Os12g0128800
| Gene Name |
Os12g0128800 |
|---|---|
| Description |
Similar to Arabinoxylan arabinofuranohydrolase isoenzyme AXAH-I |
| Version |
NM_001072595.1 GI:115487151 GeneID:4351402 |
| Length |
6675 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0128800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:1367899..1374573 |
| Sequence Coding Region |
1368563..1368753,1369137..1369258,1369358..1369505,1369882..1369951,1370027..1370172 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:1367899..1374573 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:1367899..1374573 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tgttttgaagctggagccaacacatcaaacattgacccatggtccatcattggagatgaatcctctgttcacgtgacaactgatcgctcatcctgtttcagtcaaaatcctgttgctgtaaggatagaggttgtctgtgacgattgtccagccggtggtgttggaatttacaatccaggattttggggcatgaatgtagaagaaggaaaggcatataatctggtcatgcatatcagatcattagaatcggtggagttgacagcttcactcacatgctcaaatggatcgcaaaatcttgcatcaaattctgttcgagaaactaatttgtcaacttggacaaagatagagctacagttactagctcaagggacatgcagaacttcaagacttgaactaacaactaggaaaaggggagtaatatggcttgatcaggtgtcacttatgccttcagaaacatacaagggccatggttttcgcaaggaactcatgtacatgcttttggacttaaaaccacggtttctacggtttcctgggggttgctttgtcgaaggcaattggttaaaaaatgcattcaggtggaaggaaactattggtccatgggaagagagacctggacactatggagatgtctggcactactggacggatgatggccttgggtattatgagttactcgagcttgctgaagacttgggtgctaaccctgtatgggtgctcaacattgggatgagtcaccatgatgcagttaatggaactatgctcgcaccttttataaaggatgcaactgacagtcttgagtttgcaaaggggagtgacaaatcaacatggggctctgttagagccacgatggggcaccctgaaccattcccactgaagtatgttgcactagggaatgaagattgtgctccattcaagctgatataccgagaaaattatcccaagttctacaacgccataaaagaggcttatcctgacatccaaataatttcaaactgtgatggctcgtctgggccacttgatcatcctgccgatctctatgactaccatatatatgaaaatgcatccactgtgtttttcaagaagaatgaatttgataggacatcacgtaatggtccaaaggtatttgtaagtgagtatgctgttaatggtgaggatgctggcaatggaagccttcttgcatcattggcagaagctgctttcctaattggtttagagaaaaatagtgatgtcgttcagatggcatgttatgcaccactcttcgtgaatgacaacgatcgcgtctggaacccagatgcgattgtcttcaactcctggcaacagtatggaactcctagttattggatgcagacatatttccgtgaatcaagcggtgctatgattcatccaattatgatcagttccagctactctgatttattggctgcctctgcaatcacctggcaagacgctgagaatacctttctgagagtgaagatagtaaacttcgggccaaatgctgtgaacctcacaatatcttcaagtggacttcaagctggtgtagatacggcaaaatcaactgtgactgttctcacatccagcaacttgctggatgaaaattcatttagtgaaccaaacaaggtcgtgccagttgccagcgagttgccgaatgcagcagaacagatgcaagtcttacattttccttactcaatttgttcgtttgatcttgctctggtttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>CFEAGANTSNIDPWSIIGDESSVHVTTDRSSCFSQNPVAVRIEV VCDDCPAGGVGIYNPGFWGMNVEEGKAYNLVMHIRSLESVELTASLTCSNGSQNLASN SVRETNLSTWTKIELQLLAQGTCRTSRLELTTRKRGVIWLDQVSLMPSETYKGHGFRK ELMYMLLDLKPRFLRFPGGCFVEGNWLKNAFRWKETIGPWEERPGHYGDVWHYWTDDG LGYYELLELAEDLGANPVWVLNIGMSHHDAVNGTMLAPFIKDATDSLEFAKGSDKSTW GSVRATMGHPEPFPLKYVALGNEDCAPFKLIYRENYPKFYNAIKEAYPDIQIISNCDG SSGPLDHPADLYDYHIYENASTVFFKKNEFDRTSRNGPKVFVSEYAVNGEDAGNGSLL ASLAEAAFLIGLEKNSDVVQMACYAPLFVNDNDRVWNPDAIVFNSWQQYGTPSYWMQT YFRESSGAMIHPIMISSSYSDLLAASAITWQDAENTFLRVKIVNFGPNAVNLTISSSG LQAGVDTAKSTVTVLTSSNLLDENSFSEPNKVVPVASELPNAAEQMQVLHFPYSICSF