTAATATTTTGGCTCTCACAGTTACTTATATCGTTTCTTATGACTTGACACCTATGTTTATTGCTATATTCCTTTTTTATGGATTCTCAACTATCTGTAGCTCAAGATTAATATTTACCAAAGTTTGTTTTTACCAAACTTTCTGCTTAGCACTTAGTACTTTCTTTTCATAATTTGAAGGATGTTTTATGTTTTGTGCTTTTATGGTTGTAAACTTGTTTTCTGCTTATCGGATACATTTCTGTACTATTGTCTTATTGTGCAAATTATGAAGGTCATTAATCCATAATTGGGAGGTGGCATGATATATTAGCACTTTTCACACTTGATAATTCGTGTTCAGAGTTTGTTTTTTTTTCTACTATGTTGAGCATGCTTGCACTTTGGTTTATTATGGTTAAGCTAGTCAGTTTGTCACATTTTGGTATGCAGAGAGGAAGTGATGTTCCAAATTCACCTGTATTTTATAGCTACCTTATTGTGGAGGATACCGCTGCTACATTATTTGTGGATAACAACAAAGTATCTGAAGATGTTTTAGAGCACCTCGAAAAGGCTGGAGTAAAACTAAAACCATATGAAGCGATTTTGTCCGATGTTGAGAGGTAATTCTTCAGAAAAGCAATTATTGTTTCTGATATTGATGTCATATCATCTCCCTTTATATTTGGAATTAGATAAGAACCACCTTTAATTAATTTGGTAGTTGAGCGTGCTTATTAGTCTTAGCCAATCGGATATACAATTCTGATCATAAATTTTGTGAGTTGATAACCTGTTGAAACCAGTGACCCATTACGTCATTTCCGTGTTCAACAGCTTTTATCTAAATTCTTCTCTGCCCTGGAAGTGGTAGGATTTCCTGTTCTTCCTGTCACATATTGATTTTATGTTCATCTGTGAACTTAAAATCATGTACATGATTTTGAAAGAAATACATAATGATTATGTCGCATTATTGCACGTATACCTCACAAAAGGACTTGAGCTTGTTACTGATTGAACACCAAACATGTTTTTGAGATCCCAAAATTTGTAAAGGGCATTTAGCCATGGTATTTGATTATAATAATGTGCCAACTTTACCAGTCCTTGGTCTGGTTCAGTACTTGTGTGCTGTTCCAGTCAGTATTCTTGAACCAATTTCTATTAAATTTTATAATTGTATTTTAGTAGCTCTAACTTAAAATGTGATTATATGAAAGAGACTAATTTAAATTGTCAATGTTCACCTCTTAAACTCCTCCATGATTATCTTAGTCTGGAAATTGTTTCCCTTTTCCTTTTCTAGATTGGCAGAGAATGGTGCAAAGCTTTGGCTGGATTCTTCAAGTATAAATGCTGCCATAGTTAATGTGTTTAGATCAAGCTGTGAGAGATACGTGAAAAAGAGAGGAAAAGCAGGGAGACAAATTGGAAAAGAATCATCTCAAGGTGACCCAGCTACTGGAAGCTCTGGTGTTCAGAATGGAACTGTAAATGCTCTATACAAAGTTTCACCAGCCACCCTAGCCAAAGCAGTTAAGAATGAAGCAGAAGTTGAGGGTATGAAGAGTTCACACCTAAGGTATCGTTTTTAAAAAATGTTTTTGAATTCTTTGTTTTTTCGTCAGTTGAAAAATGCCTGAAGAGTGAAGACAGAACCTTGATTTCCTGGAATTGAAAGAACCATACCTGAGGCAACCATATAGTCTGGTTATTGCATTGTAGCAACAATATAAATGTGATTTTCCCTGTACGGATTGTTCACTTCAATTATTCTTTTTCTTTATACTTGCCCAGTAAGCTCTATAATTATTTATACATGTAAAAAATGTCTAATGATATGACAATTTCACTCATGGAAAAATGTCTAATAATCTTTCCCCTTACTCCGACAAATCCGATACTAGTGTACTGATGTACAATAAATGATATTGCTTCTAATATATCTCATATCAGTTTCCCACTATATACGACTAGGTCACAAAATTTGCAATGGAAACACAGTGCCTGCTTACCTATTCATCGTGCACAAATAGATATCCTAAATATGGATATGGATATCACGTGCCAAATTCTCATGTAGTGAGCAACTCATAGTAGAGATCAAATACAAAGCTCCATCCATAGACATGTACTTAGATGATGTCATTCTCCACAGAAAATGGAGATCCTTAACCTACTACCATTGTTACTATTTTTTTTCATTAGCAATGGGTTTTTATTCATCATCACTTTCAGCATTCATCATCTTCTTGTTGTTTGGCTTTCTGCACTTACCAGTGCAGCGGCTGGGTGTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTGTAAAGGAAGCATCTTCTTTTTTTTTTTCCTTTTTCTGTTAATGTGGCCTTTGGGTCCAGCTGACCACTGCATTGTCTATACTGGCACATAAATACATTTACAGAGATGCTGCTGCTTTAGCAGAATTCTGGTGCTGGCTAGAAGGGCAAGTTCGTGAAAGTGTACCACTTACAGAAGTGCAAGTTGCTGAAAAGCTTCTTGAATTTCGTCAAAAGCAAGATGGCTTTATAGATACAAGCTTTGACACTATCAGTGGTATATTTCAACTTTTCCCTGCAATATTAAAATCCCTGAGAACTGTTTTACATGGCCAGTATCTTGAGTTTCAAATGTTAATATTTGTTTGTTATTGCTATCTATTATCTGGATTGATTGTTTGTAGTTGGTAGAGTGTCTTTAGGTATTTATTATGGTGCCTTTCTCAAACCTCTTTATTACAGCGTAATTTGATAGGGAGGGGTGTAACATGTTTCACTCAGCTTGAGCCTACTGCATTTTTTCATTGTATATATTAGGGAATAATTATGCATACATTAATGGTTAGTCATGATCTGGGTCGAAGGCAGCTCCTTGACCAGGAATGTCCTGGGAACACGTGGACATTTTCGTACCACCTTGTAAACACCTCTTGCAAGTAGCATATCACGTTCCTCGAACCAATCGATCTGGAACTTTGTTACTATTCTCAAGCAGTTTATCTAAGCCTTTTCATTATTTAGTTTTGCTAGCTAAATGTCCATGTGTTGCTACGAATGAAAATGGATCTACATGTGCTAATATTGTTTGAATAAATTGCGTGATTTTTTTCATTGAACTCACCCACCATGTTTTTGTTACTTCTGTTGAAGGGAACACTTAGACAACTTTTTGCATTACTCTATTTGTAAATTAGCATTTATACTATATATGTGACAATTTTTGTCACCATAAACCTTTCCATGAATTTAGAGATGGAATAAGATACTAACAATATTAACAAACTTAAGAAGTACTTGGTACAAATGTACTGCAGAGTTGGTGTGCTGGCAGATTCAGTGCCACAACTGCCTTGTTTCTTTTAAAACGAGTATTGATATATGGTAGGAGTACAATGCATGTTATGGTTTAGACTTATCTCAATTTTCATGCTGAGCATCATGGGAATGTTTAATGTGACATTGGACTACTGCTGTTTGCAAATGCCGTGTGATGTCTGCAGTTCTTGACTTCTAATATGTAGTCAAATTTTCCACTCAGGTTATGGTGCAAATGGTGCTATAATACACTACAGACCAACTCCAGAGAGCTGCAGCTCTGTCGGAAGCGACAATCTCTTTCTGTTAGATAGTGGTGCTCAATATATTGATGGAACTACTGACATAACAAGGACTGTTCACTTTGGTGAGCCAACCCCAAGGCAAAAGGAATGCTTCACAAGGGTTTTGCAGGTAATGTTTAATTTTGTTTAGACCTGTAACAGTTATTTTTTACTCAATTGTAACAGTTATTTAGTATGTCTTGCCTTCAGTGTGCTATGATACTTGTCTCACTCAACACTTGATTTTTGTTTCATACTTTATTCGAGTCATAAAGTTTTATTGTTTCAGGGACATATAGCTCTCGATCAGGCGGTATTTCCAGAGAGAACTCCTGGCTTTGTATTAGATGTTCTTGCACGCTCTTCTCTGTGGAAGATTGGGCTGGATTACAGACATGGTACATTTTCTAAGCACACAAAAATCTCTGAATGCTGGAAGTTATGGCATGTGATGCTACGTAAATTGATGATCAATTTTTCTCTTGTTCCAGGCACAGGTCATGGAGTTGGAGCTGCACTAAATGTCCATGAGGGCCCTCAGAGCATAAGCTATCGATATGGAAATTTGACAGCTTTACAGAAGGGCATGATCGTAAGCAATGAGCCTGGTTATTACGAAGACAATTCCTTTGGCATTCGTATAGAGGTAGGTTTCCCCACTCTTTGCTCATGTCAGTCTCCTAAATTTTTAGGACTAAATTGAGCAATTGTGCAGATAGTACATTGAATAGCCATTTCTCATTATTTTTTCTTGAATATTGCAGAATCTTCTTCTGGTCAAAGAGGTTAATTTGCCAAATTCGTTTGGTGGCGTCTCGTACCTTGGTTTTGAAAAATTAACTTTTGTTCCAATTCAGGTATACCATCAACTCGATTTGATACTATTTTTTGTGGAAACATATTGCAATAATGGCATTGATCCACATATTACTTTCTTACTAATGAGTAATCAAGTCTGAGTAATTTAACGTTGGCCTATGAAATTAATAACTTACCACAGAATTATTTTAAGGACTGGTAACCTGAGTCTTTGTGTGCTGTTCTATATGTACACTTCTTTTTATTATCATCCACCTTGTACATTTAATTTTCGTTTCTTTGGTAACTTCAGAGCAAGCTTGTTGATTTGTCCTTACTATCACCTTCGGAGATCAATTGGATCAATGAATACCATGACGAAGTCTGGGAAAAGGTGAGTCATATGTCATTGAGGCAAAATTATTTTTTGAACAATTGATATCCAAATCTGTTTCTAAGCCTGCATTAGGTGTGGCTATTTAAATAAGAAAGAGCACTTTTTTTATTTTTAAATGTCAATTGTTGCGCAATATTTAGGACATACTGTTGCATGCAGCACATGCGCATGGTTTTGATTGTCATGTACTAGCTTTTTTCCCAATGTATTATGTCACTATTCAGTACTACCTCCGTCCCAATATAAGTACAGTTGTGGGTTTCCGTATACAACATTTAACCGTTCGTCTTATTTAAAAAAATTATGAAAAAAATAAAAAAAATTAGTCACACATAAATTCATGTTTTATCATGTAATAGCAACAAAAATACTAATCATAAATATTTTTTTAAATAAGACGGACAGTTACATGTTGGACACGGAAACCTACATCTGCACTTATATCGGGACGGAGGTAGTATTCACTAGGATGCGAATCGTCGACTGTTTCTTGGGAAGCAAAATTATTCCTCGTATACATCATTCCAAGATCATATGAACCATTGCGTTGCTTAACCACAATCATTTTCACTTTCAGGTTTCCCCTTTGTTGAGTGGCCATTCTCTCGACTGGCTCCGGAAGAACACAAGACCTCTTTAG</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA024634

Retrieved from "https://ngdc.cncb.ac.cn/ricewiki/index.php?title=BGIOSGA024634&oldid=50228"