BGIOSGA025290

From RiceWiki
Revision as of 06:26, 27 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{IndicaGene| GeneName = BGIOSGA025290| Description = Putative uncharacterized protein| Definition = Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025290, complete gene.| tag = P0506C0...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

BGIOSGA025290

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA025290, complete gene.

LocusTag

P0506C07.10

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA025290-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA025290-PA

Length

7358

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:4497651..4505008

Sequence Coding Region

4497651..4497723,4500008..4500356,4502615..4502683,4504286..4504421,4504979..4505008

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome07:4497651..4505008 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome07:4497651..4505008 source=RiceIndica07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCGGACCGCATTGCTGTGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTGAGGAATGCTCTGATTGGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAKSRPPKRILESYTIKGSDKVIKPGDCVLMRASDTSKPPYVARVEAIEAAGSRGTNVRVRVRWYYRPEESMGGRRPFHGAKEVFLSDHYDVQSADTIEGKCNVHSFRSYTKLDSVNAEDFFCRFEYKSATGSFVPDRIAVFCKCEMPYNPDDLMIQCEECSDWFHPSCIGMTIKDAKKLEHFFCQSCTAENGKMAENSHEATAQSEEKQVESKRRRR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..73#2358..2706#4965..5033#6636..6771#7329..7358#ATGGCGAAGTCGCGGCCGCCCAAGCGGATCCTCGAGTCCTACACCATCAAGGGCTCCGACAAAGTCATCAAGCGTGAGGCTCCCCCTCCCACCTCCCCAACCGCTGCTCCCTTCGATCCGGAATTTCTGGGGGTTTTTTTGGGGGGGATTTTTTTTGTGGGGGCGTGGGTTTCGGTGGGTCGCGGTTTGTTGAGGTCTGGAATTCTGGGGTTTTAGCTCCGGTTAGATTGAATGTCGCGGAAATGTTTGCTCTGTTTCGGGGGAGCATTTTAATTTCCCTGATGTTTCCGTGCGAAATGAAATGGTGTTTAGGTCTCTGGTTTACTGTTGATGTAAGCTCGATTCATAATCAGAAAAGGAAACCATGGTAGGGATATGTGAGCATGTTAACTTAATCTGTTGGAGCGTTAACTCTTTGTGGTTTTGATTATTCATGGGTTTATCTCTCTTTTGCATGGGTTTTAGGACGGTTAATACAGAAAAAAATATATGTGCTATTGAGTTATGTTATGAGTTTAAACTCATCTTGATTTTCTGTTTTAGATTATGTCCAGTGGAGCCCCTACATGGTTTTGTCTGGGTTGTGAGCTACAGTTTTAGCACCATGAGCTATGTCATTTTGCTGATATAGCGTTTTTAATTGCAATTTACGATCGCCAATAGTTTGGATTCATATGTTGCTAATCCCAGTTAGCATTATGATCATTGTGGTGCTTATAGTCGTGCTGTAATTCTTGTAGCTTTACCCCTCGAAAAAAAAATTTTCTTGTAGCTTACGCTGTGTTTCAGTTCTGGTTAGTATTAGACATTTGCATGAAGAACAATAACTTCTACTCAATGTGTCTTACCTTTGACTTTTTATTTAAGAAAATCTTTATCTCACGGCTTAGACCTTGTGTTAAGCTAACTAATTGATTCTATCCAGTTAGGCATCTTAAGTTTTTTTTTGATAGATAGCGTGCTTTAGCCTTAAATGAAAAACGGTTATTTTGCCTAGTTTTTCTAGTCTTAACTCTTTTTTGTGCTATTTATTCAAAGTTGATGCATGCGTTCTACTAATCTTAGCTTATGCAAAGGTCAGAGATGCCAGATTCTGAGATTTCTGACATTGTTCTATTGGCACATTGGGATTCTTTGGGATGGAAACCTGCCTAGATAAACCTTAATTACCGGTATATTACTTGCACCAATCTATGCAAACTTAAATGCTTCTTCTAGCTTGAGCCTCCTTTTCTATATTTATGGTTAATATCCAGACGTGTGATAGCACCGATGAACCTTGATGCTTCGATTACCTTGTGTGTGTGTGTGTTTTGAGAACAGATTACCTTGTGTTTGGTGAACTTTTGATTACCTTGATGAACAGACGAATATTTTTCATGGTTTCTAGGAGGGTAATACATATATGTGCTGTTGAGCTATGTTATGATCTTAAATGCACTTTGATTTCCTGAATTCCTGTTTTAGATTATGGGAGTTCAGTCTGTAAGTAGTTTTGTATCTGTTTGTGAGCTACAATTTAGCACTACTGGCAGAACCCTTCTGCTAGATATAATCTAGAATCTGCCTTCTGATCGTCATTTTGCTAATTAGAGATTTTTTTACCATCTTAATGGCTGTGTTCATGTGTTGCAAATACCAGCTGTAGTTACAATTGTTTATGGTGCTTATAGTCTTGACCTTCTAGCCTATGTTGCATCTAAGTTCTGGTTGGTTTTGACATTTGCATGAAGACTAATCTCTTTCTACACAATGTAGCTACTGTTGGACTTTTTACTGAAGAAAATGTTTGCTTAACTGCTTAAAGTTATGTAATCAATACTATCCAGTTAGGCACCCTAAAGTTTTGTTTTGGCTAGATAGTGTTCTCTAGCCTTAAATGCAAAATCAATATGTTGCATAGTCTTTCTAGTCTAAACTCCTTTTGTGCTGTTTGTTCAAAGTTGATTCATGCCTTCTGCTAATCTAACTTATATTCAAGTTAGAGGTGTCAGATTCTGAAGTTTTGATATCTGTTAAATTCTTTGGTATGGAAACCTGCCCAGATAAACATAGTTACTACTTACACCGATATCTGTAGACTTAATTGGTTCCTTTAGTGTCAGCCCTTTGTTTAATTTTATAATTCATATCTAGATGTTGACAGCATCCATGAACCTTGATGCTTTGATTACCTTGTGTTTAGTACACTTTGTTTTACTCTAAGCAGATTGCATTTCCTTTGCTCTGAGATTATCACTGTGATGCCAGTACTATCCAATACCAGCTTTACATCTTGATGATGACCCATGTCACTATTTTTTATAAGCATAAAATTATCTCGATACCTGTCTGATTCTCTTATATGTTTCTTGCAGCTGGGGACTGTGTGCTAATGAGGGCATCTGATACATCAAAGCCACCCTATGTGGCAAGAGTTGAGGCTATTGAGGCTGCAGGGTCACGAGGCACAAATGTGAGAGTACGGGTGCGGTGGTACTATCGGCCAGAGGAGTCCATGGGTGGAAGGCGTCCATTTCATGGTGCCAAAGAGGTGTTCCTCTCGGATCACTATGACGTACAGAGTGCTGACACCATAGAGGGAAAGTGCAACGTTCACAGCTTCCGTAGCTACACAAAGCTTGATTCTGTCAATGCTGAGGACTTCTTCTGTCGCTTTGAGTACAAATCAGCCACAGGAAGCTTCGTGCCGGACCGCATTGCTGTGTAAGAATTTAATGCAACCTCCGCTATGTGATAGCCCTGAAAAGAACTTGTTTCGTATTTGCAGTTAATTCCGTTGACATCTGCACAATATTGATCTGTTATGTCGATGACATTTTCCATATTTAAATATCATGTTATCTGTTGATTATGTTTTCCAGTCTTCTTTAGGGATTTCACACATGCCTTTTATATTTGATGTGAAATCCCAAGGTCAACAAGTTCGTAATTCTGATGAGTTGATATGTGATATATGTATCCTTATGACCTGTCTAGATTCTATAGGCTTCAGTGCATCACCAGTTTTATCTTTCCAAAGAGTCACAATAACTATTTCCCTGTGTTGAAGTGGAATATGAAGGGATGCATAAGGTTTTGTGCCTATTTTCAGCTTGCCACATTTGCTGTTATTACTTGCTTTTGGAGAAAATAGAGGCACAGTAAAATGCTCTTACAAACTTGAGATGTTCTTTTACCGAAGAGCCACTGCATGCCATGATATATTATGTGGTATGTCTATGGTAGGCTCGTGTAGTGGTGTAGCCCATATTGCACATACGTACCAAGACAGCTAGAACCCATTGCTTACTACACCGCCCCAATTTAGTGCATTCTGCACCTTGCCCCATTTAAAACTATTCTTTTCGAGTCACATGCATGATACATCACGGCTGGTAGAAGGCTTATGAGGGGTCAGCGTGCCAGGCTCATGGAAGCAGCCCATGCCGTACCTTCCATCTAGCTGTTGGTGTTTGAGATGAGGCTATAGGTTGTGCTGGCCATAGTACTAGATTAGTCCGGATCATGTAGTGTTAGCGAGGTTAGAGATAAGATTGGTTACGATTTATTACTTCTGCCTGTTAGGGCTGTCTCCAATCGTATTTGTTAAGAGACACGATCTGGACAACCTGGTGCTCTCATGTGGTAGGGTGCCAGTGCTGCAGCCTTTTTGTCCATGAGGGGCCTCCTTGGACTGCAGCCATAGCCGCCACCTAGAAGCTTGAGGATGAGCTGCTCGAAAGGAGGGGTGCAATGTCATAATGTGAGAGGTTATAGAATGTTCTGAAGGCAGCAGCAGTAGTGAATGTGCATGGTTCTGTCAGAAGCCGCTGACTGGCTAACGCATCAAGAGATTAGGAGCTGGTGTGCACAGTGCACGTGAATGTCCAATGACATGTTCAACTCAGATAGGTATCGACCAAGTATTGGTCGATTATACATAAAAAAATAATTAGTTTTCTTCTCAAATATGTGGTCAACTTTTCTCTGACTCGTATGCGACACGGCCCAGCCCACATAGCCAGGATACTCAACCCTAATCCCATCCCTGTGTGCCCTCACCAGGCTAATGGAATTTTGGAACATATGGGCATGCATTGAGTATTGACTGAATTCTAGGAGCTATGGACTGTCTTTGAGATAAGTTTTCCTTTTTTACAGCTTGCCATACATTATTTCAGTGTCAAACAATTGAAAATAATGTATACATAATATTTTTATTTAAATATGTAGTGTGTCACCATATTGTCGTTTCCTTTTGGTGGGTGGGTGGGCGTTTTGTGTTGTCTGTGGGTGTTGGGGGGGGGGGGGGATGGCGAATTCCCTGTATCATTACCATGCCATGTTGACGGTCTGTATCCATGCATCATAGGCTGAAGCAACAGATTGCTGTCGTACTGTCATTAAGATTGTTAGCTAACTTTTGGATAGGCATATCTCTTATCCTTCCTATAAGTTTGACAAGGATGTTTGGCGCATAGCTAGCTTATATAAGGACACGTGACTGTGTCATTAGTATTAAGCAAGAAATAACACAATGGTTCCTTACCTTCGTTCTTCTTATCTCCCTGCCCTTGCGATGCTGCTGCCAACCATCAGCATGGTCGTACCTGTTCGGTAGAGCCTGTGGTGTTGCCAAATCCTAAGCATATATGACACTTTGTAATGCTGTATGCCACTCTGGGTGTTTCCTTATCATGTTAGTTGGTTTCAATTATTTCTTTATTTGACCATGATTCCTCATTTTACAAAATGGATGTCTTGTTTATTATGGTAGTTCTATCCGAATAACATGAATAAAGATTTTTGGCTGTAGTGGATGAACTGCGACCATTTTTATTTACTGTTGCTACATTCTCAACCAAATATCACTTATATTGCTATGCTTTGCTGGCCTATGCTATCTGTTAAATTGATTTATGTATTGCATTAATATCATCATTTTATTTGATTTTCTCATCCCTTTACTAACAATATGACAGGTTCTGCAAGTGTGAGATGCCATACAATCCTGATGACCTTATGATCCAATGTGAGGAATGCTCTGATTGGTGAGTAATGAAATAATTCATTTAAATTCATCTTTTTCCTGAACTGCGCTGGTGTACATTTTATAGTTTTATCCCTCTTGCCACTGGGTGAATAGGACAACCAATTTTTTTTACCTATTATTGGATTTGGGTGTCTTGCCCTTATCTTATTCTTGCCTATTGGGATGGGCGGCAACTAGTTAGCCATCAGAGAAATAAATGCTTTTCCATTTTTTTTACACCAGAACAAATCACTCATTGGCTCTATTTATCCACAATCCCCAAAGAGATTTGTGCAGATATAAAGGCATAACCATTGCATAATGTCTATGCTCTAAATTCCTGAGAGCAAGGCTACAAAGTGGGCCTCTCAATATGCATGGCATGTCTTTGTTGTTACATCGCCATATTAATTTGTTGAAACATGTGTTTTGGGCTGATGTTTTGGCCAATAATGTAGGTCGTGCTTATATATTGTTAATGGGAATAAGCACTATTACAATTGCCACACTAGACTCTCTTAACTCTTTCCTTGCTGTGGCAATGCAGAGACGAAGGAAAAAATTTCCTTGTTCGCTTGTCCTAATTCTAATTTAAAATAAGGAAACAATTAATGCGCTGGTCAAAACTATAGAGAGATATATATCCTAGCAAACATAAGGAAACAAGCTAAACCCCATATGGCCTACTGAGTTATTGTTTTTTGCTAGCTGTAGAACCTTGGCGGTTATAGTACTCTACACACCCCAACCCCCACACGCTCTGAAAGAAATTCATGACCTCAAGCTACATGTCCATGGAATCCACCATCAAAAGTTAATAGAATTGCTTTTGAGTAGGCTTCACATTTCATATACACTTTTCAGTACAATATATATATGAACACCAAAAGATGAGGAAGGGTTTAGCAAGTGAAGAAAGAAATCCACTCTACTCTAAACTATTTCTCTGGAGCTCTTAACCCCCTAATATATATATCCAGCTCCACCTTTCCTAGACCTGGAGCCCAACGAAACAGTTTCAGCTCCACTTAAAAGGGGAGTGGAATGGGCTGGATTGATTCCAAAAAATGAACTAGATGGGTGAAGCGGGGCTTGGGCCGCTCCACCGCTCCACTCCAGATTCCACTAGGAGTTGGAGCCTTGTCAAACAGGCCCATATTCTTTTGTTCATTGCACATGGCAAACTATTAAAACTAGGCCACACTACTACTCAACATCATTTGTCTATTTTGTTTTTCTTGTACAAGTAGTAACTTTGAGGTATGACAGATTACTTCGTACTATTGTGTTCTATAATATTTTAAGATTTTTCCTGACTATTTCACTTGGTTGGAAACACCTAATACCGGTTTAAGGACTGAGATATGAACTTCTATGCAAATGATTATTACAACTTTGAAAATATTTCTTAGCATAGAATATGATAGTATCGACCATCGTGGTTTGAACTTAAAAGTACTAGCAAAAAGAAGTTGGGAAGAGGATGGTTCACTGGAGTAAAATGGACCTTTTCCTGAGATAATAAAACATTTAATTTGTTTTGTCTTCTGCTTTTACTTTTGCATGAACTTTCTTATCATTTTTTTTGTCACAACAAATATCTGCTGCTTTTGCTTTCCAGGTTTCACCCTTCTTGCATTGGAATGACTATTAAAGATGCAAAAAAACTAGAGCATTTTTTCTGCCAGAGCTGTACTGCGGAAAATGGAAAGATGGCTGAGAATTCTCATGAAGCTACAGCGCAATCCGAAGAAAAGGTAAAATATGATATGTTGGGATTACTGAATTATCATTAATGATTTGTTTAGCTATCAGTAGTGCGATGGTAATACATCGAGGCCAGGGTCTCCCGGGTTCACCATGTCGTCTTAATAACATAGGCTACACATAATTTTCAATGATAGTGAGGCATGCTGCTTAATAATATTATTATAATATATGAGATGTCTGTCCTGTTGTATCGCTACTGTAGTTGAACAAATTTCCAATACTTAATGACACAAAGCACCAGTTGGGAAACAGTACCAATTTATTCATATGGCAGTAAAAAGTCTGGTGTGATTTTACAACTATAAAGGATTGGGGAACTTTTGCATGTTGATTACTGTGGCAATTGCTGTAACCTTTTTTTTGGATACTGCACAATTTGCCCTACTTTAGCTTGTACAGTTTCACTCTTATATTATGCATAATCTAATCATACAGTAAATAAAACCCATCCAAGGTACATGCACTATTTAGTTCTTTTTTAATTTGGTAATCACCATTCTGCGATTCTGAAAGACAAACATTTCATTTGGACTAATCTCTTCAGCAGGTGGAGTCAAAAAGACGGAGAAGGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA025290