DLALV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>665..855#1239..1360#1460..1607#1984..2053#2129..2274#2360..2405#2496..2548#2714..2864#3330..3448#3584..3655#4648..4751#5046..5102#5195..5387#5603..5746#6069..6167#agccgttggatggccatccaacggttgatggatcgtcttcaacctccagctcatggctactctctctctctctctctctcctcttgaacgattccctcctgcctcctccctccccgcacctgcacctgcaccatctccggcgtctctcgcggccggatccgccgcctcctcacccaccgcccaaggcctcccctccctgtatacgaagccccgatgaactgctcctccctccacaacccctctataccccgccagatccactccacggccccaccccaacccaatatcctaatccattcgccctctctcgccggggaagaaagccaaaaggaggaggaggaggctcatcggcgcagggatgctcgggattcaccggccagctcgacctcgttttggtgggggtggtgtgtgtgagagtgagtaacgaaggcttgaggttgaagaagcaacatggatggtttggatttgtgatctactgccaagaatatttggggagaaatcaatcacctcatgtatggcaaatgcaaggatttttgaggagaaatcaaccggctgatgtatagcaatgttgaataagaaaacattttcccccctcaataaataaataaataataatatttggagtttaactttaactgattttttgtctaatttcttgctttaggttttgaagctggagccaacacatcaaacattgacccatggtccatcattggagatgaatcctctgttcacgtgacaactgatcgctcatcctgtttcagtcaaaatcctgttgctgtaaggatagaggttgtctgtgacgattgtccagccggtggtgttggaatttacaatccaggattttggggcatggtatgagttctatccatttttataagtgcattcctatatgaataatatgcaaaatagagcttgtaattgaaagtagtatcctttttttttacgacagtttacaataaacagtgctgccacagaaagaaactatagcaaagttatttattctgttcgaaatggtgaagaaaacaaataattaagctaacctattttttgtttgatttcaatttgcatttatcttttccttgcataatgctggttttttatcagattgttgtgcattgctcttggaaaagtgtaatctatagcttttcttcgaaccgttttcattttaccttctcatattttaatgggattttaccttctggttttgtgacgaatatgatcatttcaattttcagaatgtagaagaaggaaaggcatataatctggtcatgcatatcagatcattagaatcggtggagttgacagcttcactcacatgctcaaatggatcgcaaaatcttgcatcaaattctgttcggtatatattttttccgtaacactgagataaaaaaggtttttcaatctctctcgctcgttcgctcgctaaccgaaaggattgtacatcaaatttctgcagagaaactaatttgtcaacttggacaaagatagagctacagttactagctcaagggacatgcagaacttcaagacttgaactaacaactaggaaaaggggagtaatatggcttgatcaggtgtcacttatgccttcagaaacatacaaggtgcactgtcttttacttttttattgctactgtcatcatagcttgatctggaatccggtatcatcttgtgaagaatggagaatagaattcatgcactgaccccaaagattttagccactacaccatgccaggttcaatggacaccctgttcaaatcatgtctgctatttgatattattcaaacttatttaaaaaggtcatcataaaaattatcaatttattcacattgctatctgacaagaaaaaaaagtaaattaacttatctgtaatcagtaatcccgtagagatggcagatcgagttattgttccttaatctacatttgcttactatgagtccataggagttgttgatcgacatttttcttctacatatgcagggccatggttttcgcaaggaactcatgtacatgcttttggacttaaaaccacggtttctacggtttcctggtatttcgaatgttttccaactggcaatcaatttcggttgccctgtaatttaatcgctcgcattacatttggcagggggttgctttgtcgaaggcaattggttaaaaaatgcattcaggtggaaggaaactattggtccatgggaagagagacctggacactatggagatgtctggcactactggacggatgatggccttgggtattatgagttactcgaggtatgggttgattaatgtgaaatgggttttttcttttggtctcggcatatctcaccatttgtttacttcaaaatgttcatgaaagcttgctgaagacttgggtgctaaccctgtatgggtgctcaacattggtaaatatcgtgtctatttgtcttgttcaatgtatttttaatctttgcacaaaccaacgaactgctcagggttttttatcttgtaattagggatgagtcaccatgatgcagttaatggaactatgctcgcaccttttataaaggtatgttttcgatgccctacattttttgaagtatggatgagatgaagatggacttctcatgatgtaacagaaaacagttgtaacatgtgaatattaacataaggccttgcatttattgtgatcccatgtttcttatttcgagatgctttgattttcttgctacaggatgcaactgacagtcttgagtttgcaaaggggagtgacaaatcaacatggggctctgttagagccacgatggggcaccctgaaccattcccactgaagtatgttgcactagggaatgaagattgtgctccattcaagctgatataccgaggtaaattttgcataataaacaaatagtattgtccttcgtgttaatgctgcgatgattggctaaattcatcattctgttttttatcgatctgcaagggtaatagcactattttatttaacttcaccctttttagtactatctgattgcataatggagatattttggagaaataatagatgaaaaaattggctgcatgccttgtggcagaggccagggatgtaaaatatttccattataaaaaaaataatagatgaaaagaaaaacaagaagttaatttaccagtctgctgttatgtttcgaaacagactttaccagtttctagaaggttcattagttttacatttgattgaggccaaattggctacgacgtataatgctgtttcagtacatttaaatgggctactactatcataaatatcctaattttcccttgatatcatataaccatgtaattctgttgaacagaaaattatcccaagttctacaacgccataaaagaggcttatcctgacatccaaataatttcaaactgtgatggctcgtctgggccacttgatcatcctgccgatctctatgactaccatgtaaacaactcactgagactaatttatttctatcattctccctatttttaaattctgtcttgctggtttttttcagacttggttatgtgatcattttctccatagatttctgagaatgttacatttattctgtagatatatgaaaatgcatccactgtgtttttcaagaagaatgaatttgataggacatcacgtaatggtccaaaggtaatgaatttgatataaagtggcttcttttgggaaattaagttcttttttttattttttttagagaagggtattttttacccggcctctacatccaaccggatatatgcggccattgaaatagggaacttagccccacaaacaacccaatctgaaattcgctccataggagatttgaactcaggaccttgggtactaggagattcgctccataggaaattaagttcttagattagatcagtcttacaaaggcagcttctctcatgcgccattatcctcgacattttcttgaatgaaatatgcttctagttatttcgaaaaaaaagtgtttctaggtattagtttcttccatcttcttccatgactgagactgaatctataagatcagaatatatgataacttgaataatatcccaaactagagcaatctactagtacttcataacttgaactccagatcgcttctagagcaatctgctgtggtattgattgacaacaagcatagttagtaattatgacaacaagcatgttcttcttcttctcttccttttcccatgagaagaagcctaactatcgaatagcaaaacgtaagacgctgttcttccttttcccatgtttgttggatggtttggaaggaaagaaatgcgcgtgtgtttcagaaccagcggcgctcagccggtttcctgtttggttcaatcaaagaggaagtggcgatttggaaggaagctggggttttcagaaatataggagagtagtcccttagtgtaatcttttgcttttgggaggttgctccggtgacaacttccattacttcgacagcttcttgttgaagttataactttgtatatttgtatatattcttcaatcttaagtaaatttggttggcctttcttggccggcccggcaatttattcatctcattaccctttgatgttggatagacagaatataagtgagcaggaaccactgactatgcaattgtttcactgcaggtatttgtaagtgagtatgctgttaatggtgaggatgctggcaatggaagccttcttgcatcattggcagaagctgctttcctaattggtttagagaaaaataggtgatccctctggggatactctcttaattctttatcttgggttcagagtaaatataaaatcatgcgcagagttgtctacttgtatccagaccatgcatgaatataagagatcgttcaatgggattcctggataaattgttgatttttgtttgacaactactacctcatctttgtacttctccacaaggaaaatattttgagtaaatgtataatttgtaaaaatttacattgagcaacagtaattccttattgcaagttattgaattggctctcatcatgcatgcttctttgcagtgatgtcgttcagatggcatgttatgcaccactcttcgtgaatgacaacgatcgcgtgttagtatacatggtcttatactttctttgttcaaggattctagcatctgtttcctctctgactattgctaatgtataaatgtgataaccagctggaacccagatgcgattgtcttcaactcctggcaacagtatggaactcctagttattggatgcagacatatttccgtgaatcaagcggtgctatgattcatccaattatgatcagttccagctactctgatttattggctgcctctgcaatcacctggcaagacgctgagaatacctttctgagagtgaaggtaaaccatccattccagtttcttctaaacttatatgcatttggttcaattcattagacatgcgccttattgtttggaatgatttagttacaacgatacaaaattgattcagccaatgcatacttgcataacatgcatctgtctttatatgtattactgctggagtaatatgtttggatcttagaacatcctgatcttcaaatgatcttccacagatagtaaacttcgggccaaatgctgtgaacctcacaatatcttcaagtggacttcaagctggtgtagatacggcaaaatcaactgtgactgttctcacatccagcaacttgctggatgaaaattcatttagtgaaccaaacaaggtatgaccaattttgctttgatcagtaattattggtttcagactttcattactatgcacagaatttagaagagggtaacttctccattacaaaaatctggtctgttacaattagacatgcaggtggtatgcctcgcatttgtcaagtagtgcgtgctacataaacacctttgtagatatatccctactctgccttttattttgtcatgtctggattatttccttgtctttctaaagaacacagagaatctattgtaacacacgatatctcagggtacgcaagttggtctaacatacaagtttcttgtgaacacgcattgcaggtcgtgccagttgccagcgagttgccgaatgcagcagaacagatgcaagtcttacattttccttactcaatttgttcgtttgatcttgctctggtttagccgtttaattagcacaagtttatcaggctaacatgttgggacgctgtttctgtccttaatgacatcccaggatttcatagtgatcaaaagctaattattccactgtatcagagcccattaggccaaggatggttttaattaaagcttagtttgaacaactcgctttatttataatatatccctttattgcttctaagaaatcatcgagttgtttgtttggatattagtaatgatatgggaattattaagttgaccagataaaaatgtagaatgcatcaaaaaggaacttggtatcaatgagatcacgtctcctttttgtttgatagccatggatatgatgtttctataatatggggatggtgatgagtctctcttttgttttcttgcggtaatgcagctctgttaatttctctattacggtttggcaagatggccggtgtctccggatgtgattttttttgagtaaatttcactttggacctgttttattgaccaaagtttcaccatg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |