Os12g0138900
| Gene Name |
Os12g0138900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Plastid isopropylmalate synthase (Fragment) |
| Version |
NM_001072648.1 GI:115487257 GeneID:4351460 |
| Length |
5888 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os12g0138900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:1887989..1893876 |
| Sequence Coding Region |
1888193..1888914,1890247..1890460,1890535..1890615,1890753..1890842,1890950..1891036 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008405:1887989..1893876 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008405:1887989..1893876 source=RiceChromosome12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcctcctccctcctctcctccccaaaaccctcctccttctcctccgcaaaccccacctccactccacgcccacgcgcccaaactctctcccccttccgcgccgccgccccacgcttctcccatggcctcgccaccgccgccgccgccgcaaaccctagcgcctcccgccgctgctaccaccgcgccttcgcccgccccgtccgggcgtccatggcgcagccgcggcgcccggagtacgtccccaaccgcatcgacgaccccaactacgtccgcatcttcgacaccaccctccgcgacggggagcagtcccccggggccaccatgaccagcgccgagaagctcgtcgtcgcgcgccagctcgcccgcctcggcgtcgacatcatcgaggccgggttcccggcctcctcccccgacgacctcgacgccgtgcgctccatcgccatcgaggtcgggaacacgcccgtcggggaggacggccacgtgccggtcatctgtggcctctcgagatgcaataagcgagacattgatgctgcctgggaggccgtgcggcacgcgcggcggccgcgcatccacaccttcattgccaccagcgagatccatatgcagcacaagctaaggaagacgcccgagcaggtggtggccattgccaaggaaatggtggcctacgcccgcagcctaggctgccctgatgtcgagttcagccctgaagacgctggcaggtcaaacagagagtttctatatcatatactagaggaagtcataaaagctggagcaacaacactcaatatcccagacactgttggatacactcttccttatgaatttgggaaactaattgctgatataaaagcaaacactccaggaattgaaaatgccattatttctactcattgccagaatgaccttggtctagcaaccgcaaatacattagcgggcgctcatgcaggagcacggcaattagaggtgactatcaatggtattggtgaaagggctggaaatgcttctttggaagaggttgtgatggcaattaaatgtcgtcgagaactcttaggaggtctgtatactggaatcaatacccaacatatcactatgtcaagcaaaatggtacaagagcacagtggacttcatgtacaaccacataaagctattgtcggtgccaatgcctttgcacatgaaagtggaattcatcaggatgggatgcttaagtacaaaggaacttatgaaataatttctcctgatgatattggtctaacacgtgcaaatgagtttggtattgttcttgggaagctcagtggaaggcatgctgtgagatctaaactagtggagcttggatatgaaatcactgacaaggaatttgaggatttctttaaacgctacaaagaggttgcagagaagaaaaagcgtgtaactgatgaagacattgaggcgctgttgtctgatgagatatttcagcccaaggttttttggtcccttgctgatgtacaggcaacttgtggaacacttggtctgtctacagcaactgtcaaactgataggtccggatggagatgagaagattgcatgtgcagttggaacaggtccagttgatgcagcttacaaggctgttgatgatataatacagatcccaactgttcttcgagaatatagcatgacatcggtcacagaaggcattgatgcaattgcaactactagagtggttgtcactggagatgtcagcgactctaaacatgctttgactggtcactccttcaaccgggcattcagtgggagtggtgccgcactggatattgttgtttccagtgtgcgagcttacctgagtgccctgaacaagatgtccagttttgttggggctatcaaggctagtagtgaagtatctgaaagccaaagagttcaaaccacagaatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASSLLSSPKPSSFSSANPTSTPRPRAQTLSPFRAAAPRFSHGL ATAAAAANPSASRRCYHRAFARPVRASMAQPRRPEYVPNRIDDPNYVRIFDTTLRDGE QSPGATMTSAEKLVVARQLARLGVDIIEAGFPASSPDDLDAVRSIAIEVGNTPVGEDG HVPVICGLSRCNKRDIDAAWEAVRHARRPRIHTFIATSEIHMQHKLRKTPEQVVAIAK EMVAYARSLGCPDVEFSPEDAGRSNREFLYHILEEVIKAGATTLNIPDTVGYTLPYEF GKLIADIKANTPGIENAIISTHCQNDLGLATANTLAGAHAGARQLEVTINGIGERAGN ASLEEVVMAIKCRRELLGGLYTGINTQHITMSSKMVQEHSGLHVQPHKAIVGANAFAH ESGIHQDGMLKYKGTYEIISPDDIGLTRANEFGIVLGKLSGRHAVRSKLVELGYEITD KEFEDFFKRYKEVAEKKKRVTDEDIEALLSDEIFQPKVFWSLADVQATCGTLGLSTAT VKLIGPDGDEKIACAVGTGPVDAAYKAVDDIIQIPTVLREYSMTSVTEGIDAIATTRV VVTGDVSDSKHALTGHSFNRAFSGSGAALDIVVSSVRAYLSALNKMSSFVGAIKASSE VSESQRVQTTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>205..926#2259..2472#2547..2627#2765..2854#2962..3048#3565..3665#4253..4286#4378..4452#4569..4652#4733..4867#5228..5370#5500..5641#gtcttcttcgccgcaaaaaccacgccgccatcacagcattcgtgcatcccacgaaacccccgttgtcatgtccagataagagctccacctctgactcacacacacatcaccgagaagcagagcaagtgcatctccctctcccaccatttgattcgattcccctaaacccccgagtcgtcgacgccacaaaccccggcgaccaccatggcctcctccctcctctcctccccaaaaccctcctccttctcctccgcaaaccccacctccactccacgcccacgcgcccaaactctctcccccttccgcgccgccgccccacgcttctcccatggcctcgccaccgccgccgccgccgcaaaccctagcgcctcccgccgctgctaccaccgcgccttcgcccgccccgtccgggcgtccatggcgcagccgcggcgcccggagtacgtccccaaccgcatcgacgaccccaactacgtccgcatcttcgacaccaccctccgcgacggggagcagtcccccggggccaccatgaccagcgccgagaagctcgtcgtcgcgcgccagctcgcccgcctcggcgtcgacatcatcgaggccgggttcccggcctcctcccccgacgacctcgacgccgtgcgctccatcgccatcgaggtcgggaacacgcccgtcggggaggacggccacgtgccggtcatctgtggcctctcgagatgcaataagcgagacattgatgctgcctgggaggccgtgcggcacgcgcggcggccgcgcatccacaccttcattgccaccagcgagatccatatgcagcacaagctaaggaagacgcccgagcaggtggtggccattgccaaggaaatggtggcctacgcccgcagcctaggctgccctgatgtcgagttcagccctgaagacgctggcaggtatcacttctaattgtaaatttgttcaacctttaggtccaatttttaaaattgtaagccttaaaatgaccaaaagtttgatacctggagtagtaattacaatgttggttggaaccggcatctgacctattggttggagtaataatctagatgtctgaaagtattgtgaatgaaagaggtccatccaactattgggaagctaggttgattgaggcaaagcgatatatgcttagtatatcaagtacttaaatttactttggtctggagattaagtactatgcatcatgtataccctactttgaacacattcatcattgactcagcgatgctggcatgtatcacttctaactgcatatttgtttgatttttaggccaatatttttaaactgtaagccttaaaatgaccaaaagtttcatatctggagtagtaattacaatgtggtttggaactggcatctgacttattagctaataatctagatgttggaaagtacaatgaatgaaagaggtctatccaacttttaattgcaaatttgtaatcattaggttacttttaaaatagtcagcgttgaaatgtccaacaatttcagtaattataatatgggttggaattgacaccatacctagtaatctatatgcctaagtactgtgcatgtaagaggtccatccaactttagtgaagtggggttgattttgaagcgatgcggtgtatgcttagttgcttactatcaagtactgaatttactttggtctggaaagggaagtattatgtatattgtatcttgaataccttcatccttgtactgctggtagatgtctacaatatgtaaggagttctagtagtaaatcaaagagaatgctagttgccagctactaaaattttgtggttgtgttccatctttaaatctacacacgaagcttattgttgcatatcatttactgtacattctttgctttcaaacatgttggcgcaaaaggaatgcctaaacattagctcatgccaagctattatctactccctccattttttaatagatgacgccgttgactttttctcacatgtttgaccattcgtcttattcaaaaattttatgcaaatgtataagatattaatcacacttaaagtactatgagtgataaaacaactcataacaaaataaattataattacgtaaattttttgaataagacgaatggtcaaacatgtgagaaaaagtcaacggcgtcatctattaaaaaacggaggtagtatgttttattagtcacaatcaattagcctccttttttatgcgcaaaaggctgtggcatgatatgattcactctgtcttgtaggtcaaacagagagtttctatatcatatactagaggaagtcataaaagctggagcaacaacactcaatatcccagacactgttggatacactcttccttatgaatttgggaaactaattgctgatataaaagcaaacactccaggaattgaaaatgccattatttctactcattgccagaatgaccttggtctagcaaccgcaaatacattagcggtactaccttttccttatctctttgatccattatcattggtttaatcatgtcactaatgtgacttaacctttagggcgctcatgcaggagcacggcaattagaggtgactatcaatggtattggtgaaagggctggaaatgcttctttggaagaggtgaactcatatactatgtttatgttgtttgttggtattttgcacatgttcatctaatggtttgcagaagaatgaatgcaagtaatattgatttcctatatatgcaactttttttttaaaaaaaatatatttttcaggttgtgatggcaattaaatgtcgtcgagaactcttaggaggtctgtatactggaatcaatacccaacatatcactatgtcaagcaaaatggtacaattatgtttgttttctttcttcttttgttttttttttatcttttgtctttttcaggtgactggaaatttcatgcacttttgcaaatactctgcttattctaggtacaagagcacagtggacttcatgtacaaccacataaagctattgtcggtgccaatgcctttgcacatgaaagtggaattcatcaggtaactaaatttgcattcttgccgtaatattgccatcaaatttcttgactgggttctctttagtgttgttttggtggtacctcaatttcacatctatctatatttcttgacttttagtgttgcctgggttcttgtttctgtttgccatttatctatattttataactctaaaagtgtttcttgccatcaatttacattttaggactaaggaattgattatcattactttttatttcctatctaaattttggaagtttcagaaatctttctagttgtcagtttgcatatgtgcactaggaaaaagttttgctcacatttttatagtatcacatactgagggaagtcaaattatttttatggatgcctttttttttctcagctccgatgaaatcattttctcatatatgatagatcaatcacggttttatatgaaccttgccttgcatattctcatattaattgtgttggttctaagtgaagtgatcttgatattcacttttgttattctgttttcaggatgggatgcttaagtacaaaggaacttatgaaataatttctcctgatgatattggtctaacacgtgcaaatgagtttggtattgttcttgggaagctcaggtaccatccatacatatgttcccccataatttgatttcttgcaagttgcaacattctccctgagatgttactcgaggagatagtttatctactttatgcactttcagctaatttggtgcaaagtacactttccaactatcaaacacttaaaatgttgaatgaccatatcatatggatactccatgtaaggtctaaattccgagatatgtatgcagatcatgtcacagtacaatttttacttgagaaattgtgtgatgtcatcctttgcttaaagttagtgaatttgctgttgttttttttttaattttttaggttaaacattgctcacttgacattgaggaaagctctacctggcctggtcattttatttagaattatctagttatcatatgttgttctgtacttctctagaataaatgaggttgccatattttttttttcatctttactcttgtatattaggtgaggttgatgcagcaatcctgctcaaatacttacgataggcttgcaattatgacttaaatctgatttgagattatcaactccaagttcataattatgctttcatgtcttcctttttttttcagtggaaggcatgctgtgagatctaaactagtggaggtattggaattgtctttatttttctagttagaattaaatgccttcttttcagttatcgttgctgaacaatactttgtcatccaatatgtagcttggatatgaaatcactgacaaggaatttgaggatttctttaaacgctacaaagaggttgcagagaagaaaaaggtgccagttttcctgagtgctctgttgctcgagtgacatgttcaaccttttttttttgtctgtagagcagaaagcattttgataacttctagcttatgtgctttaaatcattgtagcgtgtaactgatgaagacattgaggcgctgttgtctgatgagatatttcagcccaaggttttttggtcccttgctgatgtacaggtataattttgccacaatttactactttttggctaatggagaagttgatattttaaaattgatatgaagcctttttgcaggcaacttgtggaacacttggtctgtctacagcaactgtcaaactgataggtccggatggagatgagaagattgcatgtgcagttggaacaggtccagttgatgcagcttacaaggctgttgatgatataatacaggtgacagttgcaatattttttattgttcttgcactagtataccagtttatgggatggaatatggatgtgtttattcaatatgtaagaatgaaacatcctgcatctggtaacataacttgcagtatgttgcctctatgataaatatacaagaatcacaagaataggagattcagtacttaacaaggattagcatgcgatgtgttatgacttatgagcatgctttcaacaaaatgagtgcactattttgatgttaacagagaaattacctacatctactggcatgatttgtaaactatctgcattcatttcagtaaaactggagaaattatgaaacatctaagaatcatttgcaattcacagatcccaactgttcttcgagaatatagcatgacatcggtcacagaaggcattgatgcaattgcaactactagagtggttgtcactggagatgtcagcgactctaaacatgctttgactggtcactccttcaaccgggcattcaggtaagtcctttatactacttttttttttcactgggcaccttccttctgtgttgtttccaacatctattattgttattatcaattaaatttttctcatcaactaataatttctttgcctattgacctcagtgggagtggtgccgcactggatattgttgtttccagtgtgcgagcttacctgagtgccctgaacaagatgtccagttttgttggggctatcaaggctagtagtgaagtatctgaaagccaaagagttcaaaccacagaatgagtcttgacgctccttggttttcatatcggatggttctatgtttcacattcccagcaaggagtatgtgcttgttgaaacatggtttttccgtttagtgcatctggaggatgttctgggtttctttggtggagcctgacttaaggttgaacatccaggaagttttggggtatgtagtgtataattcatatttgaaaattgtatttccaataagacaataataaataattgtttgacatatgagtattgc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
